result

Gene information

Detail information of AfisC6G04046

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G04046	chr6	726255098	726268994	+

Sequences

CDS

>AfisC6G04046
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Protein

Gene

>AfisC6G04046
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	APL97765.1	4.1e-182	COL1
Swissprot	Q9LUA9.1	8.0e-58	Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 10
trEMBL	A0A1L5BWP4	2.9e-182	COL1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G48250.1	47.02	2e-88	322	BBX8	B-box type zinc finger protein with CCT domain

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G04046	AT5G48250.1	419	151	12	1	394	1	373	47.02	2e-88	322
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF06203.11	CCT	Motif	337	379	60.7	9.1e-17

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0007623	P	circadian rhythm
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GO:0010018	P	far-red light signaling pathway
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GO:0010161	P	red light signaling pathway
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
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GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048576	P	positive regulation of short-day photoperiodism, flowering
GO:0048579	P	negative regulation of long-day photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network