result

Gene information

Detail information of AfisC6G01905

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G01905	chr6	316434371	316447190	-

Sequences

CDS

>AfisC6G01905
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Protein

Gene

>AfisC6G01905
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020245731.1	6.8e-157	transcription factor E2FA
Swissprot	Q9FNY0.1	2.7e-102	E2F transcription factor-3
trEMBL	A0A6I9RRU9	5.4e-156	transcription factor E2FB isoform X2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02319.17	E2F_TDP	Domain	138	201	84.5	3.5e-24
PF16421.2	E2F_CC-MB	Domain	218	316	110.6	3.5e-32

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0098534	P	centriole assembly
GO:1903251	P	multi-ciliated epithelial cell differentiation
GO:1990086	P	lens fiber cell apoptotic process
GO:1990841	F	promoter-specific chromatin binding
GO:2000045	P	regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
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K06620	E2F3; transcription factor E2F3	EC:-	Cellular senescence	ko04218

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network