result

Gene information

Detail information of AfisC6G02890

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G02890	chr6	503749842	503758051	+

Sequences

CDS

>AfisC6G02890
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Protein

>AfisC6G02890
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Gene

>AfisC6G02890
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267020.1	7.5e-223	uncharacterized protein LOC109842571
Swissprot	Q05609.1	5.0e-46	Protein CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE1
trEMBL	A0A5P1EYY3	5.4e-223	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G46920.1	57.46	1e-137	488		Protein kinase superfamily protein with octicosapeptide/Phox/Bem1p domain

>>>Show top 3 blast result

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AfisC6G02890	AT3G46920.1	402	149	3	989	1390	782	1161	57.46	1e-137	488
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g412247.t1
Allium fistulosum	AfisC6G02890
Allium sativum	Asa8G03922.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00564.21	PB1	Domain	25	112	57.5	8.2e-16
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	1119	1380	201.2	1.6e-59

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000186	P	activation of MAPKK activity
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GO:0002229	P	defense response to oomycetes
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GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
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GO:0071281	P	cellular response to iron ion
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GO:2000035	P	regulation of stem cell division
GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network