result

Gene information

Detail information of AfisC4G00040

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G00040	chr4	8044538	8047596	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G00040
ATGGCCAAAAGTTTTGTGGTGTCAACGTATGACCTGATTGATGAAAGGATTTGGCATGTAACTACATTTTGTTTCAATTATGTGTTTCTGTACATAGCGTGACTCATTTGCAAAGAAGAATTGGTGTTATATCAAGGTGACATCAGTTTTTGGATAGAGGAACTTCGGCAAAACCCTAGTCTCTTGAACTCAGGGAACTAAGGTAAGCTTACTTACATAGTTTGGGCTAGTTGTTCCTAAAATATCACACAGTTGAATTGTACAAAATAATTTCCATTAACAATGGTGGATACATATTTGAGTGGTTTCTCTTAAATAATACAAAATGTTGTGATTACTTATACAATGTAAAGTATATTAGATGATTATTGATAATCATCAGATCCATTCCATATCATATCCCAAGTCACACGAATTGGGAACTTGCACAAAACCTCTCTTAATTCTTAAAGTTCAGCATTTAACCATGTTTTAGCTCCTACTATATGAGTATGATATGCTTACACACATACAAATAGATAAACACATTTATATGTTATCTTGTTGACTATTTGTTTCCACTCCCTTCTTCATAGAATGAGGAACTCATTAAATTCATAAAAGATGCCCTCCTTTCTTGTTGGTTTTCATAACATAGAATATACACAGGTCGAAACTAGCAGCTAATTAGTTCTGGATAGTTACTCGCATTACACTTGCTCACTTGATGTATACAAAGCCCAAAAGGAAGCATAGGAACAAAAAGGGAATATGTGTACTGACATTTTTACATGTGTTAACTTCTTGTGCACTGACATTTTGTTGTGCGTGCTTTTTTCCAATCATGTACTCTTTATTTGCTGCAGGTGGGTCTGATTGGACGCAAGAGGGATCGCCAGAATTCTGAGCTATCGGGTAAACCTTGAATCCGAAATGTTGTGTTTAATAAATTTGTGTTGTCATCAGCGTCCAATTTTACATTGGTCTCTTATACTTCATGACCTTCTTTAATGTGATATTCATCTTTCTAATCTACTTACTGCATCATTTTATATATCTTCTTCTCATATGTTTTCTTTACATTACCAGGTGCGGTTGCTATCTGCTTTAAGGTTGATCTTTAATCTTGAAAGTGGTACAGTTTTAGAAGTTCTAGAATCAGAGATTAACAAACTGGTTACTGGAACTATCTCACTTCCTGTCAATTTACCTGGAACAAACTATAATAGAGGAGTAAACGTAATTATCATTTGCTCGACAGGTTTCTACCTTTAGTTCTTATACTGATAGTGAAAATTTCTCATGTACAGGCAAGGAAGAAGATTGTAGGTATGCTTGAAAGATTAATTCGGGAGAGAAGAGCTTTAAACAAAAGTAGGAGAAATGATATGCTGGATGCATTGCTGTTTAATGACGATGGAACTAATTCAGATCTTAATGATGAACAACTAAATGACTTGTTAATCACATTCATTTATTCTGTATACGGGACTGTGTCGACTACTTCAATGATGGCTATCAAGTATCTTCATGACAACCCAAATGCCCTAAAGGAATTATTGGTGAGTTAAAACAATGTGAAATATTTTACACTTTGTCAATATGAATATTTACTATTTGGGCACTATAACTAAACACATGATTCCTCAACTCGTACGTTAAATTACAATGACGACGATGATGAATTAACTAAGTTTATAAAAATGAACTAAGTTCATAAAAATTAACTGAATTATTAATAATAATATAATTAAGTTAACCGAGTTTTAATAGTAGTAGTAATAATGATAATAAATTAACTAAGTTAATCAAGTTAAAATTAAACAAGATTTATAAAATTAACTAAGTTTAAGTTAACTAAATTTTATAAATAATAATAATATAACTAATTTAACAAAGTTTTATAAATAATAGTGATGATGATGATGAATTAACTAAGTTTATAATAATAATACTAATAATATAACTAAGTTTATGTTAAATAAATTTTATAAATAGTAATACTATAACTAATTTAACAAAGTTTTATAAATAATAATGATGACAATGATGATGAATTAACTAAGTTTATAAAATTAACCAAGTTCATATTAATAATAATAATACTAATAATAATAATACAATTAAATTATCTTTGTTTTATAATAATAATAATAATAATAATAAATTAACTAAGTTAACCAAGTTAATAAAAATTAACTAAGTTTTGTTAAAATTGAACAAGTTTTATAAAATTAGTTAAGTTTAAGGTAATTAAAATTTATAATAATATAACTAATTTAACAAAGTTTTATAAATAATAACAATGATTATGATGATGATGATGATGAATTAACTATGTTTATAAAAATTAACTAAGTTTATAATAATAATATAATTAAATTAACCGAGTTTTAGTAATGATAATAATAAATTAACCAAGTTAACCAAGTTAATAAAAGTTAACTAAGTTTTGTTAAAATTAACTAAGTTTAAGTTAACTTAATTTTATAAATAATAATAATACAACTAATATAATAAAGATTTATAAATAATGATGATGATGATAAATTAACTTAGTTTATAATCTAACTATGTTTATAATAATAATAATAATAATATAATTAAGTTAATCGAGTTTGAATAATAATAATAATTGTAGTAGTAATTGTAATAATAAATTAAGTTAACCAAGTTAATAAAAATTAACTAGGCTCTGTTAAAACTAAACTAGTTTTAAAAATTAACTAAGTTCAAGTTAACTAAATTTTATAAATATTAATAATATAACTAATTTAACAACATTTTATATATAACTGTAAGATTGGACTTTATTTATTTCATTTTGTTTATAACTTTGATTATTTATGACATTATTATTTATAATATGATATGCTTGTACAATGATGTAGATGTTTGATATTAGATTTGAAGTCTTGCGAATTAACATAATTGTTTGACTATATGTTGTGCTTTCACTTGTGCAGTCATTGGATTTTCGAAGAGAGCAAGGTTGGACTTTTATGGTGCTAGCTTTCACTTGTGCATGCAACAAAGAATTATGGGTAATCAAGCGTTTTGTTAGCACCAGTTTGGTATAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020244260.1	1.5e-36	cytochrome P450 85A-like
Swissprot	Q8GSQ1.1	1.1e-31	OsDWARF
trEMBL	A0A8B7D2R2	2.4e-33	cytochrome P450 85A1-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G38970.1	42.38	5e-25	110	ATBR6OX;BR6OX;BR6OX1;CYP85A1	brassinosteroid-6-oxidase 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G00040	AT5G38970.1	151	83	3	13	161	166	314	42.38	5e-25	110
AfisC4G00040	AT5G38970.2	151	83	3	13	161	85	233	42.38	5e-25	110
AfisC4G00040	AT5G38970.3	151	83	3	13	161	166	314	42.38	6e-25	110

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00067.19	p450	Domain	59	152	39.7	2.3e-10

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0001578	P	microtubule bundle formation
GO:0016020	C	membrane
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0022900	P	electron transport chain
GO:0009647	P	skotomorphogenesis
GO:0010268	P	brassinosteroid homeostasis
GO:0016125	P	sterol metabolic process
GO:0016132	P	brassinosteroid biosynthetic process
GO:0016709	F	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
GO:0020037	F	heme binding
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0048437	P	floral organ development
GO:0048438	P	floral whorl development
GO:0048827	P	phyllome development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network