result

Gene information

Detail information of AfisC6G00024

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G00024	chr6	5268861	5280777	-

Sequences

CDS

>AfisC6G00024
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Protein

Gene

>AfisC6G00024
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020244657.1	2.4e-281	serine/threonine-protein kinase EDR1-like isoform X1
Swissprot	Q9C9U5.1	5.7e-70	Protein SUGAR INSENSITIVE 8
trEMBL	A0A5P1FSX1	1.7e-281	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G58640.1	58.87	0.0	834		Mitogen activated protein kinase kinase kinase-related

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g87716.t1
Allium fistulosum	AfisC6G00024
Allium sativum	Asa8G05973.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF14381.3	EDR1	Family	2	131	104.5	5.6e-30
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	465	712	211.2	1.4e-62

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0002229	P	defense response to oomycetes
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GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005769	C	early endosome
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GO:0071281	P	cellular response to iron ion
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GO:1900424	P	regulation of defense response to bacterium
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GO:2000035	P	regulation of stem cell division
GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network