result

Gene information

Detail information of AfisC5G00879

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G00879	chr5	165641079	165656925	+

Sequences

CDS

>AfisC5G00879
ATGGCGGAAAACGCTACTGCCAAAAAGCCTCTCAGCCTCAACGAACGCCATCAGCTCCTTCTTCAAGGTCTCTCTCGTTCCCGCACTTCCGAACCCAACACTGATAATAGCACAGAATCAAAGAATCGCGACGTCAAAGTTCAAATTCAAGGTAGGCGCCGCCTCTGCAAAATACAGTCCACATCAGACGAGGATGAAACAAAAAACAACGACTTTAACAATCTCGATGATCTGGCTGATTCCCCGGAGAAAAAGAGTGAGAATATCCTGGATATCATGGACGATTTGAGTTCTAGACTAGGGTCTTTATCTGTTGAGAAGCCCAAGGCAAAGCCTAGAGCTCCTGTTAATATTCCAGAAACTTTGTCCGAGTTCAAGAGTGCCTCATCCTCGCTTTCTCCATCTTCAGATGAGAAGGGTAAGGATGTAGTTTCAGATGATTGTGTTGTTTTGGACGACGACGACAAGGAAGATGAATACAAGGACTGTGTTATCTTAAATGACAACAACGAGGAAGAGAAAGAGGTGGACGACAAAAATAAGGAAGATATCGTGATAAATTGGATTGGGAATACAAATACGAGGAAAAAATATGTGCTTCCAGGAAATACTGCAAAGATGTTGTACCCACATCAAAGAGATGGGCTGCAGTGGTTCTGGACATTACATTGTGCAGGAACTGGTGGGATTTTAGGGGATGATATGGGTTTGGGAAAGACAATGCAGGTTGCTGCATTCTTATCTGGACTATTTCATTCTTGGCTAATCATGAGAGTAATGATAGTTGCCCCAAAAACTCTTATTGCTCATTGGGTTAAGGAACTATCGGTTGTAGGTCTTTCAAATAAAATAAGAGACTACTCTGGGGCTTCTCAAAAAGTTCGTGATCATGAACTTCAGTACACATTTCAGGATGGTGGCATTCTTCTTACAACCTACGATATTGTCCGGAATAATTACAAATCATTACGAGGTAGCCATTATCAGGATCTTTATGACAACATAAATGAAGAAGACAACTTGTGGGACTACATCGTGCTTGATGAGGGACATATCATTAAAAATCCTAAGACACAAAGGGCACAAGCCTTATTCGAGATACCATGTGCTCATCGCGTTATCATAAGTGGCACACCCATACAAAATAATCTTAAGGAACTTTGGGCTCTGTTTTACTTCTGTTGCCCATCTGTCTTGGGTGACAAGGATGAGTTCAAATACAAATATGAAAGTAAGATCCTCCGTGGGAATGATAAGCATGCTACTAATCGGGAAAAATACGTTGGATCTACGCTTGCAAAGGAGTTACGAGAGCGCATAAAGCCATATTTTTTGCGACGTTTAAAGAGTGAGGTGTTTGGTGAAGATGATTCAACTAACGTTAAACTGTCAAAAAAGAACGAGTTGATTGTCTGGCTGAGGTTGACCAAGTCTCAGAGACAACTTTATGAAGCTTTTTTGAAAAGTGATTGGGTCCATTCTTCTCTGGATGGTGGCTCGCCATTAGCTGCATTAACGATATTGAAGAAAATTTGTGACCATCCACTTCTTCTAACCAAAAAAGCTGCTGAAGGTGTGCTGGAAGGAATGGATTCAATGTTAAATCATGAGGAACTTGGTTTGGTTGAAGAAATGGCAAAAAAGTTGGCTAATAATAATAGCAATGAGCTTCAACAATTGGATCACAACGAGTCTTGCAAAATATGCTTCATAATGACTTTGCTTGATAATTTGATCGCCGAGGGGCACACTGTATTAATCTTCTCTCAAACACGGAAAATGTTGAATCTTATCCAGGAAGCAATCATTGCTGCAGGATATAGGTTTTTGCGGATTGATGGCACAACAAAAATTGCAGACAGAGAAAGCATAGTGAAGGATTTTCAAGAGGGACGTGGAGCTCCTATATTTTTGTTGACCTCACAAGTTGGTGGACTTGGTCTTACTCTAACAAAAGCAGATCGTGTTATTGTGGTTGATCCAGCATGGAACCCAAGTATGGACAACCAAAGTGTTGATCGTGCCTATCGAATCGGACAGGAGAAGGATGTCATTGTATATCGACTGATGACGTGCGGAACAATTGAAGAAAAGATATATAAAATGCAGGTGTTTAAGGGCGGTCTATTTAGAACTGCAACAGAGCATAAAGAACAAACAAGATACTTCAGCCAGAAGGATATGCATGAGGTCTTCAGCTTGCCAGAACAAGGATTTGATATTTCTATTACTCAGCAGCAATTGCACGAAGAGCACGGCCAGCAGCAAGATATGGAACCGAGTTTGGAAAGCCATATAGAATTTCTGGAGAGACAGGGTATTGCAGGTGTTAGTCACCATAGTCTGCTCTTTTCCAAGAATGCCACCGTGTCATATGTACCTGATGATACTGAGCAGCCAAGCAAGTCAACTAATGTAATGCACAGAAATTATAATGCTGGATCATCTACTGAATTAGCTGTTGATGGTGCCAAATTTGCTGTAAAACCAAAAGAGTTCATCTCAAGAGAATATAAACCGAAACATGATGATGAAAACAGCAGCCCTGAAAGCATCAGAGATAAAATAAGACGCCTCTCAGAAACTTTAGCTAACGAGTCGTTAATTTTAAGATTGCCGGATCAAGGTGCAAAGATTAAGGCACAAATAGCTGAACTGAATGCAAAGCTCGATGCTCTCAAATATGCTTCCAAGTTAAAGGAAAACGAAGTTATTGATGTGGATGGTCTTACCAAAGACTTTGGAGATGTGATTTCAGTTTGA

