result

Gene information

Detail information of AfisC4G06593

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G06593	chr4	1231552267	1231570375	+

Sequences

CDS

>AfisC4G06593
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Protein

Gene

>AfisC4G06593
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020247678.1	2.9e-73	protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 2-like
Swissprot	B8B5N8.1	3.5e-47	Protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 2
trEMBL	A0A5P1E5S5	2.1e-73	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G28610.1	46.32	1e-63	240	AtPHR1;PHR1	phosphate starvation response 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G06593	AT4G28610.1	326	136	10	16	315	55	367	46.32	1e-63	240
AfisC4G06593	AT5G29000.3	254	101	7	78	314	82	331	51.97	3e-59	226
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	176	227	41.7	8.4e-11
PF14379.3	Myb_CC_LHEQLE	Family	259	306	89.0	1e-25

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003904	F	deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009567	P	double fertilization forming a zygote and endosperm
GO:0009650	P	UV protection
GO:0010628	P	positive regulation of gene expression
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network