result

Gene information

Detail information of AfisC6G02058

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G02058	chr6	339196339	339202410	+

Sequences

CDS

>AfisC6G02058
ATGGAAAAATATGAAACGGTGAAAGATATCGGTTCCGGTTGTTTTGCCGTCGCTCGCTTGCTTAAGCATAGAAAAACTGGAGAGCTGGTTGCTGTAAAATTCATCCCTCGGGGAGAAAATATTAATGATAGAGTCGCGAGGGAGATCATTAATCATCGGTCCCTGCGGCATCCAAATATTATTCAATTTATCGAGGTTGTTTTAACACCTACACATTTGGGTATTGTGATGGAATATGCTGCTGGTGGCGAACTTTTTGATAGGATTAATAGATATGGAAGATTTGGTGAAGCTGAGGCTAGGTTTTTCTTCCAACAGCTTATGTGTGGTGTAAGCTACTGTCACTATATGCAAATATGTCACCGTGATTTGAAGCTGGAGAATGCTCTTTTGAATGGTAATTTGAAGGCACCCCGTTTAAAAATCTGCGACTTTGGATACTCAAAATCATCTGTTTTGCACTCGAGGCCAAAATCAACAGTCGGGACTCCTGCGTATATTGCACCTGAGATTCTTTCTAAAAAAGAGTATGATGGCAAGTTGGCTGATGTATGGTCCTGTGGAGTGACCCTTTATGTTATGCTCGTAGGAGAATATCCTTTCGAGGACCCAAAAGATGCCAAAAATTACAAAAAGACTATTTCGAAAATACTCGCAGCAGATTACAAGATCCCGGAGAATGTTAAATTATCTCCTCAATGCATGGATCTTTTATCTCTTATATTCGAACCCATTCCATCTAAGAGAATAACAATGGAAGAAATAAAGAAGCATCCATGGTTCCAGTTTCATCTACCCATAGAGCTAAGCGAAGAGCATCAACGTGTCTACTACAAAAGAGATGCTTCCTCAAAATCCTTGCAAAGCGTCGATGAGATCATGAACTTGGTAAATGAAGCAAAAACGCTGCCTACGTCTGCACCTGGCTCTGGATATTCGGATGCAGCGGACAGTGAAGTAGTGAGAAACAAAGACGAAGATGATGGTGAACGTGAGAAGAGAGTGAATGAAGTTGAAGCCATCAAAGATTTGTTGAGCAAGGATGGATGTGAAAAAAGAGCGTATAAGTCATTCTAA

