result

Gene information

Detail information of AfisC5G02664

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02664	chr5	501639752	501646012	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G02664
ATGGCCAAATCTTCAGAAAATACTCCTTTTGCGTCATCTTCAGCAGCTTTTGAAAATCAAGTGGTTTACGATGTAAAACCGCTGCGTGTTCTAGCTCCCTTGACTCCTGATGTTCCCGAGCTAAACTCCAGCGATCCTTCTAATAACAGTTCTCCTCGTGTTTATAAAACACCTTTTGGTTCCTTTACTGCGAATCCAAGCTCCAAATTTCAGTCATTTTTTGAACCTAATCAGCAAGAATCAGATAAAAACACTGCAGTTTTCGAAGCAACTCCCATCAGTGTGAGAAACGCACCTACTCCTGTAAGTCCTACTAAATCCACTTCCAAGAAAAGAGCTAAACAAAAAGCCAGTACGTCTGAGCCTAAAAAGGAGCCATTTTTTGAAACTAATCAGCAAGAATCGGATAAAAACACTACAGTTTTCGAAGCAACTCCTCTCAACGTGATAAATCCACCTACTCCTGTCAGTGCTAGTAAATCCACTTCCAAAAAAAGATCGAAACAAAAAGCCAGTACCTCTGAGACGAAAAAGAAGTCAGCGCCTAAAAAACCTAAAATAGTCTTTGACCCTGATAACATTTTACAACAATGCTCTTCGCACGATGCAAGAGAGTCGGTGGAGAGGATTTTGATGACTTACGATGCATTACGAAGAAGAATGGAGCAAGTTGATGAGGCAAATAATGATGGAAAGCGTGCGTATATGAAGGTATGGCCTATTATGGTAGAAAATAACCTCAGGGTTAATCAAGATAAAAGAATTGGTGCTGTTCCAGGTGTTGAAATAGGGGATATGTACTATTTTCGATTCGAGATGTGTCTAATTGGGCTTCATTTTCAAACAATGAACGGAATTGATACCTTAACTGCCAAATTCGACAACGAAGAAGACACAGTTGCATCATGCATCGTGTCATCAGGTGGTTACGAGAATGAAGATGATGACACTGACACCATCATTTATAGTGGGCAAGGAGGGACAAAAAAAGATGAAAAAAGCGGCAGCAATGATCAGAAGCTTGCAAGAGGTAATCTTGCGTTGGAGAGAAGCTTGCATCGTGGTAATGAAGTGAGAGTTGTACGTGGTGCGAAAGACTTCATGTCTCAGACTGGGAAGATATACGTTTATGATGGTTTGTATAAGGTTCATGAGTCATGGACGGAGAAAAATAAGGAAGGTTTTAGTGTTTTCAAATTCAAGCTGATTAGAGAACCAGGTCAGCGTTCTGGGATTGAAGTATGGAAAAGGACCCAAAAATGGTTAGAATATCCTTCGTCAAGGGATGATGTTCTTCTTTCTGATTTATCTGATGGTATTGAGTGCTTACCAGTGTGTCTTGTTAACGAAGTTGATAGTGAGGAGAAACCGAATTTCACTTACGTTACTAAAGTTAGTGTTGATTTGAAGAAGCCTGCGCAGGGTTGCACTTGCAAAACTGTGTGCCTCCCTGGTGATGTAAATTGCTCTTGTGCACATAAAAACGATGGATTTCTTCCTTATAACGCAAGTGGGCTTCTAGTGAGCCAAAAGCCCATGATCTATGAGTGTAGCACTACTTGCCCATGTAAAATTAATTGCAGAAATAGAGTTACCCAAGATGGTGTGAAGCTTAAGTTTGAGGTCTTTAGAACTAATGATCGAGGTTGGGGGCTTCGATGTTGGCATCCAATTCGTGCAGGCACTTTTATATGCGAATACACCGGAGAAGTAATGGATAAATCTGAAGCATATAAAGATGATGATGAAAATGAGTATATCTTTCATGGGCTTGTAGGTGATAACTCATTTAAGTGGAATTATACACCTGAACTGTTAGGCGAGGAAAGTAAATCTGATGCAAGCGAGACTCCTGAGGATATGGGTTTTGTTATAGATGCAAAAAACAAGGGAAATATAGCTCGTTTCATCAATCACAGCTGCTCTCCAAATTTGTTTTGGCAGCCAGTCATGCATGACCATGGTGATGATAGATATCCACACATTACGTTCTTCGCAATAAAAAACATCCCTCCTATGACCGAGTTGACATATGATTATTGTTTGAGTAATGGCAAGGGAGGTGTGCCTTGGAAAGGGAAGAAATGCTTATGTGGATCATCAAAGTGCAGAGGACACTTTTGCTAACCCTGTAAGTTTGAGGTACAGAATATTCAATTTTTATCTCGTAATTTCTTTAATATTTTTATATGTGCCTATGTGTCTCTGCTGATAATTTTATTATTCAGTTGCTTTGGCTACAAAATGTGTAATAGCTCTATGATATTGAACAATCACGCTGTTACTAAATTATATGCATGCTCATGTGATCACTCAAGTAATTTGTGTATCATATTTCTTTATTTGGTCACTGTTTTATCCTACATATAATACGTTTGCTAACAAACTTGTAATATATGGATTAAATATTCATTTTGGTGTTAGTTTATTATCATCAATTTCCTATTATTTTATTGGGCGTAAACTACGATAATGCACCGACATGTAGTCTTCAGTTGCACGCATGCATGTGTAATGATGTCATGAATGGTTATGTGTTTGGTAGCAAGCACATGATTTATGTCAGAGTTGACAAATTTTATAACCAACTATGCGCAAATAATGATCATTATGAACATAAGCGAAGATTCCGACCTTCTTCCATGCTAATAATTTTACTCTTCAATTAAACTACCTTTTTGAGTTAACATGGTGATTGTTAGTGTGAATGAAGGGCTTTAGTAAAAGTTCTGAAATCCACCCACCTATAACCTATATAATTATGACAAGATAGTTATTACTTCAAAATAACAATTATTTACCATTGTATCCTGCTTACTTGATACACTTGTAATGTCGTTTTTTTTCTAGGCACATTATCATCTGATATGCATGTGGAGTCATGTCTTTTTGGCAATTTATGCATTTATGTTGGATTATGATTTCCAACTGATTGTATAATTGTTTTGATTATTGTGGGTAAAAATTGAAACATAAAATGTGAGATTGAAGTTATATTTAATATGCTAAATTAAGGAAAAAACCTAAATTGTCTCAAATATGTCTTCCCTCTTCGTCCATGATGGTTCACAATGATTGGTGATCTGTTATAAATTCGAACTCAAAATTTCATTACGAATCTGTCATTATAATATAACTTTTGAAATGTCCCGTTGATTCTTGCAAGACTGGATTCTATAATGCAACTATTTCTATTAAAGAAAACCAGTTTACTTTTTCTTAGTTAAATTGATTTCACTAGGAGACATCACATGTTTGGTTTTATTAAATTTTAAAAGGAATAATAAAATGAGCTGCCCTGAAGCAAAGACAGGTGTTTATGATCATCAGTTGAGTTGATGATCACAGTTTGTTACAAAGTTTACATAACCAATGTACTTTCTTCACCACCGTTGACAACAGTCAGGACTGTTCTGGTCGTAACCTAATGCAATTTGTAATGTGTGTTCTAGTATTTAATTGCACAAGGAATTCAAATACGTAGTAGAACCAAGCCATCAAGTTTCAGCTACTTGTAACATATCAGCAATCAAATCTCTCAATTTGCAAAATAATAATACATTAATATGCAAATAAGTAGAAAATCGTGTCTGCTATATATGCTAAAAGAAGTCATATGTTTACAAGAAAAAATTAAGACGGGCAAATGTTTTTCATGCAAAATATTTTCCTCAATTATTTTATGTTAGACCAACTGAATTTGTACGGTCAAGATTTAACGTAAACTTTAACTTTTTCTGTATTTTCATATTTATTAACATTTAAAAATTCTTAGCTGGATAATTCACTTGATCCAACAACCAATAAATCATGTAAAATTTTGGGTGCAAAAAGAACATTTTTAGAGATCAACATTTGATTTATGGGGTTACTATTTGGAGCACTAATTTTAGATAACATTTGGGTGCAAAAATTACATTTTAAAAATCCATGAAATTTGTTGGATATATGCATATATGGTATGTTGCATAGGGCATAAAACCGAGAATGACGATACTCGAATCAATCGTTTCAGTTGTATACATGCATTAGTAACATACAACAAAATGATGTCAATCATTTCCATATGTGACTATAATAGATCAATCGATATTACATATAGATTAAGTTCTAATTTTTTGCTTTCCAAAAAAAAAAAAAAATCATGACATAACCATATCCTTTGTATGCTGCCAATTTAAAACTGCATTTCTCATGCTTGTTATTTTTTGTTGATTGCTCCAAAATTTCTAGATTAAGAAATAATAAGCTAAGTCTAGATTGTGAACCATTATCAATTAACCGTAGTGCTAAACAACTGCTGGAATGATAAAAAATTACTGGTTTCAGTTGAGACTCATCATTTAGGTAGAATGAACTTAATTTTTTTACTTTTTAATCAAAAGTCTTTTGTAATTGATCAGCTTGGTTAAGACAAATATTGTTTTTCTACTGATGTTAAGTTCACAGAAATTCTCTTAGACATACACGCATACACATATCGACTACATCTCATTTTTGCTACACCTCAAATCACCCTTGATTTCAACCAAATGATTCGACTTAAATTGTTGTGCAAAATTTTAATTAATTTGCACTAACTCCAAAATTGCAGCGGAATACTAAGGCGCAGAAGCAACCAAAAGAATGATCTAGTTTGTCGATTAATTATCAACCACAAATTCAATGAAAAATAATCACAAAACAAAGAAAAACAGAAGAGTAGAAAACACAAAGATTTAACGTGGTTCGGTTAGACTGCCTACGTCCACGGATCCAACAACTATTCTTTATTTTATTGATGAAAGAAAGTACAATAGAGAGATTATAAAACTATAGGTAGCAAAGTGGAGAGACTAACCTATAATTGCAAATTGAATAATCAATTTCTCCAAAGACTTATTTGCGTTCAAAACCCCTAATTTGATTTGACTACAGAAATTATGGTTTATTGAAGAAAGGGATAATAGTGGATGCTCACACAAACCCTCATATGATGATGAACTTTATTCATTTAATAGGCTTGAGAATAAAGGATTACTTGGATATTAAGAAAATTAATTGTCCAATTGTCTTGAAACCTTTTCAAATATCCATGATTTGATTTTTATGTAAATGGATAATGATGATCTTGATTTTCATAATTTAGCTCAATTGATTGAATCTCCATATATAAACCTTTCTATCTCCATATAACAAATCTTTTGACTAATTAATTGATTAGCTAATTAATTAGTTTCCTTTCTTCAAAAGTAATCACACATAACTTTCCTCTTTTTCTTTCCACATATAACCTAATTGATTGATAAGATCAATTTGCTAGACTCTTTTTCTTTGGTAAATATTTGAATCACCTAAATTAGCTAATTCCTTAAAAACAACTGCTGGAATGATAAAAAATTACTGGTTTCAGTTGAGACTCGTCATTTAGGTAGAATGAACTTAAACATTTTACTTTTTAATCAAAAGTCTTTTGTAATTGATCAGCTTGGTTGAGACAAACATTGTTTTTCTATTGATGTTAAATTCACAGAAATTCTCTTGACACACACTTACACATATCGGCTACACCTCATTTAACTTGATGCAAGGGAGCAGTTAAAGTAGTTGGACCATGCATTATCATTGACAAATTTTATAGTAGTTGGACCATGCATACCAGTTTCATTTGCAATTCATATTACCTATTGAACACTTGCCCAACACGAATTATATTAAAAGTAAATACAAATAAAATCATGTTCAATTACTACTTTACGATTTAAGATGCTGTAAAATTCGTAGGATTCGGTATGCACAAGGTATGATATCAAATTAATTGCACTTTAAAACATTTTTGCTACAAGGGAACGACTTAATCCCTATATTTTCTTGGAAAATATGATCAGTTAGTATATGTTAAATGTATATAGTGCTTTTGCTGGATTTTTCAGAATAAATTATGAAGCAAGCCATAAATGAAATATACTTTTTCTGTCCTATAATTTCTGTTTATTGAAATAGTTACGCATGTTTATTCATGTTGTCTATTTTGCGTTACGTGAACAGGAGCATTATAGTGAGAACATGGAGTTATGTGGCTGACCTCGTATCGGTAGAAGATAAAGTGTCCATTATCAATTTTTGTAAGACGGTGTATATCTATTTACAGGAACATGTTGGTTCTTGGTGACTCATGGTGCATGGTATGTGTATTCAGTAAATTTTTTGAACTGATGCGGTTTTGTGTGGATGTAATTTAATGTTTGTTCTGCAAAAGCTCTATAATTACTTACGTTCACC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020249682.1	1.0e-199	LOW QUALITY PROTEIN: histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1-like
Swissprot	Q9FF80.1	7.7e-136	Suppressor of variegation 3-9 homolog protein 1
trEMBL	A0A8K0I5F4	6.5e-180	Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G73100.1	41.73	1e-152	537	SDG19;SUVH3	SU(VAR)3-9 homolog 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G02664	AT1G73100.1	707	342	14	17	707	16	668	41.73	1e-152	537
AfisC5G02664	AT5G04940.2	574	278	11	154	707	101	669	47.21	1e-147	520
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02182.14	SAD_SRA	Domain	255	408	158.2	1e-46
PF05033.13	Pre-SET	Family	437	530	59.2	4.6e-16
PF00856.25	SET	Family	549	680	86.9	1.7e-24

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0006260	P	DNA replication
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0005720	C	nuclear heterochromatin
GO:0007154	P	cell communication
GO:0008361	P	regulation of cell size
GO:0009294	P	DNA mediated transformation
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010216	P	maintenance of DNA methylation
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0018027	P	peptidyl-lysine dimethylation
GO:0033554	P	cellular response to stress
GO:0031048	P	chromatin silencing by small RNA
GO:0034968	P	histone lysine methylation
GO:0048366	P	leaf development
GO:0051052	P	regulation of DNA metabolic process
GO:0080188	P	RNA-directed DNA methylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Lysine degradation	ko00310
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Longevity regulating pathway	ko04211

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network