result

Gene information

Detail information of AfisC4G05222

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G05222	chr4	966836519	966845806	+

Sequences

CDS

>AfisC4G05222
ATGGGTTGTTTTCCTTGTTTTGATTTTAATGAAGCAAAGAATCACTACGAATCAAAAATTAGAGGTGATGAACACGTCGAGGGAGATGATGTAAAGAGGGTGGGGAAGCCTATGATCCCTCCAAAAATTCATAGATTAACTTCAAGCTCAAAAACTGATAATCCAAGGGCAAAAAGGACTTCACTTTCAAAAAAGGAATCCGTGAATCAAAAGGAAGTTCTTGGTACTGATATATCTGCACAAAAGTTTACATTTCGTGAACTTTCCACTGCAACAAAAAACTTCAGAGCAGAGTGTTTTTTGGGAGAAGGGGGATTTGGGCGTGTATATAAAGGGTGTTTGCCCAATGGTCAGATTGTGGCTGTAAAACAACTGGATACAAATGGGCTACAAGGAACTAGAGAATTTCTTGTTGAAGTTATAATGCTCTGTGTTTTGCATCACCCTAACCTTGTTAATTTAATTGGTTATTGTTATGATGGTGAACAACGACTCCTTGTCTATGAATTTATGCCTTTGGGATCACTAGAAGATCACCTACATGAAACTAGACCTGATACAAAAGCCCTGGATTGGACCACAAGAATGAATATTGCAGCAGGGGCAGCAAGAGGGTTAGAACATCTACACGACAAAGCCAACCCTCCTGTAATCTATAGAGACTTTAAAGCAGCTAACATACTATTAGATGAGGCCTTCAATCCTAAATTATCAGATTTTGGTCTTGCAAAACTCGGTCCAAGTGGCGACAAGTCTCATGTTTCGACCCGTGTTATGGGGACTTATGGTTATTGTGCACCTGAATATGCCATGACTGGTCAGTTGACTATTAAATCCGATGTCTATAGCTTTGGAGTTGTCCTCTTGGAACTGATTACTGGAAGAAGGGCGTTTGATAGCAATAGGCCTCATGGAGAACAAAGCCTTGTTGCATGGGCACGACCTAAATTCAACGATAGAAAAAAGCTGCCGAAACTAGCAGATCCCAGACTGGAAGGGAGGTACCCGATGCGTGCCCTATACCAAGCTCTTGCGATAGCATCAATGTGCATCCAAGAAGATGCGACTTCCAGGCCGCTCATAGCCGACGTAGTGACTGCCCTCTCCTATCTTGCTTCCCAGTCCTACGACCCCAACAATCCACTTTCCAGAAACCGAGAAAAGAAAGGCGTCCTAAATGAGCATGACAGTTCGGACAAAGACAATTCTCCTAAACAGGTGGCAGCTGGGATGGTTAACGTAGATTTTGACCGTGAAAAGGCAATAGCTGAGGCTAAGATGTGGGGTCGAAAAGCAGTTGGGACTTCTTCTAATGGGGGAGATGTATAG

