result

Gene information

Detail information of AfisC5G00747

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G00747	chr5	138084780	138094384	-

Sequences

CDS

>AfisC5G00747
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Protein

>AfisC5G00747
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Gene

>AfisC5G00747
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK59598.1	1.6e-259	uncharacterized protein A4U43_C08F8110
Swissprot	Q05609.1	1.0e-48	Protein CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE1
trEMBL	A0A8B9AA34	6.3e-242	uncharacterized protein LOC120110830 isoform X2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G46920.1	65.70	5e-159	559		Protein kinase superfamily protein with octicosapeptide/Phox/Bem1p domain

>>>Show top 3 blast result

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AfisC5G00747	AT3G46920.1	449	107	10	552	987	752	1166	65.70	5e-159	559
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g436249.t1
Allium fistulosum	AfisC5G00747
Allium sativum	Asa0G01949.1; Asa5G03034.1; Asa5G03035.1
Arabidopsis thaliana	AT3G46920.1
Oryza sativa	LOC_Os06g08280.1; LOC_Os06g43840.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00564.21	PB1	Domain	37	123	67.0	9.4e-19
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	711	972	203.8	2.6e-60

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0002831	P	regulation of response to biotic stimulus
GO:0005829	C	cytosol
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GO:0031347	P	regulation of defense response
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GO:0044093	P	positive regulation of molecular function
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GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0048518	P	positive regulation of biological process
GO:0060255	P	regulation of macromolecule metabolic process
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
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GO:0098542	P	defense response to other organism
GO:1902531	P	regulation of intracellular signal transduction
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GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network