result

Gene information

Detail information of AfisC5G06807

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G06807	chr5	1268363924	1268376663	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G06807
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK64827.1	2.8e-78	uncharacterized protein A4U43_C07F30380
Swissprot	Q75H77.1	7.7e-81	stress-activated protein kinase 10
trEMBL	A0A5P1EI25	2.0e-78	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G33950.1	57.62	4e-58	221	ATOST1;OST1;P44;SNRK2-6;SNRK2.6;SRK2E	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G06807	AT4G33950.1	210	74	4	16	224	48	243	57.62	4e-58	221
AfisC5G06807	AT4G33950.1	292	86	5	1	243	94	339	38.01	3e-41	165
AfisC5G06807	AT4G33950.2	183	50	4	43	224	27	195	64.48	6e-58	220

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	56	166	108.6	3e-31

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003729	F	mRNA binding
GO:0042742	P	defense response to bacterium
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0019432	P	triglyceride biosynthetic process
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GO:0070300	F	phosphatidic acid binding
GO:2000377	P	regulation of reactive oxygen species metabolic process
GO:0080022	P	primary root development
GO:1902456	P	regulation of stomatal opening

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network