result

Gene information

Detail information of AfisC4G01023

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G01023	chr4	183487617	183501998	-

Sequences

CDS

>AfisC4G01023
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Protein

Gene

>AfisC4G01023
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020244255.1	7.7e-121	receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK1 isoform X2
Swissprot	Q8H1D6.1	2.8e-99	Protein ROP BINDING PROTEIN KINASES 1
trEMBL	A0A5P1EM26	1.8e-119	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G65530.1	53.74	3e-108	389		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G01023	AT5G65530.1	374	161	6	74	444	92	456	53.74	3e-108	389
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g525548.t1
Allium fistulosum	AfisC4G01023
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	128	338	138.0	3.2e-40

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
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GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0005516	F	calmodulin binding
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network