result

Gene information

Detail information of AfisC5G02533

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02533	chr5	482398269	482406466	-

Sequences

CDS

>AfisC5G02533
ATGGAAGATTACAGTGTAATCTATGAAGCGGCATTGAGTTTTATAAAATGTTACATTGGAAATTTTGTTTTTTATGTAAGGCAGAGCACATGCCCAGTTTTGCAAACTGAGCATAGCTCAGTTGAGAAAGCTGAGCTTGAGCATAGCTCAGTTGTGCAAATTGAGTATGTACCAGGTGAAGTGCAACCAAGACCTCCTGCTCCACCACCACCTTATGCTTCTCCACATTTGCCATATCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCACAACATGTACAATTTAGTAGTGCATCTGGTGGTAATAATTCTGGATTTGAACCATTAACTCCTAATTTTGCTCCGCCAACCCCTAATTTTACTCCGTCTTATGCAAATAGCAGTTTTACATATGAAGAACTGTCAGTCGCTACAAATGGATTTTCTGAATTTAATCTTCTTGGACAAGGTGGATTTGGATATGTGCACAAGGAGTACTTCCAAATGTTGTATTATTTTCATTCTCATGATATACATTTTACAGCAAAGAATGTACCTCCTATAAATTGGCCAACACGGTTGAAAATTGCCTTGGCTTCTGCTAAGGATTTAGCATATCTCCATGAAGATTGCCGACCAAAGATTATCCATTGTGATATCAAAGCAACTAATATTCTACTTGAGTTAAACTTTGACGCGAAGGTTGCAGATTTTGGCATGGCAAAACCAAATACTGAAAATAACACCCATGTTTCTACACGTGTTATGGGAACATTTTGTATGAGAGTAGAACCCATTGCTTATGTTGATGACCTGAACATCTTCTCCATGCATGGTAATGTTGTATTTTTTGACATCCATCCTTACTTACCATCAGAAACTCCCATAGGACTTATAGAGTTGAGGAAAAAGGAACTCGAGACAATCCGCGGCAATGGAAAAGGAGAAAGGAAACATTTTGAAAGAATTTACAACTATGACACGTACAACGACCTTGGTGATCCAAGAAATGCAAGGCCCGTACTTGGAGGAAGCAAAGACTTTCCATATCCAAGGCGATGCAGAACCGGACGAGAAAAAATAGATGATGATCTGTTGTTCTTCCAGAATGGAATGCTTGACCCTAGGATTCAAGGTAAAGGTCCAGAGGATGCCAATCAAGTTTTTGCTTACTTTGCCATGTCAAAACTCGAAGAGCCTCATATTGATGGGATAATTGATACAATCCTCGGAGGCCTGACAGCTGCATTTGGCAAATGGTCATCCACTGTGGCATCTCAGTTACACGGAGGAGGTCTCTCTTACAAGGTATGA

