result

Gene information

Detail information of AfisC5G06169

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G06169	chr5	1136300248	1136309249	-

Sequences

CDS

>AfisC5G06169
ATGGATATGCTATCTGACTCAGTCAATAGCTCCCTTTTCAACCCTTTTCCATCTACTCCCCCGCCATCGGTCGATACATCTCTGCCTCCAGACATAGAAGCTCTTCGTCGTCTATCTTTGAATCTGTCTTCGCTCTTCCTTTCTCAAAACCCTAACTTTTCCGATTTCGAACTGTGTCTTAACCCAAGTCAGTCGATCTCTCTTCACAGATGCATCCTTTCTTCTAGAAGCCCCTACTTTCATAATCTGTTCACCACTGCAGATGATGGGTCGATCTCAAAATTTGAACTTGGTACGATCTTTGGTGAATATCAAGTTGGATATGAGGCGCTTATTTATGTCTTGGGTTATGTTTATAGTGGAACAGTGGGACTGCTTCCTCGAGGGATTTGTGAGTGTGCCGATGCTGAGTGTGGACACCTGGCCTGCTGGCCGGTTGTGGATTTTATGCTGCAGGTTCTGTTTGCTTCGTTTAGGTTTGAGATCTCAGAACTTGTCAACATGTTCCAGCGGCGTCTACTTGGGATACTTGGAGAAGTGGACATAGATACCATACCAAATATACTTTCTGTTGCCAATATGTGTGGTGAAGCTTGTCAGGAACTAATTACTGAATGCATTGAATTGGTTAGCACTTCCGAACTTGATTCTGTAAGCCTCGAGAAAATGTTGCCGCAAAATGTATTCAAGCAAATTTTAGATTTACGAAACAACTATGGAATAATTGGCTTGGCTTTTCCAAATAAATTTGCCATAAAAATACATAAAGCGCTTGATTCAGATGATATTGCATTAGTGAATTTGCTACTGGAAGAGGGGCATGTTTCTCTAGATGATGCATATGCATTACACTATGCAGTGGCTTTCTGCAACTCCAAAATCACAACGAAGCTTCTGAATCTTAAACTTGCAGATGTTAATCGTAGAAATCATAGAGGATACACTGTCCTTCATGTTGCTGCAATTCGTAAAGAGCCTGATATAATTATATGTCTTCTTGACAATGGTGCTCATTCCTATGATCTTACTCCTGATGGAAGATCGGCTATTCAGATCTCGAAAAGACTAACGAAAGCTGTGGATTACTATAGCAATCCTGAGCAGTGTAAAGATTCTCCAAAAGATCGATTATGTATTGAAATATTTGAACGGGCTGAAATTAGAGATCCGCCTATCCATGAAGTTTCCAGTTCTCTTGCAATGGCTGCTGATGAAATGCTTCAGAAGTTGCAATATCTTGAGATTAGAGTTTGCATGGCAAAACTATTGTACCCGATGGAAGCAAAAGTTGCTATGAACAATGCTCATGTTGATGGTACCTCCGAATTCATCTTACCCAAAGAAATTCACTTTTCAATCAAGGATGAACATATATTGAGAATGCGTGCTCTCTCCAAAACAGTGGAAGTGGGGAAGCGATATTTTCCAAGATGTGCCGAAGTTATAAGCAGGTTATTGGATCATGACATTGTAGAGCTTTCACATCATTCAGATAGCAAAACATCTGAAGGTCGGAGGAAAAGGTTCCTAGAACTTCATGGTGAGATGATAGAAGCATTTGACCAAGATAAGAAGGAGCTTGATGATTCAGTACTAGTTTTAGCTTCTTCCTCGTCTTCTAAACCCGCAAGAAGAGCTCGGTCTAAATCTGCCAAGAAGCATTAG