Protein

Gene

>AfisC6G02058
GTAAAATAATATTCCATCCTTTCCTTCCTTTGCAATTATTCTCTTGTTTTCAAAATCTCTATAAATGCTTCAAACTACTTAAGTTCAGAGAAATATCTCAACTTTGCCTCCAAAGTAGAATAATTTCGCACGATCATGGAAAAATATGAAACGGTGAAAGATATCGGTTCCGGTTGTTTTGCCGTCGCTCGCTTGCTTAAGCATAGAAAAACTGGAGAGCTGGTTGCTGTAAAATTCATCCCTCGGGGAGAAAATGTATATTTTTCTTTATTATTTTTTATTGTGAGGATCTTAGAGTTGATGTTTATTGTTTGTTTGATGCAGATTAATGATAGAGTCGCGAGGGAGATCATTAATCATCGGTCCCTGCGGCATCCAAATATTATTCAATTTATCGAGGTAAATTTTATTTTTTAAGGGGGTTTGTTTAATTTTGGGGTCGATTTGTAATATGTGAATTGTGCAGGTTGTTTTAACACCTACACATTTGGGTATTGTGATGGAATATGCTGCTGGTGGCGAACTTTTTGATAGGATTAATAGATATGGAAGATTTGGTGAAGCTGAGGTTTGTAATTATAGAATTTGCATATTTGCACTTCTACATATTTTTATTTTGCATGCCAAGGGCTAATCATATGGGGTTTCAGGCTAGGTTTTTCTTCCAACAGCTTATGTGTGGTGTAAGCTACTGTCACTATATGGTAATGAAACTTTGAACTCGAACTCAGTATTTTTTGCAGTAATCTAGATATTGTTGAGCTAAAATCATTAAGTCATGAATTCACTTTTTTTTTTCTTCATATTTCCTCTTGGGTGTAAAAATTTCTCGAATTTGCCCTTATCAAAATATCCATAAACCCTAAAATATATGCAATTTGGTTGGTTTGCAAATTTGAATCTGAAACCTATCCTTCTCAAACAAACTCTGAAAAAGTCCTTAGTCCTTGGGAAAGTAAATAAGAAACACATGCACTTCATAAAATCAAATAACAGTATATTCATTTATACAGAATGCACTTCATAAAAACAAATAACAGTATATTCATTACTCATGAAAAAAATTTTGACATGCACTGACAAATTATTTTCTCCAATAATGTCATACGGTTTTCCTCATATTTCAAAGAACACATCTGCTGGCTTACTTCTGTCCAAATATCATTTAATCAGTTATCTGAATGCTCAATTTTAATAGATTTGAACATAAACTGGTAAAAAAACTCTCATTATTTTCAAACTTATATTTTGTTCAGCTGTACCGAGAATGAATAAATGAGTAAATGCATGCATCTATCTTTCTTTATACACCAGAAATATGATCATAACCAACACACACACTCTATGTATGTATGTGGGTATGTGTACACACACATAAATACACTTATGCGCATGCGCGCGCGCACACATACACATATATATTCTTATCAGAGAACAAACCACTTCTATAATATTCAACAGTCGGTTTTTGGAACAAACATAACCATACTTTTATTTAATTAATGTTAATAAATTTTGGTGTTCACAGCAAATATGTCACCGTGATTTGAAGCTGGAGAATGCTCTTTTGAATGGTAATTTGAAGGCACCCCGTTTAAAAATCTGCGACTTTGGATACTCAAAAGTAAGCACTAAAAATCTTTAGGCATGCACTGTTTAATCCTTTTTCATGGTTACGTGAAGTTTTATATTTAATAACATAAATTTAAATTTATGTTACAGTCATCTGTTTTGCACTCGAGGCCAAAATCAACAGTCGGGACTCCTGCGTATATTGCACCTGAGATTCTTTCTAAAAAAGAGTATGATGGCAAGGTGAAGTTTGCAACTTTATATTCAAAGTTTAATTTTATGCACAAGATTTGTTTTAGAATATTAGCATGGGCTCACTATATCAAGTTTTGTGTTGTGACGGCTACTAGGGTCAAGAATTTAATATTAATTTGCCTTCAGGTTTAGATTTGGAATTCTGACATTGGTTTATACTTCTTTTGCAAGATATTATTCTTTGTGTTGGGATTGAATTTGCAACGCACTAGGAAATTTATAGATAAAATTATTTGCCATTATGACTATTGTGTTATATTTGACTTTAAGCACAAAATAACTTTACTTTTTTTGGGGGACCTCTTTTCAGTAATATCTACAAACTAACAGATGTGACTGTAGTTGCTTCCATTAGTTTCTCTTCTGAATATTAGAAAATTTTGAGATCTTGATTCCGATTTGGATATTCCATTTGAATTCTAGTTCCTAGCATTTTGGACACCTTTTCGTATATCAACATGTCAATGATTACTACAAATTTATTCAATTGTAATTGTAATTTATTAGGGCTATACTCTCTCTAAATTTCTGAACTGAAATCCTTTGCAAGAACAAAAGAAACAAAGCAAAGCTTAATAAGAAACGCCTTCTATCAATTTTGCACTTCACCGTAACCCTAAAATCATTGTCCTCAACATAGCCGCTTTCATAATAGTTAATTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTTTCTTCCTCAGTTTTTCTTGTTGCACGAAAATATGCCCAAACAGCTGTGCTCAATGCTCAAATCTTCCATCTTTCTTGCCACTGGATGTTGCTAACTGCACAATAGGTAGCTAATTTAAAACGGTTTTTCTTTTCCTTACGTCGATAACCGAGCACAGATTTCGGAACAAATTCCGTTCCGGTCAATTCCGGTATTCTGGCATGTTGGACGGAATCTTGCACCGTGATTGAGATCACTTGTCCCTAAATCATTATGTTTCCTTGTGCCCTACTTAGTGTCCTTTGATTTATCAATTCAATGAACAAAATAAAAATAATAAACATTGGATGGATGAGACAAGATTGATTGGGGACAAGGGCACGTCATAATTGGGACAGAGGGTCTCCATAAATGGATAATATCATTCCCATCAAGTTATTGTTAATATGACTGCTTGCTTTTTTTAGTTGAAACATGGAGGTGGTTGAAAATGATCTCTTATGGGTGAATGTATTGTTATACAACTTACTACATTGCAAATGCTACGTTTGTAGATTTTGAATACATAAAACTGATGCACTTCTATTCGCTTATTATGTTATAAAAAATTTATGCATTTTATATTCGATACTATATGCTGTAAAAGGATGTTGCAAATACTTACTAGTAAATGTTACTTATGCATGAAAAATCATCAAAGAAGGATTTGTTTTCCATAGTTTGAAAAACTTTGCGACTTTGAAAAAGAAGCGTTCATTAGAAACCATTTGTGGAAACTTGAAAAGGACCAAAATGAGTTTGCTGAAGGACTTTAATTTGTGACAGTGCAAATGAAAAAATAAAAAACACCTACACTATGTGGAGAAATACCAGTATATTCTGCTTTTGTTAGCAAAAGTTGGTTTTTTAATAAACAGTTTCAAAACGATTTTTTATATTTATTATTTTACAGTGTGATTTATTAGAATGACAAAAACTCTTTTATTGAACCCTTGCTTCACGCACATAATTTTCATCAGCATACGGAGTGCATTGTTCATGCAGAGTTGCAGAAAGAACTACTGATTATCTGTTTATAATATTTTCAGTCTCTTTTCTTAAGTAAATATATGCAATAAGCTGATGTTTGAGATTCTATCTATGATGCAGTTGGCTGATGTATGGTCCTGTGGAGTGACCCTTTATGTTATGCTCGTAGGAGAATATCCTTTCGAGGACCCAAAAGATGCCAAAAATTACAAAAAGACTATTTCGGTAATCTTTTTTATTTTATTTCCGTGTTGGTAGAATCATACTCCTGAAACATAAAAATACACATTATTGCTTTGAGGCACATTTAATTGCTTCTTATGTTACCTACCCTTTTTTGTGGCGTTGTAGAAAATACTCGCAGCAGATTACAAGATCCCGGAGAATGTTAAATTATCTCCTCAATGCATGGATCTTTTATCTCTTATATTCGAACCCATTCCATCTAAGGTAGGCAAATTTATAATTTTGCTTGTGTATAGTTGTAAATTATTTTAATTGCTTGCGAATAGCTGTAAATTATTTTAAATCTTGAATTTCAACTGTATTGCACACTAATGCACAAACAATCAAAATAAGGATAATTTTTTAGTTAAGCTTTGGAAAGTGTTATTTCAATAATAAGCTCCGGTTGAAACTTATTACAAAATAATATGTTTGGTTTTCATCAGATCAAGTTTTGTGTTTGTGCACAAGCACAAATATGCAATAAATTCTGATAATCTGATCTATTTTTATAGTATTTATCTTTGTAGTAAGTTTCAAACGGAGCTTATTGTTGAAATAAATTCTCTTTGAGCCCAATTATAAAATTTATCTTAAAAATAACCATCAAATGGCAGTCTGATTATTTGTTACCACATCAATACACTCTGTTATACCTTTATATACTAGTTGAAGTTCATAGGAAACCAAGGGAACATGATACGAGTGTTACAGGTTTTCCTTATAAGTTGTATATGATTAAATCAGTCAAAAAAAAAAAAAATTGAAAGGGATATTAAGAATTGTATATTTGTAAAGAAATATTTTGAATTTGTAAAGGAAGTTTAATTTTAGATCCTGTTTTTAGAATCGTTTTGAATTTGTAAAACATGTTTAATTGTTAGATTCCACTTTTAGGGGCGTTTAAATTTGTAAACGAAGTTTAATATTAGATCATATTTGTAAGTGTATTTGTAAGTGATTAAGATTTGATAATATATAGAGGGACGTCTTTGGTAGTTCACGTTGATACCAAAAAAGTATGATACCAAAGCTATTACAACTATTATTAAAGAAAATATTATTAAAGACGTCTTGAATTATCTAGAAGAACCTTTTATTATCTGACGTGCATATCTGACATATTCTCATTTCAACGAACGCGCAAACCTAGAAATATATTCATTGAAATATTCAAGTTTTTAACTTAGTTTGAATTGTTCCAGTCTAGCGTAAAAATAATATGTTAAAAATAATAGAAATTATTTTTTGTTTTAGGTGGTTGTAAAGAGAATAATACATATAATACTTAAATTATATGAGTGAAGGATATGTTGGGAAGTTCACGGTCGGATCAAAAGATTACACTTCCAAGCCAACTACTAATAAAGATGTGCACGAGTAAAGTAGTAAAAAATATAATATTTTTCAAACCCAATCGTTGAGTATTAAGATTTGTATCCCATTTCTAATAGAATTTTATTAATTTCTCATATTTAGGACACAGTTAAAATAGCAATATAAAAATAATCATCATTTGATCTATGTTCAAAAATATAAGTTATTACCATGGTAAAAAGAATTGACGATTCTACGTCATTTAATAACCCACATGGAGCAAAATTCATAGTACAGAACTACATGAAAACGCATGATTCTACGATTTTGAATGTTATATTGACAACATGAAAACGTTGCAGAGAATAACAATGGAAGAAATAAAGAAGCATCCATGGTTCCAGTTTCATCTACCCATAGAGCTAAGCGAAGAGCATCAACGTGTCTACTACAAAAGAGATGCTTCCTCAAAATCCTTGCAAAGCGTCGATGAGATCATGAACTTGGTAAATGAAGCAAAAACGCTGCCTACGTCTGCACCTGGCTCTGGATATTCGGATGCAGCGGACAGTGAAGTAGTGAGAAACAAAGACGAAGATGATGGTGAACGTGAGAAGAGAGTGAATGAAGTTGAAGCCATCAAAGATTTGTTGAGCAAGGATGGATGTGAAAAAAGAGCGTATAAGTCATTCTAATCAGAGGAATGGATTTTTTTTAGAAGGTCATTGCCAGATTCTGTTTATCTTGTTTTCATCGGTTAACATTTTCGAAAGCTTAATTCAATTACCCGTTGAGTTATTATTGTAATAATAGAGAGCAATGGTGTTTTTACTTGAAATGTTTTGGGTAGCTATGCTGTGGTTGTGGGCAACGTATTTTGTTTTGTATTATCAAAAGCAATGTCCATCCGGATTTGTTTTCTAAGACCTTCCTTCCATGGCTTTTATTTTTGATGTTTGAAGATGTGCATTCTTTATTTTCAAACTTAATACACAAAGAAACTTCTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_009406104.1	5.4e-125	PREDICTED: serine/threonine-protein kinase SAPK7
Swissprot	Q6ZI44.1	4.0e-125	stress-activated protein kinase 6
trEMBL	A0A804L6C5	3.9e-125	(wild Malaysian banana) hypothetical protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G63650.1	68.05	5e-125	444	SNRK2-5;SNRK2.5;SRK2H	SNF1-related protein kinase 2.5

