result

Gene information

Detail information of AfisC3G08811

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G08811	chr3	1569688305	1569693651	+

Sequences

CDS

>AfisC3G08811
ATGGAAAAGGCTAGTGCAGTCGGACTGAGTCTAGAGACTGTTTCTTCAAAGTCATCAGTGCCGTTTCATGATTCTAATACTAATAAAAGGAAGCATGATCAAGCTACACAATTTGACTTTGTGAATTATCGTGATCAGAACCCTAAAGAAATGAAAGAAATGGATTTTTTTTCTAAGGAGAAAAGGACTCAAGCTTCTGATGATCCTAATCTTCATCTTCAGATTCCGACAAACCTTGGTATAAAGAAGGAAGATCTCACTCTTAATACTGGTCTGCGTCTTTTAACTGCAAACGCTGGCAGCGATGAATCAACCATAGATGATGGATCATCACCTACTGAAGATGATCAAAAAGCAAAAGAGGTAGAGGCACTTAAAGCACAACTGACGAGAACAATGGAAGAGAATCTAAGACTAAGAGGAGTCGTAATCCAGACTATGAACAACTACAATGCTTTGAATATGCATTACACCACGCTACTACAGCAAAGTAGTCAACAAAGTGGGACTATTAATGTAGTAGATGGATTGAAATTAGAAGGGATAAAGAAGCAAGAAAATGGTATGATTGTGCCTAGGCAGTTCATGGACTTAGTTCCAGCACCGATCAATGAAGTGAGCGAGGAGCCTTCCCAGTCTTCTACTGAAGTGGCCACTCAAGAAAATGAATTGGCTCATGAAAGGTCGATTGCTAATGGTTGTCAAGACCATGGTAGAAGTTTACCTAGCCCTAAAATAGCTTCAGATGCCCAAGCTCAAGAAGCCACAATGAGGAAAGCTCGTGTATCAGTTCGAGCTCGATCCGATGCTACTATGATAACAGACGGATGCCAATGGCGAAAGTACGGCCAAAAAATGGCGAAGGGGAACCCATGCCCGCGGGCCTACTACCGATGCACGATGGCGACGGGCTGCCCGGTCCGGAAGCAAGTCCAGCGCTGCTCGGAGGACCGATCCGTCCTGATAACCACCTACGAGGGAAACCACAACCATCCGCTTCCTCCAGCGGCCATGGCCATGGCCGCCACGACCTCGGCCGCCGCCTCCATGCTCCTCTCCGGCTCCATGTCCTCCTCCGATTCCCTACTCAATAATAACAGCAGCAGCTTCCTAACCCGCACCATCCTCCCCTTCTCCTCTTCCCTTGCCACAATCTCCGCCTCCGCCCCCTTCCCCACCGTCACTCTCGACCTGACCCAGAACCCGAACCCATTGCTCCAGTTCCAGCGCCCCCAGCCACAGGTATTCTCGCAGTCCAGGCTTTCCGGTCTGCAGGGTCTGGATAACGTGGATCCGGCGCAGCTCATCGCGCAGATGAAGGGGGTGCCGTCCGATCAGGATAAGACCTTCGCTGACACCGTGACTGCGGCAACTGCGGCTATTACGGCTAATCCTGGGTTCACTGCCGCGCTGGCTAAGGCTATCTCCTCCGTCATTGGTGGCGGCAACAACAATAACAGCACCAGTGGGTCCTAA