Protein

Gene

>AfisC5G00879
AAACAAACAACTTTTGGTAAATACAATCGATCATTAAATTGAATTTCACCTTTTGCGACCCGTTATAAATTCAAATCAATTTCTCAACCGGGCTACCTCATTCTTTCGCTATTCTGAGTTCAAAATAAAACCCTAAAGCACAAATCCCCAAAAGTTGATCCATCTTTTTCAAGCTCTTTAATGGCGGAAAACGCTACTGCCAAAAAGCCTCTCAGCCTCAACGAACGCCATCAGCTCCTTCTTCAAGGTCTCTCTCGTTCCCGCACTTCCGAACCCAACACTGATAATAGCACAGGTATGCTTGCATTCTTATTCCTAACCGTAATCGATCCTACAATCAAAACCCTGCAAATCGTTTTCTTTTTGTTCAGAATCAAAGAATCGCGACGTCAAAGTTCAAATTCAAGGTAGGCGCCGCCTCTGCAAAATACAGTCCACATCAGACGAGGATGAAACAAAAAACAACGACTTTAACAATCTCGATGATCTGGCTGATTCCCCGGAGAAAAAGAGTGAGAATATCCTGGATATCATGGACGATTTGAGTTCTAGACTAGGGTCTTTATCTGTTGAGAAGCCCAAGGCAAAGCCTAGAGCTCCTGTTAATATTCCAGAAACTTTGTCCGAGTTCAAGAGTGCCTCATCCTCGCTTTCTCCATCTTCAGATGAGAAGGGTAAGGATGTAGTTTCAGATGATTGTGTTGTTTTGGACGACGACGACAAGGAAGATGAATACAAGGACTGTGTTATCTTAAATGACAACAACGAGGAAGAGAAAGAGGTGGACGACAAAAATAAGGAAGATATCGTGATAAATTGGATTGGGAATACAAATACGAGGAAAAAATATGTGCTTCCAGGAAATACTGCAAAGATGTTGTACCCACATCAAAGAGATGGGCTGCAGTGGTTCTGGACATTACATTGTGCAGGAACTGGTGGGATTTTAGGGGATGATATGGGTTTGGGAAAGACAATGCAGGTACATTTGGTACCATAGTCTATTCATTTAAAGTTTTTTTATTTTTATTTTTTTCAAATATACTATGGGTTGAGTTTATCTTTACTTGAAAATTGAAGCTCAAATGTTTTACTTGATGACAGTAAAGCTAAATTGTGTATATATTAGCGGTATTTTTCTTTCTTTTCTCAAAATTTGATAAGCTTTACCACATTCATGTCACATCTATGGAAGTTTAAAATTTGTTGAGCTCATTTTGTTTATAAACATGTGATCTATAGTATAAATCGCATGGATATCCAATGCTAATGTGGAGATCTTGTCTTATTTTGTTGAAGATCAGCATATGTATTTATCAACGCATATTATTCAACTTACAGCTATTTTCTATAAATCACAAAGCATTAACCTTTTATTTTCATTTTACATTTCAGCGAACGTAGCAAAATGCTCCCAAATGTTGGAATCTATTCTGCAATGACTAAAGCAAAACTAAAATAAATTTCACTGTTTAATTGATAACACATGCTACTAAGGAAACTGGTTCTGTAACTTTTCTTTTTTAGTTTCAACTTATCAACTTTATTTTCTAGGTTGCTGCATTCTTATCTGGACTATTTCATTCTTGGCTAATCATGAGAGTAATGATAGTTGCCCCAAAAACTCTTATTGCTCATTGGGTTAAGGAACTATCGGTTGTAGGTCTTTCAAATAAAATAAGAGAGTAAGGCTCATGTTTTGCATTAATAACGTAATTAATAAACTATAGTTACATACATTGGGAAATCCTTTATTTTGTTATAACTGTTTATTCATGCAGCTACTCTGGGGCTTCTCAAAAAGTTCGTGATCATGAACTTCAGTACACATTTCAGGTATATCCCTTTTATTTTGTTACAAATATCTGGTTATTATAAATTCAGCAGCCTATTTTTTGCAACATTACATTCTACAGACATAATTTATTGTGACATTAATAGGATGGTGGCATTCTTCTTACAACCTACGATATTGTCCGGAATAATTACAAATCATTACGAGGTAGCCATTATCAGGATCTTTATGACAACATAAATGAAGAAGACAACTTGTGGGACTACATCGTGCTTGATGAGGTTGATTTTTGCTTCATTGTCCATTTAATTTGCAATATTGATTTGCACGTTGTTTCTGATACTTTCCCCCACCATTTTCTGTTAAGTGTCACTTATTTAGGAAATAAATTCGCAAAAAGATAGTCTATTCAAATTGCATGAATTGTCTTCGAACTACAGTGTACTATATACAATAATCGTTTGAACTAGATTAGATTTTATCTATTGTAATTTATAAAATATATGGTTTTACCTATAAGTTTGTAGCTCATAAAGTATTTTCTTAATGCTTTACCGTCAAAATTTGTTTCTACCTGAAAGAATGATCATCAATGTGTGATTATTATTCGTTTAATATAGTGACCATGATCGGAACATGTCATTTTTTGTAAAATTCAATTGCATCCAAAATATTTGATAGTATCATCTAAACTCATGTTGTGAGTGACAGAATGAAATTTAATGTGACACTGAAAATAGTTGTCTGAATTTATTACTGGTTAACCAAGTGATTATTTGGCTTTTAAATTTTAATCTCTAACAGCTCCGATAGTCATTGCCAACAAATAAATCTTGGCCAGCTAGTATGTTTTTCCCCCTTCCGCAACAATTTTTTTTGAAGAATATATCATATATGCGATCAAGTTTGATATTTTAATAAAAAATAGGTAACCTGCTTATGAAGCCCACTCCATATTTGTGAGCTATACATGATGTAACTTTTCTCCATGGCACCTTAACATATATTTATCAAATATTTTCAGCTAACTATTATCTGTTTAAAGTTTAGACATTGCTCAAATATTAATCTGGTAATTCCTATAGTTTTGCCAAAGAAGATTTCTATCCAAAGTTTATCCCCGGTACCGATAATTTTGTATTATAATTCATTGAAATTAATGCAGGGACATATCATTAAAAATCCTAAGACACAAAGGGCACAAGCCTTATTCGAGATACCATGTGCTCATCGCGTTATCATAAGTGGCACACCCATACAAAATAATCTTAAGGTGGATATAATTTATCAGATAGTATTATAATATTCCTCCCTGATATGTTCTTTAAGACTTATAGTAAGTCTAATTATTTTTACAGGAACTTTGGGCTCTGTTTTACTTCTGTTGCCCATCTGTCTTGGGTGACAAGGATGAGTGGGCACTTCTCCTTTTATTTTGATGACTTTGGATCATCTTTTTCTTGGACTAAAAAAACATCATGCTTTTCATTTTTGCAGGTTCAAATACAAATATGAAAGTAAGATCCTCCGTGGGAATGATAAGCATGCTACTAATCGGGAAAAATACGTTGGATCTACGCTTGCAAAGGTTTTCACTTAAACTTGAATTTCATGGTAGTGAATTATATATGTTGCCTAGCTAACCTTTGTGCCAGGTTAGTTGCAATCCAAGTTTAGTTGTATTATCGGTATTTAGAGTTCTATTTCGTAGAAAGTCTCAAAACACGCTAGGCATTATTATGCTGGATTTCACTCAAATATTCATTAAGGTCACAGTTTTTATTGAAACTAGAGCGTAGAATTTATAACTCGATATACATAACCAATTATTTCATATAGCAGAGTTTGCAAATTAATGGAAAGCTTTTACATTTATTTTTTGCTTAGTTTGTGTTACTGCAAAAAAGTATTCTCCAAAATTTTCATGCTAGGTTGGTTACAGTGGAGATTTAGTTAGATAATAAGATGCTATGGTATTACCAAGGAATTTACAACCCTTTCTTTCAGACTGTTATTTTTGGTGGAAGAAGATTGAAATTTTTTGTCTAAACTATTTCATTTAGCATTTTTCATTTTGGAGTTTGCAAAGGAACATTAAATGCTTCAGATTCACTTTGTTAGTCACAGCTACTTAAGCTTCATCTGGAATAATAACAAGAACTACAGCAACGCCAATAAAATTGCTCTGTTTAACCAACAGTCCATTGTCTTTGATATAGCTAATTTTTTAGTCTTTTGCATCGGTGATAATTTACACCTATTGCTCTTTCAATGTTATCATAAATAAGTTACACCTATAGCTCCATTGGTAGACAAAGCGATGACTTTGTTTTAATTGTAGGAGTTACGAGAGCGCATAAAGCCATATTTTTTGCGACGTTTAAAGAGTGAGGTGTTTGGTGAAGATGATTCAACTAACGTTAAACTGTCAAAAAAGAACGAGTTGATTGTCTGGCTGAGGTTGACCAAGTCTCAGGTATTTCTTGTCTTGATTGTCATTTATTGTGATATTGCATTTGTGCAGTATATTATTCTAAATTGAATTTTAAAAAGGCAACCTTTATTTTGGGCTTTGGATACAGAGACAACTTTATGAAGCTTTTTTGAAAAGTGATTGGGTCCATTCTTCTCTGGATGGTGGCTCGCCATTAGCTGCATTAACGGTATGTTTCGTTCAAAGTTCAAACGTTAAAATATATAGGCTGATAGCCTGATCGGTATTTTTATTCATAACTTATTGAATTTACTGTTAGTAATATGGCATGAAAACTTGACTTCTTTCCTCTGAGGTTATATTACTAATTTGTTGTTTTCTAGCCACATCATTATTTTTCTTTGGAATTAGTGTAATTTGATCATTAAATATTCTGTTTGTCATTTGTTTTGTTTATGAGATTAAATTTACCAAACATTCTCCATTGCTGAAGGTATTCTCGACTGTCATTTTAGAGTTTTCCTATTCAAACGTAAATGGTATTCTAGACCATTTTTTAAAACTTTTATCCTTGCTCACATTTATACTTTATTGCAACCGTGAATTTGTGCTGTATTACAGCTGTGAAGTGCATGTTCACCATAGTAAATACGGTTCACTCCCCGAGGGATATACTTATTACTTCATTCTAATCTTTTAGATATTGAAGAAAATTTGTGACCATCCACTTCTTCTAACCAAAAAAGCTGCTGAAGGTGTGCTGGAAGGAATGGATTCAATGTTAAATCATGAGGAACTTGGTTTGGTTGAAGAAATGGCAAAAAAGTTGGCTAATAATAATAGCAATGAGCTTCAACAATTGGATCACAACGAGTCTTGCAAAATATGCTTCATAATGACTTTGCTTGTCAGATTACTATTCTTATTTTCCATAAGCAGCACGGAAGCCTAAAAATTCAGATGCTAACCTTTTTCTATAAACAGGATAATTTGATCGCCGAGGGGCACACTGTATTAATCTTCTCTCAAACACGGAAAATGTTGAATCTTATCCAGGTATTATTTTGCCTCAATATGCATGCTTGTTACATATTCATGTAAAGAAAAAACATTTCAGTTATTAACTAATTGGTTAGGCACTATTCTATCAGTATAACTTTTTTATGAATCCCAGTCATAAATGAACCAAGAACTCCTTTTATTTAACTACAAGACTGGATACAGATCAAAATCCGATCCATTGACACGCCTCTGCATTGGGGTACTTGCATATTAAATTATGAATAAAAAATACAATGGATAGATAAACTAGACAAGCTTAAACTTGGTTGAGTGTACTATAGGGGTATGGAATTTTTCGTTGCTGTGCATCAGGTACAAGTTATTGACAAGGGTTATGGCGATTTTTAATGTTAGAAATTTGAAGTTTGATGGATCTTTCTTTATACATTTCATTTTGGGTTTTGTAATTTCTGTTAATTTACTACTGGTACACACATTTTATTTCTGGTTGAATGGGCATTAGCATGAATAAATCAATCAAGTTCATCTCCATGGCTTTCCACATCAAAACAGTAGATTACTTTGCTGTTGGTTGTTCACTCTCATACGTGGAGGAATTTTCTTTCTTTCTTTTCGTACTCATAGGTTGATGTGTCATTTTGTACATACCTGAAAGGTCTTACTTGACTTAGAGCTGAATACTGGTTCCCACACGTGTACACAAATGTATAAAGTAACTGCCGCATTCACACACATACAAAATTTCTGAAATAGTCTCCTCGACTAAAATATGTACATTTCTACAATCTCTGTACATGCTCTTCGGAAGCCGAACTCACCAGTATGGATTCTAGTTGTGTCTAGGACAAAGAAACATATTTGATTAATCCAAATAAACACTGTCGATTCCTTATATTATTATTATTCAACAGAACCAAAAGCCTTCTCATGTCCTTTGGATTACTGGACCTTCATTTTGTTATGTTCTATTTGTTTTTGCATCTGTTCTGTAGGAAGCAATCATTGCTGCAGGATATAGGTTTTTGCGGATTGATGGCACAACAAAAATTGCAGACAGAGAAAGCATAGTGAAGGTCCATATCATTTGCAATCTTATATTTCAATCAATTGAGACGATTTAATCAATACTGTACAAATTGTATTTTCTTTTCAGGATTTTCAAGAGGGACGTGGAGCTCCTATATTTTTGTTGACCTCACAAGTTGGTGGACTTGGTCTTACTCTAACAAAAGCAGATCGTGTTATTGTGGTTGATCCAGCATGGAACCCAAGGTTAGAGGAATTTAAAAAAATGATCTGTGGCATCTAGATAGCTCAGTCACATAGCTGCAAATGTTTTTTTAACCTGATGCAAATACACGCATGTATGTTATTTCCTTTGCCTTCAGGTTGATGTGCAGTGCTAATAATACTGATAATCAATGTCCCATATGATATTCATGCGCAAGAAAGTTTACCATTCAGCTTTGTTTCCAAGCAAATTTTTAGAAATTTACACATCCCATTCAGTTGCTAACATTTGTAAATTTAATAGTTTGTCCATATATTTACTGTCTTTTTAGTTATTTCTGCTAAATTACATATTGTGGGTACATGCATACGTTTGATATGTTAGCTTTAACGTTATTTGATTTTTTTTTTTTGCATAGTATGGACAACCAAAGTGTTGATCGTGCCTATCGAATCGGACAGGAGAAGGATGTCATTGTATATCGACTGATGACGTGCGGAACAATTGAAGAAAAGATATATAAAATGCAGGTATGAAAGTTTGTAACAAATCTAATGTAGAAATATGTCTAGTTATTTGAATAATCTGCTCTAATTACCTATTTAGTTGCTAAACATCCAAAAACCATGTAATTTGGTATTTGTATAAACTGCTCCACATATCCAAAAAATACGTGTTCTCGGAGTGTAACATGATTCAAATGAGTTATATCCATTGTTAGTGAATTGAGAAAATGTTATATTTGTTGGAAAAGCTCTCATTATTTAGTAGTCAGATGGGAACGCTTGTCAATATGAATCAGTTCAAACAAGAAAAACAAATTATTCAGAGTAGGTCATAAAGATCATAGCGCACAAAACTAATTATTCAATTAGAAATAACAAATATAAACACACATGCGCGCAAACCAAATTATTCAATTAGAAAATAGAAGCATAAGTTCGCCCTCCCCCTAAACACACATACGCGCGCGCGCACACACTCTCTCTCTTCGACAGCTTTATTTAGCCATTAAGTATACCTGCCATAGTTTGATTTTGTCCAAAAAAAATGGTTCTCTTTATAGCTATTGCACTCAAGAACCAATTGTTAAAACAATGGCCTATTTTAAAAGCAATTTATAATTCATCCATGTAAAATTGGCAATGCAATAGGTGGACCTCATGCGACAATTGATCTTTGTTGCTTTCGCCATACTTGATACATATTCTCCTTTTCTAACTTCACTTTGTTTAATTTTGGTTCCACCATTTTATAGGAAAATTATGTTGAAAATTTTATATTAATAAATAAACTGACAACCAATCATATACTATTGGTGCATATTTGTCAATCACTAAATTGATTTGGAAAGTGACAATAAGAAATAGACGAGATTGCTCTTAGGTGAAGTGTCGTTATCCATTTTTGTTCCTAAAGTTTTTTTCTTTTCCATTTTTTTTATTGCATGGGGTGATTTAATATTTCTTGTTCCCCATCATCTGACAAAGCAAAGTTAAAATTGGAACCTTTCATACATGAAGATTAGGGAGAAGTGTTCCATTTCTAGTTTTAAGAAGAATAAGGTCTGATAAATTATACCTTGAAGAATAACTCAATCAGATTGTTAGGGGAGAGTTGGTATTGTAGGTGTGTCTGTGACTCTGATTAGGAATAAAAATTTGTCCATCATCTAGTGTGTGATGATAGTTGCAAATTGACTTGATTCCATTGGTTTTTTGTTTTAGGCAGAAGCTTGTAATCATCATATATACAGATTTACAGTGATGATTCACACTGTATAGTGTATACCATACCGCCTGAACTATGAATTTAAAGAATCATAAATCCAGAGTGATATACTTGTTAACACTTTACAAATATTGTTGTATTCCATTTGATCATGCTAAGTTGAAAGTCAAAACTTATGGTTAGAAATTGCGAGCACTTAATGTTCAATGTATGTATGGCAGTTAATTAGATAATAATAGTCACTAGTTAAAGCATATCTATTTTCTTGTAGGTATTGCTACATAACAATGATAATTGGTTATAATGCTATATGAAACTATGAACATTATAACATTAGGTAGATCAGTGTGCCCTTGATAATTATTACTCAGTAAAGTTTTATACCTATATTGGCTTTGTTTAAACATTAGACTGTAAAGTAACTTCGAATAGATAGATGCATAATATATCAATTTTATCATTCATGCGTCATGCCCATGTAACCTATCTTAACATGTTAGTACTCTTGAACAATTCATTTTTTATAGCAGTTGATAGTAATGGTCTTGCATGTACTGTTGTAATTCTTAATGGCATCTAATTTGACCCTTAAAAGCTCTTTACGACCTTTATGTTATGGTGATACTGTAAACAAACTTCTATTTATCTAATTTTGTGCAATTCATTTCTGTTCAACTCAAAACATTTTGTTAATGAATGTGGTAGATACTGTATTTATGTAGACCACATTACTGTTTGGCTAACCTTATTATTTTCATGTTACCTTTTTTGCTTAAAGTTTGGATTGCAAGATTCTTCAAATTCCACAAGGCAAAAAAAAAAAAAAATGCCAAACACCACCTTGTAATTGACTTATGGGTGCTGTGAACTTATGATGCAATTATTTATTTATTTATTGGTTACAGGTGTTTAAGGGCGGTCTATTTAGAACTGCAACAGAGCATAAAGAACAAACAAGATACTTCAGCCAGAAGGTGCGTTCACTCAGTCACTTTATTGTTCATACTATTGTTAAGAACAATGACAATGCAATATTTTTTGGTGTATGTTGTTTCCCCATGTATACCACTTTCATAAAATAATAACAGAAACAAGTTTATTTCAAAACTAATACAAACACAGACATCTTTCTACTACAATGGGACTAAGTTAACAATTTACACTGATGTGATTTTAAATCACCTATTCACGTCAGTGTACATATTTCTTTTCTAAATTACACTGGTGCAATTTTAAGATTGCATTTGTGCAAGTTTTACTTCCTCAAAAAATGTCAGTACTATGTTGCATAACGCCTATGCAATTTTTTATTATTAAATTTCAGCAAATTTGCGCTGGCGTGATTTGAAATCGCACCGCTACAAATTTGCTGACTAAAGAGCCATGGTCATACAAACCTGTTTTTGTAATTAGTTTTAAAACAGGCTTGTTTTTGTTATTGTTTGTTAAAACATGCCTAAATGAAGAATTATCCCCCGGTAACTAGTGTGTAACCCGTGCGTTGCACACGGTAGTGTTGTTAAAAAGTATTATTTATATTTTAATTATTGCTAAAAATATATTTTTATTATGCAATATATATGATAAATTTATTGCGATATATTAATCATAAATTAAAGTGATTTGTGAGGTTCAAATATAAGGTTGAGGGTTCAATACTCGCTAACTACATATCTTTATAAAATTAATGTCCCAACTCAAAAAAATTACAGTTAAAATTGTTCATGCTGTATATAAATAATTTTTGTTATGTGATATGCTATATATTATATGTATATATATAAGCAAATACGTAGCTTCACTATTTTGTTAATATGATTGTTGTATATATATTGAATTATCATCTTTCTTGAAGGATTTATAAATGAATCAATGAACATTAAACAAATTGAATTATTTGAATAATTTGAATCAATGATCGACATAACTAATTAAATAAGGAGATAAATGTAAAATTAAATTAAATTGGGAAGACCTTTTTACAAATTTGTAATTGAGAAGAGTATAGATCTTATGGTTAGGTTATCTGCATGTGAACTTTTTTTGAATCAGACATGAACTTTTATTCATTTTTAAGTTTTCATTTTTAAACAATTTTATCCTTGTAGTTAAACATAGATTTCATGTTCTTATAGAAAGGTCATGCTTACAATTTTAATAGTTACAAAAAATGTTATGTAACATTTGGTTGAGTTATGAGTTGGGTATGATTTGGTAACATGTTGAAGATGAGAACGTTTGTATAATCTAATCTTTGTCGCTTTAATTTGTGCGTTTATATCATAATATTGTAAAATATAAATTTATCTTTTAAAGATTGTTAAAAATGAAATTATATCATGTAATGTATGATATTTTTTAGGATAAATGAATTAGAATAAAAGAGTTACTATTATTTATGTATATACAACTATGTGATGTGATTTATATATCTTCATATATCTGAATAAAGAAGAAATAATTTTATTATTTTTCTCATATACATGAATATTGTATGTATTGAAATCGTCTTATTTTTAGGATTTATTAGATGGATTAATAAATATTAGTTAATCATATTTATTTCAATAGTTTAAATTTTAGATTACACAATTAGTTAAACATATAGATTTAAATTTAAAATATTAAAAATAATCGAGAAAGGTTTCTGAGTAATTGTAAAAAAATTAAATTTTTGGGTATTTGAAGTTAATAGAATTTTACAGTGAAATGTATGATAAATTCATTTAGTAAATAAATTATAGAATATATTTGTTATTGTTATTGATGTGTATGATTTTTATTATGTAATTCATATATATTTGCATCCAAATGAATTTTTTTTACCAATTTGTTATGCGCCTATAATACACATATTGAAAATTTCATCTTTTCGGATTTATTAATAAATATTAGTTGATTAAGTTTATCAATTAGTTTAAATTTTGCACTATGTAATTAATTTAAATGCGTGGACTATGGTGTAAAATTTTGAGAAAGAACCATGAAAAATTTAGAAATAATTGTAGATTCTTTTAATAATAGATATTCAAATGTAAAATAGTGTGAAAAGTTTAATAGGATAATTGCAAAGTAGTAAATGATAGGATTTTGAAAATAAAATATCCACTTATAGAGAATTAAGGAGAACACAAAAAACTCCTAGAATTAATATGAGAGCTTGAAATTCTTCCGCTTTACTATTATTTAATAGATGTCATCTGTGCCAACTACAATCCATATTCAACTAATTTTAGTACAAATATTACAAAAAAAGAAAAATCAATCCATCACCCAAAATGTTAGCACATATCAATAAAGTTGAAAATTTTGGTATTTTACCTTGGGAAAGATAAAGATGACCTGAATAAAAAAATCATTAATATTTGGAAAAATCTTGAGAAGGCTGAACAATTTTTCTTCTTTATGTTTTTTAAATTTTTCCAAGGCTTTTTTACGTGTTCATTTAGAAAAAGACAATTTTGATATATCCTAACTGTGTTCTAATTTTATAATTCCTGAATTCTCTTGTATATTTCCTGAAATTTCTGGTTGATTGAACTTATCGTACAAAATGTTCTTCCTTTTCAGAATTTTGTTGAGTTTATACATATATGTACATTCATAGATGTATTCATACATATATTATAATATACATATATTATTATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTGAAAGTGAGTAATTTTTGGTTCAGAAAGGATAACTGTAAAGGTAGAATAGAATAGCCTTATAAATGTGCCATACAAAAATGACGAAGCCCTTACACACGGTTAATTGCATAAGTCGGTTCGCATTCCTACTATTTTTTCTCTTACTGTTACACACACAGAGGGTAAGGTTTCGCTACACCCCTTTGGCTCGAAATCAAACAAAAAATTATCAATTTTTTATGGACTCAAGATCATCTTAAATTTTTTTGACTAATTTGGATAATCCTAACATATATAAAATATATTTCAAATTGACGGTTAAAATAAACGTTTTAGTGGTTGATATTGACTCAACATTTTGATTTTGAATGCTAGAAGTTTTGGAATGAGCTTATTTTTCGTGGACATGATGTGCATAGTGTAGATTGAACATACCAAAAAATTCATGTGATTTCAAATTGTTTAACTTAATAAGTGTAGGTAGGGTGTAAAATGAGGTGTAGTGAAAGAGTGGATAATTACCCATATACACACACAAAATTCACTAATTGAAATCTCATTAAGGAGGCATTAAAAACACCAATAGAAAAATGTTAGGGCATTATATCTATGGTTTATTGTTGATTTGATTAATGCAATGTTTTAAAATAAGCAGTATTAAGGAATGAACCTCAAAGCAGTTCTCCTTTAAATAATGTACAATTTTGAGTTGTACTGCTCTTATCATTTATATTAATTCCAATAGGATATGCATGAGGTCTTCAGCTTGCCAGAACAAGGATTTGATATTTCTATTACTCAGCAGCAATTGCACGAAGAGCACGGCCAGCAGCAAGATATGTAATGCTCCACTCTATCTTGATTTAGTTATACATGTATTCTGTAACCTCATGTGCACCTAATCATGTCTATGTCATATAGCATAACTAATAATGTTGTTTCACCTAATTCTTATGCATGAATACCACAACTTCACTAGAATTTCAAACATATACAGGAGAAGTATATCATATGTATATTTAATACTACCTTTTGCTGATGCTTGTCCTAAACAATGTCATCTAAGTTCACGTTCTAAACAATTTATGCTGCAAACATGTAATAATATACTTCATAATAACCATCATTTAGCATACTAATAGTATAAATAAATAATCTCAGCGTCTTGCTGATGTATCAATTCAAGTGTTTAATTTGATCAATTTTCCTAGTAGAATAAGCATTGTTTTTGTTCTGTAAGCAGATTAAGATGCGGTTTACATACAACCAGCGCATGTATTTGTCCTGTAAATCCCCAGGCTTAATTGCTGAAAAATAAAGCTTTTTTTTTTTAATTTTAAAAAAGGTCAAGCTATGTGTTGTGTTGATGTAACAGCCTAGGGAAAATATAGTCATACATAGGCTACACATAGTCATAACACGGCATACCCTTTTTGGTCCAGATTGTGCTTGTAACACATTATATATGGACGAATGGCTTGGTATGAGCTACACTCTGGTTTTTACTTGGTCGCAATTGCAATATCTGGATTGACTGTGTTCACGTATCCTAGTTACGAAGTTAAGTTCTTTAATGGTGGTTGCTTTTGCACCTTAGTAAAAATATGTTCTCCATTAATAAATGCATACAAATTTATGATATAAGTATCAAACATTTTAACAAACAAAATTCGCACCTTTGTACAAGTTAAATTTAATATAATACATGTGTTAGTGTGGGTTTGGGACATAGCTTCTTCTAGTAACTTGTAGTAGCTCTGTTCACTAACGTCTGGTTACCCCTTAAGGCTTTTTACTAACACATGGATGTTTTTACTTCAGACAGTTGAATCAATTTATAATTATCTTTTGACATGGGTAGGGCTGTCAACGGATACTTTCGGATACGGATAGTGCCATATCCGTATCCGTATCCGAAATTATTTTCGGATATCAGATCTCCGTAACCGCTTATTTTTCGGATACCGGATATCCGTATCCGCTTAATTTTCGGATACGGACAGATGTCGGATATTTATCCGCTCCGTCCATAATCGATAAATTAAAAGTATGAATGAAAAGGTTTGGATCAATATAAAACAGTTTTTGTACTAATGTTCATAAAAAAACCAAGGAATAAAAAAAGTGATGATAAAACATCGTTTTATATTAATATCCGTATGCGTATTCAAAAATATTCAAAAATTAAACACTAAAACTGTCTGTTTTCACTAAAAATGAGCAAAAAACCATATCGTACTAACATCCAATGGTTAGGAAATAGATGGAAAATCATAAATTAATTATATATAATTTTATATGTATATATATATATATATATATATATATATGCATCAGTTAATTGGATGGATATTTTTCGGATACGGATACCACAATAACCATATCCGTATCTAGAAAGCTTTTCAGATATCCGTATCCGCTTTCCGGATAATGGATATTTTTCATATTTTCGGATTCGGACAGATATCGGATTTTTCGGGTACCCATTGACAACCCTAGACATGGGTGGATGTAAGCTTTAGTATGAAGTTTTTATAACATCTGATGTTGAACTTTCGTCTCTGCTGGTTTATACATCAATCTTCTCAATCTACAGGGAACCGAGTTTGGAAAGCCATATAGAATTTCTGGAGAGACAGGGTATTGCAGGTGTTAGTCACCATAGTCTGCTCTTTTCCAAGAATGCCACCGTGTCATATGTACCTGATGATACTGAGCAGCCAAGGTCAGTCTCTTTTGTATTGTATCTGTTTGATTTCGTATGTCGATTAGACTGTATTGTATCTGTTTGATTTCACATGTTGATTAGATTGCAAAGTTTGCATCTAGTTTCTTAAGATCTCTAGTAGTTGTCAAAAAGTTTCTCTTCCTATATGTGAACCAGTCTGCAATATCTGAATATTGTAAGCTGCTCGACCTTTGTATCAACCAACTACTGTTTGTGGTGAAATCGTAAAAGAAAATAAATTAACTTCAATTATTTAGGAAATAAAATCAGTAGACTTGGTCCCTAAATTTTATATGACAATTTGCCTTCTCTTTACAGTATCATGCTCTTCGAAATTTAATTTTCTTCACCTGTTTGTCATCTACTGCAGCAAGTCAACTAATGTAATGCACAGAAATTATAATGCTGGATCATCTACTGAATTAGCTGTTGATGGGTATGCACAAATCAACTTTTCTTCTTCTTTCTCTACACACACACACACACAATGATTTATATCATCTCTTACAATGGCCACATCATCAGTGCCAAATTTGCTGTAAAACCAAAAGAGTTCATCTCAAGAGAATATAAACCGAAACATGATGATGAAAACAGCAGCCCTGAAAGCATCAGAGATAAAATAAGACGCCTCTCAGAAACTTTAGCTAACGAGGTATGCAAAAAATGGTCACTTGTATAATTATACGTCATGTTTATGCAATATACATGACCTAACTTGGCAATCTCATTCTTGGCAAAAATAGTCGTTAATTTTAAGATTGCCGGATCAAGGTGCAAAGATTAAGGCACAAATAGCTGAACTGAATGCAAAGCTCGATGCTCTCAAATATGCTTCCAAGTTAAAGGAAAACGAAGTTATTGATGTGGATGGTCTTACCAAAGACTTTGGAGATGTGATTTCAGTTTGAGATTGTGTACACTCGTTTATCGTTATATATATATGTGACAATGCCACAGATTTACAGCTAATTGGTGCAGTCAAAAGTGCTTTGGCTGATTGCTAGTTTTTGGCTTATTAGCTGTCATTTTGAAGATACTGATGAAAGCTTGGTTGTATGTAATTACATTTCTATATTTTGAGTTCTCAACATAATTGAATATTGGCGAAATGTTCGTTCATGGCCATACTTTTGTAGGGGTTTCCCCTCTTCTCAAGTAACTTGTAGAGGGTGTTTGACAATATTAACATATAGAGAGTGTTTGACTATATTTGAGTGAAATGGTTTACAAGTTAATTTGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020247322.1	0.0e+00	protein CHROMATIN REMODELING 24
