result

Gene information

Detail information of AfisC4G02630

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G02630	chr4	504606578	504613600	+

Sequences

CDS

>AfisC4G02630
ATGGGTCAGTGTTGCAGCAAAAAAGACACAACATCCGAGCAAAATGGCTACACCTACCAAAGGCCATCACCACCACCTGAACCCACCAAACCAGCACCACCGCCACAGCCCAAACCTGAAACCCGTTACCCCCCACCTCCAAAACCCACTCCAATTCCCGTTTCAAAACCTCAACCGGACACCATCCTAGGCAAACCCTACTCCGATGTGCGCTCCCTCTACACTCTAGGCAAGGAACTCGGTAGAGGCCAATTCGGAGTCACGTACTTATGCACCGAGAACGCCACAGGCCACACGTACGCTTGCAAGTCCATATCCAAAAGGAAGCTCCAAAACAAGAACGATAGGGAAGACGTCAAAAGAGAGATTCTTATCATGCAACACTTAACGGGTCAAGCGAACATAGTGGAGTTCAAAGGAGCTTACGAGGATAAAAATTCTGTGAATCTTGTCATGGAGTTATGTGCGGGTGGGGAGTTGTTTGATAGGATCATTGCTAAGGGGCAGTACACGGAGAGGGCAGCGTCTGGCATTTGTAGGGCTATTGTTAATGTGGTGAATATATGTCATTTTATGGGGGTCATGCATCGGGATTTGAAGCCCGAGAATTTCTTGCTTGCTACTAAGGCTGAGAACGCGATGCTCAAGGCCACCGATTTTGGGTTGTCGGTCTTCATTGAGGATGGAAAAGTATATAGAGATATAGTAGGCAGTGCATATTATGTTGCTCCTGAGGTACTAAGGCGTAGCTATGGAAAAGAAATTGATATCTGGAGTGCCGGCATCATCCTTTACATTCTTCTTTGTGGTGTTCCTCCTTTTTGGGCAGAAAATGAAAAAGGAATATTTGATGCTATATTGGAAGGAGAAATCGACTTTGAAAGTTCACCTTGGCCATCAATATCTGACAGTGCTAAGGATTTAATCAGAAAGATGCTGAATCCGGATCCTAAGAAGAGAATCACTGCAGCTCAAGTTCTCGAGCATCCTTGGATTAAAGATGGTGGTGCATCTGACAAGCCTATAGATAGTGCAGTTCTTTCAAGAATGAAGCAATTTAGAGCGATGAATAAGCTCAAGAAAATGGCTTTAAAGGTTATTGCAGAAAATCTGTCCGAAGAAGAAATAAAAGGGCTTAAACAAATGTTTACCAATATGGACACAGACAATAGTGGCACTATCACATACGAAGAGCTTAAAACTGGTTTAGCTCGACTTGGTTCTAAGCTTTCTGAGACTGAAGTGAAGCAACTTATGGATGCTGCTGATGTTGATGGCAACGGGTCCATAGATTACCTTGAGTTCATTACGGCCACAATGCATAGGCACAGATTGGAAAGGGAAGAACATCTGTACAAGGCATTTCAGTACTTCGATAAAGATAATAGCGGCTTTATAACTAGAGATGAGTTGGAGTTAGCGATGAAGGAGCATGGCTTAGGCGACGATGTCACGATCAAAGATATTATATCAGAAGTTGATGCAGATAATGATGGAAGAATTAACTATGATGAATTCTGCACTATGATGAGAAGTGGAGCTCAACAGCCTATGAAACTTAAGTAG

