result

Gene information

Detail information of AfisC4G00904

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G00904	chr4	164166887	164178072	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G00904
ATGGATGACCTCTTCTTAAGCTGTGAATCAAGCTCACCGGATGGAACAACTGCCAACTCTTCTACTCCAAACATTGATGCAGGAAAGAATATAGAAACGGAAAGAAACAGGAGAAGAAAGCTCAATGCCAAACTCTATGCTCTTCGTAGTGTAGTTCCAAATATTACTAAGGTATACATGTTCTAACCTTAATTGTCACGCATTGTGCACTGATAAGTTGATAGTGTAGTTGAATATATATTGTGGTTTGGGTTTAGATGAACAAGGCATCAATAATCAAGGATGCAATTGAATGCATTCAAGAAATGCAAGAACAAGAAAAGAAGATTTTAGCGGAGATTAATGAGTTAGAATTTAGCTATGCACAAAAGAAGCCAAGTTCTAGTGTTGGCAAAAGCAGTAAAATTATGAGTAGGATTGATGTTACTGAGGTATATATTAATTTTTTCCCAATGTTTGATTCATTGTTGATCAACCAAAATTTATACATATGACTATATTTGAATTTCGGGGCAATGCATGTAGATTATGGTGAGGGAGGTAGAAGAGAAGTCAATGGTGATAAACATAACATGCAACAAGGACAGGGGAACCATGGCCGTACTGTGCCAGCTCATTGAGTCCATTGACCTCGACATCTTGAGTGCAAATGTCACTACTGCTTGTGGCAGTATTTTGCACACATTACTTGTTGAGGTACCAATTTTTCTCTGTTTTATATATTTTGCCGATTTGTTCATTTATGTCTGCCATCAGGTCCACATATATCGGGTAACCGACTTATTCTGCACGCCTTTCTTTTATAATTTGATTGTAACAAATTTAAATCTTGATGTTTTCTTTTTTGAGAAAAAAAATTGTTTATAATTGCTAAGTTGAAATGAATGCCTGAGGTATGATTTCAACCTAGATGTATTATTACTAAATTGTGGTTGTTGACACAAATTAGTTGAATTTATTCCTTGTATTTTAAAAACAATGTATACATTTTAAATAAATTGTTGAAAAATGAAATTTAATACCCAATAACGTTTGATATACCGATAATATATGATAACATTTGGTTTTTGGTTTGTTAGTAAAAACTGTAATGATTTTTCCAAAAATCAACGGTAATGAAGCTATGTCTTTTTTAGCTGAATAATTTTCTAATTTTCAAATTCATACTTTTAACTTCTACGTTGTAACTAATATAGTTCACACACTAGTTCATACCATTCGTACAACAATCAATTCTTCCCCTGAGATGTTGCATTTTGTAGTACTTTCACATTCTACACATGTTTAATGAGTTAAAAATTTGATGAAGGTATACAGGCTATGATAAGGATATATGGTCATACCAAGTGCAGTATATATATAGTACTAACATAAATAACAGACTTTCCTTTTCTGCACTTTGTTCAGAAGGACGGGTGGAATTGTTCTCAGGTGAAGGAAAAGATAGAAAGCACAATATTTGTGCATAATGCAGCAATAAGCTCTTCAAGTTATGCATGCTATGATTAAAACCGGATTGAGTAACATTGATTGGAAATGCATCTCCACAGCATTATATCATGAAATTCAGCTAGTACTGGTCTTATATCAGATCAATTGTATGATTATTGATTAATATGAATGGGATCCTACTAATAAGTTGATAAAGGGTTTTCCTTCCCTTCTTTTATAACTTATGATATATTATCATTTTACTAGCAAATTAGAAATAAAATTCTATAGGTGTTTCCACTGTCAAAACATGAAATGACTCACGATGCTACTATACAAAGATCCATCCGTTTACACTCATGTAAATTTAGTCCCTATTGTTAACTTTTATCGATTTTATTCCAATTTTGCCTTTTTAAAACGCCGTCGTTATTGTTTTTTCTGTATCTCGCCTTTTTCTTTTTCCTTCCAATCAAATTTCTTATCTCACGTTTGTCTTTCATATATATTGTAATATATTTCGTTTTCCATTTACATATGGAGCTCGCTTCTCATTTTCGGCAATTGATTATATTCAGATTTTGAAATTTATTATTCCTAATTTGTTAGATCGAAGGTTCTGTGCTTTCATACTGTATTTGATCGAGGGTTTTGTACTCGTTTAGGTATTTCATTTCAAGCTAAGTTAATTTCGTACTGGATTTAATTCTTATTTCACTTTAGCTTATTTTTATTTTATTTAGTTATATATGATCAACTCTTCTTTGTTAATATGAATTTGAACATTTCTGTCATAAGGTAAGTATTCTTTCAGTTTTTTTCATTTTTCAAATTTTCATATGTTCAACCCTTCTTTGTTCATATGTTTTAACTTGTTAAATATTATGTAGTTGTTCCTTTGAAAACTTTAAACTAAAATATGACTTACAGTTTACTCCGGAATTGTTACACCAAAACAGGTGATTCCCAACGAGTATAACTGTCGCAAACAGTTTCAGCAACGCTTATTAGCGTCGCTGTAGGGGCGTCGCAATTTATTGCCAACGCTTATAAGCGTTGGGAAGTTTAGTTTCCCAACGCTAATAAGTGTTGGAAGGTTGTATTCGCCAACGCTTATAAACGTTGGTGTATATTATTTAGCAACGCTTATAAACGTTGGCAAATTAACCATCCAACATTGTTTAATTTTCTATGCTGACGCTTATAAGCGTTGGTAAATTTTAATTGCCAACGCTTATAACGTTGAAATATTTTCATTCTCAATATAGTGAATTATTTTAACATTAATAAACAATTAATAACTAACATGATATGCATTATTATACTACATTCAATAGGAACCCAAAATTTATAATATTCATGATCAAATAACAACATAAATTTCATAGTCAACTAATTCATAACAATGTCAACTACTTCATAACAAGTACAATACATAATTAAGTTGGTTAATTCAATACATAATCAACTACTTCATAACAATGTCAAATTGGAATACAAAAGACAACGTAAATTTCATAGTGAAATTCTACAAATACCGAATACGAAACTCCGGCCATATAACGAAACCTCCATCTGAAAAATCACATAACTTGTACATTCTATTTTGAGGACCATCATAAATTGGTGCATCTGGTTCAAGAACATCAACCACCCAAATTACTTTCTCTACATTCGGTATCACCTTCCTAAAATGACAAATAGTTTGTGTTCCAACATAACCTTTAGCTACTTCCTTCTCTAAATCTTGTGACAATAGCATTACATATTTCTTTTCCATTGTAGATGACCGAATATCATTATTTGACACGGTTGGAGTAACAACTACATTATTGTTTATATGAGAATCTCCTAAATTAGAAGCACCTTCCATTTGTGGAGTCGTAGGACTTGCAACATATTTTTCTTGCAAACTAGGCATAAATTTCATAAAAGTTGAAGTAATTGAATTGATGGCATTATTAACTTGATTAGCTACTTGCCTTTCTATCTCCAATTTCCAAATAGACAAATCCACGGCTTGCTTCTTTTCAGTTACAGCTTTTACAGCTCGAGCCATCTTCACTTGTTTTATAGAAGAAGTAGACGTAATTGCTCGACAATATTTTTTCTTCATGTCGGAATCAAAAACTTCCGCAATTGGGTCATCTTTAAGATCTTCGACTCCACCCTTAGAACTATCATCCAACTTCCTCTATTTTTTCGCTTCCTCTAGAAGTGCCTGCATTTTATATCACGTTAAATTGAATTTGCGGTTCCTTTATAAAAATTAAATTGAACATTAAATTAAGTTGATAATTAATAATGTAACTGGGCTCAAACTGCGCCCCGTCTCAGTTTCGAAATTGCGCCCGGGCTCAGTTTCGAAACTGAGCCGGGCACAGTTTCGACTCAGTTTCGAAACTGAGCACGGGCTCAGTTCGAAACTGAGCCCGGCTCAGTTCGAAACTGAGCCGTTTCGACTCAGTTTCGAAACTGAGCCAATGAACTGCAAATGAAAGAGAGTGCAATGAAATCCAAATGCAAAAGGAAATGCAGTCTCAATGTAGTTTAGGGAGATGCTATGATCGGATGGGAGTTTTAGGGAGCACTAACAGATAAGCAGTGACAGATGCTGTTGAATAAGTTTAGGGAGGAGTGTGGTGGTGTAGTAATTTGGGTTCAGAAGTTTTTGGTTTGAAGGGGAAAGTGTATATGAAAAGATTTCTGGTGGAGTTGTATGTAATAGAAGTGAAAAAGTGTGCAAATGTAGTTGCAAATGAACTGCAAAATCAAAAGTTATGTTTATTAAACTGTGAAAGTTGGAAAAATAGAGGGTTTGAACAATACTTGAAAACTGTGAAATGAAAACTGTTTTTTTTTAATATGAAATGGGATGCTTAAAAATGCAAATGCCTGAACAGTTGTAATGCAAATGCAAAAATGTCAAATTTCAATCTATTTCCATATTGATTTGTTGGTTGCTCATACTTAATAAATTGCAAGTCCAAACAGAAGAATCAGTAAGTATAATGATACGACATTTATAATAACAAGAAATGTTACTAATGATATCCCATTACTATTAAATGTCCCACAAAGCTCAAAAATTTCACTAATTCTTGACTTGTTTTCAAGGATCCCAATACACTCAACTTTAAACTTACTCAACATAACTATTATTTTTCTGGAAAGAAGATTAAAGAAATAAAAATTTGTGGTTTTAGTATAAAAAGAATTTCTTACATCATCAACATAAATGTAGTTCTCCAAACACTTGCATGCCTTGTAATTCTGGCAAGTTTGTATTGAAAATATGATGAGTGAAAGAAAAAAATAGCGAATTACACAGATACTGTATGAATGTATCAATGTCTTCAAATCTGTGCACAAAAGTGTAATTAACCATCAATTGTAAATATTTGAATGTATCAATCTCTTACATGAAAACCAAACTAATATAAAAGATGAAAAACCATCATTTGACCAGAATAAATAGATGAGACAACTAAATAAATCGGACATCAAATTAAGTTCTAGTTTTTTTCCCTCTTCAAGTCAATGAGACAGTAAAATGAATCAAACTAAGC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CGTACACAAATACGTGTACACAGGGAACAAAAAGGAAGTGCCATCGAAATTTTGTGAGCCATTCAACCTGAAATGATTTATAAAATGTGATTACTTTATTATGTTTGTAACTTGTCCAATACAGGGACAAATCCAACAAATATTGTATCAGATGAATATAGATGTATGTTCTATGAAAAAACGAATATCCTAAACTTGAGAAAGGATTTAGTGACAGTCAGTTTGTAGGTAGAAATCTGAACCATAATTCGTTACAAGCCTCATCAATTTGATCCATACTTAGGTATCTTAGCATAATATTCGCAAATGAGATAATGATCATATATCAGTGTGTTAATAATACTTCAAATAGCTCCCAGATCTCATACCAGAATAGTGAAATGAATCATGAACTAAATGATTGATTTTACGCATAAGACAAAAAGAAACACAGGAACTGTTATATATACATATATACATATGAATGAATGAAAGAAACTTCATTTCGGAAAAGAAGAAAAGATATGGATGTATTTCAAAAGTATGGATGTAGATAAATTTTCCAAAGAAGAAAAGATAGCTAAAAACAGAAAAGGAACTTCTATGCAACTTAAAAGTTGTTTAATACTTTCACAGGTTGCAATGTATAAGAGGTTGAACGATGAAGAACGAAAAACCCGCTCTTCTACTAGTATCTGCACCGAGGCTTCTTTAGGTATGTTTCAAACTGTTATTCCAGTTCTTGTCTTGCTATATTCAAATTTTTAATGATACTTATGGGAAAAAAATTGTTTTGTACCTTTCTTAAAGATTTTGCAGTTGTGCATACCAGAATTTTCTATAGAATGTTAATTTAAAATTTTCATATAATACCCATCAATAGTTATCATTCTCTTACATTTTCGTATTAAATTAAACAATAAGCATGCTTTTGCAGAAGAGAACAATAAGGAGCTCATGGTTACTATTGAAGGTTCTCAGGTGAGCCTTATTTGCCATCATAAGTCATAATATATTTTTAGTTTTCACCAGAGTATAAATAAATTAGAAAGATTTAATAATCAGTACATGGACCAATAATATATCTATCTTTCAGGACACCTCAATGAAATTGTATGAGCAACTCTCCGAGCGTACTAAAAATCTTGAACAAGAGTTGTCTACTTCCAGGCACTATCTGCTAGATTTTCACCATTTTATTGACTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_009407095.1	6.2e-35	PREDICTED: transcription factor bHLH35-like
Swissprot	Q2HIV9.1	4.9e-29	bHLH transcription factor bHLH035
trEMBL	A0A804JMY2	4.5e-35	(wild Malaysian banana) hypothetical protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G57150.2	47.09	2e-37	152		basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G00904	AT5G57150.2	189	72	5	7	176	39	218	47.09	2e-37	152
AfisC4G00904	AT5G57150.3	188	71	5	7	175	39	217	47.34	5e-37	151
AfisC4G00904	AT5G57150.4	186	70	5	7	173	39	215	47.31	4e-36	148

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00010.23	HLH	Domain	30	75	37.2	1.9e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0006952	P	defense response
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009718	P	anthocyanin-containing compound biosynthetic process
GO:0010629	P	negative regulation of gene expression
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0034756	P	regulation of iron ion transport
GO:0042538	P	hyperosmotic salinity response
GO:0043425	F	bHLH transcription factor binding
GO:0048657	P	anther wall tapetum cell differentiation
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus
GO:0071732	P	cellular response to nitric oxide

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network