result

Gene information

Detail information of AfisC5G02956

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02956	chr5	554944255	554955779	+

Sequences

CDS

>AfisC5G02956
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Protein

Gene

>AfisC5G02956
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020248529.1	2.5e-23	S-norcoclaurine synthase 1-like
Swissprot	Q8LPT1.2	1.3e-21	P-glycoprotein 6
trEMBL	A0A5P1E1A9	1.8e-23	Fe2OG dioxygenase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G39480.1	64.00	1e-23	107	ABCB6;PGP6	P-glycoprotein 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g103845.t1; g152545.t1; g174754.t1; g218050.t1; g286990.t1; g286996.t1; g287009.t1; g287011.t1; g329809.t1; g465558.t1; g81470.t1
Allium fistulosum	AfisC5G02956
Allium sativum	Asa2G00868.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00005.24	ABC_tran	Domain	168	234	37.6	2.5e-09
PF03171.17	2OG-FeII_Oxy	Domain	268	335	32.8	6.7e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000086	P	G2/M transition of mitotic cell cycle
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GO:0043481	P	anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light
GO:0046581	C	intercellular canaliculus
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GO:0055085	P	transmembrane transport
GO:0070062	C	extracellular exosome
GO:0072089	P	stem cell proliferation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network