result

Gene information

Detail information of AfisC5G01435

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G01435	chr5	269896861	269906954	-

Sequences

CDS

>AfisC5G01435
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Protein

Gene

>AfisC5G01435
ACAAGTATTTGACAGCTCCTCCTTGTCATATTCCGAACCTTCCTGGTTTACCTATTGTCATCATCAACATTCAATCAAAATTTTCATTTTCACACTATAAATCAAACGACTAAATTCTGAATCGTCTTCTCCAAGCAAAAACCCTTCGCTACAATAAAATATCTAATCTAATTCCAATTTCTCAAAATTCCCATTTATATTCATAATTCATAAATGGAGTCGAAGTCAACGGGGCGGTTTACGCTGGGAAAGCAGTCGTCCATGGCACCCGACCGCCACGAGGAATCGGACCCAATTATGCCCGACTCCGCAGACATGCCCGACGAGATGCGCCTTATGTACCTGGCGAATGAAGCAGATCTTGAAGGAATCAAGGAGATGCTGGATTCCGGAGTGGATCCGAATTTTAGAGATACTGACGGTAGAACGGCTTTGCACGTGGCGGCGTGTCAGGGGAGGTTGGATGTTTTGGAGTTTTTATTAGAGAAAGGAGCTAAAGTTGATATTGAAGATCTCTGGGGTAGTACGGTAATCATGTGTTTTGTTTTTTATTCGAATGAGCAGTAGATTGATAATAACCAGTTAATAGACTAAATGTGGAGTATATTATACGTGTTATATATGTATTTATTACCAGTATTCAATGTTAGTTTTGTTGGTTTGTCTATATGTTATTAGTATGCTTGTTTGTCATGAGAACTTCTGTGCCGATTGAATGTTTATTCAAGCAATAAGCATTAATAACCTCAAGGTGTGAAAAAGATTTAGCACGTACTTGTTATATACTTCTTAAAACACTTTGTATGGTATTATTTATTTATTTATATTAAGCGTCAAGGACTTTTAATTGCTAAACAAGCTTACCCTTAGTCTCTAGATTGTGCAACAAGGTTGCTACATACTTGATTTGGTGGTAGTTCATTGTGCTAGTGAACTAATAAGGTTACCCATTTAGATAATTATATGTTAGCATCGGAATGTGTGTTTAGTATTGATTAATATTGGGTTAGTATCAATGAATTCTACATTAATATTAATGCTACATGATTGCTTATTGTACAAATTATTTTCTAATATGAACCAGAGTCAAGTCCAATACATTATTGGGCATCTACAACAATGAATAAATTTAGCTACAAAACCCGAATTCAGCTAAAACCTTTCTTCAATTCTTTCATGAAATTTTAAAAGCAACCCCTACCAGCATTATAACGTAGCCCAATGTTGGAAAATTCATCTAGGCTATGTGTTTGAATATGCAGACTAAGTTTCTTTGGTTGGACATACTCTAACAATAACACATCTTCATCAGCCAATATAAATATCCATATATTTAGGTTTAGCTCATGATATTGCGAGCTGGAAGAGGCTTGTTATGTATTATTATTCCACAATAGAATATTAATATCCAGTGATAGATAACGGTGAAGAGATTATTATTCAGATCGCCATTTCTTTTTGTGAACATGTAATTCCTCCAGCTTGATAACTAAATTTAAAAGAATAAACTTTAGCATACGCATTTGAAGTTTTATTTTTATCCAAGAAAAATGTAGATGTGACTTAAATATTCAAGGCTAAACTTACAAGGAATCTTTTCCTTTCTTTTACGGTACAGAAAATTTTGGGCTTCTCAATTTAATGTTTTATTCCAACCTATTATCATATTAAACTATACTCAAGAGTAACATAACCTTTATTTAGATAATATTTTGACATGTGTGAAGGAACTACACATAAAATTATTTTTGAATGAGATACATATTTTACATTAGCATGTAATATTAGTTATTAATAAATTGGGAAATTTTGTGATATAATATATTTTATAGTTAGAAGCGATTATTGAACCCTAGTACTCTTGGATTTATATAAACCAATAAAATAATTTTACACAAATTTTTTTATTCTCTCAACAAGTTAAGAAATATATGCCAATAGAGGTTTGTTCAAGTTTATATAGTTTTATCATCAAATCTCAACAGATAAACCCCAATATATCTACAGAAATGTTATAATCATATTGGTGATATAAAAGCACATTGTTTTTTGTTTGTGAGCAGCCTCTTGCGGATGCAGTGCACTATAAGAACCATGATGTGATTAAGTTATTGGAGAAACATGGTGCTAAGCTCAAGGTAATGAAAGAAAACTTCTATTTTGAATTTCTTAATGGCTAAATGTTATCTCTGCCTATGTGCTCATGGCTTGCACTTTGTAGATTGCTCCAATGCATGTAAAAAATGCACGCGAAATACCAGAATATGAGATTGATCCTACTGAACTTGATTTCAGCAATAGTGTTCAAATAACCAAGGTATTTTTTAGATGTATTTTTCCCTTAGAATCAGGGTTCAAATGCAAATGAACTTTATTTGGCTAGGTCAAAATATGTTTTTGCTTCTTGAGAACCTGTAATTTTAAACGATTCATGTTTCTTGTCAATCATTTTTATGATGAACTTTTCACAGTTTTTAAACAAATTTGTTTACAGGGGACATTTCGTATGGCAACATGGCGTGGATCGGAAGTAGCTGTAAAAATATTTGATGAAGACGTGATCACTGATGAGGATAAAGTGTGGGTTGGTCGAATATATAAATCCTGCTTGTTAATAAATAAGTTTGGTTAATACATTCACAATTTCTACACCTTCAATGGAATTTTCTTGTTACTTTTTCAGGTTGGCATTCAGGGATGAACTTGAATTGCTTCAACTTATTAGACATCCAAATGTTGTACAATTTTTGGGTGCTGTTACTCAAAGTACCCCAATGATGATTGTAACTGAATATTTGCCCAAGGTGATTTTTGCTCAACAACCCTTCTGCTGTTAATTTTGGTCTATTTTCCAGATCTTTTTCATAGAGCCTTATGATCTGCTTGAAATAAGAGTTATTGACTTTTACCTTATGTATCCATTGCTGGCCCTCACTAAGCTCATCAATGCAGTGACTTTGGGAATCAAAGATTGACTTTGAATTTGTTTAGGATTAGTATATGAATCAATAATAAGGTTTATCAAGTCTGATTGTTGCTGACTGATGAATATTTAATATTATTACTGAGAGAATCATTGATTTGAGTACCACTTGATTTTGTCTTAACTTCATTTTTTATGTTTTAACTTTGTTCCTGCTTTTTGATTACATTTTCTTCAATTTACTTTCATATCTTTTAAGCAGGCTTACTTCAAGCTTTTGCTTCATATCAAATTGGCTTTTGCCTCCAAGAAGAAAAAAAAAAGTAAAGAAAAAAAGAGGAAGAAAACAGTTGCCTTTGGCTTCTGATTTTCCAGGATTTCAGGGGCTGTCCCTGAAACCATAGCAAGATAAGCATTGCAATAAAAAATGGCATTTGTTCATAGATATCATTTTCATGATACCCTTTATTTGTTGGTTGTCACTGGAATATCGTTGTCCTGCCTGGTGTAGTTGTTTCTGTAAGTTACTGATAACTGTATAGTTCCTATTTACAACTGAACCGAACTTTAGTCTGCGACGATGATAGAATTTGCGTATTTCCCAAAGTGACAGATTATGTCTATCTGCCATTATGAGTTTGCCAAATAGACAACCATGCCTGTTTGTTAGTTAAGGCATACAATTAAACCTTTAACACATGTTTCAGGGTGACCTTCGTGCTTATTTAAAGAGAAAGGGGGCTTTGACGCCTGAAAAGGCAGTCCGTTTTGCACTTGATATTGCAAGGTAACTGTGATTTTGATCTTGCGACATCAGTCAATCATAAAGATAAATTCATCAGTCTGATTTCATCTTAAGGATAAAATTATCAATATTAAACATGAGAGTTTTGAATTCCAACACTTCATTAGTTAGAAGTAGCTTTAGTTTGATCGGTTTCTATTGTTAATGAGATAGAAGTTTGAATTACCTGTTTTGCAGAGGGCTCAATTACTTACATGAACGTAAACCAGAGGCAATCATTCATCGTGATCTTGAACCTTCGTAAGTTATTCATTTGTGTTACCATGCTCATCTAACCGGATTGATCACTTAACATATTTCATTATTTTTTTTCCAAAAAATATTGAATGGTATTTAATATTATTTAATGTACTGTAACAGCAATATATTGGTGGATGATTCTGGGCATCTAAAAGTTGCAGATTTTGATTTTAGCAAAGTGCTGAAGGTTACGAACATTGTCCGAGAAAATAAACCACATACTTGCAAAGATGCAGCTTGTGAGTTCCTTGTATTGATCCAAAAAAGTTTAATGTCTCACTTTTAGGTTTCTGAACTACATATCCTTAAAAAAAAACCATTTTGGATATACTGGAACATCCCAAAGTTTTGTTCGGCCATAACTGCTGAATAACCTTTAGCCCATTTGGCAATTATTGCTGTATGCCGAGTAGTACTATACTACATTTGGCAGTTTATTTTCAAACAACCTTTAATCCATTTGGTTGAGTGAATTTAATCCACTTGACAATTATTGCTGTATGCACTGAGTTTATGGAAATGTTATGTTTAAGATTTTCCAAAGTTTGTGACCGGTTATTTGTCCAAGAGAATGATATCCCCTTAAAGCATCCCCAACACAAAAGTCAGTCACTCAAATAAAATAGCATTACTTTTCACTGACTCACCCTGACTCACCCCATCAGTATACCACTTTATCCGGCATTTATAACGCTGAATAAATATGGCCATGATTGCAATCCACGTGAAAAGTAATTAATCTCGGCCACATACTTACCTGGTATTATAAATGCCGGATAACTCAGGGACTGCGAAGGTCAGTTAGTGGTGAGCCCATATTTGGACTCACCGACCCCGTGTTGGGGTCAGTCACCAAGTGACTGACGCCCTGTTGGGAATGCTCGTAGTACTGCTTAAGTGTCAGTCACATACTGGAGATAGAGAAAGTTTTCCTTTTTTTTAGGAATCCCTTACCAGTTATTTGTGCAGAGTAAACATCTCATTGATTTGTGAAGTATGATTAACTTGTAAATAATGATATTAATGTACTAG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AGTTGATATTCCAATTTTTAATCAAGTCGACCGATAGGGAGGTTACCTTTAAACCAAAATTACATGCCTCGTTATTTTGTTTTGCCTCTTCGGT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267192.1	3.4e-164	serine/threonine-protein kinase STY8-like isoform X1
Swissprot	F4IS56.1	4.2e-74	Ankyrin protein kinase 1
trEMBL	A0A5P1EQK8	2.5e-164	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G58760.1	62.63	1e-162	569		Integrin-linked protein kinase family

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G01435	AT3G58760.1	471	158	5	1	457	3	469	62.63	1e-162	569
AfisC5G01435	AT4G18950.1	434	149	2	8	436	9	438	63.59	3e-162	568
AfisC5G01435	AT2G31800.1	429	214	6	8	425	43	468	46.85	2e-108	389

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g532707.t1
Allium fistulosum	AfisC5G01435
Allium sativum	Asa6G06049.1
Arabidopsis thaliana	AT4G18950.1
Oryza sativa	LOC_Os01g54480.1; LOC_Os01g54480.2; LOC_Os01g54480.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF12796.4	Ank_2	Repeat	41	130	48.6	8.6e-13
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	160	411	186.2	6.1e-55

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005783	C	endoplasmic reticulum
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0006970	P	response to osmotic stress
GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009743	P	response to carbohydrate
GO:0009898	C	cytoplasmic side of plasma membrane
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0036094	F	small molecule binding
GO:0044249	P	cellular biosynthetic process
GO:0044281	P	small molecule metabolic process
GO:0044711	P	single-organism biosynthetic process
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048856	P	anatomical structure development
GO:0050793	P	regulation of developmental process
GO:0071310	P	cellular response to organic substance
GO:1901576	P	organic substance biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network