result

Gene information

Detail information of AfisC5G02907

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02907	chr5	546617594	546626632	+

Sequences

CDS

>AfisC5G02907
ATGTGTTGGAGCAACCCAAAGGATGAAGAGCCTAAGGAAACAGTTCATCATGAATTTCAAAAAAGGAGAAGCATGTCCAACTTAGTATTTTTGGGCTCCAAGGAAGTACGAGACTTCAACGGAACGGTTCCTCCAATTGCAAAATCGATGCAGAAGAGGGCTCGCCAGGTGTTCCAGAAATGCCAAACCACTAATGGTTCAAAAGTAGCTGAAGTTGTCTTCTCTCCAACCGGAAAACCTTCTACCTTCGAGCACCCCACTAATGGCGACTCCATCATCAAGGTCTCCTTCAATTATGACCTGGACAAGAGTTTAGCTAACTTGGAAAGGATGGAGGAGACAACAAAGAAGAGATGGGAGGTGTTGAAAGAGGAGTTGACAATGAGTGAGACGGAGATTGATAGAGTCACGAGTGAGATGAGCATTGATGAGTTGGTGGAGTGCAAGAGGAAGCTGGAGGAGTGGAAGAGGAAGCTGGACGAGCTGAGTGAGAAGGTGGAAAAACGAGTGAAGAATTTATCCGAGTTTCAATATTATGTGCTGCAGTTTATAATTTGGAACTGCATTTTTCGTGGAAATCAGCTTTATCCATGTTTATGCAGATTTTACTGTGTAATTGGAGAATTAAAGAGCCTAGGAAAGAACTATGAAGAGACTATGCAAGTAGCACAAATGCTTGTTATTGCGAGGTGCGAGCATGAAAAAATAGTACATGCTGCAAAATGTGTGCACTTAGTTATTGGAGTGGACAAGACAGAACATTTCTTTGTTGAAACTCAAGATAAAGATATTAAATGGAAACTAAGCCAGATTATGTGTGGCAAGGCTTCTCTAAAAATCACAAATGGAGATATGGAGCCTGGATTCCAGATCCTAGGAAACATGGAGACTTTGATCTTTCCATGTGCATGCTTCATGAGTATAGCTAGGGATAAGCTTACCTTTGGCCAGGCAGATATGTTTCTTGAGAATAACAATATCATTGGCTCTGGTGGATATGCAGAAGTATACGAGGGAAAACTCGAAAATGGGAAACTAATAGCCATTAAGAAACTGATAAAAGGAACAATGGATGAAAAAACACATTTATTCTTATCTGAACTAGGCATATTGGTTCACATAAACCATGAACACATAGCAAAATTAGTTGGCGTTTCAGTAGATGGAGGCTTCAACCTCGTATTCAGCCTGTCGCCTCATGGAAGTTTATCGACTCTTCTTCATGGCCATGGAAGCTTATCATCTCTTCTTAGTGGCACGTACAGAGGTAAATTAGAATGGGAAATCAGGTACAAAATCGCTATAGGCACGACACTGGGTCTTGAATATTTGCACGAAAGGTGTCAGCGCCGCATAATTCATCGAGATATCAAGTCTGCTAATATCCTCATTACTGAAAACTTTGAACCACAGATTTGTGATTTTGGTTTGGCACTGTGGCTGCTTGATCAGTTAACCCATCACATAGTTTCAAGCTTTGAAGGCACTTTCGGATATCTTCCTCCAGAGTATCTCACGCATGGTGTAGTCAATGAGAAAACAGACATATTTGCATTAGGCGTTTTGCTATTAGAGCTTGTGAGTGGCCGTAAAGCTATAGATTCTTCGAAACAGAGCCTATTAATGTGGGCAATGCCACTGATTGAAAAGAATGCAATAGAACTTGTTGACCCTTCTATGAATCACGTTTACGACAGTGAACAACTGAAAAGAGTGATAGAAGTTGCTTCATTGTGCACTCAGCATTCAGCTGTGCTGCGGCCTAGGATAAGCGAGGTTTTGACCCTGTTAAGAGGGGAAGAAGCGAAATCGGATGATAGAGTGATGCACAAAAAGAAGGTGAAAAGGAGGACATATTCGGCAGAATTACATGATGCTGAAGATTATCATGTAACTAGGCAGTCAGAAGGGTTTGGTGTTAGGAGTAGGATATTCGTATGTCCTAGTACTTGCAAGCCTTACGAAGCAGTCCTTACAGATGTAGCTACGGAATGCCCGCGGAGCAAGACGATGGAGTATTTGTATTGTAGGCCTTACGAAGTAGTCCTTTACAGTTATAGCTACGGAGCAAGACGATGGAGCATCTGTATTGTAGGCCTTACGAAGCAATCCTTTACATATGTAGTTACGGAACGCTCACAAAGCAAGATGATGGAGCCCTTTTCAAGGAGGATACAGAAGGATACCATATTCCCAACTCGCATTTCAGTAGGCATGGGTTTTAGCATTTTTGCGAAAAATCCAAATCCACTGGAATTCGGGTTGTTGCATTTGGTACCAGAGCCTAGGTTTATGATTCCTAAGTAG

