result

Gene information

Detail information of AfisC3G08718

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G08718	chr3	1549107698	1549127504	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC3G08718
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AGV31153.1	3.6e-89	C-class MADS-box protein
Swissprot	Q40704.1	6.0e-81	RMADS222
trEMBL	T2CD95	2.6e-89	C-class MADS-box protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G18960.1	64.02	2e-81	298	AG	K-box region and MADS-box transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

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PF00319.15	SRF-TF	Domain	10	57	92.3	8e-27
PF01486.14	K-box	Family	87	172	86.5	9.7e-25

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
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GO:0010440	P	stomatal lineage progression
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0048283	P	indeterminate inflorescence morphogenesis
GO:0048481	P	plant ovule development
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0048574	P	long-day photoperiodism, flowering
GO:0080155	P	regulation of double fertilization forming a zygote and endosperm
GO:1903338	P	regulation of cell wall organization or biogenesis

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09264	K09264; MADS-box transcription factor, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network