result

Gene information

Detail information of AfisC5G04033

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G04033	chr5	750370556	750383992	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G04033
ATGGACGCAAAAGACATTCTAGGCCTCCCAAAAAGCTCATTTTCTTCGTGTTTGGAGAAAAAGCCTCGACCGCCTAAAGAATCGCAAAGAAAACCTGATGGAATATCACGCGAAGTATATGCACTCACGGGCGGCAACTTGCCGCCTGTCATGCCTACAGTTGACATTTCACACTTCAAGCCTCGGCCTCAAAATCTGGAAAATAAAGAAAAGGTTGCATTTTTGTGCTATATATATGAATGAATGGTTGCAATGTCTGGGATCGTTAGTTGATGAGTTTGTGTTGTTGCAGATTACTTGGAAGTGGCTTCCTTTTACTTCATCAGCCAGGAAGGATAATCTGCAGCTTTGTCATTGGGTGAGGATTGTCAATGGTGTTACTCCAACTGAGGATTATTCATTTGCCAAGTACAATAAGGTAAGTAATCCAGAAATAACATATTCTAGTTTGACCAAAAAGAGTAGTTCTTCTAAAGAAATTTAAGAAAATATATTCAATTGCTATGCTATAAATGCAGAAAGTGGATGTTTTGAAGTATACAGATGAAGAATACGAGAGGCATTTGACTGATCCTGTAGGTACCGGGTATTACATAATGCATTTATTTTACTTGAATGCATTTGGCATACTAGTTGCATGCCATTGTTTAATATTCAATCTGAGTGAATATTCTAAAGTCAAGTCATAAATCCTGATCAATTCTAGCAAACTCACTTTAGGGGACACCTATTAGTTGATGTGCATAGAATTCTCAGTGTAGGCTCTCTTGAGATTGTGCAACTATTTCCGGTATGTGATAGGAAAAAACTGTTGACCTTGAATATTATATATTTGATTACCACCTCCATGTGAAAAGAAAGCTATACAAACATGGAACGTTCTTCCAAATATTATGTCTTTTCTGGAACATACAAGAGAGAAAGAACTGTGGTTTAGACAATATGCAAATTATACAACCTCAAAATAAGTAGAAAAGCACTAAACCATTGAAAAATTAAAACATTTTCTTAACGTTCCGCATATAAAATGAAATTAAAACTGTCACCTTCCATTCTTGCGCTCAAGGAATTTGCCTGTCATTAAGAACTGTATTTACATATAACTGAATCTCAGGTTCTTTATTGCTGTTGCAATATTGTTATTATGACTCTTAGTTTACTGTATTATTCTTCTACCGTATTTATATTTTGTAGAGCATTAGTAGAGATGCTTGCCCTCTTAATTATTTACAATTATTTTCCTTGACATTTAGGTTGTTACTTTTAACTTCATATGGCTAAGGTTTTTATTTTGTGTGTGTTTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATGTTCTACTTTATATACAGACATGGACAAAGGAGGAAACAGATCAGTTGTTTGATTTGTGCGAAAGATTTGATCTCCGTTTTGTAGTAATTGCAGACCGTTTCCCATCCAGTCGGAGTGTGGAGGAACTGAAGAATCGCTACTATGCTGGTATTTTATGCTTTCTATCTTTTTTTATTCCGGTTCTAATGTTCTTCTGCTCCTGCTTCTGAATGAGCCATATTTCTGTTTATCTTTTTTGATTGTTCTGCAGCAATTACAAATTATGATCAAGTTGTTAAATCTGTAAATTGGATGATTTAAAAATCATCTTGTTGTGTTACATAACAAAGTTTTATTTCTATAGTTTTCCTTGACATTTAGATTGTTACTTTTAACTTCATTCTCTTTTTTCGAATGAAATGTTACTTTTTGTCTTTAATGATGTTTGGTTGCATATTCTAGCCATTGAAGACATCTTTATAGATTTTGAATTTTGAGCCATACTGCCATAGTGATACTTTCAGCATTTCTCGAATTTCAATCAAAATTTGTCTCGATATTCTGATAGAGTTTATGTTCTTGTTTGAGAAGTTGGAAGAAGGTGGTGAGAATATAGAAGAAGTTGGTGAGAAAAATTGGAAGAATCAGTGAAAAAAATAGCGAGACGGATGAAGAATTGAAAGATGTAAAGTAGAAAACAGAAATCATAATAATCTTCACTCCCTTTCTATTCATTCATCCATGCTTAAATAAGGATTGTGTCCTATAACCTGCTGTTCGTTATGCATAAAAAAAACTGAAGTTAGATAAAGGCTTTACCAATTAGACAGCTAATACACTACTTTTGGAAATCATAAATCCTAAGTTGTGCATTTCAAAATAGTGTAATAAGTTGTGCATAGCAATCTAGTGCACTTAAATCAGATCCTATCGGCTATTCCTTAAACCTAACCGTATCATTACCGCCTCATCGAAATCGACCTTGTCCTCAAGGTCAAACAAGAACTGACCAATGATAAATTCAATAAGATCAAAGATAAAAACTTTACTTTCACCCATTTTTATCTTGCATACGGTAACATATATAATCATTATATGACAATCTTTTCCCACCATCTTCTCTCCATTCCTAACTAATAAAAAAATAGATGATTTATCAATTTGCAAGCCCAAAAAATGAGTTGTTTTTGGATACAAGTAGTAATGAGTGGTGCTCGTATCTATAAGTATTGCAATTGGACCGTTGAGGACAACAGCCTGAAATCACAGAGCCTTCGGATCTGAGATGGTGGGAGGAGTGCATGGAAGGTGACGTCTTGTTTTTGCGGTTCCTCTAGTTTGGGTTTAGTAGTTTGTAGTCTTTTCATCATCTGACAATATCAGCAGTATTCGCCGATGTTGGCAATGATGAGCTGTTGTGTATTTTTCATTACAATCAAGACATAAATCAAGATCACGAAGTTGCTGCATCTCTGAGTAGCTACGGCATATGATGATGGTATTGTTGGTTTTGAGGATGGAGTTGAGGAAGGTGGTGTCTGGCTTGGAGGTGGAAGTGGGGTTAGTGATAATAGAGATGTTGGTATACTAATGGGTTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGTTGTAATAGTGGCTGTGATTCTTGCGGTGAGTTTAGTTAGTGAATAGAGGATGTGGCTAAGGGAGGCTTTGATTGTGGATGGCGGTCTTGGCCATGGTTCAAAACTAGTGAAAACATCAAATGATAGAATTTATGTTCTTGTTTGAGAAGTTAGAAGCAGCTGGTGAGAATATAGAAGAAGTTGTTGAGAAAATTGGAAGAACCAGCGAGAAAAATAGCGAGGCAGAGAAAGAATTGCAAGATGTAAAGTAGAAAATAGAAATGATAATAATCTTCACTTCCTTTCTATTCATTCATCCATGCTTAAATAAGAATTACATTCTAGAACCTGCAATTTGTTATGCATAAAACATAAAAGTGGAACCCAGTGCACGAGGCTCCCGCACGATAGCGGGCCCTGAAGAGGTCGACAATATACGCAGCATTTCCCTCGCATTGCGAAGCTATTTCCGGACTCGAACCTGGACGTCTAGATCACCATACGGGTGATCTAACCGTTGCGCCAAGGCTCCACCTCTAGAAACCATAAAGTCCTAAGTTGTGCATTTTAGAATATTGTAGCAAGTTGTGCATAGCAATCCAGTTGACTTAAATTAGACCATATCAGCTATTCCTTAAACCTAACTGTACCATATTCTCACACAAGATGATGAGATTTCAGATGAAACGAGTGTAGCTCAATGTACATCTTGGATTGACATCTCAGGTCTTAAGATAGACTATCTCGAAATAATTTATGTATCTAAACTTGATGTTTTAATGATTTTTTAACAACTGCTATCTTTGAAGTAAAAATGAAAATTGTAACACAATCGATTTGCATAGAAAAAAGAGTTGATATAATGTTTTTTCTTTTTTCTTTTTGAGAAGAGTTGTAGCTTGATTGATTTAATAGATTTGATGATATCCTCTGTTCTGAACATAAAAAAAATGAAGTTTTTGTTGTGACCACTTGGAATAAAAAGTTAGAAAAAAAAATGCAGGATTAGTACATTATACTAATTGGATTGGGTGGTTTCTTTTGAACGCTTATGAGATTAAAAAAAAAATTATGTAAAAAGAAAAAAGTATATCATTTCGGATGAGATCTCAAATTGAGATTTCGATTTATATCATTGGCTATACCTATTGAGTGGACAAGTCTTCTGTTTGAGCGGGCCTGGAGTGTGGACAAATTGTGTGCAATCGGTGTGAAATGAGGTATGAATGTGATTTGATGTCTTGTTTTGTACAAGTATTAAACGGAGATTTTGGAGGAGATTCTGATTGAGACAGAGGGGATTTAAAACCATGGATATTTTTTGTCATATTTTATGGAAAAGCGCCAGATTTTTAGTATATAGAATAAACTCATGGTAATACGTATGTAGCTTAGGAATCAGTAAGTGTTAAAATGTACACAGCTTTAATCGGACAGACTTTTTAAGGACCAACAAGGGACCATTGCAGTTTCGTACATGTACGCACGGTTTATATATATATATATATATATAGGGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGGGGGGGGGGGTTGGGGTGAGGGGAATTGCCCCAATATAGTAAGTAGTTCTGAAGTTTTTTCTCTTTGTGATTGTTTAAGCTTGTGAGGGTAATTTATACTAGCACTCTGATATGTACGATATGCATATGTATATTTGTTTTATTTCCTTCCAAAATGCATGTACTATCTATGCTCGTATTTCTTATGGAGCTGTAGCTGAAGTGATAGATTTATAATGACGATCTCATTTTTTTTAAAGAAAATTGGAAATTTTCAGAAGACAAACAAATCAGAACCATTACATTCATTGAATTTGTGCAAGCTTGCTGCACTGTTTGCATCCTCATGCTCGCTATAGTCATCTTTTATGTAACTCATAATATAATAGAGATTATCGTCCATTTTACAGTATCTCGAGCACTTTTGCTTGCCAGAGCACCAGCTATCGGTGATGTTTCTGGCCATCCACTGGTTAAGGTTTATTTGTGTCGAGATTAAGCCTTAATAAAATACATTGATTTTTCATCAGCTTTAACTTAAAGAAATATCTGA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020241070.1	4.9e-176	SWR1-complex protein 4
Swissprot	Q8VZL6.1	1.8e-138	SWR1-complex protein 4
trEMBL	A0A8K0I9Z4	1.1e-177	SWR1-complex protein 4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G47210.1	60.84	6e-149	524		myb-like transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G04033	AT2G47210.1	452	147	7	2	439	5	440	60.84	6e-149	524

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF16282.2	SANT_DAMP1_like	Domain	106	180	108.5	1.3e-31
PF05499.9	DMAP1	Family	292	371	30.4	2.8e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003714	F	transcription corepressor activity
GO:0006259	P	DNA metabolic process
GO:0006338	P	chromatin remodeling
GO:0006974	P	cellular response to DNA damage stimulus
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0035267	C	NuA4 histone acetyltransferase complex
GO:0043967	P	histone H4 acetylation
GO:0043968	P	histone H2A acetylation
GO:0044699	P	single-organism process
GO:0048518	P	positive regulation of biological process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11324	DMAP1, SWC4, EAF2; DNA methyltransferase 1-associated protein 1	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network