result

Gene information

Detail information of AfisC4G04207

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G04207	chr4	808154722	808164319	-

Sequences

CDS

>AfisC4G04207
ATGGAGAAATTGCTAGCTGGGAAATATATGATTCAGAAGAAAATCGGAAGTGGTTCCTTCGGCCAGCTTTATTCAGGAATTGAAGTGGATATGAAAGGAAAAGTAGCCATCAAATTGGAAAGTGTATATACAAGGACTCCTCTTCTTCCTCATGAAGCTGAAATATACAAGCATCTTCAAGGTGGAGTTGGAATTCCACATCTGAAATGGTTTGGTGTGGATACTGGTCTTAATATAATGGTTATTGATCGTCTCGGACCAAGTTTGGAAGATCTGTTCAATTTCTGTGATAGAAATTTTACTCTAAAGACCATTCTTATGCTTGCTTCTCAAATGATTGACAGGATTGAATTTGTACATGAAAGAGGTATTCTCCATCGCGATTTAAAGCCAAATAACTTTCTGCTAGGCGCTGGTCTGGAAGCATATCAAATTTATATTATTGATTTTGGACTTGGAAAGATGTACAAAGACTCTGAGACAAATACCCATATACCATACAGGGAGAACAAAAATCTCGTTGGAACTGCACGATATGCAAGTCTTAATACTCATCTTGGAATTGAGCAAAGCCGAAGAGATGATTTAGAATCCCTTGGGTATATGCTAATGTATTTTTTAAGGGGAAGCCTACCATGGGATAGCTTGAAGTGTACCAATAAGAAAGAGATATATGAAAAAATCAAAGAGAAGAAAATGCTGACTACAATAGAGGAACTATGTAAATCATATCCACCAGAATTTTCGTCATATTTTCACTACTGCCGATCCCTAGGATTTACAGAAAAGCCAGATTATGAATATCTGAAGAGCCTCTTTCATAAACTACTTCTTCAACAAGGATACCAATTTGATTATATATACAACTGGATCACACATAGGGGCCCTCAAAGTTCGACTGAAGTAACACAGCAACATAATGGAAGCACAAGTGGACATGAACTACCACCTATACAAAAACCAGAAGGTTTTGCTTCCTCTTTTCGCAGTTTGGCACAAGCAATTAGATGTGGAGGCTGTGGACCAAGTTATAATTCGAAAGTGGAAAAATGTAAAAGGGATCAAGCTTTAGTTGCCAATAAAGGAAGCATTGGAAAAGAATGTTCAAATAACAATCAGCCTGTAAACAATTTAGAGCATGTATCTGATGCTAACGCATGTAAGGCACCCAATGAAGGTGCAAGTTCTGGCACTAAAGTTCAGGAAGTTTACACTAGTGAGCAGAAGTAA

