result

Gene information

Detail information of AfisC4G03934

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G03934	chr4	740103164	740115889	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G03934
AAAGAATGATGTTGATTCCTTCATTTTAAAATTCATCCTTTTTATCCTTGCGAGGTCCAAATAGCCAATAATTTCATTCACACACTGTTTATCCTTTCCTCACGTCTGTTTTTCACCCCCATCCTCCACGTCTCATTTTAACCCAACCGTCCCCAAATAAAAAACACAATAATCCCCAAACACCCTCGAATAATCAAATAATTTAATGGCATCATCACGCGTGATGCCGTCAGCATCATCAGCAACAGCATCCAACATAACTCGCCAGTCTTCGCTCTACTCCCTTAAATCTCTGACATCGATGAACATAGACGATCTATTTCGCACGATTGAATCGAACGGCACATCCCCTGCGGTGTCCAGACAGGCGAGCATAAACAAGGTGGAGTGGGCCGAACCGAGTAATAACGATGGGGGAGGAGGAGCAGCGGAGATGACTCTGGAAGATTTTCTGGAAAGGACGGGAACGGAGGTGGCCGGAGTGGCGGCGGCGAGAGGGAGAGGGAGGAAGAGGATCGATAGAAGTGGGGGCAGTTTGGATCCGGCAGAGAAGGCTGCGCTGCAGAGGCAGAAGAGGATGATCAAAAATCGGGAATCTGCTGCTAGGTCTAGGGAGAGGAAGCAGGTCAACTGATTTTTTATATTTCTTTTAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTACAGATTTAGAGGCCTGCTTAAAAGAAGGTTTTTAGTCGAGTAAATATAAAAGCATAGGCGTGATTGGATAAACATCTGAAATTTAGTTTTAAAAGTTTTTCTTATTGTTGAACTTCTAAATTATTTGCTATTTTTAATTAATTAAGTTGTTGCCAAACACTATAATCACAAAAATAACTTATAAACTAATTTTCTTACTTATTAGCTATTGCTAAACACCCTCTTAGGGCTACACATGTAGACTTGGTTTTAAACTAACATCAAATATGGACCATTTTGTATCACATATGCAGGAAGCGAGGGGTGCAAATCACTTCAATATGTTTTCCTTTTTTTCTATTTTCTTTTTGCAAAAATAACCACACACTTACGCAGATGCTGCTTTGGTACAAAATGTGTACTTGCGCTGTTTAAAATAGAATTAGACTACTTATATATATATATCTCCATAACAAATTGCACTGCTTTGAATTCAAATCACTTTAGTGTCTTAGATCACTTTTTGCCATGTTAGCATAGAGTGGCCTAGATTTGAAATGAATTTTAAATGGGGTCTGAACTTGTTATTTGTTTGGCTGAAAGGGAAAATTAATGTTTATCAAGTTCTGTAACCGGCGTTATATATTTGATTTATTAGTTAGAACCAATGATTTCAATATGGGATTCAAATCGTAAATCGCAAAGTTTAAATTTTGGATCGAAACGGGATTTGAATCGTGGATCGTAGATCCAAATGAGATTCAAATAAAGTGTAGAATAATAGAGTGTAGAATAATATAACCGTATTGTAGAACCTAATCACCACATTACCTCATTTCAAATAAAGCATAGAAATAGAACCTCATCACCATACGTTACCTCACAGCCCCACACTACATCTCATATATATTAAAGAGTATGGTAGGGTTGCTTTAATATTGAAACTACATATACAGTACTGGTACTTTTGCAGTTTTTGTTCAAACATCACTTTTATGTTTAGGATAGCCATAATAAAATAAAGCTAAAATAGAAGTCAAAAGCTAGACATAGCTAGATAACAGTACTCTGTTACTGTAGCAGTAGTTCATACATTATCACCTTGTGCCCAAAGAATGCAGAAAAACAAGAAAAAAAATTAAAAATAAAAGCAGAAGTTAGAAAGAAAAGAGAACAGAAAATAGAATACGAAAAATAAAGCCTCTCGCTCTCTTTCTGATGCTTCAACCGAGTTGTTCGACTTCGGTATGCTTTATCTTTCCTTTTTTTTCACCTTAGAAATTTTTGTTGGATGCTTGTTTCTGATAGATCATTTATATACTGCTGTATATAATTTTTCTAGAGATTCTTCTCAATTTTGGAAAAGCTGCGATGCTTCATCTTCAAATGAATAATGATTCTTTTCCAATTTCGAAGAAAATGAAGTTTCGATTTTTCAAAAAATATTCAATTCAAAGTTTAAACTGAAATCGCGATGTCATTTAGGGCATCGATATTTTCGATCTGATAATGGATCGTACGATTTTTGCTAACTGCGATTCAAACTGAATATTGGATCGATAAGGTTGCGATTCGATTTGAATCGCGATCTAGATCGTACGATTTTGCGATTTTTGAAATCAATGGTTAGAACAATGCGTGGACGATTCGAGTAAAGTGTGTAGGGACGTGGCTAGTTGAATATAAAATCACACTTACATGTTGCACTTAAAGTGTGTTGGGATGTGTAGGTATGTAGAAGAAATTGAATATAGTGATCTCTTTTAAAGGTGTCTTGGTTGAACATCTGCAACTCCTAAAAAGTTACAATTACATGTTGCACGTAAGCTTCGGATCGATTGTTTGAAGCCTAACTATTGTCGTCGTTTAGAAATTCACATGATTCTTAGTCAAGTGCTCGATCATAGCAATATTGTATCTGACTACATTGACCTATTTCAAATAAAAGAGAACACTAACCCATTTTCCTTTATGTATGTATGTGTCAATGTGCCTGAGGGTAGGGGGATTTGTGTGTTAAGTCATTTCCCTGCTTGTGTGTTTGTGCGTGCTTGCACATGCACATGCACATGAATATGAAAATCAGTTACACTAGGGGTGTGCTGATGCCAATGTATTTAAAAAGTTTGTAATGATGTACGGTATTGTTTCGACATGCAATATATGGTGAATCAGATCTAAAATTGTTGAAACGAAAGCATTTTTTTGTATATATTGTTATTGAAACTGAAATTTATTGATATCATATGTTGCGACTTGTGATATAGTCTCAACGTTCCTTATTAAAACTGTCTGAAATCTTGGAGACCATTTGTTTATATGACGTGTACTAACTACATGTGTTATTCCAATTGTGGTCCCAACTACATGTGTACATGTTCTATTCAAGAAAGGCACTAGCTTTCATAAAATAAATGTTAAGTCATGATGTCATAAAACTAAGGATGTGTTTTATTCTCCTGATCACAATTGATGATGAGTAGCTTATGATTAATAGACAATGTAAAACATTTGTGATGATAGTTTTGATTATAGAGAGTATTAATGTCTATGGAAAAAAAAGTATGGTTCTGATAACATATACCATGCAAAATTTCAGGCATATACTGCAGAGCTAGAGTCTCTAGTGGCACAGCTTGAAGAGGAGAATGCTTTGTTGAGAAGACAAAAGGTAGTTATTGACTTCTATTTTTGTTACTTATATCAGTAGGCAAGGATGTGCAAAATAATTTCAGGATATCATGCTACATGTTACACAATTTCTTTTATAAGTCTTACAGCTTTCTAAATAATATCTTACAGGAGGAACAAAACCAAAAGAGACTTCAACAGGTACTTAACATTTTTGTTGTTACTTTGCTTTTAGTCATCTGCAGTTTGCACTATAACTATCTTTTATATATCAATTAGATCAATTATCATGCCATATACAGTTTGCGGGAGTTTTTACATTAATTTTATGCCCAGTATATTTTGTAAAATTTCATCCTCTGCTTTAAACATGGCTTTTGAAAAATAAATATAAAAGCAGCACATCATTAATTGATGAAGTAACAGTTTAAATCAAGGTTTAAAATTCTGCTATCCTTAATTGATGAAGTAACAGTTTAAATCAAGGTTTAAAATTCTGGTATCCGATTCCGGTCTGGTCGTTCGAAAATTTTGAAATATTGGTTCCGTTGGAGATTCCAAAAATTTCGTTTGAATTACGGTTCTATATTCCGTTATTTTTCAGAAGATTTTTATGTATAAAAACATTAATAAATATTAATAAATACTAATAATCCAGACAGTCCAATCCTTCGAAAATAGCTTAATTTATACCCTAAATTTGAGAAAATCCAACCATTTTATTAGCCAGGACCAATTTTTCAGAAACTGCCTAGTCCTTCAAAATGTTCAAAACCCAATCAAATACCAAAAATATCTGCTGCTCCTAGCCCTGGAACCCATCGTCTTCATTGACAGAAAATGCCGCCTTTTAAAATCGATAGTGAAAAAAAAACATTACATACTTATTCTAGCAAGAATTAGTGTTCTTAGGTACTTGTATATATAAAAATTTTACACCGGAACTGGACCGAAATGGTTGGAGTTTCGGCGTGCTAGTCGAAATTCGAACCTTCGTTTAAATCAACGTTTAAAATTTTGGTTTTTATTCTGTTCCGGTCATTTGAAATTTTTGAAATTTCATTGTTTTGGGAATTTAGGAAATTCCGTTTCAATTTTGTTCCGAACTTTGGTGCCTCTGATTTTTTTTTATTATGAACGAATAAACCGATAATAATATGAATTTATATAGTTTTTGATCTGATATCAGATAAAATGCAATTTAATAAGCTCACAAATAAAAAAACTCTATTATCAACCAAGACGCTCTGTTATTCGATCTGAATCCTTCCGTACGCAACAATGCAACTCTCAACAATCTCGAGTAAATCCGTCGAAGTCCGGTTTCGCGGTTCTTAACTCTAAGTCACCCCGATGAGCGTCCTCAACCATACAAACATAAAAGCAAACATAATTCATGCACCAAACAACCTGCAAACATACAACAATTCATGCTAAATGATCCTATAATGTCTCTAATCCCAGCCTAATGCACACCAAGGCAACCACGCATCAAATTAACATGATTAGAACGCTTTAAAACATTTTGAATTCGTTTTTACTTCAGATTTCACTTTAAAACAACATTAAAACCTAATTTTGATTTTAACAATGAGTTTAAAACATGTCAAAACATATAGATACATGTATAGTAATTGCATTTCACTAGTTCATGGCCCGCCCTTGAAGCTATTTAGAGCCCGACTTTCTTTTCCTAGCATCATCTACTTCCATGTCG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020174700.1	3.6e-17	ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 7
Swissprot	Q0JHF1.1	1.4e-13	Abscisic acid responsive elements-binding factor 1
trEMBL	A0A453G072	2.6e-17	BZIP domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G44080.1	52.59	8e-24	107		Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G03934	AT5G44080.1	116	45	4	87	199	207	315	52.59	8e-24	107
AfisC4G03934	AT1G03970.1	135	66	3	67	199	142	270	45.19	1e-20	96.7
AfisC4G03934	AT2G41070.2	233	72	8	13	165	11	237	32.19	3e-16	82.0

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g216731.t1
Allium fistulosum	AfisC4G03934
Allium sativum	Asa4G03115.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	117	175	48.4	6.7e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009409	P	response to cold
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GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0010152	P	pollen maturation
GO:0010187	P	negative regulation of seed germination
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010255	P	glucose mediated signaling pathway
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0033613	F	activating transcription factor binding
GO:0043621	F	protein self-association
GO:0048316	P	seed development
GO:2000028	P	regulation of photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14432	ABF; ABA responsive element binding factor	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network