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G02058	AT5G63650.1	313	98	2	1	312	1	312	68.05	5e-125	444
AfisC6G02058	AT5G08590.1	316	95	3	1	311	1	314	67.72	2e-124	442
AfisC6G02058	AT1G10940.1	304	92	1	1	304	1	303	69.41	1e-122	436

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g445999.t1
Allium fistulosum	AfisC6G02058
Allium sativum	Asa8G05856.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	4	261	240.0	2.5e-71

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003729	F	mRNA binding
GO:0042742	P	defense response to bacterium
GO:0005829	C	cytosol
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005985	P	sucrose metabolic process
GO:0006636	P	unsaturated fatty acid biosynthetic process
GO:0040007	P	growth
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009789	P	positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010029	P	regulation of seed germination
GO:0019432	P	triglyceride biosynthetic process
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048366	P	leaf development
GO:0048527	P	lateral root development
GO:0070300	F	phosphatidic acid binding
GO:2000377	P	regulation of reactive oxygen species metabolic process
GO:0080022	P	primary root development
GO:1902456	P	regulation of stomatal opening

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14498	SNRK2; serine/threonine-protein kinase SRK2	EC:2.7.11.1	MAPK signaling pathway - plant	ko04016
K14498	SNRK2; serine/threonine-protein kinase SRK2	EC:2.7.11.1	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network