result

Gene information

Detail information of AfisC5G02245

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02245	chr5	426209804	426215708	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G02245
GTTCATTTTCTCATCCACTGTTCCGTTTTCTCCCAAATCGAAATCAAAAAATATCAGCCTCGCTAATCTTAACGCAACAGAAGATATTCGCAAACCATGTCAAGAGTTGGTCCTATCTCTCAGGACTGGAATCCAGTCGTGATCCGTAAGAAAGCCCCTAACGCCGCCGCCAAAAAAGATGAAAAGGTCGTCAACGCTGCTAGGCGCAGTGGTGCTGAGATCGAAACAGTACGAAAAGGTATGTCTTTATTGTTTATTATTTTAATTTGTTTAATTTTATGATTTGCGTTCGCTTAGGGTTTTCAGTTAGATTATAGGGTTTCAATTTGTTTTCACGAGTCTTAGGATTTTGTTGTGATTTTGTTATAATAGGTGACTGAAACCTAAATATCTGTCATCATAATATTCATTCTAAAGTTGATGAAACGATACGATACAACGTTTAACTGGTGACCTTAATCATGTTGGATAAATTTTAATATAAATTCATCTAATTTTTATATGCATATTAGTATGGGTTTACTTTGATTTGATTGGGAGAAGTAGAAGGGAAGAGGAAGAAAGAAGGAGGAAATATGAAGTCCCACATATTCGAACTTGTAGGAGTGTTTGTCTCTTGATATAAAGGTTTGGCACACCCGAATGTTTCTCTTGTGTTGAGTTCACGATTCATATTTCTCTTGTGTTGAGTACAGGATTCATGCATGTTTACACATGCACAGGCATCAGCCGGGTCGGGTTTGGGTTCAAAATATATTTTTGGATAAATTTTGTACATGCTTTCAACCCAATAGTGCAGGTCCAGAACAGTACAATGATCATATTTCTGAACTGTTTCTGGTGAATGCATGGTACTGCTTAAGCAGTCATTTTCAGTCAAATGACGCTTCTATTGATAGGAATGGTTTCTGCCAGGGGATGCACCATGTTATTTACTGAAAATTACCCAATTTCAATTGGCAATGAAATGTTGATATGCTCTTCACAACAACCGGCAATGCGTTGTTTGATTTTAACATTTACAACGGAGATAATCAAATGGTAGAGCAATCATCATTCTACTGCCAAGTGCCGACTGTTGTGAAGAACATACGTACTTTCATTGCCATTAGAAAACCGAGTAATTTTCAGTGCTTTGATGGTGCGAATAGTAGTGCTCTTAATCATATTGCATTGGTTTTGATTAGAACATCAGAAAACAAATGAACTGTATTACCATATTAATTTCGTATGACTAGAGAAGCATATCGGTTGTGCAATTTTGACAGCAAAGATATATTTTTTCCCATTTCTTTGGCTCCGCGTGGAAGTTTTTTTATAACGGTTTTGACTGGTTTTGAACGGCTCTGTATTTCAGGTGTTGTAAATAACCCTTGCTTATTTCACACTGGTAATTGTTGGTTATAAAACTAGTGAAAACTGATCTAGCAATTCTCAATCCATCAAATTTGGGTGTTTGGAAAGGTTCTAACTTTTTTTTCTTTAATTGTAACCCTACTAATCATATTGGAAAATTAACCTTCATAGAACTAAATAATAAATATAAGGGTATACATGTAGTATTACTTTAGTGGAAAACTCTTTCAACCGGTGTAAACTCTCAAGCATGCATTGATCGGCTATAACAACACTTCATGTAAATCAATCAAAATCGCTATGATCATTTATGGCCAAAACCGGTACTCTTAAAACCTCTCATAACCGGTACTACAAAACTCTCAAGCGGAGCCTTAATTAATGAGGGAGTTTCATTTCACTTATTATTTGAACACTATTACCGAGTAATTATGGTAGAAGATGTGAGTTATAATTTGATTATTATACCGTCTGTTCACTTTTCATATAATCATATCTTAGTTCATTTTCAGATCGCAATCGGGAACAAATCTGAGTTTCAATTTGATAAAATATACAATTGAAAAGAAAAGAATAAACTGTGAAAAGAAACTGTCAAAAAATGACCTTGAAAAGAAAGTACAGGAGAAAAAGTCCATCAAAAAAACATGAAGAGGCAGTATATCTTAAAAGAAAGTGGCAAGATATATTTAGGGTTATAGAAAAACCTCATGAGCGTAGAAACTGATGGTGGTATATCATTTAGATTATATGTTACTTAACTGGACGATGTAATTGTCTTTATTTATTATTATTTTATTTTAAGGTTTGCTTAGATGGCTATTGCATTATTGGGCCGTTGGGTTAAAGTTTTTATTTGTTTAAAGAAAATTTAATTGCTGGGATAACTAATTTATTGGAGTAAACATGTAAGGTTTTATTATAATTTATTATAATTGCCCGTTGAAATTTAAGAGCAAAATCTATATAATTTTTTTTTGAAATTAACAATTGACCGGATTTATCAAAACTTGAGAGGCCTAAATCCCGATGGGATCACCACCTAATACCTTGATTTCAGTCTTTCAGGATTCTTGTTATAGGCTAATTGTTTATATGATGATGTTTAGAAGAGAATGTAATATGATATGCATATAATGTCATACATTGTTCTGCAGAATCGATGATTCAAATACTAAAAGTAGTTCGCTATTTGGGACCCCTAATTGTACAACGGTATCAGTAATAGGACAATGATTCTCGTTCTTTTATTGACGTTTATGGCTCACGGCAATAACTTTCATCTGACAAATTCAAAACGTTGAATCAGCTGTGTTCACACCATTTGTACTTGTGTTGGTTGATTATATATGTTTTGGTAAATGATCTCTAATCGTTCTTAAAATCATGTAGCCGCTGCTGGTACGAACAAAGCTGCTTCTAGTAGTACATCTTTGAACACAAGGAAGCTTGCAGAGGAAACAGAGAACCTGACCCGTAAGTATTTTACCTTGCATGCTTTTAATGGTGCACTCTTTGCCTTTTTTCTGTATAAGAAGTTAAATGATTGATTTTCATGTTTTATACTGGAAATGTTTAAATCAATGCAGTTCAGAATTCCAATACGACACTTTTCTTTTCACATATAATGCTTAACCAAGCATGATGCTTAATTAACCGAGTCTAACTATTTTTTGTGTTATTGAATTCACTATTCTATGCATGCTTTTGAATTTCTGCTTTATTATAACGTTGGCAATGCTATCTGCAACCAAAGTCTTATAATTGTTTGCAAAGTATGTGAGAACTTTTCATTATGAATACTAAACTAGATGGTATGATAAATAACTAAGCAACTCCCATACATACCCAGCACTAGTACAAATTTTATACATATCCAATACCTCCCTTTCCATGATCATGTGAATGAAGAAAACATGATTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTGGACCTATTTCGGTTCAGTTTCATATAACATCCTTGATGATGGAAAATGAGATTAATACTTACAATTATATATTAACTTGATCTTGGTAGGAATATTTATGCAGCCAAGGGCTCTTCTTTATGTATGGCTTCAACGATTACAAAATTATAAATTATAGGAACTTTCATCGGACGCATTTCATATTGCATGTGGCTCACTTTTTTATTGACTAGCTTCATTATCTGTAGATCAGTATGTATTTGTGCTTAGACATTTGTTACAGATAATAGTAGTCACCAGTAGAATTTTCAACAAAATATAGTACATGGAAACTTTGGTGGTTATGTGATCTGCTTGTCCGTTTTTATAAACTAGAACATCGAAACATGCACACAAACCTGAACCTAATCTGGCAACGTTGATGTATGTGTTTCCAGTCAACCTTATATATTGTACATTGGTTTTTACTAGGCCAATCTTACAAGGTAGCTGCAGCTAGTAGCCAAGTAATATGTTATCCATCATTGTTTGGATATAATAATTCCTTAAGAACTGGGATAACATCAGAATTAACGATTCTAGAGTACTTTGATTTATTGCATGTATGCTGACATGATAATTGATATAATGTATCCATATAAAAGAGTTCTACATGTATAGTGCACTAAATGGAATTTGTAAATACATATTATGCAAAATAATATGCAGAAATATATGTTAAAGCTAAAACTTAAAGTAAATTGATAAAGCATTTTTATAGATCTGTAACTTACAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATTGGGTATGTTTAAAAGTTTGGTAATTTTTGTATATCTTCAAATAGGGACCTGAAATTGCTTACTACTTGCGTTGAAAAAATCATGAATTTTATTACTGTTGAAGCTTGGAAATTGCTAAAAAAAAATGCCATGACTAAAATTTTGATGTTTAAGCCTCTTAAGATAATAGCTCATCTGAAAATTCACCTTGTTTCACATAAATTTATGATGCATGTTCCTTAAATGCACAAAACACCCCCCAAATTAGCTAGTACAATAAAAACCCTTCAAATTTTGAACCAACACCGAAATTACCTTCAAACTTGATGTTTATGTTAGCATTTTTTTTGGTTTAATTTCTGAGTGTAATTTGAAGTTCTTTGTTTTAAAATGAAACTAATTAGACCAAATTTGGGAAAATTTGGATATAGACATTAAATACTGAAGAAGAAAAAGTGCCAAGGGAGAAAAATAGTACTAAAAGAACCATTGTTATATTTAGGTTTTTTTAAATTACATTGAGAAAAATAAATGAAAATAGAGGTTTTTTTTCTGAAGTTTATTTATTTTTAATACCAAGATGTTTTAGATAATTTGCCCTGAAATTTATTACTGTGCATGACTAACCTATTTCATCAAAGTAACCCTATACCTACATAGACACAGGGTAGACATAAAAATAAAAATCTAATTCATCAAAGTAATTCATACTAACATTGTATGTTTAAAATATACTTTACCTTGTATTAACTATCCGTCTATTCGTTTAATATAGCTTTTAGAAAACAGGTTTATTTTATTTTATCTTTTTATATTCATATTCAAGTTTTTACCTTCACTTTGTGCACTTTCTTCCAGAAGTTAACTTTCCGACATAAATTTTGATTTAAAAGTGCCGCTTTATAAAGTATTTACATGGAAGCTGTTTGTAAAAAATAAACGCATTTCAAAACTTGTAAGGAAAGTGATTTATGAAGTACTTCATAATTATAGTAATGAAATGGAAATCCTTATAAAGAGAAATGTCAATGTCTGCCCACTGCGCTCTCATTGTTAAGATGGTATAATTACATAAGTAACCTCTATGATTTTGGAACATTTAGAGGGTAATTTGAGTATCTAACTATTATAGTTTGTGTATAGTGTGTCATCATTTAATGACCATTTATGTGCACCCAAATTACGGCAATGTTCCCAAATGTTATTGTTAAAATCTACATTAGATTGATCTCGTGTACCTGTTTCCCTCAGATGAGAGAGTTCCAAGTGAACTGAAGAAAAACATTATACAAGCTCGAACGGATAAAAAGCTCACTCAGTCCCAACTTGCTCAGGTGTTGTATTTACTACTACTTTGCATGCAGTTTGATTCAAGCTTTTCTGGAAACTAATTCGATGTTAACGTTTATTTCATTTAACGTATCACAGCTTATCAATGAGAAGCCGCAGATCATACAAGAATATGAGTCAGGAAAAGCTATTCCAAATCAGCAGATAATCTCCAAACTTGAAAGAGTGCTTGGAGTGAAACTGAGAGGTAAGAAGTAACTAAGCTTTGTATGCCGAAAGCTTGGTCAGTTTAAGAAATGTTGCCTGTGGAAACTATATAAAAAGTTTAGTCAGTTCAAGGAACTTCAGTCATGTGGTTGTTTGCTTTGTCCCTTGCACTTTGTTTATGTACATATTGTCGTGAAAACTAAGGAGATGCTTGTAGGCAATGCTTTTATGTTTGCTGTTGGAATATTAGGATTTGGTAAACTTGTTTTATTCAGTTATGGTAGTTTTTCTCTTTGACTC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_021688123.1	1.7e-58	multiprotein-bridging factor 1a
Swissprot	Q9SJI8.1	1.0e-55	Multiprotein-bridging factor 1a
trEMBL	A0A6A6MMB3	1.3e-58	HTH cro/C1-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G42680.1	81.69	2e-63	237	ATMBF1A;MBF1A	multiprotein bridging factor 1A

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G02245	AT2G42680.1	142	26	0	1	142	1	142	81.69	2e-63	237
AfisC5G02245	AT3G58680.1	142	29	0	1	142	1	142	79.58	1e-62	234
AfisC5G02245	AT3G24500.1	139	69	1	5	141	7	145	48.92	4e-33	136

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08523.7	MBF1	Family	9	79	78.0	5e-22
PF01381.19	HTH_3	Domain	88	138	47.9	9.6e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003713	F	transcription coactivator activity
GO:0003729	F	mRNA binding
GO:0004402	F	histone acetyltransferase activity
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0005669	C	transcription factor TFIID complex
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0007275	P	multicellular organism development
GO:0008168	F	methyltransferase activity
GO:0009405	P	pathogenesis
GO:0009408	P	response to heat
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009873	P	ethylene-activated signaling pathway
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0019216	P	regulation of lipid metabolic process
GO:0043388	P	positive regulation of DNA binding
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0045446	P	endothelial cell differentiation
GO:0070062	C	extracellular exosome

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K03627	MBF1; putative transcription factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network