result

Gene information

Detail information of AfisC4G02818

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G02818	chr4	539723553	539731246	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G02818
ATGTTAATGGACTGGAACAAATGCAAGAAGCTCCATTGGAACATAATCCTCTTATTAGGAGCAGGTTTTGCTATTGCAGATGGTGTTAAAACTAGTGGTTTGGCAGATATTCTTTCTCAAAGCCTCTCCTTCTTGGAAACTGCTCCATATCTTGCCATTGCTCCTCTCGTTTGTCTTATCAGCAGTACAATCACCGAATTCACTTCTAATAATACAACTACCACGCTTGTGGTTCCCCTCCTTATTGAGTTGGCCAAGACCATGAAGGTAATTTTCTCATTATATACAAATTTTAGTGCTTTATGACAAATACACAGGATTCTGCATAAACTTTATAGTGAATAATAATCATCCTGTATTAACTGAAATGTGTAATAAATGCATAGTCAACTGGAGACATTGAAAACACTAACTCAGTCTCATTTGTGTCATATACATACATGAATATTGAATAACATTGTGATGATTCAGATCCTATCTTAGAAATATGATATATATGTGTCCATTTAGGAAAATATTTGAAAGATGATTTTGAATATGACAGATGTTGGAGATACATGCTTCCACGTTATTTAGATAAATATAGATGTGATTTTTTTTATGATGAATCATGTTTTGATGCTTTAAGTGGAGCATGTGTTGTTCTGATCCTACCCTCTACAATCATTATGCATATGTTCATAACCAAGCCATTTTGAAAAATAATTGAAAGATCTCCATTTCAAGTGGAACAGCAAAAAATTATTTCATGTACATGGCATAATTTGTACAAAATGACAGTAGTACATCCACATTTTGGTATTTCTCAAAAATTGTAAGGTAAAAAATTTCCTGAAAAATAACATACAAAATATACTAATATGAACAGGTGCATCCTCTTCTTCTAATGATCCCTGGAGCAAAAAAATTCACTTGGCATTGCTGATGGAATGCTACACATTTTTCAATGAAAAATATACTAAGAGTGTAGCAAATGATTTGAACAGTTAATGATAAGCAGCAGTGCCTTAATCAAATCCAATATGGATCCCTTACTATATTTTATTATGATATGCACATATTTTTACATATCTCTAAATCAGGCTTATCAAATACTAGGTAAAACAGGCTTTTTATTCAGGTCTTGCATAGCCAAGAATCAAAAGCCGACAGACAAATTAGGAATGGCATAGATGCATCATTGAGGAGATTAACAGGTTTGGCAGTAGGTGCAAGTCGTGATTTTACTCATGTGTACCAGTTTTATCAAAAGTTGCAGATAGAGATGCGGATGGTAAACCATGTTAACTTGCTTATAAAAGACGAAAAGGTGATATGCATATGCCCCACTAACTCAAACTTAGTCAATGTTTGCTTTTCAAATCTACACATCCACTGTTAATTCTGCTAATAATTGATTTTGTAGATGCTTGCCTTCATCTGTAAAGAGAAATTCAATCTATATATGAGAGCTTCTAAACAGGGAACAACGAGTATGATCAGTTTTGCTGAGAACAAAGAAGAGGTATCATCGCTGTTAGCATTGATATTGAGTTTATTTCTATTTTGTGTTTTGGCTGCAGTTTATGCTAGGTTATAATTTTGGCTTTATCAGAAATATTGGTGTTTAAAATTTGATATCGAGTACATTGACTGAGTTGTCGATGCTGATGCGATTAGCTTGTAAGGATATAGTTTGATGCGAGTTAATTTGATTTTTTTTTTCTCAAACTATGGGTTACGGTTCGAAGTGGTTCAATTTCGAAGTTAGAAAATATATTTCATTAATATTGGCCAAGAGTTTGGTTTTTTTCCACATATTTTTTAGAATGTATGTTGGATCAACATTTACTGTTAATTATGATTTAAATAAACTTTCATTCAATTATCAATATCCAAAATAGTAAACGTCAGCAAGACTGCAAAATAAATTTGTTGTAAGATAATTTTCCTGCTGGTTAGCGAAGTACAACAAAATGTGATTATTTCCACTGATATATCACATATGGCGCAGCTGAAACAATAAACATATAGTAGGAAAAGACTATGAACCATGGCCATCTGAGATTGAATAGTTTAGATTAACTCAAATTACTGAGCTCAACAGATGTGCCTAAATTTTTAAGCCATATCATCCAGCATTTCCATATTCCAACTATATCAATTTCTAGTATCGAATTTGCAGTGAATGGTAAAAGTATATATATAGGTTAGAAGAGAAAAGATCAGCGAAAGGATGAAGTACCTGCAGGATTTGGTGCCAGGGTGCAGTAACATAACGGGTAAAGCCAGCATCCTAGATGAAATAATCAACTATGTGCAATCTCTGCAGAAACAAATAGAGGTAAATTCAATATATGATATAACAAAATTTTATTCTTCTTTTCTTTCTTTTTTTAATTTATTGTAAGATGTTGCGCATGCAGTTTCTGTCGATGAAACTTGCCGCAGCATATCCAGTGGCCGACTGCAGCAGCATGCAGAACTACATTGTAAAGGAGGTGTGCTTTCATTGCTCTTCATTGTTTTCTTTTTTTCCTTGCATGACTTAATCTGAACCGTATATTGGAACAGGTACAGGTGAATTCATCTTGTTGCACAGCAGAAAGGTCGCTGGCACTGCAGAATCCAGCGTTTCAGTTGTTGGATCATCTCCAACCGGACATTGGTGCTTCTCAGAATGAACTTGCTTTTATGGTACGTAATTCAGTAGTCTAAAGATACAGTTATGGCTGTTGTGTATTGCTGCTAACCAACCAAATATTATGTTGTGTTTCTAGGAATGCGGTTCATCTGCTTGGGACTACAATCATATGCCAGATGTTCATAAACTAGACTGTATTGTATTAACCAACTTAATTATGTATTGTACTTGTTATGAAGTAGTTGACATTGTTATGAAGTAGTTGACTATGAAATTTATGTTGTTATTTGATCATGAATATTGTAAATTTTGAGTTCCTATTGAATGTAGTATAATAATGCATATTATGTCAGTTATTAATTGTTTATTAATTTTAAATTAATTGACTATATTGAGAATGAAAATATTTCAGCGTTATAAGCGTTGGCAATTAAAATTTACCAACGCTTATAAGCGTCAGCATAGAAAATTAAACAATGTTGGATGGTTAATTTGCCAACGTTTATAAGTGTTGCTAAATAATATACACCAACGTTTATAAGCGTTGGCGAATACAACCTTCCAACGCTTATAAGCGTTGGGAAATTAAACTCGCCAACGCTTATAAGCGTTGGCAATAAATTGCGACGCCCCTACAGCGACGCTAATAAGCGTTGCTGAAACTGTTTGCGACAGTTATACTCGTTGGGAATCACCTGTTTTGGTGTAGTGATATTTGTGCATCTCTTGCTTACATATTCTCAATCTATGATAACCAAAATATTATTTTTGTTAAACCACTTCCTACAAGTCAAAGTATTCACATTTATATACTTAAAGGAGATCATAGGAAGAATTGTAATATTAGTCAAAATTCATGTTATTTAGAACACTTGTTTGTCAGAGAAATACTATTGTATTAGCATATTCCTCTGGGCGAAGTGAGGGTTATTTGGTTAAAGGAAATACCGAAAGGAAGCTTCGGGACTGGACGTAGGACAGGAGGTCCGAACCAGTATAAAATATCTAGTGTGCTCACTTTTATTATTTACCTTTTTTATATTCAGCTATTATTCTCTGCTTAGTGTAATTAGTAATATAAACTCTCACACTTATATATAAGTTGTATTATCAAAGGTCCTACAGATTTTCAACATCTTGCTCATGAGCCTTTGATTGGTTTCCCGAATTTTGAAAGCTGAAGGCATCAACCCATTAGTAATATAATTCCGTGTTGGTAATGAATGAAGTATATTCCTGATCAGGTTCATGCATGGAAATTTGATTGCACTAGGAGTAGGCATCCATGAATGTCAAAAACATATGTCTACTAGTTACATCCATGAGCTGGTTAATGCTCAGTAGATGGAAGCTACCTTTCGGGCAAGCTTTATTAAGGTCAGGGAAGTCAATGCATGTTTTTCAGGTTCTGTTGGGCTTTCGCACTAGCACTGGCTTGGCCACCCATATCAAACTCTAATGAACCATTTGTTAAGAAGCTTTTCTATCTCCTCTTTCATGTTTTATATCTTTCTGGGTTGAGCAAACTTCTCTTTTAGAGAACATGGTGAGAATTGGGGTCGATGTTAATAACATGACAAGTGATGGAGGGATCTATGATGTTCATATCATCATGCCCCCAAGCGAACACATCTGTGCTCTTCCTAAGGAACTCTATCGAGTCTATTCTCCCTCTTGGCCAAATCGGGGTGGCTGTGGTCGCCACTATTTAGGAAGATTGTTTCAAGCTTTGTGGTTAGAGCTCCATCTATGTTGGCGTCACCCATGAGGCAGACACTGGTATTACTTCATGCGCTAATTTTTAATTTTCACTATTCCAGTGCATAGACCATGCATTCGATGAAGTCCTCGATGGGTGCGGACATCCGTGCATGAGTGTGGGGTACTGGCCTCCTACGACCTTTATAGGTGAGTCCTTTGGTGTTGAGAGGGAAGGTTTTTCGTATTATGTACTCCCTACTCCCACTTGCCAGTAAGGGTGGACATATTCATTCCAAGTGGAAATGAGTTATTTGGTTTTGATCAGACTAGCCAATGAGTTCTAATTTCAATGCTATCTACCTCGGCATAAATGGAACCAGTGTGTGGTTTCACGTTGTCCCGAGGATGGGCTCGCTGTGATGAAGTGTTACATTTGATGTAGCTTTCGTGAAGGTTCTTGAATGGATGGGTGAAATGATGGGCTCTCACATTCTCTTAGAATTTTTGAGTTGGGATGATATGACATGAGCGGGAACCACAAGAGATTCATGTACTGTATCATTTGCTTCGATTTGAACAATGACTCAGGAACGAGTACGAGCTTCGTGAAGCTCTCACACTCTCCCAGTGGGAGTTGATGCTTTGGCTAATTACTAGCACAGGTAGGAGCAATTGAATGCTATCTTACCCTCTTAGGTTGGTCATTGTTGAGGGTTGCCACCTCTTGCTGGAGCATGAGTGCTCCTTTCATGGCTTATTATAAGGAGATGCCTTATCAATCCCTAGTGGCTTGTTAATTGTTGTGGACATAACCAACTCCCCTTTAATGGGGAACTTCATGGTGAGTCATTGATATGCCACATTTGCATCCATATCGGCCAATGCTGGCCTACATATACCAATGTTGTACGGGGAGTCTACTAAAACAAATTTTACTTTTATTTTGGTGAAGTGGGGTTCCTTGCGAAGGTCACTACATGCAAAGTAGAACCCAAAGGAAAAAATCTCAATGTCGCGATGCCATAAATAGGGTAGGTGCATGAAGTGAGACTATAACATGACGTTGATGGAGCTACCCCCATCAATAAAGACTCAGTGTACTCGGGTGTTGGTGACATTGACGGAGATGACCATAGGGTCATAATGAGGGTATTCAACGCCCCTCTTGTCTTCAGTTGTGAAGGTGATATAAGCTCCATCTTCCTCCACTCTCATTGCTTTCAGGGCTTAAGGTTCTACTAGATAAATTTGGTTTGTGGGGTATGTTCCCCACTGTACTAGGATTTTCCTCTCTGCTACTTCCATCCATGTCCAGATCACCACAAATTGACAAGATTTCTATGTTGACGGAGGCCACATTTTTCTCATCTTCCCGTTGAGGTGGGGGCGAGTTGATTTTGATGTTTGACCCTATGCTCTACCTATCGTCTTGTATAAGTATACCTTCACGGATCAACTTCTCTATCTTGTTCTTTATGTGATGACACTCATTGGAAATGACATCATTAAATTGATGGAACCCATACTGTCGACTATTACCGTTGGGCTCCTTCTTTCTCCCTAGGTAGGCGGTGTAACATCCCCAATTTGGAGGCCCAAAACTAACTGCTACAGATAATCTAGTCATCCATAGTTATTAATTTTCGGTAACCTAATGCAGTAAAGTTAGATACATTGATATACCAGAAACACATGAATATGAAAAAATTTAAACTCAATTTAAAACAAGTTTCTCATTTCACTACAAATAGCATTTTAGATTCATTACATAATCTCATACGTAAGCCACGTTCAGAAAAATTACAGTTTATTACAAAATATGCCAGCAGAGACATATGAAGATGTCCATTGGTTGATCAGAGTCTAAATATTGGCAATTAAACAAATTTACCCTTACATCCAAGTAATACAGCGGACAATAGATAGAATCTCTTAAATAGCTAGCTTGCCTCCTATATGTCTCTGGAAGCTTATTCATCGACTAATAACCTGAAAACCCTTACCTTCATCCTACTCAAATTAATTTTGAGCACCCAAGAGTTTAATGGGAAAAACATAAACTTCGAATCAGACAAAAAGTCTGGTGTGAATAATAATATACCATCTTGAACCAAATAGATATCTAGCGAGACCATGTTGTTGAGCGGAACGGGATTTCCCTCGCTAGTACCTTAACCAAAAACTAATTAACCATATATTGTGCACCTGCATCTAAAATGGTTAAAACATAACAAAATATGATGATATGCAATTATATAATATATCCTGGGTTTCCCATCCCCATTCATCTGACTATCTGTCTCAAGTTATAGTTTCTAGGGTCACTATCAACCTATTAGTTTTCATGGGCTAACTTACAACCTATTCCATGCTTACGGACTATCTTCCTAGTTTCATAGTTTTCATAGGATTACTAAGAACCTATTGGTGTCTACCAATTACATCATCCAAACATAGTTTTCATGGCCTGACTATGAACCTGTTGATCTTTATCAATAACCTATTCTGGACATAATTTTCATGGGATCACTAAGAACCTATTGTCCCCTGCCAATAACATTTCTCAAGGCATAGTTTTCATGGGCTAAATAAGAACCTGTTTAAATCAATAATCTTTTAACCAGTTTTGGGCATCCTATATTCTGGTCTATCAGACCTCTTGGATGCAATTCTACTCCAACATGGGTTAAATAAATGTAAATTCACTACTGGGTAAACCTAGCTGTTATCCTTCTCTTAGCACCCCAAATGTAGTTATGGGTTATAAATGAAGTGAATATGATTACCCAAGCATACATACCTCGTTTATAAAACATACATTGGTATCCCCTAATGTAAACGACAAAGTTTTACAATTATTACTGTTCCCAATTATAGTATCGACTTTATTAAAATATGCTTTAGTGTCCTTAAGGGCCAAAAGCAACTTTTATAAATTCTAGGGCTATCCACCCCTTCGTTTGTCTATTAAAAACAAGGTGACAAGAAAATAAAAAGATTGTTTGGGCTATAACTTTTTATAGGTGTAGAATTAGGATCTCTAGCCTATTCCATTGCATCTGAATGATGGTTTCCCTTTTCGTAGATTGGTCATAATAGAGAAACAGACTTACGGTTAGAAAGTTATGCATGTTTTAAGTTTTTAAAACATAACTAGTGAAAGGGTACTAAAGCAACAGTGGCAAAAGAGGGTCCTCCGACATTGAAGAAAGGGGTTCCACCGACATTGGAGAAAGGTGTTCCACCAACATTGGAGAAAGGGAGTTCCTCCGACATTGGAGAAAGGGGTTCCACCGATATTGAAGAAAGGAGGTTCCTCCGACATTGGAGAAAAGGGTTCCACTGTTATTGGAGAAAGGAGTTCCTCTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260624.1	5.3e-36	tonoplast dicarboxylate transporter isoform X1
Swissprot	Q8LG88.2	4.1e-33	Vacuolar malate transporter
trEMBL	A0A5P1EZK9	3.8e-36	Tonoplast dicarboxylate transporter

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G47560.1	79.78	2e-36	150	ATSDAT;ATTDT;TDT	tonoplast dicarboxylate transporter

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G02818	AT5G47560.1	89	18	0	2	90	379	467	79.78	2e-36	150
AfisC4G02818	AT1G26260.3	128	56	4	164	288	170	292	50.00	7e-25	111
AfisC4G02818	AT1G26260.2	128	56	4	164	288	221	343	50.00	8e-25	111

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00939.16	Na_sulph_symp	Family	2	88	44.7	8.7e-12
PF00010.23	HLH	Domain	184	226	22.4	8e-05

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005887	C	integral component of plasma membrane
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006811	P	ion transport
GO:0009637	P	response to blue light
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0015361	F	low-affinity sodium:dicarboxylate symporter activity
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048446	P	petal morphogenesis
GO:0070062	C	extracellular exosome
GO:1902448	P	positive regulation of shade avoidance
GO:2000488	P	positive regulation of brassinosteroid biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network