result

Gene information

Detail information of AfisC5G03636

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G03636	chr5	660382718	660391717	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G03636
ATGTTTTCTTCTTCTGACGTAGATAAAACTGCAGTCGGAACTCACCTCCAGACAATTCAAAATCAAAACCGGTTTCCTCAATGGAGTCAGCAAGAAGCACAAGCTCTTCTGAATATTAGGGCTGAACTCGATAGCAAGTTCACTGAAACCAAAAGAAATAAGGCTCTTTGGACTGAGATTTCTACGCGGATGCAGCAAACAGGGTACAACCGAACTCCAGAGCAGTGTAAATCTAAGTGGAAGAATTTAGTCAATTGCTATAAGGTCTATTACGTATACTCATCAGTTATACTATTTAGATTTGCATGTTGTCAATTAGAATATCTACTCTATTTGTGTTTTCTGATTTTTCAGGTATATATCATAGTTCTACAGAATGATTTTCTATCAAATTATTTTCTTTAATCATACAAATATTTTTTTTTGGTAACTTATCTGTATTTTATTCTGACATTTGATCTGTGTATTCATGTAATATACATGAGAATATTGCTTTGTTGCACCATACATATGAAGTATATATATTTTGATCCATAAAATAAATAAATAAAACAATAGAAGTAAACTTTGCAAGACATCAATCCAATAAATTGGTATACTAAACATAAGTTTTATTCTTCAAAAATATTTATAACATTATTTTTTAACAACATAACCGTTTGTAATGCCAAGTTACGCACTATTCTCTGTGTAGACACACATCTTATTACACAGAGATGTTACACTTGTAGTTATCGCCCTTATTATCTCTTTTCCTTGTCGTACTTGTTGAGTGTTAACAAAACTTGGTAAATGCAAACATTAATTATTATGCGCCGTCATATTTTCAAACTTGAATATTGTTACACCGACGTGTTTTTTAATGGCATACTGTATACCTTAAATCATCTGCAGTTTTAATGGTGTATCCCAGTTACAGAGAAATTGAACCATTATGCTCTAAATGAAAATAGTGTTAAGTACGCGTATTTACGAGGTATTCTTCTATCAATCTTTTAATAGCTTAATTTTCCCACCACCTTTAACCAAATTGGACTTTGCTTTCACCTTTCTCTCAGGTATCTTCCTCGTTCACATCATGGACTTTCCCTATGTGAACCCTGATTACTACTTCATACCAAATCCCACTTTTCTTTTCCTAACGTAGATAAAATTACAGTCGGAACTCAGCTACAAACTATTCAAAATGGAAGAATTTAGTCAATTGCTACAAGGTTTATTACGTATGCTCATCTGTTGTGCTATTTAGACTTGCATGTTGTCAATTGGAATATTCACTCTTTTTATTGTTTTCCAGTTTCAGGTATATATCATAGTTCTACAGACTTGGAATATTTGACTTGAATAGCATACTTGACTTCTTGTACTAGTATAGCATACTTGACTTTGGATTGGTACTAACATAGCATATTTGACTTCGAACTTGAACCTCAATAGCATATCTGACTTCGACTTCGAACTTGCATATGCTCAAATGACTTCGACTTTGATGACTATACTAAGGAATGTTATGAGAACTCTCTTCGACCTGATGACTTCGATTGGCCTCAACAGGACCTCTCTTTGTATTTGCACTGTTTTACTACCAATTTTTGGGGTTAACACACATACACACTATATCTTAATGCAAACATTAATGATTATTGAACATTATATTTTTAAGGATAATTTCTACTTGTAGACTTGAGAAAAAACCTATTTCAACTTTAAATCTCATTCAAAACTTATTATAAAATAGATCTTTTTTTATACGAGGCATTTTATAATTGGATCATTTGAATTTGAGCAAGTGCAATTTTTTTTTTCTAAATCAAATTACACTTGAGCAATTTGAATTTGTGCATGCATTAAAAAAAGATTTCAAAAAATTACATTTGGCTATTGAGGTTTTGTGCTTGCGCAATTTGATCAAGTGCAAATTCAGACTTATTGAAAACAATGTCTATTTTTAATCAGTTATGATCAAAACATAAATTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTTGCCTCCCTCTTTTTTTATTCTTTTCAGCCAAAATTTGTCCTATTGTTAAACTTGAATTTTTCTACAGATGCATGTTTTTTGATGGAATACTGTAAAATTAAATCATATGGAGCTGAAATGGTTTATCCCAACTACAAAATATGGAACCGTTTTGGACTAAATGACAATAGCGTTGAGTGTCAAGTGTTAAAATGGGTTGAGTCTACGGCTCCAACATTCCACACATTCGATAAGCGCGTATTTACGACGTATTTTTCAATCAAGCTGGACTTTGCTTTCACATTTCACTCTCCCTTTGCAAATTCAAAATATTTTTTTACAAATATATAAATCTTAATATAATTTGAAAATAAAAAAATCATTTTTTTTATTGATTTAAACATATACAATTTATAAGAAAAACAATTCACGCGCAAAGCGCATGCCATAACACTCGTATGTATACATGTTTTTCGAGCTTATTTCACATATTGGAGAAAATACCATGCAAAAGAATAGAAATGCAAATAAAATCCTACAATGGCACTTTTACAAACATATCATGTGATAAGAGAACACAAGCTTAATAGCATAACTAGTTTATATTGGATGGTAGTTTCTTCATTCGCCCAAAAACATATGAAACTTTTTTCATGTTTCGGTGAAAAAATAGAAAAAGATTACACGAGTTGCAAATGGTTAAAATGGACCGTGTTCACCAACACTCAATAATGTATCTAGAGTATTAAGCATTACCATTCAGTTACTGGTAGAATCACAACTTTACATTAACTAGTGTGTAATCCGTGCGTTGCACACGATAATGTTAAAAAATAGTCTTTAAACTTTAATTATTGTTAAAAATGATTTTTTTTAAATAATATGTGATAAATTTATTTAAATAAAGGAATTTATAATTTAAAATGACATGCAATGCTCATATGTAAGGTAGAGTCGCTAACCACATATTCTTATCGGAATTATTATCCTAACTCGGTAATAACAAACACAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATTTGCTATTACTATATATGTAAATAGTTCATGCTATGTGATACGTGTATTTTTTTATGTATATAGATAAAAAAATGAATTTAATTTCCATTTATATTAACAAGAATATTCTATATATATTTTTAAGGATTTATAATGAAATAACGAATATTACATAATTGAATATATATAAATATTGTAAATCAATGATCAACTTAACTAATTAAATATATGGAGCTGAATGTTAAAAAGTAGGAAAAAAATGAGAAGAGCTTTGTATGTAATAGTAGTTGAGAACTATGCAATTAAAGCGCTCGGTGGATTCAAAGCGGTGGAGGTGCAAAAAGTCATAGCGGGGATACAGTGAGGATATAGCGGGATATAGCGGATGGCTCTAAAATAGCATATAAAACTCGTACTTAATGTTTTTTCAAATATATAAATGGTAATTAAATGAAAAAATATCATTCAATTGAATTATAATTAATACATAAATAATTTTAAATAAAAACATGTGCGAATATACTTTAAATAAACATAAAACTAGTATATAACATAATTGAATTTAGTAGAATATTAGAGTATTTTCATTTCTAAAAATATATTAAAAATTAAATCAAATAAACTAGTTTCATAATTTTTATAATGTATAAATGCAATTTTTCAATTCATTTTATTAAAGAAGATATAGCGGAAATAGCGGAATATAGCGGGAATAACGGGATATAGCGGAAATAGCGGGGCTTAAAGCGGAAAGGCTATATTTTGGGGCTATATGGAAAAATCGTAGCGGTAGAAATCCGCTATGAGATATAGCGGGGTAATAGCGGGGCATTAACTGCACAGGTTGAGAACAAGATCTTACAATCAACTCATCTGCACAGGAACTTTTATTCATTATCTGAGATTTCAATTAGTAAACCTTTTTTAACTTTGTATTTAATCATAAATTTCACGTTGTTGTAGGAGTGTCATGTTTACAACACCAATATTTGCAAAATAATAATAATTGCAGCGTTAGTTTGAGTTATGCGTTGGGTAAGTTTTAATGCCATGTTGAAAATAAGAATGTCTACAAAACCTATTTTTTATTAGAGTAATCCGTGCTTCCACACCCATGTTGTAAAACATAAATTTATCCTTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAATTTGTAATGCAATGTATGATATTTTTTGAGATAAATGAATTATAAATTAAAAAATATATTATTGTTTGTGTTTACATTTTATGTTATGTGATTCATATATCCTTATATATGAACAAAATAATAATTTTATCATCTTCGCTTATATATGAATGCTGCATACACACTTAATCGGTATATTTTATGATTTATTAGATGAATTAAAAAATGTGATGAATCAGATTTTTGACCCTCGAAAATCGACATCAACACGTCCACTGTGTAGAGTTCCAAGCAATCGAGTACCGAAAATACTAGTTCATTAGGGTGAAGAAGAAAATGATAGAAGAAGACAAACACAGAAAACACAACACAGAATCTCACAATCGTAGTGGAACAAAATATAATAATATATAATGATAGATTTTAAATACAAGGACTGTACTGTTAATATACATACCACTATCAGAGTACAATAGACAACAATCAATCTGGATAGTTTAATAACCTATCCTCACACAGCGGAAATACAAATCAAGTACGGAAAATACGCCTTTGTCATCCAGCTCATCTCCTGAGCTCCAAAGCATCCTAACATAAATCTGTAATACTCGGTCTAACCCGTGCATTATAATAAAAAAACACCCGAGTCAGTTTGGAAAACCAGCGTGAGAAAACACACTCAATTTGAATTATTAAAGTTATCAAATCCTTTGAAAAAAACAAAGGTGTCTCGTAAGACCACGCCACACATAAACACGACGGGTTTTTACCTTACGATAACCAAAACATTTTATATCAAAATCATCTGATATTATAACAGTGTCTAGGTACAAATACTT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261391.1	2.3e-39	WAT1-related protein At4g08300-like isoform X1
Swissprot	Q9LV20.1	2.4e-17	WAT1-related protein At3g18200
trEMBL	A0A5P1F2C4	1.7e-39	WAT1-related protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G18200.1	42.45	7e-19	91.3	UMAMIT4	nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G03636	AT3G18200.1	106	61	88	193	202	307	42.45	7e-19	91.3
AfisC5G03636	AT3G18200.2	106	61	88	193	95	200	42.45	7e-19	91.3
AfisC5G03636	AT2G40900.1	106	67	88	193	198	303	36.79	3e-18	89.4

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF13837.3	Myb_DNA-bind_4	Domain	27	91	65.1	5e-18
PF00892.17	EamA	Family	97	190	29.0	9.2e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0022857	F	transmembrane transporter activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006896	P	Golgi to vacuole transport
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009705	C	plant-type vacuole membrane
GO:0009826	P	unidimensional cell growth
GO:0009834	P	plant-type secondary cell wall biogenesis
GO:0010315	P	auxin efflux
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044425	C	membrane part
GO:0051453	P	regulation of intracellular pH
GO:0071702	P	organic substance transport
GO:0080171	P	lytic vacuole organization
GO:0090355	P	positive regulation of auxin metabolic process
GO:0090358	P	positive regulation of tryptophan metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network