result

Gene information

Detail information of AfisC4G03572

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G03572	chr4	677254429	677264049	+

Sequences

CDS

>AfisC4G03572
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Protein

Gene

>AfisC4G03572
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261502.1	1.1e-171	PTI1-like tyrosine-protein kinase 3
Swissprot	Q8H1G6.1	1.1e-154	PTI1-like tyrosine-protein kinase 1
trEMBL	A0A8B9AJK0	4.0e-165	PTI1-like tyrosine-protein kinase 3

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G59350.1	76.12	3e-155	545		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G03572	AT3G59350.3	356	81	3	1	355	43	395	76.12	3e-155	545
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AfisC4G03572	AT3G59350.2	356	81	3	1	355	1	353	76.12	3e-155	545

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	78	351	155.2	1.7e-45

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0004715	F	non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006979	P	response to oxidative stress
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GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009860	P	pollen tube growth
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0048768	P	root hair cell tip growth
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13436	PTI1; pto-interacting protein 1	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network