result

Gene information

Detail information of AfisC5G01010

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G01010	chr5	190503033	190510634	+

Sequences

CDS

>AfisC5G01010
TTCTTTCCTTCTTCTTCTTGCTTGCTCTCTTTCGCTATGTATCCTTCTCACCTTTTGAGCAATTCCAGAGTTAGCAACAATGAAGAGGTGCAACTGGGGTTTAATGTTGGAAATGCTGTTTTTGATCTCACAAGAAGTAACGCTCACGTATTTCATAATACAGAACAAATGCAGCAACTTGATAATTGGGGTGATAATAGCATGGTTGTAACCAGCTCCTTAATTGATACATCAACTGATACTGAAATTAATGGCTCGAATCAGATTTTGAACAATGGTGTGCGTACGGCTGCTATTTCTCCTAATTGTTCAGCTGTATCTCAAGAGAAAGGAGAGGACTGTAGAGTGATCCGAAGACTTGCTCAGAATCGGGAGGCAGCAAGAAAAAGCCGTATGAGGAAAAAAGCATATATTCAGCAACTAGAGAGTAGCCAGATAAAACTGAGTCAATTGGAACAGGAGCTTCAACAAGCAAGGCAACTGGGTATATTTATATCCGGAGAAAGCTTACAAGATAATGGGTGTTCAGCAGGAGGAAATGGTGCCTTAGCCTTTGACGCGGAGTATGCACGATGGCTAGACAAACATCAACTACAAATCAGTGATCTCCGATCTGCTTTGAATTCTCAGTTAGGCGATGAAGACCTAAGAGTTTTAGTTAATGCCCTGATGTCACATTATGATGAACTGTTCAGGTTAAAAAGTATAGGAACAAAGTCCGATGTGTTTCACATGCTTTCTGGAATGTGGACAACTCCGGCTGAAAGGTGTTTCATTTGGATGGGAGGCTTTCGTTCCTCCGAACTTCTAAAGGTACTTGCAGGCCATCTTGAGCCATTGACTGACCACCAACTAATGGGTATCTGCAATCTTCAACAATCTTCACAAGAAGCAGAAGAAGCATTATCACAAGGAATGGAAGCCCTTCAGCAATCTTTAGCAGATAGTCTCGTGGCCGCGGCTCCTAAACATTCCGTAAGCTCTGACAATGTTGCAAATTACATGAATCAGATGACCATTTCTATGGGCAAGCTGACCACACTTGAGAATTTCCTTCGCCAGGCCGATCTTTTGAGGCAGCAAACATTTCATCAAATGCATCGCATACTTACCACACATCAGGCAGCAAGAGCTTTGCTTGTTATCAGTGATTATTTCACACGTTTGAGAGCATTAAGTTCACTGTGGTTAGCTAGGCCAAGAGGATAA

