result

Gene information

Detail information of AfisC6G02415

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G02415	chr6	413084975	413095773	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G02415
ATGGAGATGCGACGGGACTCCACATTTATCCATGAAGACGAAGAGGACTTTGACGGTCGTACGTTGAAGAAGTACGTACCGATCAACTGTCTCTACTCAGCCACGTCGCCCTGCCTGAACCCTAGTGGATCCTCGACCGTTATGTCAAAGAAGGTGAAAGCAAGGAAGTTGAGGTCGTCTGAGAATGGCGAGGAGGGAGAATATGGGGCTGAAAATAGTAAAAAAAATTATGAACTGAGAAAAAGTGCAAGAGAGAGTGGGAAATCTGAGAGTGCAAAGAGAAGTCTTGTCTCGAAGAAGAAACGATGGATTGAGTAAGTGTTATTTCTTACATTTTTGTTAAAAAACTCAATCCAATTTAATTTCGTTAGCTATTAAGTAAAACTGAATTGGGTGGGTTGTTTGGGCAATGTAAATAGTATACATTCAGTAAGCTGTCCATTCATATATAAATTTTAAGATAATTTGTAAAAAGACAACTATTGAACCGAACAGATAAACAAATGCGATGTAGAAGCAGTGGATGAACATAAGCTAGGTTTAGCAATTAGCAGTGAGTAATGTAATCAATTGTTTAGTCTGTTTACTCGAGGTTGCGATCCCTGTGATAGTTTATTGTTTTTTATATGAAAGCAGACTGGGCAGCAACAACAAGGTTTTGTTTTGGGTTAAGCAAATGTAGCTGACTCCATTTTTGTTGCGAGTTTAATATGCTCATGTTGAATTCTCCAATTTTATGAACCTTTTTGCGCATTAATACACAAAAGAATCATCAATTTCATGATTCGTGGCTCTTATCCCATTTTCATTTTCAATATGTAAACAGCTTTCTTGTGATTTGGAAGGTTTCAATCTTTTGGTGGTTGAAAAGTGATGAGGGATTAGGTTTATATACTACGAGCGTTACGGCACGCGCTTCACGCGTGAACTACAAATTGTACATGCTTAACATATTCAAGTAAAAATGATTAACATAAATATTTAGTCATATTTTTACGTTAAAATCATGTGTAGTTGGTTTGAATTTTAATTTATACATCTAATTATTTTTGTTAGTTTGAAATTTTCTTATATTATTAATTAATAAAAAAATTTGTAAAAGAAATTTATTTGTTAGACCCTATTTTTATGCGGTATTAAGAGTTGATAATATTTATAGAGGAGCGTTTTGAATTTGTAAAAGAGTTTAATGTTAGATCCTATTTTTAAGCGTTATTAAAATTTGATAATATCTGTAGATGACCGTTTTTGGTAGTTCATAATGCTACTAAAAAAATGTGATATCAAATGTATTACAACTATTATTAAAGATAATAAATAAATTTGTAAAAACAGTTTATTTGTTATATCATATTTTTAAGTGATATTAAGAGTTGATAATATTTATGGAGGGGCGTTTTGAATTTGTAAATGAGTTTAATGTTAGATCCTATGTTTAAGCGATATTAAAAGTTGGTAATATATGTAGAGGGGCATTTTTGGTGGTTCCCGCTGATACCAAAAAAGTATGACACCAAAGTCATTACAACTATTATTAAATGATGTTAGATCATATTTTTAAGTATTTATGGAGGGGCGTTTTGAATTTGTAAATGAGTTTAATGTTAGATCCTATGTTTAAGCGATATTAAAAGTTGGTAATATATGTAGAGAGGCATTTTTGGTGGTTCACGCTAATACCAAAAAAGTATGACACCAAAGTCATTACAACTATTATTAAAGATAACTTAATCTAGGGATGTAGTTAAAGAGATGCACATTGAGTTATCTTTACTTAATGGAGTAAGTGTAATATGTTTTCTTGATAGCACAAAGAAGCTACGTAGTCTTAGCCATCAGTATATTCTTCTTATGTTGAATTATGTCTGGTTGCAATGCTTGTACTAGGTTGGATTATGAAAGCGTTGATCCCAATACATTTGTGGGTTTAGCTTGCAAGGTAAATAAATATTATAGATTTTATATGAATTTTTCGTAAGTACCAGGAATTACAAGTTTGAAATGTTGAACTATCTTATGCAGGTTTTTTGGCCATTGGATGAGGATTGGTACAAGGGGTCAGTGACAGGGTATAATTCAGCAACAAAAAAACATTGTGTACGTGTATATCTGTATACCCATGACAACACCATCATATATTGTTTTCTCTTATACTGCCTTCTATGGAAATCATGCCCACCTTTGCTTGAATATAAGAACGTTGTTGTTTCTCATGTTGTTGCTAGTCAACTTATCTTTCACACTGCTACGACATGCTTGCACTGCTCAATTTTGTTCACAACTTCTTAAAGCAACTATGATAACCAGTGTTATTCAAATAATTGATACTGATAATTAAATTTCAGTGAATTGTTGATATATGCTCTTTATTAGCTAAACAAAATTATACATATTGACAGATTGAGTACAACGATGGTGATGTCGAACAATTAGTTCTTTCAGCCGAGAAAATTAAATTTCACATCTCTTCTGCTGAAATGCAAAATTTGAATCTGAAGTATGATTTGTCAAGCATGGAGCAGAATGGACTTACTTACAACGAAATGTTAGCATTAGCTACTCTTGATGACAACCAATCTCTAGAACCTGGAGATACTGTTTGGGCCAAACTTACTGGTATCGTCTTTACTATTTAACATTGTTTGACAATTCCATCCAATATTTCAGACTTTTCAGATCCAACGAAAATGTGAATTTTGAGAATGTAATATACCGTTCTAGCATTTCTATATTTGTTTGTATGTGTATGTAATTCCATGTTTTTTAAACTGTCTGCAATCCTGTATTTGATTGTAGATATATAAGAAAATCTAATCAATTTAATTTTTTGTGTGGATGATTGACATTTCACCTTGGATGTCAGTTGAAACAATCAATGGAAGTGGAACGTTAAGAAGGCTAGATTTTGACATGTAAATATTCCAACCATTGTTGACAAAAATCTTACGATTTAAATCCCGATTCAAATCGGATCTTTCCCTTTACGGTTCGATTTACATTCCGATTCAAACTTAGTCAAAACCGCAATTTAAAAAAAAACTTATACTAACAAAATCAAAATATCCATTTAGATTCACAATTCCAATTATAATGTTTTCAAAAATATATATATAAATTAATGTAATTAAAGAGAATATAAGTTTTAAGTTTAGTTGTAGAAGTTCAAACTTTAAAATCAATGTCAGAATGTGTACATACCTTAAAATATGGATCTTTTGAATCCACGATTTATGATTCAAATCCCGTTTCGATTCAAAGTTTGAATTTTATGATTTACAATTTAAGTCCCATCTTGAAAACCTTGATTCCAACATCTATTTTTTGGGCACATCGGTATTCAGCACAATATTACAGCTCCACCAAATGTATTGGATATGTTTGTTTTTATAGCGACTATTAAGATTTTATAACTCATAAGCACTTTCATTTGTGTAATCTTGATGAAAATGTGTTTGCAATTAACTAAATACATTGACATGTCATGTTACAACTTGTATGGAGTTTATGAGTTATAATTTATAGTTAAAACAGCTGATATATCAGTCGAATTGTCCGACATATTCGACTTCATCCACTGAATTACTGGAGCATGCCTTTTTTGTTCAAGTTTCAAACGTAGAATTCAAACTGTGTGCATCGCCAATTTAATTTTCTAACATATTGGTTAATGTTAAGCACATAGTTTAAATTCTTCAGATGGACCTATGATTATCTTTAAAATAGAGAGGAATACCGAAATAGTTTTCTGCATATTACAAAGTTGGCTCATATGGCCTTTGACTATTTCATGCTCAGAAACACGATCTCAATTTTATTGGCCATAATAACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTAATTTGATTTTATCAGTCTGTGTGTCAAATTGTTTCCGCAATTTTCTGGAATGTGTTCAACTTGGTGTTTTTTACATACATATCCATTGTCTTGTTTAGGTCATGCTATGTGGCCAGCAGTCATTGTTGATGAATCAAAATTTGGGGCAAGAGGGGGCCTGCAGCTTCACAGAAAGCAAGCAATTCTTGTGCAGTTCTTTGGAACACATGATTTTGCTAGGTTGAACTTTTCATCATTGAAGTGGTTTAATAGAATTGCAAAACTTGTTGTCCTCAACTGTATATTATTCTGCAAATAGATATAAAGTTAATGTTGTTCAAAGACCCTTTTGTATTGATGTTATAAATTACTTCAAAATTCTATATATGGATAATGCCAGCTTCACCATATAATTTGCTATCTACAATCTTGAGATCTTTCAATCATTATCATAGCTTAGATTTTCCCCTTTTTTTCTAACATAATTGATTTTTGTCTATTTAGGATTAATTCTAAGCAGGCTATTCCATTTGTTAATGGCCTGATTTCTTCTTTGCATACGAAGTGTAAGCAAATACGTTTCTTTCGAGGCTTAGAAGAAGCAAACTTGTAAGTACATTGTTATGTATTCTGCAATATTAATCTATTGCATTTCGTTTTTATATCGAACAGCCATATTCTTCTGTAGTATCCTTTTTAATATGTGACAGTCTAAATGCCTAGTTAAATATATATTGTTTATTCAGTTAATTTTATATTGAAAAAACTTGTGGTATAGATGGGTACATAGTTATGCTATTTCTCAAACCTCAGTGTTTGGTAAATATTTATTAAATCAGTGTGTACTTAATTTTTTTTTTTTAAAAAAATTGTTTACCGACAACAAGAGGGCTGTTGCTTGGACATTTTAATTGGCTATACCATGTTCTGTTAGATGAGACAATTCATGATAGTTGTCATGATGCACGTTTTGTTATATTTTTACACCTTTTCTAGCTTCATTAATTAACACAAGTTATATAGGTCATTGTTGATATTTTAATTGATAACTGCTTAAAATAATAACTTGTACTCGCCATTTTGAAAAGGTATCTCAGTAAACATCAACTTCCTGAGAGCATGATGGAGCTACAAAAGAACATGAGGGATAATTATTG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK56476.1	