Protein

Gene

>AfisC3G08811
CTTCTTTCTGTCTTCCTCTCCTTTTCTTCTTCTAAACCTAAAAATATAACCTTGAAAAGCAAAGAAAAAGGTCTTATAATGGAAAAGGCTAGTGCAGTCGGACTGAGTCTAGAGACTGTTTCTTCAAAGTCATCAGTGCCGTTTCATGATTCTAATACTAATAAAAGGAAGCATGATCAAGCTACACAATTTGACTTTGTGAATTATCGTGATCAGAACCCTAAAGAAATGAAAGAAATGGATTTTTTTTCTAAGGAGAAAAGGACTCAAGCTTCTGATGATCCTAATCTTCATCTTCAGATTCCGACAAACCTTGGTATAAAGAAGGAAGATCTCACTCTTAATGTAAACTCATCTATTTCTTTTTTCTTTCTTTTTCACATCTATATGCCTTTTTTTTAAATAATTTCCTTCAGTCATATGTGTGATATATTCATATATAGCTAGTATTTCAACAATGATTATACTATAATAAGGTACTGGATGTTATTCTTGTTCTTGATTTCAGAACATTTGTAGAATCAATATAATAATTTGATCACTGAGATTTTTTCTATTTGTTTTTTTAGTTTTTTAAGTCAATGTTCAGAATCCCCCACCATGACCCAAATAATTGAATAGCCATACACTGGCATGAGAGCATCATTATTTTGTTAACAATAAGATTAATCAAATGAAAAGAACTGGGAAGAAATTTCTATGATCATTTTTCTTTTGGTCAATTAATTAAAATAAGTTCAATATCTGGCGTATTTGATTTGATGTTTACAAAATGTGTCTAGTTTACTTGTTACTTGTTAGTATGAACTACATTAGGGTCATTATTCAAAGAAACCCAGTCAACATTATTTGGTTTAAAATATCTAGTATCAAGATTCAAATATTACAGAATATATCCATTTAAATATTACTGATAAACAAATGTTTCAAATTGTTTAGACTGGTCTGCGTCTTTTAACTGCAAACGCTGGCAGCGATGAATCAACCATAGATGATGGATCATCACCTACTGAAGATGATCAAAAAGCAAAAGAGGTAATTGTGAATTTTCAAGCATTTAATTATTTGACTGAACTATTACAAACTTGAACATGGAACAATTCTTATTTGTTTTATGTTTCAGGTAGAGGCACTTAAAGCACAACTGACGAGAACAATGGAAGAGAATCTAAGACTAAGAGGAGTCGTAATCCAGACTATGAACAACTACAATGCTTTGAATATGCATTACACCACGCTACTACAGCAAAGTAGTCAACAAAGTGGGACTATTAATGTATGAATTCAGCCAACTACTTTTTATTATTATTTTCAAACCAAACTATGTAAAATGTCTTGTAATTTAATTAAAATAATTTAATACAAAAATGCAGGTAGTAGATGGATTGAAATTAGAAGGGATAAAGAAGCAAGAAAATGGTATGATTGTGCCTAGGCAGTTCATGGACTTAGTTCCAGCACCGATCAATGAAGTGAGCGAGGAGCCTTCCCAGTCTTCTACTGAAGTGGCCACTCAAGAAAATGAATTGGCTCATGAAAGGTCGATTGCTAATGGTTGTCAAGACCATGGTAGAAGTTTACCTAGCCCTAAAATAGCTTCAGATGCCCAAGCTCAAGAAGCCACAATGAGGAAAGCTCGTGTATCAGTTCGAGCTCGATCCGATGCTACTATGGTCAGTCAAATTATTATATTGTTAAATAAACAAGTTTTTGCTTTTGTTTCTGTTTCTCAGTTGATTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAAATGTTGGTTAAAGTTGATGTTTCAAGTATTACCATGATAGCAAATTCCTTAGTAATAATGCTAAGTATGATTGGACATTGGACTAGAGGTGGAAACTGAGAAATATATACCTTTTGATAAGGATATGATTAAACGTTAGCTAAAAGTTTGTATTACAGGAAAATTGTTTAACCTCACTTAATATTTAATCCATTTTGGAACGACTTGTAAACACAAGCCATCCAAGATCAGGTTTATTTTCAACGCCATCCTTATCAGATTTCCAAATATTGAGGTCTGCCAAATGAATTTGTATTTTCCATAATTTGTAAGATTTATCATTCTGATTTTATATTTTTGGTATCAAATTATTTCTGTAAGATTCTATGGCAACGTGCGTGCATAAAAAATTCTTTTTACAATTATAAAATTTAAAATTTCTGGTGTAACTTTGATAAAAATAAATTAAAAAATATAAAGAAAAAATTATAAGTTTTTTGGTACAGAATTTCGTATTTGTAACCTTATTTAGTGTCAAAATTTACATTTGGAAATAAATGTTAATAATTGTTTTTAGTGGGATTTAATGTTCTGACCTCTTGTTTGCATTTAAGAGTATTTTTAGAACTTCGTAGTCGGACCAAAAAATTGTGTTTCTACTCCAATTGTTAATAAATTAATAAAAATATTGAGTACATTAATTAATAGTTCACAACAATGGAAAAAATTTGCTATTTTATAAATACCACTTAATCATTTTCACAAAAATATCATATTTAAACCCTGGTATATGTTGGTAACTATTTATAACCAATATTACTGAAAGTTCAAGTATTAGGTCACTGATTGAAGCCAGAAACATCGTGGCCATAGCAACAAAGTGACCCTTAATTTCCATCCTTCGGTCCGTTTTTCTTCTTCTTCTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAATGGTTGTTCACTACAGAACTGTACACCCAAAATATTACACTAAACAAAAGTTCCGATCAACAAACACAATTGGTAACATGAAAATATGTAGCTACGGCTCCGTTTGGAAGTTTTGTGGTTCCAGTTATGAGAGGTTTTGAGAGTACTGGTTTTGATCGTTAATGATCGTAACAGTTTTGATCGCTTCAAATGAAGCGTTGTTATAACCGATCAATGCATGTTTGGAAGTTTAACGTACACCGGTTTTGAGAGTTTTTCACTGAAGCAACGAAATTACATATATATCCTTATATTTTGTTTAGAATTATGGAGGCAGGGGCATAATTAAAAGAACAAGTTATAATCCTCAAAACACCCTAATTTGATGAGTTCAGAATTGCCTTGAAAATTACACTACACCGGTTTTCATCGATTTTATAACCAACAACAATTGGTGTGAAAAAAAAATTACAAGCAACATTTACGATAACACCTAAAATATAAAGCCGTTCAAAACCAGTCAAAACCAGTAGAAAATGAACTTCCAACCGGTGCCAAAGAGTTTAAGTTCATACAAACATAAGTCAAATATAATACAACCACCTTTTTGTCTTAAAGTCATACTTTTTGTACAAATTACACTATCATTATCGTCGTCGTCGTTATCTTACAAATTACAATGGCTTTCTTTAAAACATACATTAACCAAAAAATTTGCATTTTTCTTGGTAGAAAATAATGTCTTTTCTATTGACTACTTTCAAAATATTTTCGATAACTTTAAAAGAGGACAAAAAAATTCAGTGCAAACTTTTCTTAAAATTGCTTTATTTACTTGATCAGAAGTGAGACTTATGGAATAACTTCGGTAAATGCGGTTCATAAAAAATCAAGTTTTTTTTAATGTCATCATTGTCATATTTCAAATAATTGAGCTTTATCAAACGAGTTCTTATTCTCTGTACTTTCCCTTAGAATTGTTGTTGTAGTCCATACTTATTTCGTATGAATGAAAATATAATATTTTGTTATGCTTTAGAAAAAAATTAATCAAAAAAGTTGTTAACAGCCTTGTTGATTTAGAGGAATCTCAATGTCATCTTTAAACATGTTAAACTAAAACACACAAGAGCATTTTTCAAAACAATTACATATTTAAACTACATGAGTTATTGCTTGTTTAATATATACTTAAAAGTTAATGTTGAAATTGTTGAATAAAAGAAAGCAAAATAGAAAAACAAAAGAAATAGAGAAGAATAAACAATTAGATATTGAAGACTACATGTTTATTAACGAGTGAATTAATAATTCAAGAACACCCGGTTAATATTTATGTTTTGGTTACCTGAAATCCAAATAATCATACAATAAAAAATATTATAATCAGAAAAACTACAAAATATGATTGATAATAAAAAAATGTGGAATCTCCTGAGATATTCAGAAAATACATTCGCTGTAAATTTACTTTGAGAAAATTACACTATCGATGATTAAAACATTGTTAACACAGAATTTCACATTTGCTTGGTAGGCAATAACATGTTTTCTGTGACGGTTCTTAAAGTGATATAGATTTATAACTCATTTCGAATGTGATCTAACAAGTAAAAGTCCAAGTTTAAAAAATGATTCGAGTGGGTTTAAATTGACAAAAATATATTGGAATACACAACATTTACTACATTCTGCAAAAGAAAATAATCCCTAATTTAAAATAATCGGCTATAATAGATTGGTACTGAATTTACAGATAACAGACGGATGCCAATGGCGAAAGTACGGCCAAAAAATGGCGAAGGGGAACCCATGCCCGCGGGCCTACTACCGATGCACGATGGCGACGGGCTGCCCGGTCCGGAAGCAAGTCCAGCGCTGCTCGGAGGACCGATCCGTCCTGATAACCACCTACGAGGGAAACCACAACCATCCGCTTCCTCCAGCGGCCATGGCCATGGCCGCCACGACCTCGGCCGCCGCCTCCATGCTCCTCTCCGGCTCCATGTCCTCCTCCGATTCCCTACTCAATAATAACAGCAGCAGCTTCCTAACCCGCACCATCCTCCCCTTCTCCTCTTCCCTTGCCACAATCTCCGCCTCCGCCCCCTTCCCCACCGTCACTCTCGACCTGACCCAGAACCCGAACCCATTGCTCCAGTTCCAGCGCCCCCAGCCACAGGTATTCTCGCAGTCCAGGCTTTCCGGTCTGCAGGGTCTGGATAACGTGGATCCGGCGCAGCTCATCGCGCAGATGAAGGGGGTGCCGTCCGATCAGGATAAGACCTTCGCTGACACCGTGACTGCGGCAACTGCGGCTATTACGGCTAATCCTGGGTTCACTGCCGCGCTGGCTAAGGCTATCTCCTCCGTCATTGGTGGCGGCAACAACAATAACAGCACCAGTGGGTCCTAAATGCAATACTTTTGTTATGAATAGGACTTGACTACACAACACTTGTTGATTATTTTTATTTTTTGAAATTATCGTTCTTTCTTTTTTGAAAGAAAGGAGTATTTGGGAGGAAGAGGAGGAATAAATGATAATAAGGTTGTTCTTTTCTATGAGATTGTGGTAATAAGGTTGAGATCGAAAGTTGATAAATCTAGTTTTGCAGACTATGAAATATTTGTTTAAACTTTAAATACGTGGTTAGACTTGTGAAACAAAGGCTTTGAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010916103.2	1.3e-92	probable WRKY transcription factor 31
Swissprot	Q9XEC3.1	6.2e-60	WRKY DNA-binding protein 42
trEMBL	A0A6I9R0Q9	9.3e-93	probable WRKY transcription factor 31

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G04450.1	46.80	3e-94	342	AtWRKY42;WRKY42	WRKY family transcription factor

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G08811	AT4G04450.1	485	193	16	51	479	28	503	46.80	3e-94	342
AfisC3G08811	AT1G62300.1	491	168	17	53	486	89	545	47.25	5e-92	335
AfisC3G08811	AT4G22070.1	471	154	16	31	425	16	471	47.98	4e-83	305

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03106.12	WRKY	Domain	275	332	93.7	5.8e-27

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0006952	P	defense response
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009267	P	cellular response to starvation
GO:0009685	P	gibberellin metabolic process
GO:0009719	P	response to endogenous stimulus
GO:0010033	P	response to organic substance
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0070887	P	cellular response to chemical stimulus
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network