result

Gene information

Detail information of AfisC5G00998

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G00998	chr5	187524853	187532749	+

Sequences

CDS

>AfisC5G00998
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Protein

Gene

>AfisC5G00998
CTAAAACAACAGGTTGCTTCCTCCTCCTCCTCTCTTCATTTTTTTTTGGGATTTAGCTGCTGGCTTTTTACATGCTTTTCTTGTTTCAGATTTTAGTTACAAGTGACAAATAAATCGAATTTATAGAGTGTTTATGTTGGTGAAATTTTGGGGTCACATTTGTTTCTTTGTTCGTACATATCAGCTAATTATTGGGTTGCTTTATGAAGCGATAAGGTTTGTTTAATTCCTTTACTTCCTTGAATGGAAATTTTTTATTTCAATCTTTTGCAACTTTTTTTATATATTTCAAAATAGAAGTGATTCGAGATGAGAAGAGCTGAATCTATCATTTTCCTGTGCTTTTCAAAGCAGTATGCAGCATGTTAAATTCCAGTTTTCCCTTATTAGAAATTAAAGATTAGTATTATATCAGAAATGTCAGTCTTTAATCTATTTAATTCCAGTTGTCATAATCTGACATTGAGATGGGCGGTTTATGTATCAGATACAAAGCAGTGAAACGCGAAGCAAAATAATCATCTGCGAATTAGCATTAGCTAGTGTTCAATGTATTTAGCAGAACCTTTAATTTACAAATGAATCCAGCATAATAGCATATAGTTGGATAATGAGAGAAGAAATATTACTGGGGTCACATTTGTTTCTTTGTTTAAAGCTACTAGCTTATCAGTAGAATTGGATTGTTTTGTGAAGTGATAATGTTTGTTTTCCTTTAGTTCCTTTAATGAAAAAAAAAAATATTTTAACATTTGATTGTTTTTTTAGTGTTAAGTCGAAATTGTGCTCGGAGATGGGCAGAGCTGAATCTATCATTTTCATCTGCTCTTCAAAGCAGTTTGTAGTATATCGAAGTTCAGTTTTTTGTTATCAGCAATCATGATAAATACTAGTGTTATATCAGAAATTTCAGTCTTTTATTTATTCAATCTTAGTTGGCACAATCTAACATTGAGATGGGCAGTTTGTGTCTAACTTACAAAACAGTGATTAGTACCAGTTAATAGTTTGTGTTTAATGTACTTAGTGAACTGTTAATATATAAATGAATCTGGCATAATGGTACATAGTTAGATGATACAGGGAAGAAATTTTACGCTTCCATCACTTAACTATTACCAAACTTGTATCTTGTTCTTTCCTTGTAATCCTTGATTTTATTATGTTTTCAGGGAACTGCACAAATCTACCATATCTATTGTCAATCATTTCTACTCGTGGACCTCGTGAAATATAGTATTTGTAAAGATCCAAATAAAAATAAAATAAAAATGATGAATTTCAAGAACATGGGATCAACTGATAGAAAAGCACAACCACCACAACCAACACCATCCACTCCATTTCCACTAACCAGACAGCAGTCAGTCTACTCCCTAACTTTCGATGAGTTCCAAAATACCCTTGGTGGACCCGGAAAGGATTTCGGGTCCATGAACATGGATGAATTTCTGCGTAACATCTGGACCGCTGAAGAGACGCAGGCCATGGCATCAGCCTTAGGAGCCACAGCAGATTCCAGCATGCCCGATGCTCTTAACGGGGGATCCGGACTTCAGAGGCAAGGCTCCTTAACATTGCCTCGAACATTAAGTCAGAAGACGGTAGATGAAGTCTGGAAAGACTTGTTGAAAGAAACGATTCCAGGTCCCTCTGGTCAGGTGCCAGGTCATGGATCTGAAATGATGCAGCAGCGTAATAGGCAGCCTACACTTGGAGAGATGACTTTAGAAGAGTTCTTAGTTAGAGCCGGAGTGGTTAGAGAAGATAATAATGTTAACGCTAATGTTAATGTTAGTAGTAGAGCTCAAGAGACTACTAGTAGTATGAATGGTAACAGTAATAACATGTATTTTGGAAACGGTAATCCTGGATTAGGACTAGGGTTTGGTCAGAATTCTGCTAGGAATGGCTTGATGGTTGGAGCTGCTAGACCTTCATTTCCAGCACAAATGCAAGTGGGTAGTAATGTGGATATTGGGATTGTGGATCCGGGTGTGAATAATGGGTTGATGTCAGGGGTTCCAGGTTTGGGTGGAGTGACAGTTATGACAGTGGGGTCGCCTGATGGAATTGGGAAGAGTAATAATGGGGATTTGTCTTCTTTATCGCCTGTGCCTTACCATGTATTCGGGTCCGGTACGAGAGGTAGGAAGTGCAGCGGAGCAGTGGAAAAGGTTGTGGAGAGGAGGCAGAGGAGGATGATCAAAAATCGAGAGTCGGCTGCTAGGTCACGAGCAAGGAAGCAGGTTAGTTCTGTTATTTTTACATTTTTCAGTTTGATGTTTGTTTATTCCATGTTTCGTAAGGGAGATGCTCCTCTGTTATTATGGTGAATAACCAAAGTGGGAAAACTTCAGTTGCTTAGAGCCAGCCATTTGATCCAAGATTTGACAGCTTTTGACTCAAACTGAATTTTTAAAGACTTTGCTAACATGCACCATGGGTTAAAGGTTGATTATTGGATCTAATGATGGCGGGTTTTGCATACTCTTGTGTCAATCAGAGTTGGGAAGTCATAATATGTGGTTGAGATTTGAGATATTATTTTTCAAATCATGGCTATGTTAAGGGTTCAAACTTGTTAGTAATTCCAGCGGTTGAAATCATGCTACATTGTGTGGCCAGAAATTGGTGTGCACTTGAAAGCATCGTTGACATGCTGAATCATTATATTGACAGGATGAACTATTTTCCTTACTGATTCGACAAACAACATGTAGTCTTATTTGGTGTAGAATACACGTACATGCACCAAATATTTGGAGGATGCAAGTAATTACATCAAGGTTTGAGGGATTTGAGTCATATGCTAATCAATACCCCAAAAAACTAGAATGTATTTACTGGACCGTGCTGCTTTATCTGTACTGTTTTGTAAGATTGAGCATAACCCACAAATTTATTCGTTCAGTACTCATCTATGGACCTTAGGATACATGAATGATTTTCCAAGTTGAGTTTCTAGCCATTGTAACATAAACTGAAGCTTGAAATGGAAATTCTGTAATATAGCTCATCTTAGCTTCTATAGTTTGATGATTTATTGTTTGATTTTTAGTGCAAATAAAAGAAATGTAATTGCCAGCAACATATCAGATTACCTCCATGATTTTATCATTGGTAAGGTGGTAGACAGTACATAAATGAGTAAATATCAGGTTATTACCATATTTTATATTTATGACCCAAACATTTTAGTATCCATAATGATAGATAACTTCAGTTTTGCCCTATGCAGTTAAAGTCCCGCAAAATCTCCGCTATAACGTATAGCGCTCTTCGACCGCTATGCTTTTTTAGTTTAGCCCCAATGAATAGTAGATCCGTTTTAAGCCCCGCTATTTTCCGCTGCAACCACTAAATCAAGGCTTTTAGCACCCGCTTTAGTAACATTAATACAAAAATGCTAATTTGACTAGTTATCTTTTAAACCAAATCAACAAAGTTAGATAAATGCCTAATTTCAAGGCATAAGTAATCAATATAAGTTAGAAACATATTATATTCACCAAATCTGGATCGCATAAATCATGATATTCTTCAGTTTTATTATATAAGATTAATATAAATGATGTGAGAATGAAAATAAATTAAATTTAAATATTTGGTTTTTTTTATCAAATGGAGTATTTTGCACCTCCGCTATTTTTCGCTATATCTCCACTTTAGCTCCACTATAACTTTTTGCACCTCCACCACTATAGAATCGTTAAGCGCTTTAACTGCATAGGTTTTGCCACAACACTATAAATATAAAGTTCAAGTACCAGTATTCTATTTATAAGTTTGCCTACCTGATCAGGCTTATACTATGGAGCTGGAAGCTGAAGTAGCTAAACTGAAAGAACAAAACCAGGAATTGGAGAGAAAACAGGTATCTTGTTGATAGTCTATTGTTATTTGAGCAAATTAACTCAGGAATCAATAGTCACACGTGCACTTTATGTAAACAATATGATCTTAAATCTTAAATATTTTGAATCTTAAGTAGCTTTGCATTGCTCTGACCAAGTAATATATAACATCAACTGATGTTTTTGTGTAATTTTGATTCACCAGTTATGTTTAGTTGGACAATTATACTTGGCCTTGCTCTGTTAAAGTTATGCCATATTTTGGCACAATGTTTAACATGTGTGTAAAGAAGCAGTCCGCTTAGTTGCATGAGATGTGGAAGCATTTCCTAGCTTGTAGGTAAAGGAATAAGTTAGTTGGTTAGTGTGTTATTAGTCTATTTAAATACTTCCTTTCATATGTAATGACGGCGATGTCAGTCGAAGCCTGGAGCCAGTGGCCATCGAAAGTTTTGAAGTCACCATGGTTGGTTTGAAAAGTTCAGTGTTGCCCGGAGTACTGTAATCAACCAGATGTGTGTTCTACTTTAGATCCCATAAGGGTGATGGATGGCCAAAATCAGTTAGAGTTGTTATGGATCAGAAATGACGTGAGGCCCTTGAAGGTGATGAGTTGGCTAGAATTTCGTGGCTTTGCTCAGGAAAACGATGCAAAGCTTGCAAGATGATGGCATTGGCATAGGAAGTTTCTTGGATTCGATGCGAGAAGTTTGTATTAGCTTGGAAGTTGCGTTAGAGCTTTGAGAAAATAGGTTGGTTAAGAAATATAACAAGTAGCTTGAAAATGACGTGAAGCTTTATTGATAAACTGGGGAAGATGAAGTGATGTGGCAAGAAAGAAAGGGATTCAATGGGAATAAATATGACGGACCCGTGGAATTGAGTTAAATGAGTTATCATTTGTATGCACGGATGCATGTGATTGTATTTTTTGAAATGTATAGCATTTTAAACATGGCATGCTGGTGAACTAGCATAAATTTTGAAATGCTACTGGGTCTTAGACCTTGAGTATTAAAAAAGGAGGAAACGTTGATATTTATTAGCTAAGATTTTTTAAAGTGAAAGCAAGGGGGATGATAAGAATGAACAAAGGAAGGTATTTAAGTGCTTGAAGCGGCAGCAACAGTTACTGAGAGATAG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008797272.2	3.0e-89	bZIP transcription factor TRAB1 isoform X2
Swissprot	Q9M7Q2.1	2.5e-64	bZIP transcription factor 38
trEMBL	A0A8B7CE17	2.2e-89	bZIP transcription factor TRAB1 isoform X2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G45249.1	50.48	1e-82	303	ABF2;AREB1;AtABF2;ATAREB1	abscisic acid responsive elements-binding factor 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G00998	AT1G45249.1	420	122	15	27	384	21	416	50.48	1e-82	303
AfisC5G00998	AT3G19290.1	417	160	10	18	384	26	431	47.00	3e-80	295
AfisC5G00998	AT1G45249.3	431	122	16	27	384	21	427	49.19	4e-80	295

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	306	358	47.0	1.8e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0010255	P	glucose mediated signaling pathway
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043621	F	protein self-association
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:1901564	P	organonitrogen compound metabolic process
GO:2000028	P	regulation of photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14432	ABF; ABA responsive element binding factor	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network