1.8e-304	uncharacterized protein A4U43_C10F9110
Swissprot	Q6K431.1	7.9e-265	SET family protein 33
trEMBL	A0A5P1E647	1.3e-304	Histone-lysine N-methyltransferase ATX2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G05830.1	54.02	0.0	837	ATX2;SDG30	trithorax-like protein 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC6G02415	AT2G31650.1	773	304	10	93	836	182	926	53.30	837
AfisC6G02415	AT1G05830.2	772	330	10	81	836	185	947	54.02	837
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g494504.t1
Allium fistulosum	AfisC6G02415
Allium sativum	Asa6G04737.1; Asa8G04324.1
Arabidopsis thaliana	AT1G05830.1; AT1G05830.2; AT2G31650.1
Oryza sativa	LOC_Os09g04890.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00855.14	PWWP	Domain	209	296	53.5	2.2e-14
PF05964.11	FYRN	Family	354	404	57.2	1e-15
PF05965.11	FYRC	Family	413	491	51.3	8.5e-14
PF13831.3	PHD_2	Family	525	559	39.1	3.5e-10
PF13832.3	zf-HC5HC2H_2	Domain	568	690	105.1	1.9e-30

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000123	C	histone acetyltransferase complex
GO:0000785	C	chromatin
GO:0001709	P	cell fate determination
GO:0003002	P	regionalization
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0016055	P	Wnt signaling pathway
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006928	P	movement of cell or subcellular component
GO:0007173	P	epidermal growth factor receptor signaling pathway
GO:0007476	P	imaginal disc-derived wing morphogenesis
GO:0009605	P	response to external stimulus
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GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0030030	P	cell projection organization
GO:0030855	P	epithelial cell differentiation
GO:0040011	P	locomotion
GO:0042063	P	gliogenesis
GO:0042800	F	histone methyltransferase activity (H3-K4 specific)
GO:0043967	P	histone H4 acetylation
GO:0048523	P	negative regulation of cellular process
GO:0048666	P	neuron development
GO:0048749	P	compound eye development
GO:0051179	P	localization
GO:0051568	P	histone H3-K4 methylation
GO:0051704	P	multi-organism process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network