result

Gene information

Detail information of AfisC6G01966

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G01966	chr6	326296927	326306849	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G01966
ATGGACGTGTCAACTACTGAAGAAGGAATGGGGGAGAGTTCGTCGCCGTTAAGAGGAGTAGGCGATATCAAGAGCGAGATTTATGAGAGATTAGTTGAAATCAATCATCACGAGGTTGTTGGTAATCCGAATTTTAAAGAAGAGCTTTTTGCTCATTTTAATCGACTGCCTCCAAGGTGATTTTATGTTTTGTCTGTAGCATTTTTACCGTCCACTATTTTTTCGGATGATCCTTTAATTTTGAAACCGAGCTAATGAATAGCGAATATACTGTTTCATCCAATCAGTGGCAAAATACGCATGATTTGATAACAGAATTATAGTACTTGTCCTGCTTGTGCTTGTGTCTTAGTGGATTATACTATAAAGCTGTTGGAAATAATGCAGGTAGTGAGGTTTAGTTGAGTAATGATTTTTAGTTTGAATAATGGTTGGCCACCGTAGAAATACTTAAATCACTGTGGACTTTTGAATTACACATATAACTGATAATGTTTGAATCTTTATCTTGAGCACTGTGTATTGCGCGTTTAAAAATTACTTAAAGATTAACTTTAACCATGCACTTTTGTGTCTATCTGAACCTGAAATAATATCTATTGGTTTTAGGCAAAAGCTAAATCATGTAGATGCATGTGTATTTTAAGCATGAATTTTGGTTAAGGTTTGATGTCAACTACCAAAGCTTGTATTGAAATTAATACTGTGAACATTAAGTTTGTGTTTCTATGTTGCATGTAAATGAATTTGATGTTTGATATGTACAGCTATCTTGTGGATGTATCTGTTGATAGAGCTGAAGATGTTTTGCTACACCGTGATATTCTAGCCGAAGCTAGGAACCCAGCAAAACGTCCGGTGTTCTATGTCCGTTTTCTGAAGGTGCATCCGTGCATGCCATGAACACTTTCTCTCATTCTTTGTTCTGATTCTGATTTAATTAACAAACCGACGAGTAATTATACCATATATTATGCTATATAATATAAGATGCAAAATGAAATATTCTCAAGTTTCAACTGTAGACTTTAGCTATTGCACATATAAATGATTGTTGTTGGGTCTTTTCCCCACTTAGTCAAATCGGATCCTATTCCCAATTATATGATCGTTGCTAAAGCCTAATTTTCGTAATGAGGTTTGACCATCATCTGCAACTTAGAATGATTCCTGTTGTGTTTCCTATGTCTATTTGAACATATATTATAAAATGCGATACATATTAAGCATTTTGTAACTTCTTTGAGTTGCTTATATAAACTTAATTTAATTTAAAATGCAATTGAATTTTATCTGAAGTTTTTCATATCCTTATTTTATTTTGGCTGTTGGTTGTATGTTGAATAACAATAACAATAGCAACATGTTCTTGTTTAAGTTTGAGGAAACAAATTCAGATATTGGAAACACTACTGCTGATGCTGAAGATGGAAGCGAGGCTAGTTCTGCAAGGTAGTTTTATACATGAGGTAGTATTATAATGTAAAATAAATGGTTATTTAGACCTCTACAGTTATAATATTGGAAGATTGCAGTTATATTTAAAATCTGCACTTGAGCATCTTAAGTAATAATTGAGGTCAATGATAATATAGTTATCAGTTTAAATTCATTTGCAGGCATCTTATTGCATCTGCTCCACTTCATGAGATCATATTTTCTACTCTTGACAAACCTAAGCTACTGTGTCAGGTGGTTTCTAAGAGCTTTGTTTACAGATTTTAAGTTTGACCATTCAGTATAATGTTTTTTCTTCTTCTCAGCATTGTACAATTTTATCAATAATTACCCTTATTTTTCCTTGTTTTGAATAAGCAGTCGTTTTCTTACTTAATAATATTCCTGCAGTTGTCTGCTGTGCTTTCTGATATCGGATTAAATATTTGTGAAGCTCATGTTTTCTCAACTAACGATAGCTATTCATTGGATGTATTTGTAGTTGGTGGATGGCATGAAGAGGTATAACATATTTTAGAACTAAAACTAGGAAACTTAATAATGTAAAGGGTTCAGTTGACTGTTAGGATTCAAACACTTGGAACTTTGGGTGTGCAATCATGATGGCAATTTACTAAAGCATTTCCGCATACGTATTATAAAATCTTGTAAATTTCTCCTTAATTTCTCAAAATAGTTCAGATTGTGCCTTCCCATATGAATATTTTATCATGATGTGTGTGTGTGTGTTTGGGACAAAAGTTGATGACACAATGGATACGAACCATTGGGTTGTCTCCTGATTTTAACGCCAAATGAACACAATGAGATCCAATATTCAAGATCTATTGTATTACATTTTGTGTTTTATTTTGTGTCCAAGCAGCCTTCCCATGTGTGTACGCACGCGCAAGAATGCGTACATGCATGTGTGTGCATGCGTGCGTGCAAACTAAATTTGTGAGTATATTTCCTTTATGACGACTATAGTTTCCTATGAATGATATATTTAACACAATTGCATGTCAATATATATCTCAAATTTATCATCGTTGAGGGGGTTCACCGTCTTAAATTTATGCACCTCACAGTCCTTTTTGTTGTCTTTAAGAGTTTTCACCCACTTGTTGACCATCTTATGCAGATTTGAGCATGTCAATAATATTATTATGGAGTGGAAATCAAGTACCTAGTAGGTTTAATTAGCCAGGAGTTACATTGTCACAAAGGGACACCTCGTAATTGTTTTTTGCCCTCTTTAATATTATTTACCCACTTTCTGAATGCCTTCTGCAGATTTGGGCATGTCAATAATATTATTACGGAGTGAAAATCAAGTGCTTAGTACGTTTAGCTAGCCAGGATTTACATTGTCACAAAGGGAACATTAATTTGATTATGGGGCAACTTGATTCTATGTATGTTATTGCAGGGATCTTTTTCAAGCTCAAATGTTGCTGACTTTGCAATGGTGTGCTCAGGAAACAGATGGGCTGCATGCTGCAATCAAAGCTGCAATCACAAGAAATGAGGTGTTTTTATCTTCCGATTTTATGAAGAATTTCTACTTTATTCTTTTATATCGTTACTCGATTGATTGGAAGTTTCATGAATGTAATATATGACGTCCGCATTTGAATTTTAGAGCGTATTTGATTAAGATTATTTTGTTCCAAATGTGTTTTTATATGGTCTGCATGCGAGTTAAAGTATAATCTTAGCAATACTGAACTAAAACTTCTAAGCCACCAAAACATGGCCTGTCTATAAGAAATTCCCTTGACCAATTTACATGATAACCCACCTTATATTGTCGAATTCTTCAGTAGCTAAATACCACGTTTTAGCTTAACACCTTTAAAATTAACCCTAGGCTTACACCTTTCTGATTGTTAACTATAGTTTTTCCATGGCTTGCTGGACTTCATGGCGATTCTTGTCAAATACCAGGTTATATTCTAGGTGAAGATCAACCATAATTTTATTTGACTTTGTTACTCCAATATATGTGCACCATACAGTTTTCTTAGGACCTTTATGTCCTAAAAAAAAGAAGAAGAAATAAGAAAATATTTTTTTTCTTAAATTTATGCCATGTCTTCATTCTAATACCAGTGAAAACCTTTAAATCTTTTGGAATTGTAGCTTATTGAGATTGCAATCGTAACGGACTTCAACTTTAGTTCTTGAATGTTGCTAAACCATTATATATTGCTGACTAGATATCGTGCATCTCAATACATGAACTGTTTGTCGACCACATTTTTATTGGCCAGTGACCATAAGTTATCATTATGTCATGGTAACTAGATGGAAAAGTCGACTAAATGGATTCTTCAGTTTGTGTATGTGTGGATTTAGGAGCAACTATTGAGACCAAAACACACACACAATTCAAACACAATGTATTAACCATTGGATCTTGTTGTGTTTGCATAAATAGTTGAATTCAGGGTAAGATCTAATGGTTCAAATCTGTTGTGTCACAAATTGTTGTGCTCCAATAGAATATCCATATGTATGTGTGTGTACCCGCGCGCGTGCACCTGCTATAATCTTGACAAGCACCTAAAACCCACACATATAAAACCACAAGGTAATTAGTTTTGAGAAGGAAATGGAAAAGAGAAGGTTAATGGTTACTCCTGAAGGCTCGAACTTATTGATTTTTTTTTTGTTTATTTAGAAAAGAAGGAAGAAAGAAAAAGGGCAACACAAAATCATTATTTGTATTCTTTTTTAATGATGAAAATTCAATTTTCATGAGAGTATAATTTTTTTGTCAGGGTTCATGGTCGGGCTCATCCCTCTCATCAGCTGCAGAGAAGTTATTGGCTACTCAACCTAAAGTTGGGGATTCAGAAATTGATATGAGATTGTTAACCATAGGGGAAAAATTTGCAACCGGATCTTCTGGAGATATGTAAGTTGAGCATATTTAAGTACATGAATACTTGATCCATCATCATTATTTAACTTTCATAAACGTTTCTTTATATACATTTTCTGTTGCTTATTTTATCAACTCATCTCTTTTGTTTAAGGCATCATGGAACTTATGATGGCAAAGATGTTGCAGTGAAGGTTCTAAAATTAGAGCATCTAACTAAAGCTGCATTAGATGAATTTGCTCAAGAAGTTATCATTTTAAGGTGGCAATCAGATGCTTGGTTGATCAATTAAGAAATAGGAAACAATTGATATTTTGGCACTCATTTACGAAGTTTTAAATATAAAATTTTCACCAACCCAATGTCTAATAGCAATTTTGTATGCTTACAGACAAGTTCGTCATAGGAATGTAGTTCATTTTATTGGTGCGTACACGGAGCATCCAAACTTCTGCATTGTAACGGGTATGCCTTTTTTACCTTATGAAATTGATTAATGTGGGCTGATGAGTGTAGTTGTTGCACCATGAACTTTGAATATTGTTTAAGCTTTAGCTCCAAACTTTCAAACATTATGTTTACGGTTTAACTGATTCTTCCTGTTACATGTTGATGCTTATTCCTACAACTGGAAGCTAACACTTGCAATTCTTTCTTAGTTGATTTATAAAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020245582.1	5.8e-197	serine/threonine-protein kinase STY8-like
Swissprot	F4JTP5.1	9.5e-128	Serine/threonine/tyrosine-protein kinase 46
trEMBL	A0A5P1E4E3	9.7e-194	Non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G35780.1	47.57	4e-131	465	STY17	ACT-like protein tyrosine kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G01966	AT4G35780.1	536	229	7	12	496	23	557	47.57	4e-131	465
AfisC6G01966	AT4G38470.1	487	191	7	43	481	54	540	50.92	5e-131	464
AfisC6G01966	AT2G17700.1	513	224	6	22	488	32	543	47.17	2e-128	456

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	232	478	228.3	8.4e-68

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0002229	P	defense response to oomycetes
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004709	F	MAP kinase kinase kinase activity
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005769	C	early endosome
GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
GO:0005802	C	trans-Golgi network
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GO:0009414	P	response to water deprivation
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GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009686	P	gibberellin biosynthetic process
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GO:0009750	P	response to fructose
GO:0009788	P	negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009873	P	ethylene-activated signaling pathway
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010182	P	sugar mediated signaling pathway
GO:0012510	C	trans-Golgi network transport vesicle membrane
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900424	P	regulation of defense response to bacterium
GO:2000031	P	regulation of salicylic acid mediated signaling pathway
GO:2000035	P	regulation of stem cell division
GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network