Protein

Gene

>AfisC5G02533
ATGGAAGATTACAGTGTAATCTATGAAGCGGCATTGAGTTTTATAAAATGTTACATTGGAAATTTTGTTTTTTATGTAAGGTATCAGAACAAGAAAATACATAACGTTAACTGCATCAAATGTGCACCAATGAAACCTGGCATTAAGTTTTAGTTCCTATAAATTGACACTTGATGTTAAATCTAGCAAACATTTTGACCATACCTGATTTATGAACAGTTCATAGTTGTATGGCATCTCCAACTGAGCTTCACTCAGTCTGTGATTTTCAGGTTATTGAAAACTAGAACTTTAATTTTCACGTATTAGGTGTTGCAAGAGGGTGTGGTTGGCAGCACATAGGCGCGTAAATAAACCTCGGTGCATTTTATATTTTTGGAATTCCAGTTGTTGTTGCTTGGCGATATACCATGTTCATGCAATTGTGAAAAGTTGTACCAATTGGCGGCAACAGGTATGCTCCTCCATGTTACTTCATTTTGCCCAGTCAGGGTACTACCCTTTATAATAGTTTATCACCATTGGCAGCAAAGGCGGTATCCAGTCAACTATCAGTTTTATTTTCGTTTATGCAGGCAGAGCACATGCCCAGTTTTGCAAACTGAGCATAGCTCAGTTGAGAAAGCTGAGCTTGAGCATAGCTCAGTTGTGCAAATTGAGTATGTACCAGGTCAGTTGTGCAAACTGAGCTCGGCTCACTTGTGCAAATTGAGCACAGCGCAGTTGAGGAAATTGAGCATATGCTCAGTTATGTAAACTGAGCTATGCTTAGTTAATCGAAACTGGGCTATGCTCAGTTATGCAAACTGAGCTATTTGGTGATATTGTTCTTACGATTGGTGATAGGACAACTGCCCTTAATATGGATTGTCGATCTTGGGTGCATTTCAATTTGACAGCCCTGAGAAAAGGAACTTAAAAGTTAACGTATTGTGATATTTTGGCATTGAGTTTAAAGAGATTTAAAAGTTAACGTATCTACTTGTTTTTTAAAACAATTTTTGCAATTATTAGTGGTTACTATTCAAAATTTATATAATTTCTACTGAAATTAAATTTCTCAAGTTCTTTGTTCAATATGTGTTTGTTTGTAGACAATTCTCATGATGTAAAACCCTAACATTGGCAACATAATGATGCATCACAAGGTGAAGTGCAACCAAGACCTCCTGCTCCACCACCACCTTATGCTTCTCCACATTTGCCATATCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCACAACATGTACAATTTAGTAGTGCATCTGGTGGTAATAATTCTGGATTTGAACCATTAACTCCTAATTTTGCTCCGCCAACCCCTAATTTTACTCCGTCTTATGCAAATAGCAGTTTTACATATGAAGAACTGTCAGTCGCTACAAATGGATTTTCTGAATTTAATCTTCTTGGACAAGGTGGATTTGGATATGTGCACAAGGAGTACTTCCAAATGGTAAAGAAGTTGCAATCAAGCAATTAAAAGCAGGTAGTTGACAAGGAGAACGTGAGTTCCAAGCAGAAGTCGAGATTATCAATCGTGTGCATCATAAACATTTGGTTTCATTAGTTGGTTATTGCATTTTTGGATATCACAGATTGCTTGTGTATGAATATGTTCCTAACAAGACTCTCGAGTTCCATTTGCATGGTAACCTTTCTTTTCTTCTTTATGCTCTAAATGTGTTTGTATCTGTTTTGTATTGTAATTGTTAGGTTGTTACACACTACACTAGTAGTCAGAAAAAACACCCGTCCTGCAAATTCTTTGTAAAATGGAAAATGCATCGGTTGAGAAAATTTAGGTAGTGTTTGGTTTAAACACGAATTTAGTGTTTTTGGTTTTCAATATGTATGTCAAATATGAGAAGAATTGAGAGACGATGGGGGATGAAAGAAAGACGGATAGGAGGACGAAGGGATAGAGGGACGACGGAAGAATAGATTGTTTCACGTGCTTGTGTTATTTTCCAAAACACGGAAAACAAAAAAGTTTTTTTCTATTTTGTATGTTAACTTCGTTTTCTAAATTGGTCGTTTTCGACAATACATATGTATCGTGTGCATTTTTGTATGGAGGAAAACCCAAAATTGAAAACAATAAACCAAACACTACCTTAATCTGTATAATTTTGTTAATCATCCGGATGGTTTATATCTGTTTATGATTTTTTTTAGGTTTCTCTCCGTTTCCTTTGTTTATCCTTGCATGTTAGACATTGGCCAAGTGAACAACATTAACATAACTCTGGATAAAATTATTTAACAAACTTGTTTTCCTGGCATGTTATAGTAATAACATCTACACCAGCCATGGATCCAAAACATGCCATCTACATCATCTATATTAACAGCTAACAGTGTGCTCACACATTTCAATTAGTTAGCTGGAATTTGATCATATGTTAGGTCAGTTCTATTTTAACCTGTCAAACTGCCTTTTGTATCCGCTTATAAAGTTATAATTTTTTTACTGACCAAATTATCATCCTTTGTTTAATACTCTTGAATCATTATTATAGTAACCAAAAATGTTTGCACAAAAAATGGGTAAACACCTCCAAGTTGTATGATTTAGTTGATTTTATGTTGTTTTTAGTGATCTGCGTGATTTATGCAAATATATAAAAAGCAGAGACTAAACTGTAAAAGACACATAGATTTATAGTGGTTCGGTCAGAATGTGCCTACGTCCACTTTATATGTTATTCTCCTTTACTGTTCAGACTACAAGTACAAAGCTTTGATACAAGTATATGAAAGTTGTTTGAAAGTTCTACCAATAACTCAAAAAAAAGTATATATCTTTGCAACGCTATTAAATTGTAGTTAATGATATTCAAAAGACAAAAATGATAACGGAATCGAATCCTAAGAGGTAAATATTTTGAATGTGGTTTCAAGATTTTATTCTTTTCTTTTTCCCACTTATTTCTTTTGCGAACAAGCTGGAATGAAATTGCCATGTAGATCAATTACAAGAGAAATCAAACCTAAGTACATACGCGAGTTGCTAAACTGTACGCATACATAGTATGTGGTTGTTTTGACTGAACACGCAAGCCGTTGTAGGATATATATATAAATAAGTTATACAATGGTGATGTTTATATTAGTTGAGGGTACAAAATGCAAATTTTGAGCTATACATTTTTTTGGGTAATAGCTGATTTTTTTTCAGCTTCCAATTGGAATTTTTCCACAGTGCTCCAAAAATAACACTTACAACCAGATTTCATCGTGATCAACATGCAAATGATCTTTTTATAGCACACAGATTTTCATGTTATTCTGATATGTAAGCTTAATTCTGGTAACCAAGGCCTCCTGTTTTTATAGCATTTTATCAAATTCCATGCATCAGTCCCCCTATTTGCTTCCATTTGTCCTTTAACAATTATTTTATTTTTATTTCTATTATTGAATAAAAACCAAAAAATTTGAATTGCATGTTATGGAATTTATGATGCTTCAGTCCCTCCCTTGTCCTCTTCTCTCTCCCCCTCTCCTTTTCTCGTATACCCAGAGTTTAAACAAAATTAAAATACACCTTATTCTTCTTTGAGTAGCTATATCCTTCTTTGTCATATAGTTGTATTATTTTCATTCTCATGATATACATTTTACAGCAAAGAATGTACCTCCTATAAATTGGCCAACACGGTTGAAAATTGCCTTGGCTTCTGCTAAGGATTTAGCATATCTCCATGAAGATTGTAAGTTTATTAATACTTTTATCTTTCAATATGATTATAATGAAATATTTTCAACTTATCTTCCTTTTGTGAAGGCCGACCAAAGATTATCCATTGTGATATCAAAGCAACTAATATTCTACTTGAGTTAAACTTTGACGCGAAGGTAGGCCTAGGCCTGACATATGATATACTTGAAGCTCTATTATAGGTGCAAAAATAAATTTAGTAGTATTTTGTATTGCTTGTAGGTTGCAGATTTTGGCATGGCAAAACCAAATACTGAAAATAACACCCATGTTTCTACACGTGTTATGGGAACATTTTGGTATGAGCTCCCAAATAAAAATACATCTAAATTTCCATTAGATTTTTATCCTTGTTACCTTTTGTGTCTAAGTCTTCTGACTATGAAACATTGGCATAAATTTGAGATATATACCCACATTATTTAGATGAACGTCTCAAACTGATAAGTACTGAAATAAAAGTGAATTGGTATGACAATCAGTATGAGAGTAGAACCCATTGCTTATGTTGATGACCTGAACATCTTCTCCATGCATGGTAATGTTGTATTTTTTGACATCCATGTAATCTTCGTTAATTATACCATTGACTAATTGCTTCATCACTAAGTCCTTAATTGACCAGAATAATTGCTTCTTCCTACTACCCCATCTGCATGCGTATGCTAAATTTGTTTGTTCTTTGGTGATCAGAGTACTTTCTTGGTTTACACAACAAAGACGGTGTGCAAGTAAAAAATGTTATTTCTTTTATTTCATAACATGTGCTCCCTCCTGAAGTATATACAGTAAAATTTCCCTAAAATATTTATAATATATACACATAAAAGTACATTGATAGAATAAATTATGATTAGTAGACTTATTTGATATATTTCACACTAGAATGAATAGCCAATAGAAAACAATTGAAACTCATAATATAATTCATTTTATATTAACACCTAGGTAATGCAACTATTAACCGACATCTATATTTTTTTTTATTTTAGCCTTACTTACCATCAGAAACTCCCATAGGACTTATAGAGTTGAGGAAAAAGGAACTCGAGACAATCCGCGGCAATGGAAAAGGAGAAAGGAAACATTTTGAAAGAATTTACAACTATGACACGTACAACGACCTTGGTGATCCAAGAAATGCAAGGCCCGTACTTGGAGGAAGCAAAGACTTTCCATATCCAAGGCGATGCAGAACCGGACGAGAAAAAATAGATGATGGTATGTACAGCTAAAGTTTAGTGCTTCACTTGTATCACAACAATCTCCCATTTTATATGCATCC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	OMO84343.1	8.4e-32	hypothetical protein COLO4_22096
Swissprot	Q9ZNQ8.1	8.4e-29	Proline-rich extensin-like receptor kinase 4
trEMBL	A0A1R3IP57	6.0e-32	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G49270.1	44.25	4e-41	166	AtPERK7;PERK7	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G02533	AT1G49270.1	226	72	3	77	248	276	501	44.25	4e-41	166
AfisC5G02533	AT3G24550.1	195	51	3	107	248	250	444	46.67	2e-40	163
AfisC5G02533	AT2G18470.1	198	58	3	104	248	251	448	43.94	2e-38	157

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	184	243	36.5	2.9e-09
PF00305.16	Lipoxygenase	Domain	287	353	93.7	8.4e-27

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0006633	P	fatty acid biosynthetic process
GO:0040007	P	growth
GO:0019722	P	calcium-mediated signaling
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009617	P	response to bacterium
GO:0009695	P	jasmonic acid biosynthetic process
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009901	P	anther dehiscence
GO:0010193	P	response to ozone
GO:0016165	F	linoleate 13S-lipoxygenase activity
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0034440	P	lipid oxidation
GO:0043167	F	ion binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048364	P	root development
GO:0080086	P	stamen filament development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network