result

Gene information

Detail information of AfisC5G01556

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G01556	chr5	295856133	295867655	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G01556
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010910323.2	1.2e-47	probable WRKY transcription factor 24
Swissprot	Q8GY11.1	3.3e-42	WRKY DNA-binding protein 43
trEMBL	A0A6I9QIS0	8.6e-48	probable WRKY transcription factor 24

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G46130.1	76.47	7e-45	177	ATWRKY43;WRKY43	WRKY DNA-binding protein 43

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G01556	AT2G46130.1	102	24	0	173	274	7	108	76.47	7e-45	177
AfisC5G01556	AT5G41570.1	111	27	2	164	274	70	176	72.07	2e-43	172
AfisC5G01556	AT1G64000.1	101	23	1	174	273	91	191	76.24	2e-43	172

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03106.12	WRKY	Domain	196	253	91.4	3e-26

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001046	F	core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0042742	P	defense response to bacterium
GO:0050832	P	defense response to fungus
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006817	P	phosphate ion transport
GO:0008134	F	transcription factor binding
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009624	P	response to nematode
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009867	P	jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:0010055	P	atrichoblast differentiation
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010228	P	vegetative to reproductive phase transition of meristem
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0032107	P	regulation of response to nutrient levels
GO:0043620	P	regulation of DNA-templated transcription in response to stress
GO:0048527	P	lateral root development
GO:0051607	P	defense response to virus
GO:0070301	P	cellular response to hydrogen peroxide
GO:1901002	P	positive regulation of response to salt stress
GO:1901141	P	regulation of lignin biosynthetic process
GO:1904369	P	positive regulation of sclerenchyma cell differentiation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network