result

Gene information

Detail information of AfisC5G02856

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02856	chr5	538061577	538076376	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G02856
ATGCAGGCGGAGGAGACGCGAGGTGAAGCTGGCGACTACGGCAAAGGTCGCGAAATGGTGCGGAACTTGAGAACCGCGACTAGAAGAAAGATAGCCCATGTGACCAAGCAAGAGTAGGCGATGCGTTCAAGTAGTTGGGAGGATGCGACATAGGGTTTAAGGCTAGAGTTGATGAAATGGACTAATCCTAGCAAACTCGAGTTTAGATGTGGGGATAGGAGAAAGTAGCGTGTACGATCTGAGTACTACGTGAGCACTACTGGAGTAAGCGGTTGATCTAGGGAGTTGCAACTTGAAGCAAGCATGGTGGTTGAGCCGACATCGGCGAAGGGCAGAGACAAGGAGATTTGCTGCGTTGGTTATTGATGAATGTTGGTAGGAAGAATGCTTTGGTTTTCGGTGAGTAAATTCTTTTACTCACAACTATTGCTTGTTACATCGCACTTTGTGCTTGATTGCAATTGCTTGATTGGGCTATGCTATTGAATAGTTAATTGGGTATACTGGCATTGTTTGGGTGAGTTATATTGTAACAACCTGATTTTTCGAGTTAATTTAGTAAAATAAATAATGGTTTAAATTGAAGATTTAAGTGGAAAATGTGGATTTTATTCATTTAGAAATATAATAAAATCTTTCAAAGATTTTAATTAATGTTTTATTATTTTCGAATGTTTTGATTTAAATGGAAATTTTTAATAGCATTTCCAAAATTGTATATTGAATATCATTAATTTGTTAAACAAAAATTAACGAAGCAACCATATAGCATTAGTATTGTAACTAAATCAAAACATAGGTAAATAAGTGATTATGATTAATGGAATACAATATGCAGTGTGGTGTAAGTTTCAATGAAACTTTGAATAAATTAAATCAAGGAAGATGCTCACACACATACACACAAACAAATCATAAGGACACAACTGTTATGAGTAAAAAAGAAGATAAAAACGTAGGCTCTTTTTATACAAAATTCTTGAACTTTAAGCTTATTGTGGTCTATACTAATCCTCTTTTTTAAAATGCCTTGAACCATAATAGGATAATTTCTTTCAAGGATAGAGCATATATGCAAAGCTTGCACATACATAAAAGAACAACACATAAAAAAACAATTATGCAGATAAAACACACATTAGGCTAGTCTGGGAAATAAAGCTTTTAAAATTAAATGGAAGGTTTCTTTTTTTTTCTTTCAACTGATCATCCGATGATTTACCCAATTAGGTTTTGAATAGATGTCTTCATCACGTTTGGTTGTATTGAATCATCTGCTTGTTCTCTATCATCAATATTCAGTTGAATGAGAGCATGAATCGTAAATTAAACCAGCAACATTGATGGCTACCCTGAATATGTTGAGGGTAAAAAGGAAATGAACTGTTGGGTTGCTTCGTGTTTATTGTGACCAAGATATATTAGTTCTTTAAAAGCCCTTCAACAGCAGAAGGATCAGCTATAAATATTGATTTATTTACTGTCGTTTTTTCCAATTATCATCCAACTTTGAGCTTCATCACTAATTACTCAACTGTAGCTACCAAAGGGTTAGTAGATTTATTTACAATACTAATTTGTGTGATTGTATTTTCAATAGCTTCTAACGCATAATGCAAGGAAAGACAGCGAATGGGTTATGAAGAAGCAGGGAATTGTGAAGGCAAAGCATGGCACTTTGACGTTGCTTGCTGCCTCGAAAAAGGTTAGTCCTTTTCTTTTCTTATTTACAATTGCTTCCCCCAACAAGCTATGTTTATTCTATTAGGATTTTTGGTGATACAATATTTCCAAAATTAATAGATTTTGGAGATATTCTCGGTATTTAGTTACCCGTTTTGTGCATGAAGGAAATGGAAAGAGAAATTAAAGAGATAGGGATTTGGAGATATTTGCCATATATATTTGATTGCCATATTTTATAAAAAGAGAAACAAAAGGAATCAAATAGGAAAATAATTGATTGATGGATGGAATATTATCAATCAATTACATGGCAAAGCAATTAATGGGAATATTATTATTCCATGAATTGATTTATTTATATAAATCAATTGCTTCATCCCTAAGTAACTTTTCTCTATATATAAAGAGAGGCATAGAGAAGGTTAAGATAAGATGTGAGAGAACAATCTCTTGTTTATTTTTCTTCATTTTCTTTTCTCTTCTGTAAAAAACTCTATAATCTCTTCATATAGTAATAAAGCTCTTCCCCATTAAAGTGGACGTACACTATCTCGCGATAGTGGAACCACTATAAATCTGTGTGTTCTCTCTTGTCTCTATTTTTTTTCTGTGATCTATAATTACATGTTTGTTCTATCACGCCAAATTGCAAGATCCTATTTTTCGCTGAGAGGGACTGATTTCCTTCCCTCTACAACTGGTATCAGAGCCAGGTTCGCAAAGAAGGTGTTTTGGTAGAATGGCAGGAGGAGATGAAAATAGTTCAAATAGTACTTTAGCGCCAGTAGTTGCTCCATACGTCAGAGGCTCCTATGTGGCTTCAGGATCACAGTTGACGATAGAGAAGTGGAATGGTGAAGGAGATTTTGAAAAATGGTAATGGATGATGAAAGCAGTTTTGAGGAGAAATCGCGTTCATCGGGTAGTATTTGATACAGAGACGTTGCCTGCTGATATTTCATCAGTGGAATTAGAAGAGATGGAAGAATGGGCCTTTACTACTCTCCAGCTTGCTATGGGAAAGAATGTAATTTCTGAAATCGGTCAGGAAACCACAGCCAAAGGCATTTGGAAGAAGTTGGAGGACCTCTACATGAAGAAATCTCTAACTAACCGTCTGATCCTATTGAAGACTTTTTTCACTTATAAAATGAAGGAAGGTTCTTCAATTAAAACACACCTAAGTGTGTTTGATGACCTGTTGATGAAGATGAAGTCTGTTGAGTTGAAAGTTGATGAAGAACAGAAAGCAATGATTCTGTTGTGTTCGCTTCCAGAACGATACACTGGTTTCGCTAACAGCCTTATCTATGGTAGAGATACATTGACATTAGATGATGTGAAGACAGGTTTGCTCAGTGAGGAGTTGAGAGATCAGATGAAAGAGTTTGGTGTTGGTGATAGTAGTGGAGGAAGTAATAGTAGTTCAGGTTTATTTGTTGAGAGAGGTAGAGCAGAGAAGAAAGTGAAGAATTATAGAGGGCGTTCCAATTCTAGGAAGCCTCATTGGCGGAGTAAGTCAAAAGATGGAAGGTGTCATCATTGTAAGAAATCAGGCCATTGGAAAAGAGACTGCCCAGATTTGGAGAAGAAGACTGAAGGTTCTTCATCTATTGCGATGGTGAAAGATAATAGTGATTTATTGACAGCGGTTGTATCAGATGTTGCAGACCATTGGATATTAGATTCTGGAGCATCATTTCACATGACTCCTAATAAGGATTATTTTTCTTCCTTTGATGCTAAAGAAGGAAGTTCCATCCTTATGAGGAACGATGCTACATGTAAATCTGTGGGAGTTGGTTCAGTTCGCATTCGCATGTATGATGGGATTGTTCGCACACTTTTAGATGTTCGCTATGTTCCTAGTCTTCGGAAGTCATTGATATCATTAGGCCAATTGGCATCATTGGGATGCAAGATAACCATTATCAAAGATGGTTTGAGAGTTTCTAGAGAGGCATTTGTATTGATGAAGGGTGTTATGGTAAGAAATCTGTATTTGCTGATGGGTACCACTGTTCATGGAGAATTATGTGTTGGAGTTGATAGTTCTAAAAGTTTGGATGCTACCAAACTTTGGCATTTGAGACTAGGTCATACTTCGGAGAAGAACTTAGAGTTGCTTTGTAAGAAGAAAAAGATCAAGGGACAAATCTTCAACAAGTTGAACTTTTGCAAGGAGTGTGTATTGGCAAAGCAAACCAGAATTTCTTTTGGTGACGGTATGCATACTTCTAAGAGGGTACTTGATTATGTGCATTCAGATGTTTGGGGGCCATACCCTACTGCTTCCATTGGTGAAGCTTATTATTTTGTTTCATTCATTGATGACTACTCGCGCAAGGTTTGGGTGTATGTAATGAAAGCTAAGTTGGAAGTATTTCAGAATTTTAAGGTTTGGTTAGCTCTTGTTGAAAACCAAACAGGAAAGAAATTGAAGATTCTTAGATCCGATAATGGTGGAAAATATGTCTCTAAAGAGTTCCTCGACTACTGCAAACAACGCGGTATTAGAAGACATTTTACTACACCTAGTGATCCGCAATCCAATGGGGTTGCTGAGAGGATGAATATGACTCTACTTGAGAAGGCCCGTTGCTTGATATTGACTGCGGGTATGTCTAAGGGTTTTTGGGCTGAAGCTGTTTCGACTGCAACACATATTATTAATCGGATTTCGTGCTCAGCCATTGGTGGGAAGATTCCAGAGGAGTTATGGAGAGGTAAAAGCACTTTATTAAGTTATTTTCGTATATTTGGATGTCCAGTTTATGTTCACAATACAGGACAAGATAAGTTGGAGCCTAGGGCCTCCAAGTGTGTTTTTCTTGGTTATACAGATGGAATAAAAGGATACAGAATTTGGAATCCAGTTACGAAGAAAGTTATACACTCCAGACATGTGACTTTTGATGAGTCAGCAATGTTTAAACCTTTGGAAGGTTTATCAGACGGTTCAGATTCAGTTGATGAGAAGGCTGAAAAGACCGAGATTCCCAATTTTCAAACCCAAAGTACAGCTATTACTATTAGCAATAGTGATAGAACAGTTGATGATACATCACATGATAATCCACAGATTTCCTCTAGTAGTGATGGAGATGGTCATAAAGCTAGAGAGGATTCAGCTCAGGGTGGAGCTCAAGATGGAGCTCAAGGTGGAGCTGAAGGAGAGTCAGGCGACATAGTCATTCGGGCTAGTCAGAGACCAAAAAGAGCTCCAATTAGATATGGAGATTGGGATTATGCAAATTTGAGCCTTGATGATCAGTTTGAGTATGCTTTACATGTTGTTCATGATGAACCATTAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	KAD5507774.1	2.3e-28	hypothetical protein E3N88_15477
Swissprot	Q9M8M5.1	2.9e-23	Ethylene-responsive transcription factor ERF084
trEMBL	A0A5N6NWW4	1.7e-28	AP2/ERF domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G12980.1	60.00	7e-25	110	DRN;ESR1	Integrase-type DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G02856	AT1G12980.1	90	35	1	100	189	49	137	60.00	7e-25	110
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AfisC5G02856	AT5G44210.1	59	18	0	109	167	33	91	69.49	8e-20	94.0

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00847.17	AP2	Domain	108	157	47.7	1.2e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001944	P	vasculature development
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
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GO:0005829	C	cytosol
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GO:0019760	P	glucosinolate metabolic process
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GO:0034059	P	response to anoxia
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048825	P	cotyledon development
GO:0051301	P	cell division
GO:0070483	P	detection of hypoxia
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GO:0071456	P	cellular response to hypoxia
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:0090708

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09286	EREBP; EREBP-like factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network