Protein

Gene

>AfisC5G06169
AAACCAACCACTTTCCTGAAACAAATCATTCTTTCTTTAGCTGTTTCTTCCAGCATCCAATAGCAATGGATATGCTATCTGACTCAGTCAATAGCTCCCTTTTCAACCCTTTTCCATCTACTCCCCCGCCATCGGTCGATACATCTCTGCCTCCAGACATAGAAGCTCTTCGTCGTCTATCTTTGAATCTGTCTTCGCTCTTCCTTTCTCAAAACCCTAACTTTTCCGATTTCGAACTGTGTCTTAACCCAAGTCAGTCGATCTCTCTTCACAGATGCATCCTTTCTTCTAGAAGCCCCTACTTTCATAATCTGTTCACCACTGCAGATGATGGGTCGATCTCAAAATTTGAACTTGGTACGATCTTTGGTGAATATCAAGTTGGATATGAGGCGCTTATTTATGTCTTGGGTTATGTTTATAGTGGAACAGTGGGACTGCTTCCTCGAGGGATTTGTGAGTGTGCCGATGCTGAGTGTGGACACCTGGCCTGCTGGCCGGTTGTGGATTTTATGCTGCAGGTTCTGTTTGCTTCGTTTAGGTTTGAGATCTCAGAACTTGTCAACATGTTCCAGGTTTCGATTCTAATTCCTTGATTTTTTCCCCCCTTTATGGGTTTGATGGACAAATGGGATGACTTTAACATTGAATATTGAGATGATATAAATTTTGCATGTCCTGATTTTTGACTTTGCATACATTTGCATATACAGAGATCCAGTTAATCAAAATGGCTGAAAAATGCTTAATGATCAGTTTTGTAGCCTTGCGGATAGATTTGGTTGGTAAACCGACACGTAGGATGTACATAAATTTACGTCACTTGCATGTGATTAAAATTAACCTTTCCAGCAAAATATGAAGGGTTGGTTAAGATGACACAAACAACTAATATATATTTGTTTAATTTTGGTTCACATTATTAATTTTCATGTTAAGCGGTGGACTTATTAGAGAATATTGTAAATCAATTTTGGGAAGAAAACAATATTTTAATCGTCATATGCTTTATGAAAAAATTCAAACCACAGAGATATCATGTTAGAATACAGTTAATAACGAACTTCGCAAAAGGTTTGTTTGAAGATTGAAATTCAAGCTAAAATTGCAATTAAAGTAAATAGATATAAATAGAAGCTATAACGGGTCATTTTGACGTTTTAGAAAGGCATGTCGAACCTTATTAAAAAAATAAATAAATCATTAATAGTAGAGATATGTCCCCTGTTAGTGCGAATTTGCTTTAATTTGTGACAAACATCATTTGAAAAATATACCGTGATGATATATTTGATCCATTTGCCACCTAATGACTTATCTCACGATACATTGACATTTAGCATGGAAATGTTTCTATTTCTAAAAGGCTGCTTTACTTGTTTGCAGCGGCGTCTACTTGGGATACTTGGAGAAGTGGACATAGATACCATACCAAATATACTTTCTGTTGCCAATATGTGTGGTGAAGCTTGTCAGGAACTAATTACTGAATGCATTGAATTGGTTAGCACTTCCGAACTTGATTCTGTAAGCCTCGAGAAAATGTTGCCGCAAAATGTATTCAAGCAAATTTTAGATTTACGAAACAACTATGGAATAATTGGCTTGGCTTTTCCAAATAAATTTGCCATAAAAATACATAAAGCGCTTGATTCAGATGATATTGCATTAGTGAATTTGCTACTGGAAGAGGGGCATGTTTCTCTAGATGATGCATATGCATTACACTATGCAGTGGCTTTCTGCAACTCCAAAATCACAACGAAGCTTCTGAATCTTAAACTTGCAGATGTTAATCGTAGAAATCATAGAGGATACACTGTCCTTCATGTTGCTGCAATTCGTAAAGAGCCTGATATAATTATATGTCTTCTTGACAATGGTGCTCATTCCTATGATCTTACTCCTGATGGAAGATCGGCTATTCAGATCTCGAAAAGACTAACGAAAGCTGTGGATTACTATAGCAATCCTGAGCAGTGTAAAGATTCTCCAAAAGATCGATTATGTATTGAAATATTTGAACGGGCTGAAATTAGAGATCCGCCTATCCATGAAGTTTCCAGTTCTCTTGCAATGGCTGCTGATGAAATGCTTCAGAAGTTGCAATATCTTGAGATTAGAGGTGACTTATTTTATGAACATTGATTGATGTATTAGTGGTTTTAGATTTTAGGAGGTAACCATAGGTCCATAGTTATGGGAGGCGCGTCAGGGCACGGCGTGGTGTGACATTTGCGCCTTTCTTCCTTGTGGCGCGATGCACATGAAAAGGCGCGGCGAATGGGCCAAATGGCGCACGGCGTAAAATGACGCACCGTTTCATTATATTATTGTTTTTTTATTTCTTTTTTATTTGTTTTTTATTTTTTATAATCCAAACTGTATAAAAATTAGTATTCATCATATCATGAAGTATTAAAAAGAAGGTACAATATAACCTCCGTGACACCATTGATCTAATATCCTTGAAGGATATTGATGATTGTAATGAATGATTAACGAAAAATATGGATGATGTATCCGATGCTGAAGATGAGCTTGTATTTGATGATGATAATGATGACTTGACTCGTAGTGTTGCTACTAGAGTTGTAGGAGTGGAGGAAGCTAGATATCCGAGTAGAAGAACGTCTACATCGACAGGTTTTTAAGCATCCGCTTCAACTCCTTATATCTTCACGAAGAAGAAAAAAATCTAAATGAGATGGATGAGAAAGATGCTGAAGCTTATGAATTTGATGATGTAAACATTGATTTGGAAAATATAATTGCTGAATCATATTCAAATTTTTAGTTTATCAATAATATGCATAATTATATTGAATTTTGGTTGTAGAAACTATTATGCTTGAAATTCCATGTTTATAATATTATATTTGATAAAAAAAATTTACAGAATTAAAAAAATTCTTTGTTGCATGTGTTTAACAAAAATATTGAACTTCTTAAATTTATTGTTATATGTAATTAAATTTATAAAAAAAAATTCTAAACGTGCGCATTAAATTAAAAAGGCGCGCGTCATTTGCCGCGCCGTGCGCCAGGGCTCCGGAGAGACTTTGTGCCTTTTTGCGCTGTGCGCCATTAATAACTATGGAGGTAACAGTGAGTGAGTTGTGGGTTATACTTGACGTGGCGTGAACAAAAATTTACACTTATCCACATTCAAGTGTTGGAAAATTTCCAAAATAAAATAATCAACACAAATCAATCACCACAAATAGTATAATAGTAAAGTTAATCAAGAATTCAAAGATTCATATTAATTCACAAATCATGATAGTTATTTCTTGGTTGGAAATTCACTACTCGCACGCTAAGTAGTTAATATCGGATAATATCAAATTATGGATGATCTATGACATTACGGACTTCAAGGGATTTTATTATATAAAATATTAGCTAAAATATCGTTTGACGATATTAGTCAAATATTGTTATTTATTAGAAAAAATATATGAATATCTCATATTACAATGAAACTCTAGACTAGAACATGTTGCAAATTCTCTATAAAGATATATCTCCAAAAAATCTAAGAATTATTTAATTTGATAAAGAAGAATATTTACACCTTTTATTATTACCATATTTTGCATAGTTTGCTACAAACATATCGATATTACTTCAATATTATCTTGATGTTTTCAAATATCACATTTTGATCCTTAACTGTTGTTTTATGGGTATCAACATTAATTACTTAGCGCACCCAATGGAATTGAGGAATAAAGAGTAAACCGAAGATTAACAACAATCTTCAGTATTATAAAAAACTAACCCTGGTTTGTATAGTGGAAACTCAAAACAGGTCCAAATCTATTTTGACCCGATCAGATATTAAAGCCACAACTAGAGCCAACTCTTGAACAAGAGATGAAGATAAGGTCTGATTTTAGCTGGACTCCATGTTAGAGTCACAACCAGAGTCAAACTTTTAAGTAAGAGCTGATGCAGATAAGAGCTACTGTCGTTACAGTCATTGTTAAAGTTCTCTAAATTGGAGCTGCGCCGACGCAGATGAGAACAACTACCATTATTATAGTCGGGTTCAAGTATTTGAATTGATTTTAAACACTTGGCTTCTTTTCCTTGCTGTTTAATTTAGTTACTCTCTGTCATTTTTTGTCAGTTTGTGTGTTCGTGTTACAAAGGTATTTATTTAGTTATTCACTTCGGACATGTCTTGTGGAAGCAGTTCATAGAATTGGTGCCAACAAGTTTCTGGCAATCTTTCTTTTTGAGATGTTTCCGATTTTCTTACGTCATCTTTTCCTTTGCAGTTTGCATGGCAAAACTATTGTACCCGATGGAAGCAAAAGTTGCTATGAACAATGCTCATGTTGATGGTACCTCCGAATTCATCTTACCCAAAGAAATTCACTTTTCAATCAAGGATGAACATATATTGAGAATGCGTGCTCTCTCCAAAACAGGTAATACCATTGGTGGAATTTCGGGCATGTATGTTGAAATAACAAAACTCTAAATCTTAATGGGTGGAAGCTGACCAAGTAAATGAATTACTTGTATTGCGCAAATAAATATTACAACACAACACTTGCACAATGAATTTCTCTCAGACTTTGAGAGACAAACTTTAAAAGACAGTTGGGCTCACTTTATGTACCACCTTTAGTTGACGATGTAACTTTTCAAACTGGATTGTTAAGACTTGAGCTTTCGCGAGCAAGTCTGCAACGTTATATCTGTATTAATGTGTTTCATTATCACTTGTTAAACTTTTTTCCCGATGACATGGTGGTGAATCTCCACATGTTTGATTCTTGCATGAACTGCAAGATGAATTGTCTGTTGATTGATGCTGTATGATCAAATCAAATAGTCTATTAGTTGATGTAGATTCTTCGCTAGTTTTAGCAGCCACAAAATCTCTTCCTGTTGTAGTTGCTTTTTTATATTCTGCTTCTGTACTTCATAAGAATATTAATTGTTCTCTTGTTGCACCACAAAATCATTTCTGAACCAGGATTAAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008782513.1	8.1e-152	BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR1
Swissprot	Q5D0W8.1	6.5e-130	NPR1 homolog 1
trEMBL	A0A8B7BP50	5.8e-152	BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G64280.1	44.59	4e-121	432	ATNPR1;NIM1;NPR1;SAI1	regulatory protein (NPR1)