Protein

Gene

>AfisC5G01010
TTCTTTCCTTCTTCTTCTTGCTTGCTCTCTTTCGCTATGTATCCTTCTCACCTTTTGAGGTACTACATCATAAGTGCACGTGTGTGTATATATATACATACTTCCATACTTTGATGGTATATACTCTTTATTTTAAACACCTTTTGTCTAATCCATTTGTAATTGCTTAGCAATTCCAGAGTTAGCAACAATGAAGAGGTGCAACTGGGGTTTAATGTTGGAAATGCTGTTTTTGATCTCACAAGAAGTAACGCTCACGTATTTCATGTAATATTTTGGATGATTATTTCTTTTGTCTAGTAATCCCTTTGCATGTCAATTTTAGTGGTTCTGATCATGGAGTTATACATTTTAACTGTTGTATATTGTTTATGAACAGTCCAAACTGTAATATTGATTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGGTTTTATGTTTTGTTTGTTTAAATGCTTTTGCAGAATACAGAACAAATGCAGCAACTTGATAATTGGGGTGATAATAGCATGGTTGTAACCAGCTCCTTAATTGATACATCAACTGATACTGAAATTAATGGCTCGAATCAGATTGTAAGTAGTTTACATGCTAAGATAATTAAGGGAAGTTTGATTTGCTCTATATGATTTCATTCGATTTCAGTTGAACAATGGTGTGCGTACGGCTGCTATTTCTCCTAATTGTTCAGCTGTATCTCAAGAGAAAGGAGAGGACTGTAGAGTAAGATCTATCAACCTTGTTCCTCAAATTTCTTGATGTTTTAATTTCATACATCTTATAAACTATTAGCATTGTTAGTTCTAGTTGATTAATATTGAACCTAACACATGACTTAACAAACTGTTTTTGAGATTTGAATCTATATAAGTTACTTAATAATTAAAGGTTGCTAAATGCTGTATTCTCTTATAAACTTAAATTGTGCATTGGAAAAGCTTATATGTTATGAAGTTGAATTATCATTTCTTTTTAACATGGTTAATTAGTGCTAACAAGCTGTTAATTTCGAGATTTGAACTCATGATCGATCTCACAGTCCAAACCATCAACCAACTTAACCAACCTTATTGGCTAATCGCCTTTAATTTCATTTCTGTATGCCCAACAGCCTCAATTAATACAACCAAACATATAACCCATCTTTTTTCGAAGAGTAAGAAATAAGAATTATGCAAATATGGTTTGAGAAAATCTCATACAGGATTTTTTCTTCTTCCCCTATTTACTCAAATGTATATTTTGAGTTGAAGTCCTTTCAATATGGACTGCAGGGGAAACATATATGTAGTTACTCTTCTCCTTGATGCTCATTAAAACTGAAAAGTTGTTACTTAATGAATAAAATTCTTTAGGTGATCCGAAGACTTGCTCAGAATCGGGAGGCAGCAAGAAAAAGCCGTATGAGGAAAAAAGTAAGTGTAAAATTCAAGGCAAATCATGCTTATGTAGTTTTTTTCTATAATTCTTGATTGTTCTAGTCATTATTGTACTTTATTGGTGTTAAGTTTTTAAAATTCAATATTTGCATTGTATCCAAATGGCACTCAGATTCAGGAATTTAGTTAATACATAAGCGTTAATTTTGTTTCATTCTAATCCAATTTGTGAAAGGCATATATTCAGCAACTAGAGAGTAGCCAGATAAAACTGAGTCAATTGGAACAGGAGCTTCAACAAGCAAGGCAACTGGTAAGTTTAGTTGTTCTTGTTATTCACTTTCCTTGTTTTATTTATCTACTGCAGTTTCTTGTTACCACTTACAGTTATCATGCAGGGTATATTTATATCCGGAGAAAGCTTACAAGATAATGGGTGTTCAGCAGGAGGAAATGGTTTGTTATCTTATAAAACTGAATATAATGTTTTGGTCTACGATCTTGGGTTTGTTAATTTTCGCTCTAATGAGCTTATAATTACGAATATTTAAGGGGTTTGCATACAATGCCTATCAAAACTATATATTCTAAAGGGTTAAACTGCCTACCAATGTCTCTTGGTGTTTTCATATTTAAATTGTTCAGCAACCACTTAGATCACTTGTCCCAAAATTTTGTTTCTATCTCTAGCTTTTGTTTCTGTCTTAGGCAAAAAGATGCGACATGCCTTTAATTTTAAAGGCTTCTAATTCTCTATATTACACCGAATTTCAATGTAAGACAACTTTACTAGCGTTGGAATTATTCAATCAAAGCTTCTTTAGAAAGCAAACTCGCTAAAAAGTTTGGAATTTATAATGTAAGACAACTTCACTAGCGTTGGCGTTGATTTTAAAGGCTCCTAATTCTCTATATTACATTGAATTTTAATGTAAGGCAACTTCACCAGGAATCATTCAATCAAAGCTTCTTTAGAAAGCAAACTCATTAAAAAGTTTGGAACTTATAATGTAAGACAACTTCACTAGCGTTGAAATTATTCAATAAAAGTTTCTTTAGAAAGCAAACTCATTATAATTTTTGTAACTTATAATCAAGTCTAACACTCATATGTACCAACCAATCCATCGAGTTATTGCATTTTGAAATTTATTAAGATGATCGCCAACAAATTTTATTTATTTTAATCTCAAATGCACTAATTTTCGAATAATTGCATGAAGGATTTCTGGCTCATTCAAAGATGCTAGAAAATAATTGCATATAATAAGAGTTTATCTCAAATCTCTCTAGAAACCTACGGAATTGGGTACATGTGAGTAAGATACAAGTCGAAGAATTGAATATCAGTTAGCAGTCCAAAACCAAATAAAAGTAGTAAATTGAAATAAACGAGTATAATACATATATTTATAGCGGTATCACTATCGACGTGATAATGTACATTCACTTTGAGAGATGAATTTTATCACAAATTTTGGAGGGAATTACAAGAGATTGATATATCTGTTTTAATCGAGGTTTAATACCTAATTAAAAAAAAAACTAAAATCAGTCTCTAAAGAATGGTTTCATTTATGTAGAGATTTGGATACTTGAGGTTGAAAGAAACTTTCCATAGCACATGTATTTTTTTACATTCAGTACCTTTCAATATGCATACGCTTAATCGCATGTCTTTTAATGACTAATTAATTTGGAAATTAATTAGTTACATTTCATTTTTAAAATTCATTTCCTTTTATGTAGATGATCACTTATCTTGTTATTTAATGCAATAAATTTGCATTTGGTTAATGCAATCGAATTTTAACAAAATCCACAATTTATACTTTTCAACTAATCTAGCATATATTTGCGTTACAACTTCAACACATCACCTTGATTGAAATATATATTTAACCAAAACCTAAAATCTGCATTCGACCAATGTCCATCAAATTCAAAATGATGCAAATTCCGGCAAAACCCTAAAATTTGCATTCAACCAATATCCATCAGTTTTTCATAGATGTATTAGGGGTTCGAACCCATAACCTTTAAAACCCATGTTTAGAATGTCATACCACTAACCAATTAAGCTAATGGTCATTGGTCATTAACGTTCTTTTACTACTAATCTAGCTTTATGTATTGCATCATCCTTCACCATAAATACCCACTTGTATCTATGACTCGGCTTCATTGAGGTAATGAAACCAGTTCTCAAGTTTTATTCTTCTGCAAAGATGACATCTTCTCTTCCATAACGAAATCACTTTGAACTATCACCAATGTATTAAATCATGGATTTTGATCGTTTATCGTTTCAGGAATTCTACACTTAATATCTCATATCGGACGAGATGAATGATCAGGTACATCTTGGATCAATACATTTCGAATTTTAAAGGCCGAGAAGTACCTTAAACGTCTAAAATTGACTTTTTTAAAGATTTTTGTAATAGTTATCATATCTGAATATAAAAATTTTAACATATGTAATTCTTATGACACAATAATATTAAATTTTCCTTTTAATGCGATGGTAAAAAGTCATTAGCTTGTGATTTCTTTTGGATCCACTGAAGAAAAATATGTAAATGAAAAAACGTAATTCATATAAGATCTTCCATCGAGATGTTACATCGAATTTTGCTTGATATCTTGATATTTTGAACGGGATGAGTGTCAAATAAAAAATAAAATAAATCTAGTCTCATTTGTCTAAATCTCCTCGCTCAATTTTGAAAATGAAATTTTAAACGAGTTCTCGGGTGAGATAATCGAGATTTGAAAAAGCGCTCGTCGCTTGACTTCAAAACCATCATCAAAGTATAAAGGATAATCTTGTACGACATGCAAATGCATAATCAAACTGATTTCTAAGGCTAAGGTTTGCATAATGTTTTACTTAATTTCTCTATGGTGTTTTTCCTGTACTTTGACTAACCTGAATGGCTCCAACATCTCTTAAATCTCTTGCATCTCCACCATGTTATGTTTCAACACCACAACGCGTCCTAATGTACGTGCACTCCGTTGAATGTTGACAAAACCATTGAACGAAATTTTCAATATGCCTGTGTCTCGATTGAGCACCCCTACATCGTCTTTCTTTCAGCGTTATGTACTAACAGGAATGTTCAATGTCTTCGCAACACTTGATTGTACCAAAAAGAATTTTTAGTGTTATGTACTAACAATCCCATTAATATACCATGCTTATTACATATTTCTTATGATGTGGGAGTATTCTTAAGTTCATTACACATACTCACTCCTTATATAATGTGAGTCAGTAAAAATCTCCATCTTAATGAGTTCCTCGAGTCTTTTTGGTGCACACCAAAAAACTATGCAGTTGGGTTAGGTTGCTTTTCACAAGTGTCTTCTTCTCCCAAAAGTGATGACCGACTGCTTTATCCAAATTTTCACCTAGGCTTTTGCTCAAGTCACTTTGGAGATATTGAGTCATCACCGTCTTCTTTTTTAAGCAGGAGGAGCCCCGACGAGCATTTTCTTCTCCATCCTCAATCTGGATTCATGCTTTGGTCACGCTACATTATATTGGTTCTTCGAACCTTAAGCTCTGATACCATGTTAAGTGTCGACGTCCCAACATGTCCCATATGTGTGCACTTTGTTGAGTG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020110773.1	2.2e-130	transcription factor TGA2.3-like isoform X1
Swissprot	Q5Z6N9.1	1.8e-113	bZIP transcription factor 47
trEMBL	A0A6P5GYD1	1.6e-130	transcription factor TGA2.3-like isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G68640.1	67.31	7e-114	407	PAN;TGA8	bZIP transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G01010	AT1G68640.1	312	101	1	90	401	141	451	67.31	7e-114	407
AfisC5G01010	AT5G06950.4	293	91	3	110	401	40	329	67.58	3e-111	398
AfisC5G01010	AT5G06950.3	293	91	3	110	401	40	329	67.58	3e-111	398

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	114	155	33.0	4.4e-08
PF14144.3	DOG1	Family	199	274	103.6	4.2e-30

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0009410	P	response to xenobiotic stimulus
GO:0009862	P	systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway
GO:0009909	P	regulation of flower development
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14431	TGA; transcription factor TGA	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network