result

Gene information

Detail information of AfisC4G07199

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G07199	chr4	1359662710	1359672345	+

Sequences

CDS

>AfisC4G07199
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Protein

Gene

>AfisC4G07199
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020276881.1	1.7e-185	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610 isoform X2
Swissprot	F4ICB6.1	1.3e-142	Protein IMPAIRED IN BABA-INDUCED STERILITY 1
trEMBL	A0A1D1YBQ0	2.9e-163	Putative serine/threonine-protein kinase At1g54610 (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G18670.1	53.01	1e-151	533	IBS1	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G07199	AT1G18670.1	532	198	11	1	482	175	704	53.01	1e-151	533
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	2	241	188.1	1.7e-55

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0002944	C	cyclin K-CDK12 complex
GO:0002945	C	cyclin K-CDK13 complex
GO:0009615	P	response to virus
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GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005794	C	Golgi apparatus
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GO:0007346	P	regulation of mitotic cell cycle
GO:0008353	F	RNA polymerase II carboxy-terminal domain kinase activity
GO:0016607	C	nuclear speck
GO:0019908	C	nuclear cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex
GO:0030097	P	hemopoiesis
GO:0030332	F	cyclin binding
GO:0043405	P	regulation of MAP kinase activity
GO:0043410	P	positive regulation of MAPK cascade
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GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048366	P	leaf development
GO:0070816	P	phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain
GO:0097472	F	cyclin-dependent protein kinase activity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network