result

Gene information

Detail information of AfisC4G00918

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G00918	chr4	165371466	165388861	-

Sequences

CDS

>AfisC4G00918
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Protein

Gene

>AfisC4G00918
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Functional annotation

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nr	XP_020269134.1	0.0e+00	probable histidine kinase 6
Swissprot	A1A698.1	0.0e+00	OsCRL1b
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Best hit in Arabidopsis

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AT2G01830.1	62.34	0.0	1170	AHK4;ATCRE1;CRE1;WOL;WOL1	CHASE domain containing histidine kinase protein

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g246663.t1
Allium fistulosum	AfisC4G00918
Allium sativum	Asa4G00973.1
Arabidopsis thaliana	AT2G01830.1; AT2G01830.2; AT2G01830.3
Oryza sativa	LOC_Os02g50480.1; LOC_Os03g50860.1; LOC_Os10g21810.1

Pfam domain

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PF03924.10	CHASE	Domain	87	266	123.1	1.1e-35
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PF00072.21	Response_reg	Domain	823	946	83.3	1.1e-23

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000155	F	phosphorelay sensor kinase activity
GO:0000160	P	phosphorelay signal transduction system
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GO:0010087	P	phloem or xylem histogenesis
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GO:0010271	P	regulation of chlorophyll catabolic process
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GO:0018106	P	peptidyl-histidine phosphorylation
GO:0019955	F	cytokine binding
GO:0023014	P	signal transduction by protein phosphorylation
GO:0033500	P	carbohydrate homeostasis
GO:0034757	P	negative regulation of iron ion transport
GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0043424	F	protein histidine kinase binding
GO:0044182	P	filamentous growth of a population of unicellular organisms
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048509	P	regulation of meristem development
GO:0048583	P	regulation of response to stimulus
GO:0070417	P	cellular response to cold
GO:0071215	P	cellular response to abscisic acid stimulus
GO:0071329	P	cellular response to sucrose stimulus
GO:0080117	P	secondary growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14489	AHK2_3_4; arabidopsis histidine kinase 2/3/4 (cytokinin receptor)	EC:2.7.13.3	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network