result

Gene information

Detail information of AfisC5G01311

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G01311	chr5	244558634	244565584	+

Sequences

CDS

>AfisC5G01311
ATGATGATTACTGGTTTGAAGAGAGAGAAGCGTGATAATAAAATTGTAGTAGCTGTTAAGGAATCCAAAGATATATCAAAGAATGCTCTTGTTTGGGCATTAACTCATGTAGTTCATCCTGGTGATTGCGTTTATCTTCTTGTTGTCATGCCTTCTCAAAGCTCAGGCAAGAAGCTGTGGGGTTTTCCTAGATTTGCAGGTGATTGTGCTAGCAGTCATCGAAGAATGCATTTCGGAACAGTTTTAGAGCAAAAATGTGATATCAAAGATTTATGCTGTCGAATGATGGTTCAACTGCATGATGTGTATGACCCCAACAAGATAAACATCAAAGTGCAAGTTGTTTCAGGATCACCTTGTGGTGCTGTTGCCGCTGAATCTAAAAGAGTTCATGCTAACTGGGTGGTTTTAGACAGACAGTTGAAAAGCGAAGAGAAAAGATGCCTTGAAGATTTACAGTGTAATATAGTTGTTATGAGGCGTTCTCAACCTAAAATTCTCCGCTTAAATTTAATAGGATCGCCAGAGGCAGAAACTCATTTAGATGAATGTATAGGCAAACAGTCAATTAACACAAAAGATTGTACTAGGAATTCAATCCAAGGTCCATCGGTTACTCCAACCAGCAGTCCTGAAATCGATACAACATTCACTACTACAGAAGCAGGAACATCATCAGTTTCAAGCTCAGAACTTACTGTTTCCCCACTTTCTATTCATGAGACAAAAACAACTTTAAACAAAACACCAAAAACCATTACAAGGAGAAGGAGTTCAAATGCACCCAGTTCTGATTCTGAAACCGATAGTTTGAATCTTTCATGGTCAAAAAATTTTGTGGATATATCTAATAGAGTTAATGACAATGCTCGTATTTCGTCAGCAAAAGCTTTGGGGGATAAATTTAGTAAACTAGACAGAGAAGCTGGAATTAATCATCGTGTAATTAGTTTAGATTCGGAATTCAGTGGAAATATGAGAGATAGAGTATCTTTGCCTAGAAATGCTCCTCTGAGTGCACCTCCTTTATGTTCATTATGTCAACATAAAGCTCCTATATTTGGGAAACCGCCTAAGGTGTTCAGTTATAAAGAGCTTGAATTAGCAACTGATGGATTTTCTAAGGCAAATTTTTTAGCGGAAGGTGGGTTTGGATCGGTTCATAGAGGAATTCTACCAGATGGACAAGCAATTGCAGTAAAACAACATAAATTAGCAAGCTCACAAGGCGATCATGAGTTTTGTTCAGAGGTTGAAGTATTGAGTTGTGCACAACATAGGAATGTCGTGATGCTTATTGGGTTTTGTGTTGAGGATAAGAGGAGATTGCTGGTTTACGAATTCATATGCAACGGGTCCTTGGATTCACATCTTTATGGTCGTAATAGAGAACCGCTAGAATGGTGGGCAAGACAAAAAGTAGCAGTTGGAGCTGCTCGAGGGCTGAGATATCTTCACGAAGAGTGCAGAGTTGGTTGCATCGTACATCGTGATATGAGGCCAAACAATATTCTCATCACACATGATTTTGAATCTTTGGTTGGTGACTTTGGATTGGCAAGATGGCAGCCTGATGGAGACTTAGGCGTTGAAACTAGAGTAATCGGAACATTTGGGTATCTAGCACCTGAATATGCTCAAAGTGGCCAAATTACAGAAAAAGCAGATGTATATTCTTTTGGTGTAGTGTTGGTTGAGCTGGTAACTGGACGAAAAGCTGTAGATATCAGTAGGCCAAAGGGTCAACAGTGTTTAACAGAATGGGCTCGTCCACTACTTGAAGATTCTGCTATCGACCAGCTTATAGACCCTCAACTTGGGAACAGTTTCTCGGAACATGAGCTTTGTTGCATGCTGCATGCGGCCTCATTGTGCATCAGACGTGATCCACTCCACCGCCCTAAAATGTCACAGGTGTTGCGAATATTGGAGGGAGACATGTTAGTAGAATCAAATTATATGTCGACACCGGGCTTTGATCCTGGAAATAGAAGCGGCCGTCACAGCGTTCCAGCAGCCATGCAGGAGTTATCTTATGATGCATTGAAAGCAGCTTGGGATAGAGAAAGTATATCTCGATCTTTCCATAGATGA

