result

Gene information

Detail information of AfisC4G06500

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G06500	chr4	1211542008	1211548239	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G06500
ATGATGGACAAGGTGACTGGCAGAGGTTGGAGGTCGCAAGGTGGCAAGGGCATGCAAAATAGGTGGATAGGCAAGAACGTGAGAGAGATGCCATGAGAAACTATAGCAAAAGGAAGCAAATATCAACAGGCTTGATAATATAACCTTTTACATTGTTATATATCTCTCTGAAAGGTAAAACAGAAATGGTAGGGGAGGAGTATGAATGCAACTTGTATTGTATATTTTATTTTTCAAAATGGAAGAGGTGAGAAAGAGAATAGACGTGAGCAAACGAATAGTGAATGAAAGTAATACTAGTATATTGTATATTTATTTCAGAACGAAGCCAAGAAGGCAGAGAGAAATGAACAACTTATATTTTGAAACTAGTGGGATATAGAAAGTCAAAAGGTGAACTTATGGGAATAGTAACAGTCAAGCACAAATTCAGAGAATTATTAAAAGCAACGTCCATTCATTTTCTGACGGTTGGAACAAATAAATGGTCATTGGGAAACCAAAAGGCTCAAATGGGTACCGATACGGTTAACGGTTACGTAGATTTCACCGCGTACCGGACCTCGAATCACACAAATGGATATACTACAGAGATCAGCACGACGAGACGATCAGAATGGTACATAGATATTAGCGATACGACCATCCTATCAAAATTCGATATTTGCTACCAAACTGCTATAAATTAATCGAAAATAAGATAAACGGAGCTAGAGAAATCCATATTTGATGAAATGAATCATGACGTCTCACTCAAAAAATAGTTTACATTTTTATCATATAAAAATATTCACGTTTCGAAAACATTTTATTTTCATCTAATTAACTGATTATAAATTGAAAATTACACAACAGAATTTACTTTCATATATTCCAATAAAAATTTACCAGTTGCTATATTGAAATAGACATATTTCAAATATCAAATCTCCATTGGAGGATTTTATAATTAAATTTCAAACAAAATTTCAGTTAATTACGTTATAAAAACCGTTAAAATTTACGGATCGTTACACTCTCCCCCACTCAAAACTTTTCGTCCCCCAAAAGGAACGAGGTAGGAGAATATGAACAACCAGAAAGAAAAGATAGATTTGAAATACTTAATACAACAATCAATTTAAAACCATTTAAATTTTATTTGATTTTAAATTGATCGTTATTCAACCAATTTGGATACAATCCATTTTATTCAATCAATAACTATTAATTATAATCATATTTTGTTGATTCAATTTAATGTATTTCAAATGATAGATTTGATTTCAAGTTATTAACTTTGTTACAAAATTTCTTTCAAGACAAAAATTATTTTATTTAACTCATTTATTAAATCTATTTATCTCCAGTTGAATTCTTAGCGGAATTAACTCAACTATTCTTTAGTCCATATTTATTTACTTAAATAGTATTATCCTTTTATTATTTAATTTATTTCACTCACATTATTTATAACATCAATTAAATGTAGGTTAAGTGTATAACATTTATTATAATCACCTAAATTTTTATTCAAGATTTCCTAACAAAATTCATTTTTGACATCTTATTCATTATTGTGTATTATTCAATTGCTTATTCTCATTAACATTTAACTATTTCTAGGTAAGTTATGTTTAAGGTTCTAAGTGTAATTAAATATTTTACAACTTTTCCTTTTATTTACAACATTTATATTAAGCAAAACCCCAGTTTGAACATATTTTTTATTACTTAAATTTCTATTGTATAACCTTTAATTATATTCACATAAACAATTTAACTCTTTGAATATTTCAGTGAGTTATACATTTTTTAGAGTGAAATAAGTGGTATACAAATAAATTTATCCTAGTTTCAAGTTATTTCAAATTCCATTTCTTATTTTAAAGACTTAAATTAGTCAAAATTTTGGTTTGTTTCAATAATTTGAAAACCATCACTTAACACAGAATTCAAGAATACATTTCATGTTTCACTTCGAATCATTTTGAAGTAAATGTATACATATAATATTTTGTATATCAAATTTTACTCAAGAAAATTCAAATCAAATTCGTTTTCTAAACCAAAGTATAGCAAAGCTACTAAGTGGTCTCTCCACTTTGAGACTCGAAAATGAATGTCAATGATGCTGCAGTCATCACCGAAATTATTTTCCAACGACATACGAAGAGAGTACAGACTTAATTATTTTTAAAATTATTTTTTTGAAACAATTTCCATTCGAAAATACTTTCAAATAATATATTCCAAAACTTTAAAAACCAATTTTTTTGAGAATACCGGAAATTAAATTCTCAAATCTTTAATTTAAATTCATTTCATTTCATTTCATATGCAAATCAGATTTATAAACCATGCTTTAAAATGTCATTTCCTTATAATATACAATAATAGTTAATGGTTTAGACATATTAACAAAATAACAAATGAAAATCTAGTATTATTGGTTCTAACAACCAATTTATTTAACTATCTAATTTTAGAAATTTTACTTTTATATGAAATATAATCATACAAAATTTTACAAATTTTGGAAACAATATATTGTGTCAATTTGCTCTGTTCAAGTGTTTTGGAATTCCTATCGATAGCAATAGCCAGACGAATCAATCGAAACCCAAAATTCAAACTTAACAACTCACACAACACAAGATACACTACAAGAAAGTATGTTATTAATAACGCCATTCAATAACGTCTTATTCTAAAGCGTTATTAATTACATTTAATTATTTATTTTTCTTACTTGGTTTGTTCTCTTCTGTATTGACGTAATGCATACTCGGTTCTTTACACACGTAACGCCCCAAAACAAAATTACCCCTCCCAAAATTTACATTTCCCTCTCAAAACACTTAATCGTTCTCGTCTTCTTCCTAAAGCCCTAAATTTTCGTCTCCCTCCTCATCACTCGCCATTGCTCTTAAGCTATCGAGCAATAATAAGAAGGAGAAAGCGAACAGCTTCGATGAGGCTGTAGCGAGAAAGGCGGCCGCAGCGGTTAGTAACGTTCATGGTCAGGTGTTTGCGTTCGGGCAGCACCCGCTTCCCCGGCCCGTGTCGTCGCCGTTGCCTTCGGTGCTGCGGGAAGTTTCGGCTGCGGGTTCGGTATCTACGTCCGAGTCCAGTGTTAGTTCTTCTGGTTCTGATGAGACTCCCAATCTTACCTTTTATAGGTGATCATTCTTACTATTCTGTTTTTTATAATTTAGGGTTTTGGGTTATTTGGTAAACTGTTAAAATTTTGGGGTTAGCAAGTTGTTTCGATGAGCAGTAGATAGTTTATGGTTAAGAAGTGCATGATTTGTGTAATATTTTTTTGTTCTGTTAACAACGATACACTTATTTTGGTTTCGGGGATTGCAAGTTGTTGCCGTTTGATTTGAAAAGGACTGGATTTGCATCAACCTATGATTGTTCGGCTGTTGCTTCTGTTTAATCACATCGTGCATGTACAGTTGGATTACTTAGAGCCTGTTTGACAACAATCTATTTTGAAACTTCTTAAATCAAGTTTTGAATGGTAGTAGTTTTAAACAACTCCTCATAAATGAGTGTTTGTATGTAATTTGATTTTAAGTAATAAATGTTAGATCAAAATTGCTTATGAAATTGCATCATAAGCAACAACCAGTTGCTTCTTAGATTTCTTCTTATTAGCTAATTTTGCAAGCTACTTATAAGCGGTTCCACCAATAAGAAGTTTGCATACACTAAAAGGGAATTAAGTTACTTGCAAGTAGTTTTGAAATTGCCAAGCATGTTCGTAGAAGCCACTTCGTAACTTCATGAACAAATTTTTAAAGGAAAAACACCATACCTGTATATGTGTCCTAGTCCTAGGCTCCTAGAATTAATTCACCCATAGAATTTCAAATATAGATAAGGACTTAAGTTGATCTTAATCTTAGTTTGTTTTACAATTTTAATGGTTATGTTAGATTTGCTGCTGCAATCAATGTACCGAAGGGCGATAATGGTTTAGCATCCAAGCATCCAAGAAGCATATCTGTATCTCCGAGAAAGGATTATAATCACCCAACCACCTCAGAAAATATTTTCAATTCAGTACATGCTATGAGAGGTAATAAACGCCCTACTTCTCCTATGCATCCAAAATCTATTGGTGTATGCCCTGGTTCTCCAAATATGTGCCCAGGTTCTCCAAAACTAAGGTGTGACGATATGAAGAGCCCTCCTCATCCACTCCCTCTTCCTCCAGGCTCACCCGGGTCTTCTTCGAGGTCAAATACTAATACTCAGTTGAGTCCTTCATAATGGAAAAAAGGGAAGTTGTTAGGAAGGGGAACTTTTGGTCATGTGTATACAGGGTTTAATAGGTACCGTTTTTATTTTGTTCTGCATTTCATTGGTTAGTTTTGTATCAAGTTAGTGTTTGTATATTAATTTTTTGAGCATTGAACTTTTTAAACCACTATAAAATATAGCTTCAAACTGCACTAATATGACACTCTAACACACTGTATAGATACATCCTTCTCCCATACCAAAAAGTTCTTCGTAGTTTCTGATGGAGGGGACAGTTTGTGCATATAGTCCGTATAAACTTTGTCAACATTAATTTTACTGTTCCACTATAATCACAGTAATGCAAACTGATAAAAACGATCTGGTTTTATTGTTTGCTGTAGAGAAAACGGGCAGATGTGTGCCATTAAGGAGGTCAAGGTTATTTCAGATGATTCAAATTCAAAAGAATGTCTCAGGCAATTAAACCAGCTAAGTTATTTTGTTATCTTGGGGGTGTGATATTGGATTTTCATGTCCAAAATTGAAAGTCTTGTTTGATTGACATTCTTTATGCAATTTTTACATAGGAAATAACATTGTCAGTGTACCTTGAATACGTTTAACCAATCACAAATTTCTTGATACAGGCCGATGACACACTGTCAGTGTACCTTGAATACGTTTCAGGTGGATCCATTGACAAATTACTTCAGGATAATGGTCCTTTTAGGGAGCCTGTAATACGTAGTTATGTTAGGCAAATACTTTCAGGACTTGCATATTTACATAGGAGAAATACCATACATAGGTATTACATTGCTTCCGTTGAGGTTACATAAAAAAAGGTTAACATTGTTCCTCAAGTTAACATTCACGAGTGATTTTTGCAGGGATATTAAAGGAGCAAACATACTTGTCGACCCTAATGGTGAAGTTAAGCTTGCTGATTTTGGCATGGCCAAACATGTAAGCTGTCTTTTTTTGTTATTTTTCAGGGATAATTTGGATATTTTTTGTACTTCTGAGAAAATATGCATTGATTCCGCCACACGCTTAGGGTAATTACCAAAGACATGTATGCCAACTTGTGACATTTGCTTTCAATTAAATGCCATGCCACACGACTATCATTTGGGCATATATCATCACCTTTTATTGTTTAATTACAACTCAATAACAACCTTTACCATCTGATATCTCACTATAATATCCTTTAACAATTTAGCCAAACTCTGCATTATGACATAGGCATTTAGTGCCATTACTACTACCTGTCCAGTTGTGCTCATTGCTATGTTGCAAGCCCAATTTAGAAGACCTGGTAATAATGTGTGTAAAAGTTAAAATGTTATGGCGTCTATGAATCCATAATTCGAAGTAAAATAGCTTCATAATTAACAGTTGAATACAAAATATTTTTCTTTACAGTATTATAAGCTTTAATGATAAGTTGATAACTACGCATACACTTTCTGAGGGATTTGTTTCACCTTCTTTGCCATAAGAATGATGAAAATTTCGAATGAGTATATTCCCTAAATTATTTACAATTTTATTTTCTCCTTCCAATAATTTACTCCTTAACCTTCTTTTTTCTACTGCTTCCTGCCGATTTTACAATTTTGAGAGAGTATTTTCCTAATTTGTTATTTTGATTGCTAGCCTAGATCATAGAAAATGTATTTAATAAATGGCATAACTGTCATAATATTGTCCATATAAAAAGTTTTTAGTGGATGCTAATTGTCCGCTTAAATCATGAATGAGTGTAAATAAGTTAGAGGTCTGTGTTCCTTACATGCACAGTATGTTACTTTCCATTGGTCAAGATTTACTACTTAGTTGTTATAATCCTTTTAAAATGAAGCCACAAATATACTCTTTTTGTTAATTACATCGTGTGAACACGTGCAGATGTAGAAAAAAATAAGGGCTTGCATTTGATAATATTGTCGGTTCTTTTGTTTAGGAAAATAATCTTATTGGGCTATGCTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_029122490.1	4.1e-60	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 isoform X2
Swissprot	F4HRJ4.1	3.6e-45	MAP3K alpha protein kinase
trEMBL	A0A8N4IFL3	2.9e-60	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 isoform X2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G53570.1	68.99	2e-46	183	MAP3KA;MAPKKK3	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G06500	AT1G53570.3	129	27	1	189	304	235	363	68.99	2e-46	183
AfisC4G06500	AT1G53570.2	129	27	1	189	304	235	363	68.99	2e-46	183
AfisC4G06500	AT1G53570.1	129	27	1	189	304	235	363	68.99	2e-46	183

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	188	306	90.0	1.5e-25

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000749	P	response to pheromone involved in conjugation with cellular fusion
GO:0000919	P	cell plate assembly
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004702	F	receptor signaling protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009524	C	phragmoplast
GO:0009793	P	embryo development ending in seed dormancy
GO:0010098	P	suspensor development
GO:0010103	P	stomatal complex morphogenesis
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0022622	P	root system development
GO:0032005	P	signal transduction involved in conjugation with cellular fusion
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0043622	P	cortical microtubule organization
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048046	C	apoplast
GO:0048522	P	positive regulation of cellular process
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1902065	P	response to L-glutamate
GO:2000071	P	regulation of defense response by callose deposition

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network