Protein

Gene

>AfisC4G05222
TGCACAATAAGCGTGTGCTAAAATCAAGTAAGAAAACATAGAGGCCGGCGGGTCCATCCACACTTCAAATCGTCAACCCTCAATCAGCAAAAGAGTTTCAATTCCAGTTTGGTGTTCTCACTTGTTCTCATCTATATTTAATAATCCAATTGGTTTATCGAAGTACAACTCTAATGGCTTTAATTTGAGATAAGATCGTTTCAAGTAATGGGTTGTTTTCCTTGTTTTGATTTTAATGAAGCAAAGAATCACTACGAATCAAAAATTAGAGGTGATGAACACGTCGAGGGAGATGATGTAAAGAGGGTGGGGAAGCCTATGATCCCTCCAAAAATTCATAGATTAACTTCAAGCTCAAGTGAGTTTTATTATTATAATTCAATTTCCATCATTTTCTGTAAATTATTGAATGTAACTGGATGTAGAACTATGAAATTTTCTCCGATGCGTACTTTTTGAATGAATTGTTTGGTTGCTTTTGTTCTTTTATTTAGTTAGCTAATCTCATGAAGTTTAGTCGAGAATTATTGATCGTTCTCTATCGTTCTCTAGGATATTGATGAAACCTTATGGATTTGCGTAATAAGAAAGCTGGGGAATCAGGTGTTAGTCTACAGTATATGAGTAGATGGGATCATGATCCCCATTTTATGATGGGATATATCATTTTGAACTATCAAGTCCACTAAATAACAATGTTTGAGTGATGCAAAGTGTTAATATTGTATTTTCTCCTTGTAATCCAATTGATTTCAGTGTAACTTTTTACTATCCCAGCTTGTGAACTCACATTTTTTTTCTCTAATACGTTAGTCACGGCTTTTGTCGTGTTGTATAGTATAGTAGCTTTGATCTTTCCGCTGATCAGTTCTAAGGTACATTCATGTCGATGAACACTAAGATGCACTCTGATAAGGACCTGATCCCATGGTCACATGTAACTTGGCTTGTTTTCCTTTGTCCACCGGATTAAAGCTTATGTCAAGCGTTTGAATGGTCAAAGTGACCATAAGCTATCACATCTTTTGAGGCATTCGTTAAACAGTCGAGGCACTCTAGTTTCGGTTGTCTTTTTTTCTTCCATAGACTTGTATGTATGTTTGTCTTGTATATGACTTATGGGCTAGTCAAAGCAAAATGGAGTTATAGACCCTAAGAAAAAGGGAGACTGGTTGAAACTAGGTAGAGTGACTAAACTTTTTCTCTATAAAATAAATATTAACAATATTTTATACCTAGCAACAGTTAAACATTTAAAAAGGATACTCTGGAATTTTTACTATTTTTTTAACTCTTATATGCTAGTTTTTTTAAAGATCTGAAGATACAGATATTAATATAACAACTTGAGTTGCATTGATACTTCTTGCAAGGACACAAGTATTAAGACTCGTATACACGATTTGATACAAATAAGCTGTTTATGCTTGGGTACTCGGTCGGTATGTACTGAATTTTATGGATACATATTAGTTCACTTTTCCATTTTCAGCACGTTAGTTAAATGTGGTGTATAAAACCATTTGGATTTCTTTTTTATTAAAATATCACCTCATTAGAACTGTTAATAATTTAAAGTAAATGTTTATGTTTTTTTAGTTATTTGTTAGACAAACACATAGTGATTGTTAAATGGAAAATTAGTCAATTACTCCTTAAGAAAACATAGAATCGGATTGTTCAAAAATTTATATCTTGATAAACCATCTTTATTGGCCGCATTACTTAAGGGCGAAGGCACTGAGAATATTCTAGTGGATCGAATCTTTTATGATTATCGTGATTTTACTTTTATTCAATAGTACTTAATATGATTACCTATTGTAAAACATGTTGAAGTTTGGATACTTGTGTAATTCATTAAATTATTATTAAATAATAATTATATATTTATTGAGTAACCCATGACGTACCCATACATTAACTTTTAATGATTTGAATTTGAAGTATCCTCGCATCGCATCATATTAAGTTTTGAAGATTTAAAGATTTATGCATACAAATGTTGCAGAGATCACAATCGTAAGTAACCCAACAACAATTAGATAATTAACATATCACACAAAAGCTAATTTCTTCAATAAAATTGAAGTAAGATGTAAACATATCAAATATTCTAGATGTTCAGCGATAACAAAAATAACACAACTAATCGATCAAAACATCCAAGGGCGTTCATTGACATCTAGAAGCATGTAGGCCGTGGCACTTCGAAAACCAAGCATAATTGAATGGTCATACAAATAATTTATCTTACGGATACCGGTGTCTAGATGGCACCTATAAGAGCATAGCTTCCGAGCTTATAATTGAATGATAAAAAAATTAAAATTAAAATTAAAACACGTGCAATCATAAGCTCGGTTATCGTTCTGGATGTCACCAAGCCCATACCCGAGCTTATGATTCTTTCTTTTTAACAATATTTTTAGTATAAAAATGTATAGTATACATGAAGGCCGACAAAATTCTTGAATTTCTTGCTTATCTTCCTTGCATGGAACATTGCAAACTGTTCTGTGGCACATGTTCATATCTTTGTCCAATGTGTGTACATATGTTTTAGCACAAATAATATTTATCTGTTGGTTGCTACCATTAACACTTAATGGAACTGAGGGATCAAACATGTTTATTTCTCTAATGATTGGACTTCGTGCAAATGATCCATTTTGAATGGATTGACATAAATATGCATAACCCATGTAGCCTTTTCTTCTTCTTTTAGTTAGAACTTAGAAGCATAAGCCTGTAACCCTACTTCAACTGCATCTGGAATCCAAGTTACTATTAGCTTAGGAGTTGGGACTTACTAGGTTTTACGTTGGAATGATTTTAACTTATGTTCTTTTTAGAAACTGATAATCCAAGGGCAAAAAGGACTTCACTTTCAAAAAAGGAATCCGTGAATCAAAAGGAAGTTCTTGGTACTGATATATCTGCACAAAAGTTTACATTTCGTGAACTTTCCACTGCAACAAAAAACTTCAGAGCAGAGTGTTTTTTGGGAGAAGGGGGATTTGGGCGTGTATATAAAGGGTGTTTGCCCAATGGTCAGGTATTTATCTAGTACATTCTGTTTCCATTTTTTTAGGGTAAATTGCACTTTACATCCCTTAACATTTTATTTTTTATTCAAAAAGCCCATAGTTGTGAAAATTTATCCTGAACTGTTATGTGGTTTTGTTTAGTGCTCTGCATTGATGTCATTGTTCATTCGTGTTTACTTCATGAATACACATCACCATAGTTGATCTTTTCATAAGATTTAATTATATGCTGGAACTTGTTATAAGTTTAAGATACGTAATAATTTTTTTGTGAAATCAAAGTATAAAATATTTAAGTGGAAAAGGTCGATTGTAAAGGGTGCTAAAGATTTTATGCACTCCCATAGTAAAGATTCCTAGTTAGCCACTTATATAATATATACTGTAAATATTGAAAATTACATACAGTGCTGAATTTTTACTGGTGATAACAGATTGTGGCTGTAAAACAACTGGATACAAATGGGCTACAAGGAACTAGAGAATTTCTTGTTGAAGTTATAATGCTCTGTGTTTTGCATCACCCTAACCTTGTTAATTTAATTGGTTATTGTTATGATGGTGAACAACGACTCCTTGTCTATGAATTTATGCCTTTGGGATCACTAGAAGATCACCTACATGGTATGTTTATCTATATCTTATTAATAGGGAACAATTCATCTATTTCCTTCCATGTTAGGATGTTATTAAATATTATGCTCATGTTTCTAACATTTATGTTGGCATACCACATATTTTTCTATCCTAGTGTGTTCGCGTGTGTCACACACACATTATTCTTTTATCTAAACGCGGTTTCAATACTAGTATTTACATGCTATGCTGAATCTATTAGCATCTCTTAATTTTCTTTTCACACCTCACTATTTTGTAAAAAAATATCACACCCTATTTATTTCTTTTCTTACCCCATATTATATCATTTTTACCCTTCTATTTACAATGTCTTCTTCATTCGCTTTCCACTCTTTGTCTTCGTAATTTGTCAAATTCATGAATCCTAAAATCATGGATACAAACCGACAACTTTTATCGTCAATCTTTGTAAAAAATTAGTTAAGAAAGACAAAATTACTCTAAACAAGTTTTATTAAAAAGGTATATATTCTCTTTCATATAGAGATTAAGGGTAACAATTTGTTTTTTTTTTATGAAATTGGTTAAATATATTTGGAACATGTTGAAGTCGACCAAAATCTTATATAATTTTTGTTAATGGAATGGAATTAGTATGAAATTAAATATAAGTATGTATTTATTTTAAACTTTCAATTTGAGATTAAGGAATGGAGGAGAGGGAGGGAGGAGGAAAGAAAGAACATCTAGACTGCTATGTTGATTGACGTCAAAGAGTAAATTTGTAGTTAATCATTTTTAGCGTTAACTGGGTGGGAAAAGAAAAAATTAGGGTGTTAATAGATTTAGCCTACATGTTACTGTTCGCCTAACTGGTTTCTATCCATTACACATGCTTATTTGTTTTGTCACTAAAGTTTATATGCAAACTTTCATACATAGAAAACTATATACCTAATATCGACATCTTTATGTTTACATAAATAAGAGAAAATGATATTCATATATGTTAATTTATACAAGATGTGTGGCTAGGCAGTAAGTGTGTTGTTTTGCTTAATTGTTTGGCTTGTGAGCCTGAAAGATGTAAAATTGTATACGGTTTATATACAAATGATTTCAGTCGACTTATCTTTACTCTTAACATACATTATATTACAAACGATTTACGCATAGAAAACAAGATTAAGCTGTAATTGAACCTTAAAAAAAACAAATAATAGCAAAATCATACAATCGTACATTATATTTCAAAGTTTAGACTTGAAAGGAAAAAATATCAAATCATACTATTAAGGTTTCAAACCAATAAAATTCTTGTGTGTGTGTGTGTTAGTATATGTCTCCAAATAAAAATCAATAAGCCTGTTCAAGTATTGAGTGCTCAGTATATAAAAATCATTGTTTTTAAAAATCCGCCTCGATACTCGTCTTGAGAAGCGTCTCAAAGCAATGAGAGATAAAATGCCCCAAGGCTTTTCTCAAAAAGCCTTCTTTACCTATAAGTTTTACGCCCCGGCAACTTGAGGCACACGTGCCTTGCACGCCTCAAACCGTTGAAGCATGCAATTCTAGAATTTTTTTTCCCAAATTGTAAATATAGACGCTAATAGAAGTGATTAAATTTCAATTATTTGATGGAAAGCAAATAAATTAAATTTAAGAAAATGAAAATTAACGTTTTTCTATTTTAATTTCAATATCGACATGATTAAGTACGATTAGTTTTGAAACAACGATCCATGGCTACGTAATGATTTTCTCAATTGTTATTTAGAGAAATTTTTTGAATTGTCATCACTGAATTTCTGAATGCGGATCGATTTAAATTGGTAATTGTTAATATGAAATTTCAACTGGATGTTTCAAATGTTAAAAAAATGCAAACATTTGTAATGACCATTTCCAAATATAGGTTAATAGCAAATATCTGCAATATTTACTCTGAATTGCAAGTAAAATGCAGGTAATGAGGTAATTATCTGCAATTTCTACTTCGAATCGCAGATATTTGCACAAATAATTTTTTCTTCAAATCACATGACACGGAAATATTGTTAGAAAGATTAAATTTTGTGAGTTAAATGCTGTAACAAAATTCCAACTGAATGTTTTAGATTTGAGAAAAATGCAAATATTTACACTTGGTTGTAAATTGCAAACATTTGCAGTTTGAGTGTTTGCATTGTAAATATTTTTGCAAATATCTGCAAAGATAAAACTTCATCGAAACATAGAACATATGAATTTTGTTTGAAAGGGTGTAAAATTTGAAATTCAATGGTAAATGAAATTCCAACCAGATGTACTTATTTTGTGTTTGGATCTACACAGAGGTAAGTTTACACGTGGTTGACAGTATCAAAATCCGTCAGCCAAAAGTAATCCCAAGAACCCGAGTTATATAGGCTGATTGGTAGCGACTTTACATGGATTAAGTTTGGAAGGACTTGGGTCTAATATCCAATATATTGTTTTGAAGTACACCTTCAAGGATGCATTTGTCAAAGTGTGTAATTCGATGAGTTATTTTTGGTCATGGTTTTGAAATGATACATTTTTATACGAAGAAGATCAATATGATCAATTGACTATATTTATAAAATTAGCTCAAATGGAGACTTTTCTGAATCAGGTTTGTCTTTTTTTCTTTCCCCTCACCCAGTGGAGTAGGATGTAAACATTTTGATGATATACTCTCTGCAAAATACATGATGTATATCTATAGAACAACTGATGCGTCTAATAAAAGGATATCTATTCTACTTTGCCAGAAACTAGACCTGATACAAAAGCCCTGGATTGGACCACAAGAATGAATATTGCAGCAGGGGCAGCAAGAGGGTTAGAACATCTACACGACAAAGCCAACCCTCCTGTAATCTATAGAGACTTTAAAGCAGCTAACATACTATTAGATGAGGCCTTCAATCCTAAATTATCAGATTTTGGTCTTGCAAAACTCGGTCCAAGTGGCGACAAGTCTCATGTTTCGACCCGTGTTATGGGGACTTATGGTTATTGTGCACCTGAATATGCCATGACTGGTCAGTTGACTATTAAATCCGATGTCTATAGCTTTGGAGTTGTCCTCTTGGAACTGATTACTGGAAGAAGGGCGTTTGATAGCAATAGGCCTCATGGAGAACAAAGCCTTGTTGCATGGGTAATGAATCATTACAGCACATTCTTGTACTTTATAGGATACTTATTTGGATGTTTCTGACATATTATTAGCGTATTTCTTACATTCGAAATGAAGTTAGATCAATCATGCTAGAATGGCGAATATTTTATTATGATTCATGTTCAGTTGGTTGGACTGGGTGACATTCATATCTCTAACTGGGCATGAATTACGAAAATAAACTCAGGCTTAATATTTTTTTATGTTACACGCATGCATATACACAGTGTGTGTGTGTAGGATGAGTCTTTAAATCCCCACTTCAGGACCCCCATTATTTTCCGATCAAAAATTTCATGCGCGCGCACACAGGCAGACATATTGAATTGAGCTAAATTTTTGTGTGTATGTTCTTCTAATAATATAAATTATCTTCACAAAACTTTTATATTTTCAAAACTTTTATCGCCTTTAATATCACAAGTGAATGTTAGCGGTAAAAAATCTCTTTTCAATCATTGATTTAAATGTTGATTTGAACTGATGGGAAGTTTCAAAAATATCCAAAATTTTGTGTGGATCAACATAATAAGAATGATAAACGAAAATTGCTTAATCTGATAATTCCTTGAATACACGCATGCACGTCTCATCACCCTTCGTTTTTTTGTCTTTTTAAATATGGTTAGTTAGGACCAATGGTATGTTAGATTCAATGATCAAACTCGTGATCTTTAATCTCACAATCTGAACCATTAACCAACCGAACCAACGCCGTTAGCATATTTTTTTGAATTGAAGTAAATTTTTGTGGATATGTATTATTTATTAGCAAAATCATCTATACCAAAAATTTGAATCATTTTATTTTTAACGGTTTATATCCACATGTGCTTTTGAAGGAGTTAAAAGTGTTGAAATGATTCGAAATTGTGTACACACATACTTATATATAGGTATGGATCCTTACACTTGAATTTCTTGCTCAAATTAATAATCATCACATCAAAGTAATCTAATGGTCAAAATTTTTATGTGGGGAGAAATATGGGAAGAATTTTGGAGGATCAAAGTTATAATTTAATCTTCACATTCAAAATGAATTTGAGCAAGTTTCAAGTATGAAGTTTAAGTGTAAAAATAATGTGTGTGCGTGTAAGTGTATCATGACATTTCTGATTTCGAAACGAATAAATCATTTATACATAAGAAAACAAGATTTGCTCGAAAATGTAAAGTATGCTGGTGCACCCTAAACTTATTGGGTAACCGGCAAGAAATAAAGCCAAACATGCTTCAGTCTATTGACCCCTTGATCAATGGTCCTTTGCCTCTTCCAACCTAACTCGTGAGGGCTTTCTAATATTTTACATATATACCCACAAAAGCTAGGACATGGATCAACCGCATAACGCATACTTTAAATAATCACCGAAGGATCTACAAATTCATGAGGGCCCTCTAACTTTCTTTATATTGTTAAATATGTGTGTGTGTATGTATGTATATTGAATATACTTCGGAGAACCCCGTGGACCGGTAAACTATTGAGGAGAATTAAGTTGTGTCTGTCCGTTTCAACTCATGACATCTATAATCCCTGGGTACTATTTTTTGCGAAAAGTGTGTGCAATGCAGAGCTCAAACCTGGGTCTGTTATCGGACCTAGGCACCTCTTTTCCATTGTGCCACACCTGCGGACTTATATTGTTAAATATATTATAATCATTCCCTTAATTTGTAGGCACGACCTAAATTCAACGATAGAAAAAAGCTGCCGAAACTAGCAGATCCCAGACTGGAAGGGAGGTACCCGATGCGTGCCCTATACCAAGCTCTTGCGATAGCATCAATGTGCATCCAAGAAGATGCGACTTCCAGGCCGCTCATAGCCGACGTAGTGACTGCCCTCTCCTATCTTGCTTCCCAGTCCTACGACCCCAACAATCCACTTTCCAGAAACCGAGAAAAGAAAGGCGTCCTAAATGAGCATGACAGTTCGGACAAAGACAATTCTCCTAAACAGGTGGCAGCTGGGATGGTTAACGTAGATTTTGACCGTGAAAAGGCAATAGCTGAGGCTAAGATGTGGGGTCGAAAAGCAGTTGGGACTTCTTCTAATGGGGGAGATGTATAGTAGTTTGTTTGGATTCAATGTCTTTGTTTTCTTTTGTACGACGTTGCTTGTATGTAAAGCACATGTGCTGAAAAAGTCGATTTTATTACAGACTTTAGGACAATTGTAAGTAAATTTTGTTAGTCTTTGATAATAGACAAATTGTATGGCTATCTTATATCGTGTAGATGTTAAAGGCAATGGATTATAGCAATAGCTACTGGTTGTTTTTTTTACTTGTTTGTGCAGGGATTGTATGCTTTTTGCTGTAAATGAGGTGATCGTGGCAAGCAGTTGAAGTTTCTGGCTTCAATTTGCAGTTTAGTAGATCTTTTAGCTTTTGGAAAGAGCTTTGGTTACTCTTGGTAAAAAATTTGGGTGTACTTTTTAATCTCAATGAAATCGTCTTAGTTTTA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261126.1	1.3e-165	serine/threonine-protein kinase PBS1-like
Swissprot	Q9FE20.1	2.3e-154	AvrPphB susceptible protein 1
trEMBL	A0A5P1F0Z8	9.6e-166	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G13160.1	64.80	2e-160	562	PBS1	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G05222	AT5G13160.1	446	129	10	1	429	1	435	64.80	2e-160	562
AfisC4G05222	AT5G18610.2	385	118	3	2	385	3	374	65.71	1e-148	523
AfisC4G05222	AT5G18610.1	385	118	3	2	385	3	374	65.71	1e-148	523

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g174645.t1
Allium fistulosum	AfisC4G05222
Allium sativum	Asa5G04347.1; Asa5G04358.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	100	365	155.5	1.5e-45

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0040007	P	growth
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13430	PBS1; serine/threonine-protein kinase PBS1	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network