Protein

Gene

>AfisC4G04207
AATAAATATCATTTAGCCAACGTTTATGTAAACATCTCAAATCCTTTATTCAAATTTGAAATTTCCATGTTTTAATGCTCATGCAATTAAGTCCATTGATTGAGCCCAGTATTCACTCTGTCATTTCAAACTTATTTATACGATTTCTCTCAATAGGGTTTGCGTATTTCATTCTTCGGTTTTTGCTGTGATTTTGGTTTATATGTTAGCATGGAGAAATTGCTAGCTGGGAAATATATGATTCAGAAGAAAATCGGAAGTGGTTCCTTCGGCCAGCTTTATTCAGGTTTCTTAAATTAAAATAATTTGCTTCTTCTTCACTTAATTCTATGACTTTCTAGTTTCGCCTTTTTGTTGTGTTCAAGGAATTGAAGTGGATATGAAAGGAAAAGTAGCCATCAAATTGGTATGTCAATTAAGTTTCTAATATGTTTGTTTATTCTATACATTTCTACAGCGAGTAATTGATATTTAATTTTGGGATACATTGCTCTACTATGCATTATGTTTTCATCTTTTCTACATAAAAGGACTCAAATCTTTCTCCAACTTTTGAAACTGTAAAGAGATTCCTGATTTGTATGGTGGATCCTTCCTCCTTTATTATTTCTTAAACTGATCTGTATCATACGTTCCTGTAATCAAATATAATTAACAGTTTGGATTATATATATATATATATATATAGGGGCCGCCTAGTTGATGACACAAATGGAGACAAAAGATCTGGACCATCGGATTTTTTTGTTTTTATATGAAAGGTGGAATTCGGGGACAATCCAATGGTAGAGATCCACTGTGTCACCAATTCCACACATATGTGTGTGTAAGAAAGAATATATGATTTTAAAGAAAATTCAAAGATCTATTGTTCTAATTTAGTGGTTTTGTTGTAGTTTACACTTTTACAATGAAAGGTACTTCGATCTTTTGAATTTTTTGGATTTTGCAGAAACGTTTTACATTATGTAAATAAAATAACATGTAGCCAATATAAAGATGTTTTATATAAGTAGAATAAAGAAGCAGGCATTATCAACCTTGAAAAGTTCATGATTTTTTGAGTCATTAAAAACAGTGGACAGTGGTAAATTTTCTTGAAGTAAAATTTTGGAAACACAAATTACACCTGTTGGAGCAGTTAACCTTTAATCAAACACATAAATCCCAATTGCTACTAACATAGAGAGATGCCAAGCATTATTCCAACATGTGCTACATTTTAATTTGTTTGACCTAATAAACATATATGTGTTTGGATAAATTGTTCTAGGCAGTTTACAAGTGCGTGCTTTTAAAATATCAACTAAATATATTGTATATAGTTGGGGCTTTAGAGGTTACATCCCTAATTTTAACTATCATAGAAAAAACACCATAAGTCTTTTATCATTCATTTCCTTCATTAACATCCGCTATTGTCACACTACTTTAGATACTTCACGCGTCATTTTAAATTTAATTTATTCAATATGCAATAATTTTTTTCAATAAATATTAGATTGACGAACGCTTTTCATCCCTAAAGACAAACTTTATGATTTTCTAGTGATAGAGATTATGCATATGTAAAATTAAAATTTTGGTAACTTTTTTTGAAAAGTCAAACACTGTTACAAATTCAATATATAGGGTACATCTTTCTTCTAGTTCTATATATACAACCGTTTCTATAAAAGATTTCTTTTTCTTTTTATCATGACCACAAACAACATTAGAACATATCATATTTAGAGCCTAGATAAAACTTCTATTATCTCAAaaTGTTTTTATATGAAAATTTGCTTGAGTCAAGATTAGACAGTATATAGTATAAAGGTAAAGTTGAATGGGAAGGATCCATCACTTCAGTCATATGTATTGAATTTGTTGGAGCTTAGAACGTAGGTAGTTAGTATGTACTATTTATTATAAACTACTTGTACGTAAAATATTTTCTAGTAGTTTGATGTACAAAAGTCATAATTTTCATCCCAAGTTGTTAACATAAGTGCTAAACGAATAATAAGTACATAGAGGCATATTCGTTCTTGTCCATCAAACGTGCAAGGAATGCCTTGAAATAGAGAAAATAAATAAAAATGACAGTAAAGTTATCAAAGGATGGGTTGTTTGGAAGCAAACATATTGTAAACACATTGTCAATTTTGTCAATTTTGTGGATTTATAATTTGCACTGATTCTTTTCATTTTACCTTTTTATACCGAATTTATTAAGAGTTCAAATAAAAGTAGGTACGAGAAAACAAACACAATTAATACTGTAAATATGACAACTAAGTTAATTTGTACGAGTGTAACTCCGATATATATACAACCCTTGATCATTGAAGTTTCATCCACAGCGAAGAGAGGCTAATGGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTATGTACGTACGTACATATGTATGTTTTGATAAGTGGTAGATCATTTACGTAGTTTTCTCAATTATTTAATCACGTAATTTATGGTTTTGTGAATGTGATCCTCAAATTATAGCCAAAGCTAGGTCCTCAGCGTCAAGCAATAGTGGATCCAAGCTGATATCAAATTCAACTTAGAACTGGTTTGTGAAAGTTATGGTTTTCGGTCTCTATGAATGACATTAAGCTTAGTATTATTTGAAACTGCAAAATAAAACATTGAATGCAAAGTTTAAGTGCGTGTTTATTCTATCACAAAAATTAATTTTGAAGAATAGTCCATATATGGATGATCAAAAATAAAATCAAAACGTAGCCTAAAATGAAAAGTAGTATGAAAAAACATTATGGATTAAAATTAGTTTGTTGCTCACAATTAAAAATCTTGATATATCATACATGATACATTTTATTTCATATTCTTGATTATTTGTTCAGCGATATTATAATGTATACATTGATAACCAAACATGGAAGTAATTTAAGTAAAAAGTGAAAAACTATTGTTATATTGTGTTTACGATGAAAAATTATATTTGAATAATTTCATACTCAATTTAATACCAGTTTAATACGTACGATTATAATATATATTTATCGTTATATCTTCTAACTTTGCTGCCAATAGTCAGTGATAAACAACCTCAGTTCAAACTTACACAACACTAGAACTTGCCATTCCTTACCCTTATAACCGTTATAAATAAATTTTGTAACGGAAAGAGCCGTGATAATCAAGTGCGTGGGAAAAATTTCTCATGAAATTTGTAACCTTTATAACCGTTTAAAATATGGTATTTGCAACTGTTATAACCGTTGCAAATTGCAATATTTAGATATAAGTTATAAATCTTTTTTCATTTGTTTCCTTCATTAACATCCGCTATTGTCACACTACTTTAGATACATCACGCGTCATTTTAGATTTAATATTATTCAATATGCAATAATTTTTTCAATAAATATTAGATTGGCGAATGATTTTCATCCCTAAACACAAACTTTATGATTTTTCTAATGATAGAGATTATGCATATGTAGAATTAAAAATTTTGCACTTTTTTCGAAAAATCAAACACTTGTAATATAAATGGCATATTGACGCATATAAACCTTAAATTGCTTTCAAATTCTTTAAAAAGCTTAAAAACTATCCTCGCATATGTTTTAATTACATCTCACATATGCAATTATATCTAATAGATTTTACAAATTCAATATGTAGGTTACATCTTTCTTCTAGTTCTATATATAACACCATTTCTATAAAAGATTTCTTTTCTCTGTTTATCATGACCACAAACAACATTAGAACATATCATATTTAGAGCCTAGATAAAACTTCTATTATCTCAAAAGTTCTTATATGAAAATTTGCTTGAGTCAAGATTAGACAGTATATAGTATAAAAGTAAAGTTGAATGGGAAGGATCCATCACTTCAGTCATATGTACTGAATTTGTTGGAGCTTAGAACGTAGGTGGTTAGTATGCACTATTTATTATAAACTACTTGTACGTAAAATATTTTCTAGTAGTTCATGTACAAAAGTCATAATTTTCATCCCAAGTTGTTAACATAAGTGCTAAACGAATAATAATTATATAGAGGCATGTTCGTTCTTGTCCATCAAACGAGCAAGGAATGCCTTGAAATGGAGAAAATAAATAAAAATGACAGTAAAGTAATCAAACGATGGGTTGTTTGGAAGCAAACATATTGTAAACACATTGTCAATGTTGTGGATTTATAATTTGCACTAATTCTTTTCATTTTACCTTTTTGTACCAATTTTAAAGCTCAAATAAAAGTACGTACAAGAAGATAAACACAATTAATATTGTAGGTATGACAGCTAAGTTAATTTGCACGAGTGTAACTCCGCCATATATACAATCCTTGAACATTAATTGGAGTCTCACCCCACAACCAAGAGAGACTAATGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATATACTAATAATAAAATGTAGCCATGTGTAATTGTATTAAGTTTTGATAGGTGGTAGATCATTTAAGTAGTTTTCTTAATTATTTAATCATGTAACTTCTTGTTTTATGAAAGTGATCCTCAAATAAATGCCAAAGCTAGGTCCTCAGTGTCAAGTAATAGTGGATCCAAGCTGATATCAAATTCAACTTAGAACTGGTTTGTGAAAGTTATGGTTTTCGGTCTCTATGAATGACATTAAGCTTAGGATAATTTGAAACTGCAAAAGAAAACATTGAATGCAAAGTTTAAGTGCGTGTTTATTCTAGCACAAAAATTAATTTTGAAGAATAGTCCATATATGGATGACCAAAAAAAATCAGAGAGTAATCTAAAATGAAAAATAATATGAAAAAACATTTTGGTTTAAAATTATTTTGTTGCTCGCAATTAAAACTCTGGATATATAATACATGATACATTTTATTTCATATTCTTGATTATTTTTTCATCAATATTATAATGTATTCATTAATAACTAAACATGGAAGTAATTTAAGTAAAAGGCGAAAAATTATTGTTATATTGTGTTTACAGATTATACTTGAATAGTTTCATACTC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020676398.1	3.3e-118	casein kinase 1
Swissprot	Q6K9N1.1	1.9e-118	Protein LOW TEMPERATURE GROWTH 1
trEMBL	A0A8T3ATG1	2.4e-118	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G23340.1	64.00	2e-119	426	ckl10	casein kinase I-like 10

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G04207	AT3G23340.1	300	108	0	1	300	1	300	64.00	2e-119	426
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	9	239	86.9	1.3e-24

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
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GO:0000155	F	phosphorelay sensor kinase activity
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GO:0010087	P	phloem or xylem histogenesis
GO:0015631	F	tubulin binding
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019200	F	carbohydrate kinase activity
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0032091	P	negative regulation of protein binding
GO:0032436	P	positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0043622	P	cortical microtubule organization
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0046835	P	carbohydrate phosphorylation
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GO:0048364	P	root development
GO:0051510	P	regulation of unidimensional cell growth
GO:0055028	C	cortical microtubule
GO:0060069	P	Wnt signaling pathway, regulating spindle positioning
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GO:0080117	P	secondary growth
GO:1903827	P	regulation of cellular protein localization
GO:2000052	P	positive regulation of non-canonical Wnt signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network