Swissprot	Q8W103.1	2.7e-250	DNA excision repair protein CHR24
trEMBL	A0A5P1E0Y9	0.0e+00	Protein CHROMATIN REMODELING 24

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G63950.1	62.71	0.0	909	CHR24	chromatin remodeling 24

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G00879	AT5G63950.1	716	257	7	198	908	367	1077	62.71	0.0	909
AfisC5G00879	AT5G63950.1	164	65	5	1	109	1	164	26.83	3e-06	51.6
AfisC5G00879	AT2G18760.1	610	313	11	200	766	377	935	33.28	4e-89	326

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g180717.t1
Allium fistulosum	AfisC5G00879
Allium sativum	Asa6G06328.1; Asa6G06329.1; Asa6G06331.1; Asa6G06348.1
Arabidopsis thaliana	AT5G63950.1
Oryza sativa	LOC_Os04g59620.1; LOC_Os04g59624.1; LOC_Os04g59624.2; LOC_Os04g59624.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00176.20	SNF2_N	Family	222	516	160.4	4.4e-47
PF00271.28	Helicase_C	Family	571	679	64.1	1.2e-17

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000303	P	response to superoxide
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003678	F	DNA helicase activity
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0006366	P	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005694	C	chromosome
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005813	C	centrosome
GO:0006283	P	transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0006284	P	base-excision repair
GO:0006290	P	pyrimidine dimer repair
GO:0006362	P	transcription elongation from RNA polymerase I promoter
GO:0006996	P	organelle organization
GO:0007256	P	activation of JNKK activity
GO:0007257	P	activation of JUN kinase activity
GO:0008022	F	protein C-terminus binding
GO:0008023	C	transcription elongation factor complex
GO:0008094	F	DNA-dependent ATPase activity
GO:0032786	P	positive regulation of DNA-templated transcription, elongation
GO:0008630	P	intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
GO:0009636	P	response to toxic substance
GO:0010165	P	response to X-ray
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0010332	P	response to gamma radiation
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0022402	P	cell cycle process
GO:0030296	F	protein tyrosine kinase activator activity
GO:0032403	F	protein complex binding
GO:0035264	P	multicellular organism growth
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0045494	P	photoreceptor cell maintenance
GO:0045951	P	positive regulation of mitotic recombination
GO:0047485	F	protein N-terminus binding
GO:0071824	P	protein-DNA complex subunit organization

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K20093	ERCC6L, PICH; DNA excision repair protein ERCC-6-like	EC:3.6.4.12	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network