result

Gene information

Detail information of AfisC6G02592

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G02592	chr6	449429043	449446108	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G02592
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AQP25671.1	6.4e-80	MYB transcription factor
Swissprot	A0A2R6S148.1	3.1e-47	Myb-related protein 1
trEMBL	A0A1S5VID8	4.6e-80	MYB transcription factor

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G66370.1	44.05	3e-44	175	AtMYB113;MYB113	myb domain protein 113

>>>Show top 3 blast result

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AfisC6G02592	AT1G66370.1	227	102	6	28	251	7	211	44.05	3e-44	175
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g233442.t1
Allium fistulosum	AfisC6G02592
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	31	78	48.3	7.4e-13
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	84	129	48.8	5.3e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
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GO:0005634	C	nucleus
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GO:0006796	P	phosphate-containing compound metabolic process
GO:0008195	F	phosphatidate phosphatase activity
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GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009745	P	sucrose mediated signaling
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009800	P	cinnamic acid biosynthetic process
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009867	P	jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:0009892	P	negative regulation of metabolic process
GO:0010091	P	trichome branching
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0019430	P	removal of superoxide radicals
GO:0031542	P	positive regulation of anthocyanin biosynthetic process
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044255	P	cellular lipid metabolic process
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0048354	P	mucilage biosynthetic process involved in seed coat development
GO:0048629	P	trichome patterning
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0080167	P	response to karrikin

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09422	MYBP; transcription factor MYB, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network