result

Gene information

Detail information of AfisC4G06254

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G06254	chr4	1156663171	1156675520	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G06254
ATGTCGAAAGCTAAAAAACCACCTAAATGGCTTGCGTCTCTCCCATTAGCCCCTGAATATTACCCAACCGAGACCGAATTCTCCGATCCCATTGCCTTCATATCTAAAATTGAAAAAGAGGCCTCACAATTTGGCATTTGCAAAATCATACCTCCTCTTCCTAAACCTTCAAAACGATTCGTCTTTTCTAACCTCGGAAAATCAATTTCACCCGCCTCTTCACAAACTCCAAAGTTCACGACTCGTCATCAAGAAATTGGCCAGAGAAGTCAGCCCCATCTTCACAAGCAGCAAGTTTGGCAAAGCGGGGAGTATTATACCTTGGAACAATTTGAGTCCAAGTCCAAAGCTTTCCGAAGAACCCAATTCGAAAGCTTCAAAGAAGTCACGCCCATTTTGGTTGAATCCTTATTTTGGAATGCAGCTTGTGAACAACCAATTTATGTGGAGTATGCTAATGATGTGCCAGGTTCAGGGTTTTCTGTTTACAAGAAAAGTCGAAAGATGGCGACGGAATTGTCTAATAGTCCTTGGAATTTGCAGGCAATTGCAAAATCACCTGGATCATTGACTAGATTTATGATGGATGAGATCCCCGGGGTTACTAGTCCTATGGTTTATATCGGGATGTTGTTTAGTTGGTTTGCCTGGCATATTGAGGATCATGAATTGCATAGTTTGAATTTTTTGCATTTGGGTGCGGCAAAAACTTGGTATGCAGTTCCAGGGGAGTATGCAAGTGAATTGGAGGAGGTAGTTAGAGTGGAAGCGTATGGTGGAGATTACGATCGTTTAGGTAGTTATTTTTTTTTCTTGCTTTCTATTTTTCTAGATGCTTAGTTAATATCATTTTTTTGACTAACTATTAGTATGCTTTCTAGGTAAATCTGATATACATTAAATGCTAATTATCAATTGCATTCTTCATGGTTTATGACATCAGTGTACATTTCTTCATGTGACTTAGAGGTATCTTGAACATTAGCTTGAAGTTGTAGCAAAATGTATGAAGATTACAGTAATGTTTTTATATCCATTTTCTATGATGTTTCATTTCAAAATGCTTGGAATTGATTATGTGCTGAAGTAAAGGATAACCTATGGTTTTCCGTATAGTAGGATAAAGTATGATTTACGGACGTTCAGGGGAAATTTTTAGAATTATAGCACGAACCATCCAAAAACTTCACCTATCACCTTTCAACATTTTACGATGAACTAGTTTATAATTCGTACGAACTACATGGGCAGCCCAGGGCAGTTGTAAATCTTAGCTATACCCTTTAGGATTTAAGTTTTTCTTTTTTTGGGCATTGGGTGTTGAGTGGGTAATTTGTTTGTGGCAGAGGCTTTTACTATGTTGGGTGAGAAGACTACATTGCTCTCCCCTGAAGTGATTGTCAAATCAGGGATTCCTTGTTGTAGGTATAAGCATTGAATTATATCACATTCTATTATTATTTTTGTATCTTTACTAGTTTTCTAGTTTGGTAACTGATGCGATGCTTGTGGTACAGATTGGTGCAACATCCTGGTGAATTTGTTGTGACATTTCCAAAAGCTTACCATGTAGGGTTCAGCCATGGTAAACACTATTTGATGTTTTTTTTCCATGTATGTAAATTTCTTGAGTGATTATACTTGATAATTCATCCATAATTTTACGTACCCTTTAAATAAAGATATGTAGTTCCTCTCAAGTAATTTGACACAGGTGGTATAGTCATGACAAACATGGTAAGACATTTATGTGAGGTGGAGTCTTGGCGCAACGGTTAGGTCATCCACATGATGATCTGGACGCTCAGGCTTGAGTCCGGAAATAGCCTCTTCGCAACGTGAGGGAAAGGCTGCGTATGTTATCGACCTCCCCAGAGCCCACTATCGTGTGGGAGCCTCATGCACTGGGTTCCACCTTTGACTTAACCAAGAACTTTTACACTACCTCTAGTAACTAACCAGCTTGCTTTTTTAGTCTTGGTATAACGTGAAAAGTCGTCACTAATGTACATTAATGCATGTTAGTATATTTCAGTTTTTTCTAACTGGTCACTTTCTTATGATCTAGCTAGTTCCTGTTACATACCCACATCTACTATCCAAAACTAACCATATTCTTTCCACGGATCTGCTAATGAAATGTCATTTGTTGTATGCTACTGATATTCCATTTGCATTTTGTACTTTAGAATCGGCACGTGGTATATGTGAATATTCTCACTATTAGAACCTATGTTATCACAATTCACACTTTATTTGTTGTATTCCGTTTTGGTAAATGAGTTTCGAAATGCAATACATCACTGTTCTGAAACACTATGCGAACACGGTTTGGTACACTAATTTTGATGTTCTGAGACCTCGAATTTAGCATTCCAAAACGTTTAATTTGAATTTCAAAGTGTTGATTTTGATATTTCTTATTTTGACGATTTTAAGTTCAAAATGGGATTTAAATCGTAAATCGCAAAGTTTAAATTTTAAATCGAAAAGAGATTTAAATCGTAAATCGTAGATTCAAATTATTCACATTTTAAGGTTTGTATGCACTTTGAAGTTGATTTTGATTATTGAACTTCTACAGTTGAACTTAAAACTTAATTTTGTCCCTAGTTCCATTTTTATTTTGTTTTAGAAACATTATAATGGGAACTGTGAATCTAAATATGTATATTAAATATGTTAGCATGAGTTGGATATGTTTTTGGCTGTAGCTTTAACCAAGTTTGAATCGGAATATAAATCGGATCGTAAAGGGAGGGATCCGATCTGAATCAGTATTTAAATCGTAAGATTTTAAGATTTTTGACAACAATGTACTATATTAATTTGTATGAAGAAATAATGATTTTCTATTGAAAATATAAAACATCAAGTAATAGTTATTTCCTACTGAAAACATAAATAAATAATGAAGGATGATTTCAAATTAGCATTAGAAAAACTAAATGTCTTGTATCTGTGTTATTTTAACTCTCAATTATTATAATAATGTAAAGTAACATACATATGCTTATGAACTCTCCATTTATACTCATATTCTTCTCGTTTTACATAACGTTATTTTAACAGATACTTCATAACGTCTTGTTTTCAAATGTTCTCGTTTTTCACATAATTTTTTCAAAATAACTAGTACTTTAAAGCATGATATTTGGGAAAAGAAAAAACATTGACGGTAATGATACTGTATTTGAAGAAGATAATGTTGTATCAAGGAATTGTTCCAACTTCAACGTTCATGCAACAGGAAGGGTCATCATCAAGAATTGACAAAAGAAAACATAATGTGACTTTGGTATAATTTTCAACTACTTAAACTATAAAAAAGAATGTAAAGAAATTGATGTTAGCACTTATGGAACAATATTTGAGCATTATGAAGTTTCGTTTAGTTTCAATTGATAAGTTATAATTTGTAACTAATTGGAAATAAACATTAATGGTATTGTCTATTTATAGAGTGACTTTGCTTTGTGTCCATCCATTTGCAGTGGATAACAATATTATATAAGTTTGTATATAAAGTGAGTTTTTTCAAAAATATCCCACGTTCGGTCTAAGCATATTTCACTTCGGCTAAGCGTTCCGGTTAAGCCTACCTATAAAAGTATTGTGTGTCGCAGTACGTAACCGTTTCCGTTCCTTTTTTCGTTTTGCGTATCAAAACATTCCGCGTCCCCGGTAACACAGATTAGAACCTCGAGTTACATAGTATGAGGATACATAGAACAAAATCAGAAATGCAAATGTTATTGCAGAACGTGGTATGTTATGGGTATGCTTAATCGGATCGCTAAGTTGGAACAAAATATATTAAGCTGACATGCAGAGCATTATATAGGAACGTTCTCCCTACGTAGTTCTACACATGTATCTGTTTTTTAACTACCACAAATAGATGTGTGTATGCCATGTAATAAAAACATTCTTGTAACAAACGACTATCATTCACGTCTATTTCAACTAGTTATAAATTATTTTTATAGCAGCTAACATTTTCAAATATTGTAGCCTGGTGTCATGTTCCAATTATATTTACAAGTGAGTCTTTTTTTACAGCTTAAGTTTAAAATTAAAATAATTACACATAATCCGTTTTTCAATATCCTAAATTCACATATTACACTTTTCAAATTGTTAGTAAAAGGTTCCAATCGACAAAATTGATCTTTCAAATTGTTGAAGTCAGCAGTTCTGATTGTCAGAATCAACGTGTCAAATGGCGTGTGTTTCATGTTTCAAATGATGTGTGTATCATAATTAGGAATGCATGTCAAATCAGAATATGGTAGCTAAAGTGTGAATTATATAACCTTGATCATACCCATACCACAACCTAAAAGATTATGAAACTTTGAAAACATGGGTGGTTTTAGTAGATAGCCCTGCGCAATTGCCATATGCATCACAATATCAACGTCACTAGTCATATATATGAATTTTGTGCTATTACTTGTCATTGTGCACAAACAAAACAACAACAACTAAACCATTATTTCCAAACAAGTTGAGGTCGGATAGAGATGGAACCCAAAACTAAATGACAAAGTCAATTTAAAAACCATGATAATAAAAAAATAAAGTAAAATAATTAACTAATAATAAATAAAATAAAAATAAAGATAAACATAAAATAAAAAATAAAAAAATAAAAAAATAAAAAATAAAAATATATGAAGAAATAAAAAAAACCATGATGATGATGATAATAATGATAATAATACTAGCAATAATGATACTAATAGTAATAGGGATCGAAGACCAAACACTACATCTTAGGCTCCTATCCGACATCAGCTCGTGATTTAGGTACGTGGATAACTAACTTTCACACGCTTCTGTCCGATACAAGCTCTTTAGATATATTTCAATCCCTCAAGTCTCTTTTTATTACTTCCTCTCATGTCAACCTTGGTTGACCTCTATTTCTCTTTGAGCATTCGATGCGGTCTATAATTCCAACACGCACATGTGCCGAGGGAGGCCTCTGTTGGAAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK57028.1	4.9e-161	uncharacterized protein A4U43_C10F15830
Swissprot	Q10RP4.2	6.5e-142	Protein PHOTOPERIOD SENSITIVITY 14
trEMBL	A0A5P1E3C6	3.5e-161	JmjC domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G48430.1	52.34	3e-112	402	JMJ12;REF6	relative of early flowering 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G06254	AT3G48430.1	384	154	5	10	366	13	394	52.34	3e-112	402
AfisC4G06254	AT5G04240.1	195	43	0	172	366	259	453	77.95	3e-95	345
AfisC4G06254	AT5G04240.1	177	56	2	8	160	7	183	54.80	7e-50	194

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02375.14	JmjN	Family	18	51	54.6	6.8e-15
PF02373.19	JmjC	Domain	205	324	131.6	1.6e-38

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000792	C	heterochromatin
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0006302	P	double-strand break repair
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009741	P	response to brassinosteroid
GO:0009826	P	unidimensional cell growth
GO:0009908	P	flower development
GO:0045935	P	positive regulation of nucleobase-containing compound metabolic process
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GO:0033169	P	histone H3-K9 demethylation
GO:0035067	P	negative regulation of histone acetylation
GO:0040010	P	positive regulation of growth rate
GO:0044428	C	nuclear part
GO:0045814	P	negative regulation of gene expression, epigenetic
GO:0045815	P	positive regulation of gene expression, epigenetic
GO:0048366	P	leaf development
GO:0048577	P	negative regulation of short-day photoperiodism, flowering
GO:0048579	P	negative regulation of long-day photoperiodism, flowering
GO:0051213	F	dioxygenase activity
GO:0065009	P	regulation of molecular function
GO:0071558	F	histone demethylase activity (H3-K27 specific)

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network