Protein

Gene

>AfisC5G02907
ATGTGTTGGAGCAACCCAAAGGATGAAGAGCCTAAGGAAACAGTTCATCATGAATTTCAAAAAAGGAGAAGCATGTCCAACTTAGTATTTTTGGGCTCCAAGGAAGTACGAGACTTCAACGGAACGTGAGGATACTCTAGGATGGCCCTTTGGGTAGGCCTAACGAAGCTGCACCCCCAAAGGCAGGTCTGTAGGTGTTCCATCAAGAGAGTATGCCTTGACTGCATTGCATTGTAGGCCTAATGAAGCAGACCATTCACTACACCAAACAGTCTATTTTGTAACACTTTTCCGCCTTAAATTACTAACGGTTATAACCGTTACCAAATTCCAAAGGTTATTTTCGTTACTTCTAGCTTGCCACGGTTATAAATGTTGGAATATTTTTTAACAATGTAAATAATACAAACTTGTTGGACAAATATGTAATTTCCCTTTTCTTATTTTACAACACACCCGCAACCCCTTGTTCAATTTTCTACTTTCCCCAATATGTTAGGGTTCCTCCAATTGCAAAATCGATGCAGGTAAATATTTGCTCTAATTAATCTCTAAATCAATGTTCCTTTGTCTGCACTCCTTATCATTCCATTTCTTTGAACTGCTGGGATTTTGTATTTGTTTTGCCTTTTTGGGCTGCTAGGGCTTCTTTGAACTACAAGGTTCTTTTTTCTCTTTTTAAATCAGAAGAGGGCTCGCCAGGTGTTCCAGAAATGCCAAACCACTAATGGTTCAAAAGTAGCTGAAGTTGTCTTCTCTCCAACCGGAAAACCTTCTACCTTCGAGCACCCCACTAATGGCGACTCCATCATCAAGGTCTCCTTCAATTATGACCTGGACAAGAGTTTAGCTAACTTGGAAAGGATGGAGGAGACAACAAAGAAGAGATGGGAGGTGTTGAAAGAGGAGTTGACAATGAGTGAGACGGAGATTGATAGAGTCACGAGTGAGATGAGCATTGATGAGTTGGTGGAGTGCAAGAGGAAGCTGGAGGAGTGGAAGAGGAAGCTGGACGAGCTGAGTGAGAAGGTGGAAAAACGAGTGAAGAATTTATCCGAGGTGATTGCCCATTTTTTATTTATGAGTATATTGATGTTCTATTGGTTCAGTTTAGCTAGTAATGAAAGCCTGGTGAGGGGGGTTGATATTCTACTATATGTTGTTTGTTAATTTTTATTTTGTTAGTTTATTGTTGCACAGCCATCTCTGTTCTTTGAACTACAACTGTTAATTTCTGGGATTTTACTGTAGTTTTTGTGCCATCTCTGTTCAGTTTTTTTACTACATAGAGTTGTTTATCTATTTTTTGGAGCAGTTTCTGTATCTTTTGGTGTTTTTTTGGGTGCAGTTTCAATATTATGTGCTGCAGTTTATAATTTGGAACTGCATTTTTCGTGGAAATCAGCTTTATCCATGTTTATGCAGATTTTACTGTGTAATTGGAGAATTAAAGAGCCTAGGAAAGAACTATGAAGAGACTATGCAAGTAGCACAAATGCTTGTTATTGCGAGGTTTGTGTTTGATATAGATTTTTGGTTTCGAATAAAACAATATGAATTTTGAGTTTTCTATTTTTGTGAAAAGGTGCGAGCATGAAAAAATAGTACATGCTGCAAAATGTGTGCACTTAGTTATTGGAGTGGACAAGACAGAACATTTCTTTGTTGAAACTCAAGATAAAGATATTAAATGGAAACTAAGCCAGGTTGGTATTTTTATTATAAATTGAGCTGTTAATGAAATTATATATATGCTGAATTATTTAATATGTTATTCAATAGAGTATATGTTGAACAACAATGAAACTATTCAAGTCATGGTTTATGTTCAAAGCCATGAACAACACATCATGTCTTGGAGTTAAAACAATATTAATCAAATTCATACTTTATTTTTTATGTAGCGTGAATACTTTATTTAATCTATATGTTGTTTTCATCTCATTTTTGTATAATTAGATGCCTAGTGTTTCTGTATTTTATGGTTTGGGTAATGCGTCGTTCCTTAATCCGCCCTCTAAGTATCAAAAGGAGTCTGCTCAATCAGTTGAAGAAAAACGGTTTGAATTCTTTTGGTTTAAATTCACGAATCTAAACATGAAATTAGAGTAAAAAGAGAAGATTCCCATGAACAAGGTTTTCAAAGTGAGATCCAAATCGTAAATCGAAAAATTCAAATTTTAGATCGAAACAGGATTTAAATCGTAAATCATAGATTCAAGACATGCATATTTTAAGCTTTGCACACACTTTAAAATTGATTTTTGATGTTTGAACTTCTATGTCTAAACCTAAAACTTCATTTTCTATATTTTTCCAATTTTATTTTGTTTGGAAATGATTAGAATTGAAATTTTAGATCCAAATAAGTATCTTGAATATATTAGTTTGAATTGGATGATTTTTCTAAACTGCGGTATTAGCTGGGTTTGAATCGGAATATAAATCGAATCGTAAAGGGAGAGATTCAATATGAAACTGGATTCAAATCGTTGGATTTTAAGATTTTTGACAACAGTGCCCATGACTATAGTATCACACGTTGGGTCTGAAGTGTCTTCCAACTCCAACCCCAACCATGCTAAATAACATAGAGCATCCTCTGTTTTGAATATAAACTCATAAACATCAAGTAAAAACTGATGTGCCTTATCTAAACAATTTTGGAAACAGCAAAGAAAGTTGAAGAAATTATGCTAGTAATAAAGGACAAGGGCTTGGTGATAGTGTTTTGAATAAACAAAACTGAGGCTCAATGGTAAACAGCGGCAGTAGCTTAATTGATTCTGTCGATACTTTGAAGAATGACGAGAAAAACAAACATACTGTCACAATAAAGAAGAAATTGTATAATCTTTCAAATTTCACAACAAAGTTTGACCATGCTTTATTTTTTGTGATTAAGAGAAGATGACTGAAAAGAGAAGCAAATGCCCTATATTCCTATTCTTTTCTGTAAGTGTTTTCTAACCAATTATGATTAGTAAACTCTAATATTCATCTTCTTTTGGATGAGATTTTCATTAGTAGTATGTATTTTCTTAAGTAACCTGATGAGTTCTTCTCTTGTATTTCTATTATTAGACATTTATGGTCATCTCATTCATTTGAATTAAAATGATAGGTAAATGCTAGTGGCCAGTTTCGTGGAGTATCCGAAATGCTTGATCATGCAGATGTCAACAAAAGCATGAAATGTTGACAGTAGGATAAGTGGAATGGTTTTTTCCCAGTAAAGTGGCATATAATTAAAGATGTCCCAAACCCACAATTTTGTCACATATTATTGGAAAATAATGAAAACAAACCATTCATGAATAGCAGACATGCAGGAGGTAACGTTCAGCTAACTTCAGAACGCTGCCATAATTCTTCTTAATATATATTTTCTATAGTTTCTAGGTCAAATTATGCATAGCTAATGTGTAACATATATTGCTTTGTCAGGTGAAATTTCCTCATGGCAGCGAGGTGCTAAACATTTAAAAAGTACTCTTATAAAACATCGATATTAGATGACTTTGATATTTACAAGAACTGCCAAAAAGCAACGCAACGCAAAAGGACCCAGAACCCTATGCTGACTTTTGGAAGTTACCAATCAGTAACATATCTTTTATTATTATTAGGTAGTAGAGTTCGAGTGCTATTATTAACACCCATTAAATGTCTTCCTAACGCCACTTTAAAAATGAATTTACATCCTATTGGAGAAATCAAAGTAGAATTGGATTTGCCTTCTGATTTAATCAGAAAAGTGTAATTCAATTTGAATCGAAGAGAGCCAAACATGTTAAAATAGATGGAAAACTATGTTGGATGTAGTGGGTGTATTGAGGTTAAATGTGGGTGTGTACGGTTGCATTCTATAATTTTTCATTCGAATATTAGCAACTAATAGATAATCATGTTGTGATTTTCTACAGCCTAAAATTGAATAATTAACTTACATTGTGAAGTAAGAAGCAATGAAATCAGTTTCAAGCATCAAGCCTTTGGATAGAGTCCGTGTTTAGAGAAATTTTCTGTTTTTGTTTGTTGGCATCTATTATAGATATGGTCACCATAACATTATTTTACCATATAATAATTATCATCAACTTCCTTACTTAGAGACTGAGATGTGTAATTTAAAAATCACTGTCCCTGTTATTTTTTAGTTAGATAATTTTATCACTTCTTTTTTACATATGTTTACCATTTTCCTGTCCTGCAGATTTTGATGTTCCATTGAAGATTACGGATTAGGCAACATAGCTTGGTTTAAATGTAATTTCTCCTTCATTTTCTCACCGTATTTCAATTAATATATTTTCTGTGAGTTTGATTCATCCTTATATTCACTAGATCAAAATAAAAGTCTCATCACTCAATGTATGTAAACTAACGATCAAAGTTCATCCATAGATATTAAATTTAAATTAAATGATGATATGGTTACATCTTATTTAGTAAAACTAGATTATGTCTTGAAAGTAAGATGTTGTATGTATTAACATTATTTAATGTATAACAACCAGATTATGTGTGGCAAGGCTTCTCTAAAAATCACAAATGGAGATATGGAGCCTGGATTCCAGATCCTAGGAAACATGGAGGTAATACCATTCTCCCTTCTCCCTTCTCTTTCTTCTATACACACACATATATATACACATACATACATACATACAAACACACAGATACACGGATGCATACCTTTTATATTTATAATAAAACACATATATTTTAGATCTTGTGATGGCATTTGCAGGATCTGCCCTTGCTATGTTTGTGGTTCGTCTTCTAATTTTTCTCGTTCCTTTACATAGTATCAAAATTACAATTATACATTGGCAATTTTAAGTTGATAATTTATGTGTTTTGCAGACTTTGATCTTTCCATGTGCATGCTTCATGAGTATAGCTAGGGATAAGCTTACCTTTGGCCAGGCAGATATGTTTCTTGAGAATAGTAATTTTTTTGTTTCTTATGGTGGTACGTATAATTTATATTCATG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020101291.1	5.1e-104	receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK2
Swissprot	Q8RXC8.1	1.3e-91	Protein ROP BINDING PROTEIN KINASES 2
trEMBL	A0A8B7C2H3	3.7e-104	receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF04900.9	Fcf1	Family	203	272	42.2	7.7e-11
PF00069.22	Pkinase	Domain	323	546	135.2	2.4e-39

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0005829	C	cytosol
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0009623	P	response to parasitic fungus
GO:0009814	P	defense response, incompatible interaction
GO:0010150	P	leaf senescence
GO:0012505	C	endomembrane system
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0051020	F	GTPase binding
GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network