result

Gene information

Detail information of AfisC5G05657

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G05657	chr5	1048179759	1048196087	-

Sequences

CDS

>AfisC5G05657
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Protein

Gene

>AfisC5G05657
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020242545.1	4.0e-254	SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10-like
Swissprot	Q38997.3	1.0e-238	SNF1-related kinase 1.1
trEMBL	A0A6I9SBF1	8.3e-246	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G01090.1	80.74	0.0	852	AKIN10;KIN10;KIN10;SNRK1.1	SNF1 kinase homolog 10

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g261223.t1
Allium fistulosum	AfisC5G05657
Allium sativum	Asa5G00125.1
Arabidopsis thaliana	AT3G01090.1; AT3G01090.2; AT3G01090.3; AT3G29160.1; AT3G29160.2
Oryza sativa	LOC_Os03g17980.1; LOC_Os03g17980.2; LOC_Os05g45420.1; LOC_Os05g45420.2; LOC_Os05g45420.3; LOC_Os08g37800.1

Pfam domain

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PF00069.22	Pkinase	Domain	17	269	270.1	1.6e-80
PF00627.28	UBA	Domain	291	327	22.3	8.2e-05
PF02149.16	KA1	Domain	467	508	51.1	7.8e-14

Gene Ontology

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GO:0071417	P	cellular response to organonitrogen compound
GO:1901796	P	regulation of signal transduction by p53 class mediator
GO:2000505	P	regulation of energy homeostasis

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K07198	PRKAA, AMPK; 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit	EC:2.7.11.11	Apelin signaling pathway	ko04371
			FoxO signaling pathway	ko04068
			PI3K-Akt signaling pathway	ko04151
			AMPK signaling pathway	ko04152
			mTOR signaling pathway	ko04150
			Autophagy - animal	ko04140
			Tight junction	ko04530
			Insulin signaling pathway	ko04910
			Glucagon signaling pathway	ko04922
			Adipocytokine signaling pathway	ko04920
			Oxytocin signaling pathway	ko04921
			Axon regeneration	ko04361
			Longevity regulating pathway	ko04211
			Longevity regulating pathway - multiple species	ko04213
			Circadian rhythm	ko04710
			Thermogenesis	ko04714
K11912	ppkA; serine/threonine-protein kinase PpkA	EC:2.7.11.1	Bacterial secretion system	ko03070
K11912	ppkA; serine/threonine-protein kinase PpkA	EC:2.7.11.1	Biofilm formation - Pseudomonas aeruginosa	ko02025

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network