result

Gene information

Detail information of AfisC6G01283

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G01283	chr6	196108187	196132490	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G01283
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Swissprot	Q9FNN6.1	1.7e-54	Protein SALT-RELATED MYB 1
trEMBL	A0A8B7CNE8	1.1e-79	transcription factor SRM1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G08520.1	55.82	4e-76	281		Duplicated homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G01283	AT5G08520.1	292	99	10	1	267	1	287	55.82	4e-76	281
AfisC6G01283	AT1G49010.1	306	119	9	7	270	3	302	45.42	2e-58	222
AfisC6G01283	AT2G38090.1	188	79	3	10	190	27	213	53.72	6e-50	194

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	11	55	33.3	3.5e-08
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	118	162	44.1	1.5e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005829	C	cytosol
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009630	P	gravitropism
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0009787	P	regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009793	P	embryo development ending in seed dormancy
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GO:0010114	P	response to red light
GO:0010116	P	positive regulation of abscisic acid biosynthetic process
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0030307	P	positive regulation of cell growth
GO:0048262	P	determination of dorsal/ventral asymmetry
GO:1901001	P	negative regulation of response to salt stress
GO:1901371	P	regulation of leaf morphogenesis
GO:2000469	P	negative regulation of peroxidase activity
GO:1905615

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network