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G06169	AT1G64280.1	527	259	7	30	527	41	563	44.59	4e-121	432
AfisC5G06169	AT4G26120.1	582	295	13	4	554	18	581	40.89	3e-108	389
AfisC5G06169	AT4G19660.1	524	284	11	35	524	35	551	37.98	1e-91	333

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g394320.t1
Allium fistulosum	AfisC5G06169
Allium sativum	Asa4G05272.1
Arabidopsis thaliana	AT1G64280.1; AT4G26120.1
Oryza sativa	LOC_Os01g09800.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00651.28	BTB	Domain	49	124	31.5	1.4e-07
PF12796.4	Ank_2	Repeat	255	338	30.1	4.8e-07
PF12313.5	NPR1_like_C	Family	354	539	197.5	1.5e-58

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006508	P	proteolysis
GO:0008219	P	cell death
GO:0009408	P	response to heat
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009625	P	response to insect
GO:0009682	P	induced systemic resistance
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009817	P	defense response to fungus, incompatible interaction
GO:0009862	P	systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway
GO:0010112	P	regulation of systemic acquired resistance
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0031348	P	negative regulation of defense response
GO:0044267	P	cellular protein metabolic process
GO:0080185	P	effector dependent induction by symbiont of host immune response
GO:1901149	F	salicylic acid binding
GO:2000022	P	regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:2000031	P	regulation of salicylic acid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14508	NPR1; regulatory protein NPR1	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network