Protein

Gene

>AfisC5G01311
CTAATCTCCAATCCCAATTTTGACGCCATTCCACAATAAAAATATTAAATTCAATAAAATTGTCCCATTTGCTTTGGTAAAATACTCTTTTTTTTATTTAGGGCTCCACTTGATACAAATTTAGCGATTCTTTCATCGCGTTTACGCTTAGAAGCTTCGTTATTTGAAATCATATTTTATTAATCGTATCATATTGGAACTTGTTACCGTTTAATAAAGTGAGCTATTTTATATTTTTTGTCCTTTGTTGTAATAAAAGAACAGTGCAATCAGTTAAACAGCGTTCTCTTTGATTCTCAGATAAATAAGCGACAAAAGTCGAATATTTGTGCAAAATTGTTAGTTGAGGATAACAGAAGAGGCATCTTTCTTGAGTTTTTGTTGCTATCTCTGTTATTTTGATAAGGAGAATGAATGTCTGAGGGAAATGAAGATGTCTTGTGCTTCGAAATAAGGAAGGGGCTCTGAATATTTGTGAACATTTTTGGGGTTTTAAGCAGAATGATGATTACTGGTTTGAAGAGAGAGAAGCGTGATAATAAAATTGTAGTAGCTGTTAAGGAATCCAAAGATATATCAAAGAATGCTCTTGTTTGGGCATTAACTCATGTAGTTCATCCTGGTGATTGCGTTTATCTTCTTGTTGTCATGCCTTCTCAAAGCTCAGGTAACAATATTCTTGTTTTTTTCTTCTCCTTTTGAATTTGATGTTGATATACTGCTATTGTTGTGTTATCAGTACACTTTTGGCTATTAAACTAGATTCGTGGTGAATATTTAAGGTCAAGTTAGGATTTCTTACTATTTTGAAATCTTTACATCGATTGTAAGGGGTTTATGACTACATTTGTGGAGAAGCAGTGGTTTTTTTTCCTTACAGTAAAGTCGAACTCTGAAAGACTTAATTTAATCTTTGATGAAACATAGCATGTGTTATTTTGAATGCTAAATTTATACCGTTGTATGCATCTGATCTTATGATTTTATTTTATTGTTCAGGCAAGAAGCTGTGGGGTTTTCCTAGATTTGCAGGTGATTGTGCTAGCAGTCATCGAAGAATGCATTTCGGAACAGTTTTAGAGCAAAAATGTGATATCAAAGATTTATGCTGTCGAATGATGGTTCAACTGCATGATGTGTATGACCCCAACAAGGTGTGATTCAATTTCAAATCATGGCGCCTCTACTTTAGTTACTTTGCATATTTAAATTCTCTCTGAATACCTTTTCTTCTTCTCTTTTGTAGATAAACATCAAAGTGCAAGTTGTTTCAGGATCACCTTGTGGTGCTGTTGCCGCTGAATCTAAAAGAGTTCATGCTAACTGGGTGGTTTTAGACAGGTACACTTCTACAAACTCACTCTTTTTTCTCGGAAATTCTCAACAGTTACTCCTACACTTTTTGTTAGCAGACAGTTGAAAAGCGAAGAGAAAAGATGCCTTGAAGATTTACAGTGTAATATAGTTGTTATGAGGCGTTCTCAACCTAAAATTCTCCGCTTAAATTTAATAGGATCGCCAGAGGCAGAAACTCATTTAGATGAATGTATAGGCAAACAGTCAATTAACACAAAAGATTGTACTAGGAATTCAATCCAAGGTCCATCGGTTACTCCAACCAGCAGTCCTGAAATCGATACAACATTCACTACTACAGAAGCAGGAACATCATCAGTTTCAAGCTCAGAACTTACTGTTTCCCCACTTTCTATTCATGAGACAAAAACAACTTTAAACAAAACACCAAAAACCATTACAAGGAGAAGGAGTTCAAATGCACCCAGTTCTGATTCTGAAACCGATAGTTTGAATCTTTCATGGTCAAAAAATTTTGTGGATATATCTAATAGAGTTAATGACAATGCTCGTATTTCGTCAGCAAAAGCTTTGGGGGATAAATTTAGTAAACTAGACAGAGAAGCTGGAATTAATCATCGTGTAATTAGTTTAGATTCGGAATTCAGTGGAAATATGAGAGATAGAGTATCTTTGCCTAGAAATGCTCCTCTGAGTGCACCTCCTTTATGTTCATTATGTCAACATAAAGCTCCTATATTTGGGAAACCGCCTAAGGTGTTCAGTTATAAAGAGCTTGAATTAGCAACTGATGGATTTTCTAAGGCAAATTTTTTAGCGGAAGGTGGGTTTGGATCGGTTCATAGAGGAATTCTACCAGATGGACAAGCAATTGCAGTAAAACAACATAAATTAGCAAGCTCACAAGGCGATCATGAGTTTTGTTCAGAGGTTGAAGTATTGAGTTGTGCACAACATAGGAATGTCGTGATGCTTATTGGGTTTTGTGTTGAGGATAAGAGGAGATTGCTGGTTTACGAATTCATATGCAACGGGTCCTTGGATTCACATCTTTATGGTAACTGACAAATTGTAGTTGCATTTTCACTAATGCGTTCAATATTTCGTATCATGCAATCTGTTACAACAGTCTATTTTTGTGTATAGTGTAGTCAGTAAACTATCATGAACTGTCAACATCTCTTGCCAATAAAACAATAAGTTTGTTACCTCAAAACATAGTTGTTATCTGTCATGTGAGTAGCATATGACAAGAAAGTCACAAAATGTCCTAATATTTTTGTTGCTTTGTTTCATCTTCAGATTTCAGTTGCCTTGGTACTTCAATTGTTTTACAAAGTTACCCTTTGCATTGTTTTCTTCATTAACACATTAAATGCTTGTAGGTCGTAATAGAGAACCGCTAGAATGGTGGGCAAGACAAAAAGTAGCAGTTGGAGCTGCTCGAGGGCTGAGATATCTTCACGAAGAGTGCAGAGTTGGTTGCATCGTACATCGTGATATGAGGCCAAACAATATTCTCATCACACATGATTTTGAATCTTTGGTATTCCCCTTGTTTTAGAATAAGTTTGGATTAAAATTTGCCCTTTCACAAAAATAATTGCATATGGTAAAATATAGAGGGATATTTTCTTAACCTTAGGCCAGCCGAATCATAAATCCTGTAGATTTGATATCGATGGTAAATGTGGATATTGATATGAAAAATACGACATTCATAGGTTGGTGACTTTGGATTGGCAAGATGGCAGCCTGATGGAGACTTAGGCGTTGAAACTAGAGTAATCGGAACATTTGGGTACTATTCTTTGTGAACAGTTAACTTATACCATCTGCTTGTACCAATCACATCAAATGGGCCTTGAACACTATGTTCCAGCCTTTGCATCATTTGTTTGTGAAATTGTGAGGTTTACCCATACATATTTTTCCAGGTATCTAGCACCTGAATATGCTCAAAGTGGCCAAATTACAGAAAAAGCAGATGTATATTCTTTTGGTGTAGTGTTGGTTGAGCTGGTAACTGGACGAAAAGCTGTAGATATCAGTAGGCCAAAGGGTCAACAGTGTTTAACAGAATGGGTTAGTTGTGCATTTTCATTGTTTGGTAGTAATTAATTAATGGACAAATTTTTGAAAATAGGTTTTTCAAAAGCTTGTTGTCACTTTAGGCCTTTGTTCAAACTTATTGTTAAAACAGACCTCATTGATGTTATGAAATTAAAACTCATTTATGGAATGCATGTGTCAATTTTGATGCTATTGCACACTTGTTATGCAAAGCAAGAAAATATTACTATATATACAGTGATTTGGCTGGTATGAGTGTACATTTTGAAAGCATAAAATAATGTTAGTTGTTTGGCTGGTATGAGTGTTAATTTTGAAACATCAATACAAAGCCACTTGACTGTAAGTTTGAACTGATAATTTCAATTACCATAGTTTTTTGAAAAAACTTACATAAAATCTCTTTAATTAATTAATCTTGTTTTATTCTTTTTGTTTAGATTGAATAAATGTTAACTATTATGCAGATATCGATAAGCACAAAGCACACACCTACCCTTTTTAGCTGTTTGTGATATACAGAAAGTTGTAGTCTTGGTGACATATAAGAATAAACTTTAAAGGTTAAAGAAATTATTAAAGTAGGATGGGTATTTTTGTGGAGGAATAATTTGGTTTAGTTTGAATTTCAAATTCAAATTAAGGGGTTTTGTATGGCTCAAATATATAGGCTCTTGGTTGTTTCTGAACCTTTTATCTTTTCAAACTAAGGTGAGATTTGTTATGGTACCTTTTATAATTTGTTATGTAACCTTTTTAATTCATCTTTTTCAACATTTCATTTATATGCTTGAATCTATCAATATAATGTATGTAAAAAGTGTTATGTTATTAAGTTATAAAATGACCATAATATATTTTGGAATAGGCTCGTCCACTACTTGAAGATTCTGCTATCGACCAGCTTATAGACCCTCAACTTGGGAACAGTTTCTCGGAACATGAGCTTTGTTGCATGCTGCATGCGGCCTCATTGTGCATCAGACGTGATCCACTCCACCGCCCTAAAATGTCACAGGTAACACTATGTTATATGATATTAATAGCTCAATTATACATGGATGACGTGACAACACCAATGCTATCAAATCATATTAGTCTTTCTAAAATGAGTTCCCAATTTTTCCATACCATAAACTTTCAAAATAGTTACATATTAATTCTTTAACCATTCAAATTGATAAAATTTAATCATAAGAAGTACGTATGTAATCCATCTTAAAACAACTTTGAACTAAAATAAAAATGGTTTGTTTACACAATGAAAATACAACAAATAATCAATAAACGGTCCAAAAATGTAACATTGTGAAAAGTCTAATATTGAGACAATTTTAAATAATTTTATATTAAAATTTGAAAATGATAAAAAAAAATGAAACTAAAAAACAACCAGTTAAAGTTGTTGAAATTTGTATATATATTTTTTAAAATGTATATCAAGTTTTAAAGAATACACAACAAAAAGTTGAAAATATCATACTCTTCTGGATGTGTTTTTGTTTGTGAATTTAAACCATAAAATTAAAGTTAATGTAAGTTCAGTAAAAGTAAATCAAAAATAATATTCAAATCAAATAGACTAAAAAATAAAAAGGTAAATTTTAAGC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020265209.1	1.4e-297	inactive protein kinase SELMODRAFT_444075
Swissprot	P0DH62.1	1.2e-125	Inactive protein kinase SELMODRAFT_444075
trEMBL	A0A5P1EXT3	9.8e-298	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G13690.1	66.38	0.0	929		Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC5G01311	AT3G13690.1	690	193	8	13	667	20	705	66.38	929
AfisC5G01311	AT1G55200.1	656	195	10	14	649	17	655	64.63	861
AfisC5G01311	AT5G56790.1	653	242	6	20	649	22	666	58.19	739

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	377	642	138.2	2.6e-40

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0019722	P	calcium-mediated signaling
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048364	P	root development
GO:0048367	P	shoot system development
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network