result

Gene information

Detail information of AfisC5G04124

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G04124	chr5	766217646	766225945	-

Sequences

CDS

>AfisC5G04124
ATGAATGATGAAATTAAAATGAGAGACGAGAAAGGTGAATTTCCGATTGGATTGAGAGTGCTCTCAGTGGATGATAATCTAATCTGCTTAAGGATTCTGGAAGCAAATCTGATACAGTGCAAATACAAAGTGACTTCAACTACTTCAGCAATTGAAGCCTTGAATATATTGAGACAGAACAAAAACAATTTTGATATTATCGTTACTGATGTTCATATGCCTGATATGGATGGGTTTAAACTGTTGGAACATGTAGGCCTTGAAATGGACCTTCCTTGTATTATGTTATCTGCAAATGATGATCCAAAAACTGTGATGAAAGGGATTGAACATGGTGCTTGTGATTATCTACTAAAGCCAGTTAGAGTTGAAGAGCTTAAAAATATATGGCAACATGTCATTCGTAAAAAGAAGGCTTGTAAAGAACATAATGATTCTAACAATACAACTTCTGATGATGGGAAAGGAGGCAATAGTAACAGAAAACCTCACACTAAGAAAAGAAATGAACGAAATGATGATGAAGAGGAGGAAGATGAAGAAACCATAGCTGATAATGAATCCGTTTCCACGAAAAAACCAAGGATTGTTTGGACTCAAGAACTGCACCACAAGTTTATGGATGCTATTAGATTTATAGGAGTCAACAAAGCAGTACCAAAAAAGATACTTGAGACGATGAATGTTGAAGGGCTCTCAAGAGAAAATGTTGCAAGCCATCTTCAAAAATACAGACTTTACATAAAGAAATTGGAGGAGAAAGCAAATATGATGGCTGTGATGGGATTGAGGGAACAATACTTAAATCCTACTGCATGCGATAGCTATAATGATTTCCAAGCATTCTCATCATCTTCAAATCATATACAAACTCTCCAACCATACCAACAAAACACTACATTCAGTAGAGGCAATTCAGGCATGTTACTGGGAAACAACGTTGCTCGTGGTCTAGTTCAAGTACCTCTCCCTCCACATATCAACAATCCTATAAACAGTCATGGAAATAAATTTCATCAAGGGAACATTCATCAGCAAATGCCTCCAACTTCACAAAAACAACTGTTAATTCATGAAAACAATTCCTTTAATGGGTTTCAAACATCTACCAACCGGACACATGTCAATGGTAACATTTCAATGCCCGTGAATTCAACTATGATTCATTCTACTGCTGCACCAAATTCTTTACCTATGAATATGAACTCTATGCTTTCACCAAAAGTTACTCAAGCAGGTTCGAATATGAACTCAAATATGAATCATGTGAATTTTACATTAAATGGTTCAGTATCACGTTCTACCGTTGGTGTTAATAACAACTGCCTTGCTGTTGATCCTATGCTTATGCTGAATGTAACAAATGATGATTCAAATTACTTGAAATTTGGAAATGCAAGTCAAAGCCAGAATCGAAATATTGCATTAGGTTCTCAATTTGGTGGTCAGCCCTTAATAGATGCCAACTCTTCTCATAGTCAAAGATTAAATGTTGGATCAAACAACATAGGTTTGAATGTTAATGAACGCCAAGACTATAACAATAACATGCCTCCTGCTCAACAACAATGTAAATTTATAAAGTCGAGCCCTGATAACCCATTTAAGAGTAGGGATGATATTTTCTTGGACAATTCATTTTTGCAAGGAGATCTGGGTTCAAGCGGATGCAGCTTTGATGAACTGGAGAACTTGATCCAACCGGATCAAGCATTTGGTTCACCATGGCCATCTGACTTGGAGATGGACCTCTTAAATTAA