Protein

Gene

>AfisC4G02630
CATTAATCCCACAATAAAAATATTCAACAGGCGAAGTTGGACTTGGAACCTTCCTACTCGTTTCAAGGTTACTCGTTTATCACCAACCTGCAACGTACTCTTTCGAGAATTATTTATACTCTAATCAAAGTATCCGAAGTTTCAATTTTCTGTTTGGGTATAATTTGAACCCTAAAAAGTCGACCCAAAATCCAATCTTTGTTTCCCCGCCTACATTGAACAGTGCTAAGATTTAATAATCGAGCTCATAGTCAAACCCTGTATTGGCTTGCAGGTATTTCTGGTAATTTTTTGTCAGTTTTATATTGGGATTTCAGCTTAGGATTAAGGTACTAATGATTTAGGTTCTGTGCGAAGTCTAATCTTTTAAATTGAAAGTGTCGAGTGTTATAATTTATGATTCTGTATTCTTTTTTGTATTTTAGTTTTGATAATTTTGCTCCGCAGATCTGATTTGTTTCACATCAAATTATAAGTTCATTCATCTCATGTAGGAAATTTAGGCTTGTGAAGGCTCTTTTTTACAACCGATAAATAGTTTGTGTATGAATAAATTGCTACATAATTTATTTTGTATAGCAGGTCAGGCTGAAGATAGCATTATTACGTCTTTCATATTTCTTTCATTTTAGTGTATCATCAACTAAGTTAACACGTTCATGTATTGGCTTGGGATAGTGTTTTTATAAAAGAGAACTTTATCTTGTCAATAATACGTAGCTTTTTCCATGTTATTGCACAAAAAAGATAAAAGTGCTTATGGAATGAAAACAGTATTTACTCACCTGGCTATTTTGGTGTTTCCGTGCAATAACCATAACACGGAAAAATTCCTGTGTTATTGGCACAGAAATGATCTTTTTAATAAATTCAATTCATTTAAAAATAAACTTGCAGAGTAATCTAGGCTGTTAGCATTATATCTCCTCATTATATTTCTAATTTTGCTTGGTGTGTCTATCTACTACGGACTTCTAGCTTTCAATTGATATAGGCACACTCAATTGATGCTCCAAACTCCCCAAAAATCAAATAAAAAATGGGTCAGTGTTGCAGCAAAAAAGACACAACATCCGAGCAAAATGGCTACACCTACCAAAGGCCATCACCACCACCTGAACCCACCAAACCAGCACCACCGCCACAGCCCAAACCTGAAACCCGTTACCCCCCACCTCCAAAACCCACTCCAATTCCCGTTTCAAAACCTCAACCGGACACCATCCTAGGCAAACCCTACTCCGATGTGCGCTCCCTCTACACTCTAGGCAAGGAACTCGGTAGAGGCCAATTCGGAGTCACGTACTTATGCACCGAGAACGCCACAGGCCACACGTACGCTTGCAAGTCCATATCCAAAAGGAAGCTCCAAAACAAGAACGATAGGGAAGACGTCAAAAGAGAGATTCTTATCATGCAACACTTAACGGGTCAAGCGAACATAGTGGAGTTCAAAGGAGCTTACGAGGATAAAAATTCTGTGAATCTTGTCATGGAGTTATGTGCGGGTGGGGAGTTGTTTGATAGGATCATTGCTAAGGGGCAGTACACGGAGAGGGCAGCGTCTGGCATTTGTAGGGCTATTGTTAATGTGGTGAATATATGTCATTTTATGGGGGTCATGCATCGGGATTTGAAGCCCGAGAATTTCTTGCTTGCTACTAAGGCTGAGAACGCGATGCTCAAGGCCACCGATTTTGGGTTGTCGGTCTTCATTGAGGATGGTAATTGCTATATTATATTTTTGTTAGTGTGGTTTAACTTTTGGTGTTGCTATTAATGGAATTTGGTCCTCTACATTGGTAGAGAGATCCAAAGTAGGGATACTTCTAGAGTACATGGATTCCACACTTGGTTCACATGATGCATCTCAGCAAAATATGTGTACTCTAATTTTAAAATTAAGTGTGGAACCATGTATTCGAAGAGTATTCGTACTCTGGTTCTCTAATAAAGTAGAGGATCTCATTGCACTATTGATGGTATAAGTTTGGCTAAAGGATACAAGTAGCTATAGTAAACCCATACTTCCTTTGTATTTTGTATTGTACAAGGAAATTATTATTATGTTTTAGAAAAAAATGATTGTGTCCTTAACAAACAGGGAAAAGAAGAAAAAAAAATCGCTATGACTTAAACTGATATTGCCAATAGCAATCCCTGGCCTTTTACATATATGAAAAGACTTATGAAAAACTGATACTACCACCAACAACCCTTAGCTTTCTACATATATGGAAAAAGAAAAAAAGATTTTGCTTGTAGACAAACTGATGCTGGCTGTAGCATCCTCTAAGTTTTTACTTATATGAAAAAACATGGTTCTATGGATTTTGTGATTAAGCTTCACATATGTTTTTAAAATAAACTGATTTTCCATTTTAATTTTGAAGTATCCCCTGCAAGATTTAATTTTAAAATTTGAGTCTGTAGGATTAAATTATTAATACTCATTGACGAGAAAATTGTCGTCCACTGTTTATATGTTCCCTATATTTGAGATATTTATAGTTGAAGCATATTACCTATTGCTGAGAATAATCCTACATCCTCTACTTAGTATGGTTGGTTGTATGGTTGGTCCTATGAATATCAAGGGATCTCTCTTCACATAACCAATTAATTTTGTGATAACAAGTGGTTCACTGATATGAGTGCTTTGCTTGAATAAAGTAGTATCACTCTTGTTATCAAAGCAAGTGGTCCACTGATACCTAAATTCAGGAAAACAAGGTGAATTGCCATTTTATTTTTAAGGTATATCTTGCAAGATTTGAACTCAAATTTTGGGCTATAGTATTAATGCTCATCAGTGAGAAAATTATAGACCACTATCTATAAGTTCTCCACGCTTGAGATATATGTAGCTGTAAATTGCAGAAACTTCAGAGGTTTAGTAAATATTCGTGGTAAAAGAACAATAATTGGTTTATGGTTGTACACGTGATACATAATTTTTGTATGGTTATCGCATTTATGAACACCGTTAGGCACTTTTTAATCCTCTCTAGCCCTAAGTCATAATGAAGTGTGACTGTAAACACATTTGAGGTTTCAAACATTAAAAAGGATATGTCAAAACATGGTAGTTTAAATGTAAGTGTAATTAACATAATTGGAATGTTGAATTTCATTTCAGGAAAAGTATATAGAGATATAGTAGGCAGTGCATATTATGTTGCTCCTGAGGTACTAAGGCGTAGCTATGGAAAAGAAATTGATATCTGGAGTGCCGGCATCATCCTTTACATTCTTCTTTGTGGTGTTCCTCCTTTTTGGGCAGGTACAACTTAACTGCAATTAAAGTACCTTTCATTATTATTGAAGTTCTCATGATTATCACATCATATGAACACTTAATGGATATAAACCCTTTTTAGAAAGAAAAAAACATGCTTAATATTTAAAATTGATCAGCATTTAACAATTAAACTTCTTGTCCTAAGCAAATCCCGCCTAAATAATTGTTTTTGGGGGTTTCACAGAAAATGAAAAAGGAATATTTGATGCTATATTGGAAGGAGAAATCGACTTTGAAAGTTCACCTTGGCCATCAATATCTGACAGTGCTAAGGATTTAATCAGAAAGATGCTGAATCCGGATCCTAAGAAGAGAATCACTGCAGCTCAAGTTCTCGGTATATATAGATATATAAGTTTCTTTTGTAAAATATATGTTAAAAAAAGTAACTAAATACTTGTTTTGCACTTTAAAAGTACGCTTACTGCCGAATAAAACCGTTCGGCTTATTTCAGTAAGTGTTCTGTATGCTTATTTCAGTAAATATATGTTAAAAAAGTAACTAAATACTTGTTTTGCACTTTATAATCTTGAACACTGAACAAGTTGTTCTTCTTTGGTTTAATGAAGTCCTTAATGTCTATTGTATAATGAAAACTTTAAAAATATAAATTTTGACGTCAACACATTTGAAACGTACCAACATTTCACTACCAATCTTCTTATTCAAACCAAACTCAACCTAATTGTGCCATTTGATGGTTAATTGTATTCAGAGCATCCTTGGATTAAAGATGGTGGTGCATCTGACAAGCCTATAGATAGTGCAGTTCTTTCAAGAATGAAGCAATTTAGAGCGATGAATAAGCTCAAGAAAATGGCTTTAAAGGTACACTAATAAATATTTGTGTGCTTCTATATTTTTCTTTTCGAACTTGGCCATTATATGTGCATAGAGAAATGAAACTAATGACCTTTGGTTTCGTAACTGGATGTCCTATTATCCTTGTCATTGGCTCTTCATGTGTGCATTTTGTATAAAGGCATCAACATATAAACATATTATTGGATATATTTCTAGGTTATTGCAGAAAATCTGTCCGAAGAAGAAATAAAAGGGCTTAAACAAATGTTTACCAATATGGACACAGACAATAGTGGCACTATCACATACGAAGAGCTTAAAACTGGTTTAGCTCGACTTGGTTCTAAGCTTTCTGAGACTGAAGTGAAGCAACTTATGGATGCTGTAAGATCATCAAAGTTTTTCTCTTTCGAATTTTAATTTTCGTTTTGTTTGCATATTGCTGACTGAGCCTGTTTGGGACAATTTTTTCGTGTAACTACATGAAAAAAGTTTGCATAATGCTGACTGAGCCAGTTTGGGACATTTTTTTCGTTTTGAGTTGTGCCATCTAAGTATTTCAAGTGAAAAGTTAAATTTTAATGAAATTTAGTTATCAAAGTGAAATAAGTCATTAACAAGAATTTAGTTGCTCATGACTTATTAAATTTGTAGTTACTTTTGAGTTAAAATATTAATTTGTTGGTACACACTTCAGGTTAGAAAAACAACATGCTATTTTTCTTACCTATAAGGTATATTGAACAATGGTCCAAGTAGTCGCAAACAGTTTGGGTATTCTTATTAAAAAATTTGAGATATCTTTGTGCTTGGATCGACTAAAATAAGCTACTTTTATGCCTTTTGAAAGCCAAGATCAATTCATTTTGGCTTTCAAAAAGCAAAAAAGTAGCTTATTTGAGTCGATCCAAACGGACCTAGTGAACGATTTCGTTAATGTTGAAAAGTGATATATGCTTTTGTTTGCGATTTAGGCTGATGTTGATGGCAACGGGTCCATAGATTACCTTGAGTTCATTACGGCCACAATGCATAGGCACAGATTGGAAAGGGAAGAACATCTGTACAAGGCATTTCAGTACTTCGATAAAGATAATAGCGGGTATGCTTTCATATAATAAAAAGTAATACACAGTTCAGTGCAAAAACTGATAATTTGTATTCAAATTTTACTACAGCTTTATAACTAGAGATGAGTTGGAGTTAGCGATGAAGGAGCATGGCTTAGGCGACGATGTCACGATCAAAGATATTATATCAGAAGTTGATGCAGATAATGTAAGTCATTTCAAAATGAGAAAAAAGAATTAGCCGTGTGCATATTTTTGTTATACGTCTAGTATACCAAAACAGAGACTAATCAATAATAAACTCGTCTCACAAGTTTACAAATCAGATTTCCACTACGTTGGAATGTTGTATTAACTATTTTATCAATAAGTATGTTGTAATTAATTACAACAACAAACTAACAACCATAATAATAATAACTATAGCGATAAATCAAACGTTATACTATTTAAAGAAATAGTACAATGTAGAAACGAAAATGATATATATATATATAGCCGGTTGAAGAAGGAAATTCCTTCTGAGGCTTGTCGTAACAATTTCCTTAAGACTTTATTCAAAGTCTCCCAAGATACAACAGATGTAAGCTGCTCGAGATCGTGATGTGTATGATCTTCTGTGTGATAGGACTGATTATGATTTTAAGAAATGAAGATAAAGAAGAGATAACTCGGTTTTAAAATTAAGTAAAGAAAGTGATCAGGTTTTCTTCTTATTTATAGCCGAATTCTCAATGGCTACACCCGTTGAGAAAAGTAGCATTCCTTCATTTGCAACGCCAAAAAGTGTTACTGTTCGCAACATGCACTTCCTTTCATCTGCAACGCCAAAAACTGTTGTGGTTCGCAACAGCCGCGTCCGTTCGTTTGCAACGGTTCAGAACTGTTGCTGTTTGCAACAACCGCGTCCGTTCGTTTGCAACGGTTCAGAACTGTTGCTGTTCGTTGTAACGGTCTTCTGAAAAAATCGCGTTTCTTCATCAGTTTGCAACGGTCACAACCGTTGGAAAATCCGTTTCTATTTAAACACACTTCTGTTTTAAAATCAGTCCATTTTTTAGGTAGCAAAAATATATGAACACAGCCCAATCTTATTGGACCCGACCCAGGTCGGGTGGTCAGGCGGCGGCGCGCGTGTTAGTCCATGGCCATATAGGTCCTCCCCCTCGTACAAAATTACCTGACCCTAAGGGCCAATATAGGGATTGAGAGTACACCATAAACAAGAAAATTGACTTATTTTTGGCGATGTGGGATATATCTCATTCACTATTTTTGAGAATTCTAACAATTTTTTCAGCGAGTGGTTGAAAAATCAGTGTTATAACACTGAGATGAGATATTTTAAGTGAATTTTTGACTCAGTATTAACATTGGTGTATATATTTGTAATGCAGGATGGAAGAATTAACTATGATGAATTCTGCACTATGATGAGAAGTGGAGCTCAACAGCCTATGAAACTTAAGTAGAACTCAGAGGAGATTTATGTTCTTGTTTCACATGAGTTTTTTTTACTATGGAACAGCAATTCGGAAATGAGGATAGTCAAGCTGAGTTTGTGTTGCTTTGCGAATGCACTGTAGTTTCATTCTTTGATCTTTGCATCTTGCTCCACGTTTATATTATGTTGTATGTTTTGCTTGGAGAAAAATAATGAAGGATGTTTAGGTTGTGGAGATGTTATAAGTGGTGCAAAGTTTATGTATTGCTTTGAGAAACGTGATACGAGTTTGCAGTATTATTACTTGATGATGTATGCCGAGAAATTTGTATGGATGGTTGAGAATTATAAACCGGTTGATGTATTTGTTAGAAAATATTTGAATTCAGTACGTTTCATTTCC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256858.1	2.3e-233	calcium-dependent protein kinase 2-like
Swissprot	P53683.2	7.5e-221	Calcium-dependent protein kinase isoform 2
trEMBL	A0A5P1FEF8	1.7e-233	Calcium-dependent protein kinase 29

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G04720.1	74.66	0.0	812	AtCPK21;CPK21	calcium-dependent protein kinase 21

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC4G02630	AT4G04720.1	521	125	2	4	517	3	523	74.66	812
AfisC4G02630	AT1G50700.1	527	124	6	1	517	1	518	72.87	788
AfisC4G02630	AT3G20410.1	540	133	5	1	517	1	538	70.74	783

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	74	332	249.8	2.6e-74
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	379	439	47.3	1.9e-12
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	448	511	49.3	4.5e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005773	C	vacuole
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network