result

Gene information

Detail information of AfisC4G01193

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G01193	chr4	214523577	214537489	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G01193
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AAT08717.1	1.1e-24	bZIP family transcription factor, partial
Swissprot	Q8W191.1	1.5e-23	bZIP transcription factor 64
trEMBL	Q677A7	7.9e-25	BZIP family transcription factor (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G17609.1	70.93	7e-28	119	HYH	HY5-homolog

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g257197.t1
Allium fistulosum	AfisC4G01193
Allium sativum	Asa4G01089.1
Arabidopsis thaliana	AT3G17609.3; AT3G17609.4
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	78	137	42.3	5.5e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000977	F	RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0042753	P	positive regulation of circadian rhythm
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K16241	HY5; transcription factor HY5	EC:-	Circadian rhythm - plant	ko04712

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network