Protein

Gene

>AfisC5G04124
ATAGTTCATACTACATTCCCATGATGGGAATCCCATCTCAATGATAAACCAAGCCAATGCAATGGAAATGACAAGATTCTTTATAATCTAAAGTATTGTCCTTCACATAACACAGACAGCAGCAGATCAGATCAATCATATTATTCACTGTATAATCCCATCTTCGTATGTGTTATAATCTATCGTCGGTACATTGAAGCATGTTCGTCTTACCCAGGGCGCATTGGAGCCATGGCCCCGACACCTCCTTTAGATCTTTTTCTCTTCCAACGCCATCCCAGCACGAACCAGTTGATCCCCAGATGCCATGAGTTTTGTCTTGCATAGCCATTTGCCACTAGATTTCACCCAGATCTTAAAAACCTTGATGAGGGCATAGTTGATGATTTAGCATCGACATGAATTGGAATCTTGCAGCCAGCTCTTGAAGATCTCACATGAATTAGAATAGACATCGCAGATGTCAGGCTCAGTCTGAAGTGGACAACGATAGTGATGGCTGCAGCAGCAGCGAAAACGAAAACGGCGCGACAAAGAGAGACGATCGATATTTAATTGTAATTTTTGTGGTTTCGTGGAGCTAAATTTCGGTTTTAAGATGGAAAGTGCAAGAACGAAATATAGAAAGGGTTATTTAGTCCGAAGAAAAAACAATTTAAATTTTAATAACGTAAATAGTTGTCCTAGATATTAATTGCCTATTATTTGAGCAAATTTGCATTTTCTTTCAAATTCATTCATTTAGTTATGAACTTTCCCCCTTTTGCTTTCCGCCTATTTATGGACTTTCCATATATGTGAGCAAATTATGAACTTTTCATTTATTTGCTTGCCAATCTATCTCCTTTCCCTATGTTCAAATACTTCCCACCTTTTGCTTGTAATTCATTATTTATCTTATTGTTTTCTTTTTATCTTTGAACATCAGAGTTTGAACTTCTTCAAGTCGGAAAATGAATGATGAAATTAAAATGAGAGACGAGAAAGGTGAATTTCCGATTGGATTGAGAGTGCTCTCAGTGGATGATAATCTAATCTGCTTAAGGATTCTGGAAGCAAATCTGATACAGTGCAAATACAAAGGTATTTTGTGTTTTGCTTAGCCATATGGATTTTGATCTGTGATTAAAATCATAGTTTGACATAATCTAATTTATTTGGGAATTTGTGCTTATGAGTAAATTAAATCAGACATTTTTGTATAATTTGTTGCAGTGACTTCAACTACTTCAGCAATTGAAGCCTTGAATATATTGAGACAGAACAAAAACAATTTTGATATTATCGTTACTGATGTTCATATGCCTGATATGGATGGGTTTAAACTGTTGGAACATGTAGGCCTTGAAATGGACCTTCCTTGTATTAGTAAGTTTTAACATGTCTTTTCCTTCTTGTTGCAATTGATTTGTTCTAATTTGGAATCATAATTTTTACTTATACCGTCTCTCAAAGCAAGTATGTTGCAATTTTGTACAAGTTGTAAGAAATTAAATCCTTGGAAAATTACATCAACGCATCTATATGGCAGTAGTAAAAATATAAGAAAATTTTTATAGGAACAGTTAGAGCATTATAGTGTAGAAGAAGAGCAGGTTTGTCTACTTTGTTTCACTTGTGCTTAAAGATCGGTTTGTATGATTGCACTTTTTTATTCCTCACCATGGTATACAAATAATATTATTGATTTAATTTGAAAAGCATATTAAAGTTAATATTTCTTTCATTTAAAAAAAGCAATAGACTATATATTCAACAAAAACCATTTAACTTAAAAGCATATTCTATGTGGCAACAATTTCTTAAAATCTCTTTAAAAATAATTTTGAATAACAATTTTTAAGTGGTTTTGAGTGATCAGTAAAAATTATTGATTGGTGATATGTAAGTTGAAATTGTGACAAATTTTAATTGTAAAAATTGAAATAGGGTGTATGTTTATGACTTATCAACTTATTTTCTACTTTTACGTAAAAAAATCAAGTTGTTGCAAAACACTTCAAATTACTAAAATAGCTATTAAGTTATTTTTGCTATTTATAACCTATTGCTTAGCACCTTCTAAAATTAATGTTTCTTTCTTGTTGCGGAAAAGTAATTAATTATATTCGTAGAAAAAAAAGAACATGTTTTGATTATTTGTACTTAGATAAGTCCACTTAGTAAGTACAAATCAATACTGTTTAAATTATAACTTTCAAATTGGACTTTCAGGAAATCACTTGAGGTTTTAGACTAGAAGAGATTCACTAACACGTGTATTTGTAGAATAACAAAGAAGAACCATATATTTTCAATTCCAGATTTTTCACAGTTTTGAATCTTCACGATGTTTCCATTTCATACTATTTAATACATTAGCTGAAGCCATGTTGAAATTTATACGATCGCACTGTTGAATGTTTTTTTAATGCAGTGTTATCTGCAAATGATGATCCAAAAACTGTGATGAAAGGGATTGAACATGGTGCTTGTGATTATCTACTAAAGCCAGTTAGAGTTGAAGAGCTTAAAAATATATGGCAACATGTCATTCGTAAAAAGAAGGCTTGTAAAGAACATAATGATTCTAACAATACAACTTCTGATGATGGGAAAGGAGGCAATAGTAACAGAAAACCTCACACTAAGAAAAGAAATGAACGAAATGATGATGAAGAGGAGGAAGATGAAGAAACCATAGCTGATAATGAATCCGTTTCCACGAAAAAACCAAGGATTGTTTGGACTCAAGAACTGCACCACAAGTTTATGGATGCTATTAGATTTATAGGAGTCAACAGTTAGTCTTTTATTGATCTCACTGATTTTTTTTAAAAATAACTAGTACTGTAGATTCTTAGCAACAAGTCTTTTATTAACCCCAGTATTAAAAATAAAATAAAAAATTGAGCACTGTAGAAACTAGTAGTATAACAGTTTGTTGCTGAACCTTTTATGTATTCTTGGTTAGGATCATTATGAGATGTCCATATTTATCATAAGCACAATATAAATGTATTCCACAAACTTTTATTACCAAGTTCAAACCTTTTTTTTTTACAGAAGCAGTACCAAAAAAGATACTTGAGACGATGAATGTTGAAGGGCTCTCAAGAGAAAATGTTGCAAGCCATCTTCAAGTATGTTTCATCCTTTATTCAGTAACCTGTATTGTTTATCATATTACTATTAAATCGGTAAGTGTTAGATATTGGTAATCATCATAATTTGGAGTTACTGATCTCAAGTGGGGTTCTCAATGTGTATTTTCTTTCTCTCAGGGTCTTCATGTCAACTTGTATGATTTTTTTTAGTATGTAGCGTAAGTGTTGTTTACCAATTTGTAGTGTTTAGATTTGCATCTTTCTTTTCTAGCTGTATGCACATTGTAAATGCTAACGCCAATGAATTATACTCTTATATTTATTAGAAGATATATATGGCCATTGTGGGTCAATTACAGCGGTTTAGCAGTTAACCTATAAGCTTTTTGGATCATCAACATGTTTTTTCAACATTTGTCATGTACAATACTATTCCTTTCTCAGCAATCGAAGAACCAAAGATTTGTCTTATCCCTATTTCCTTGCCTTTCCTTTTTCTGTAGGTAAATACAAACAACGTCACGCTTTATTTTCCAAAGTATCTGCTTAAAATTATTATTTTGTTTGTAGTCTATCATGCGATAAAAAAGTTGTATTAGTGCATTTTTACACACTGGAAACAAATTTCTTGTTACACATAAAACCAATTTTTTTTCTTAAATAATATATTATGTATTAATTCCTACGTAATGTAAAAAGTGGAAATTCCCTGCTATTACACTGGGTAAGTTCTGGCTCAAGTCCACCACTTCTCTGTTTTCCCTCATCAAATTTATTACTGATTTATATTTATTTTCCTACACAAATGAAGTAAATTCTCAATTTTATGAACACAGAAATACAGACTTTACATAAAGAAATTGGAGGAGAAAGCAAATATGATGGCTGTGATGGGATTGAGGGAACAATACTTAAATCCTACTGCATGCGATAGCTATAATGATTTCCAAGCATTCTCATCATCTTCAAATCATATACAAACTCTCCAACCATACCAACAAAACACTACATTCAGTAGAGGCAATTCAGGCATGTTACTGGGAAACAACGTTGCTCGTGGTCTAGTTCAAGTACCTCTCCCTCCACATATCAACAATCCTATAAACAGTCATGGAAATAAATTTCATCAAGGGAACATTCATCAGCAAATGCCTCCAACTTCACAAAAACAACTGTTAATTCATGAAAACAATTCCTTTAATGGGTTTCAAACATCTACCAACCGGACACATGTCAATGGTAACATTTCAATGCCCGTGAATTCAACTATGATTCATTCTACTGCTGCACCAAATTCTTTACCTATGAATATGAACTCTATGCTTTCACCAAAAGTTACTCAAGCAGGTTCGAATATGAACTCAAATATGAATCATGTGAATTTTACATTAAATGGTTCAGTATCACGTTCTACCGTTGGTGTTAATAACAACTGCCTTGCTGTTGATCCTATGCTTATGCTGAATGTAACAAATGATGATTCAAATTACTTGAAATTTGGAAATGCAAGTCAAAGCCAGAATCGAAATATTGCATTAGGTTCTCAATTTGGTGGTCAGCCCTTAATAGATGCCAACTCTTCTCATAGTCAAAGATTAAATGTTGGATCAAACAACATAGGTTTGAATGTTAATGAACGCCAAGACTATAACAATAACATGCCTCCTGCTCAACAACAATGTAAATTTATAAAGTCGAGCCCTGATAACCCATTTAAGAGTAGGGATGATATTTTCTTGGACAATTCATTTTTGCAAGGAGATCTGGGTTCAAGCGGATGCAGCTTTGATGAACTGGAGAACTTGATCCAACCGGTTAGACACTCTTCTTTTATGTTTATATCAGTCAATGATGCACATTAGTTTCTTCATTATTAATTTTATTATAATTGTGCCCTGAATAGCTTAAGTTCAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020241175.1	6.4e-91	two-component response regulator ORR22-like
Swissprot	B8B3I4.1	2.6e-68	Two-component response regulator ORR22
trEMBL	A0A8B9A637	2.3e-74	two-component response regulator ORR22-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G25180.1	43.81	2e-78	290	ARR12;RR12	response regulator 12

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G04124	AT2G25180.1	404	197	10	13	395	12	406	43.81	2e-78	290
AfisC5G04124	AT4G16110.1	290	122	5	14	283	24	311	50.34	8e-77	285
AfisC5G04124	AT4G31920.1	255	100	3	1	255	3	245	56.08	9e-75	278

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00072.21	Response_reg	Domain	20	128	78.0	5e-22

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000160	P	phosphorelay signal transduction system
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0010082	P	regulation of root meristem growth
GO:0010380	P	regulation of chlorophyll biosynthetic process
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0031537	P	regulation of anthocyanin metabolic process
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0080022	P	primary root development
GO:0080036	P	regulation of cytokinin-activated signaling pathway
GO:0080113	P	regulation of seed growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14491	ARR-B; two-component response regulator ARR-B family	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network