result

Gene information

Detail information of AfisC6G04473

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G04473	chr6	806780593	806792181	+

Sequences

CDS

>AfisC6G04473
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Protein

Gene

>AfisC6G04473
CATCTCCTTTCTAACGGTAATTTGAGGGAAGATTTGGGGTAACACCATCATACTGCTTTAACCCTTGCGCTAATTGATTCCGTTAACCTGCGCGGAAATACAGTAATTTTCTCTCTGCGTTTTCTCCTTCCCCAACTCCGCTGCAATGCTTGCCTTCGCAAATTCATTTCACTTCTTTGCACCCTGAACGGAGAAGACGAGGATTCATGGTGGTTGTGAAGTATATTTGCGCAATACAACCCTACAAACTTTTATTACATAAATCCCCAATTAAGTTATGTGCGCATTTAACCCCCACATAAAATCTATCTATAAAGACCTTCTGTCTCTCTCTGTTTCTTAAAAAACTGTTTACTCATTACATATCCCCTTCATATCTTCTCTCCCAATATAAAATTAAAAATTAGGGTTTTTCTCTTCGCTTTAGATTCACAATTCAGCCTCCCGTAATTATATTTTCCATGATTTTAAGACACAAATTGCGATCGTCAATACAATCCAAGACCGTTGAAGTCTCAAACAACGACGATGAAGACGATGACCTCGCAATGGCGTCATCTTCCAGGTATCGCCGAAGCAGTCGCAATATCTTAAGGAGAACCCGTGGCCGCCCTCAAGTGCTTCCCAGACGGTTTGCTGATTCGGTACTGATTGATCCATTAAACGCAGGCAGGAAATCCAATTTGAAGACCCTAGATCCTGATTTTGAAATTGATGACCAAGCAGTTGCTGATTTGCCTCCTTTGAAACGGAAGAAGGTTGGTTTGCATGTTTTGAAGCCAAAAAGTAGGTTGCCCCACGAGGAGTGCGTTTTGAATAAGCAAATTGGTGATTACGATTATGATCTGACCAATGTGGATGAACTTGAAAAGAGGGAGTTTGTTAAAGGAGATGTGATTTGGGCAAAATTGGGAGATGAGTATCCAGCCTGGCCGGCGGTGGTTGTTGATGCAATGCAGAATGTGTCAGGGACTGATTTTGATTTGTGTGTCCCGGATGCAATTCTGGTTATGTTTTATGGCAATAAGAAGGTACAAAATTTTGTAGTTAAAAAGTTTTCATTTTGCTTTTGTGTTTATATTATTTTGGATTTGTTTGTGAACCCCAGGAGTATGGCTGGGTAAACAAGGAGATGGTGTTTTCTTTTTCAGACTGCATGGAGAGGTAACGTGTGGTATTTTTGAGAAGATTTGATTTTTCCTAGCCCTGTATTTTCCTTTTTCCTTTTTCCTTTTCTGGTGGAGTGAAATAAGAGTATGTTATGATGGTATGTATTAAAGACTTTGTGGGATTAAGATTATTGACCAAGCCGCTAAGGGTTAAACTATAAGGGTAAGAAAAGTAAATTTAGTACAGTGCAGTTTTATTATTGATTTTGGAGGCTAAATACCGTTAATACATTTGTCTCTTGTCCAATCTCAACTACATTTCAAACTATACCAGAGTCCCATCTAACTTTATTTCAATTTCAATTTGAAATCTATTTTGATTGCAATTATCAATCCGACGATTTTAAGATAAATATCAAACTCTATTGAATTTTGTTTTGAATTTTTTGGAGTTCTTTGTTTGTTCTTTGCTTGTTTTAATGACTTTTTATCAAAACTCTTAAGACAAATTGAGATATTAGATAACTTAATCTGTCATATTTCAGTTTTAACAAAATCATACAAAATCTATCAAATTGTTCTTTGCGCTTTTGGAGCAAATGGGCAAACCTAATAAAATGGGTGCTTGGTGTTGGACATATCATGGCAGAAAGTACATTTTAAAAAAATAAAAAAGATATCTTTGAAGGGGAAAAGCGACGAAGGGTGCAAATCTAATTTGATTGAATGATGATACAATTTGGTTGGGGGATTAGTCAATTTAATACTCTTCTCAACAATTAAGGACACCAAAAAAACACTTTAATATTCAAATTGAGAGAAATGTTAGCCATACTATCCTTACAAGGATACTGTGGCTATCGGTGGAGAGTATAGGCTTATACATCCATAATGATGAGTGCCTACCTTCTCTATCAATGAGGTGGACTATCCTTTCACTAATCATTGAAAAATCATCTGACATCTGTTTCTCGGGTGGTTAATGGTAACTTCTTATAATCTGAAAAGTTAAAGATTCAAATTTTGCATTTAATTGGAAATCAATAATTTGTGTTGTTATGGAAAGAAATTTTTATTCACAACCCCCGCCCCCCCCCCTCTCTTCCCTTCGAGGCATAGTTGTCAAGGCGAAAAAGCCCCAGGCTATCGCCTAGCGCTTTTTTGCGCCTAGGTCTTTTTTGGGCGCTTTGAGCATCATTTTTCTGGTTTTTAACAAAAAAACCGCATTTAGAAAATGCATTAAAACTCAATTTTTGACTTCAAAAAATTGCATATAAATACAATATTGAGAATAAAACATCATACGGTTATCATAAATCAAGCTAAGAAGGCACAAAGTCATTCAAAGTCGAGCAGCTGTGGCAAAAGTCGGGCGGCGGCAACGATTTTGAATCTAAGGTTTTTGTTTTGTTCGAGAACGATGTATTTTATGTTCGATACTGAAGCACACTTTTTTTTTGTTTGTGGTTGGATTTTGGAATGCAATTGGGCTCCATATTGAGCCAAATGCTAGAATTTTATTTTCTCCTCAATAATGCTGCACAAGGCGCGCTTTTTTAGGGCTTCACAAGTTGAGCACTTTGGCGCCTTTGGGGCTTTTTTAGCGCCTTAAGCATCGTCGGCGCTTTGAAAGGTAAAAAAGCCCCAGGCTGGCGCCTAGGGCTTTTTGGCGCCTAGGCGAGGGCTTTAATAACTATGCTTTGAGCAATGTTCAGTGTAACTGTCAGAAGGTGCTAAATTGATATTATGCACTAAACATTTGTATGTAGCATTCTTTTACATCGACGGCTATATCTGTTCATTGTAGGTTTGCGGAACAATCAGAAGTGACAGCAGCTAGCAAGCTCCAAAACTTCCATAATGCAATTGAGGAGGCTTACTTAGTTGATAACGGTTTTAGTAGGTTAAGCGATGATCATGAAATGAGCAGGCAACCTCAGATTGATCATGAACTTTTACCTCAAGAAAGTCAGGAGGCTACTAGCTCGAATCATGATCAGGATTGCCAATTACAGAACAAGGTAAGATAGTAGTATCCCATTTCCCTTCATATTTCAATTTTGGCCTAATCCCCTATGTTTCTTACATCATAGTAATATGATTGAGAACGTGTATGGTTGTTTGTTGCTATGTTGAAAGCTATTTATTTTTCCATTAAGAAAAGGCAATTGGTTTAACCTTTATTCTTGACTTTAAAATTTTAATTTAACAATGTGCACCTTTGTATCCTGGATTGAGCGAATATGCTTTATGTGTTCCTGGCACATGTTTCTGATTTGATCATGTCTTTTCCCATTACTCCTGTGCTTCTTATATTACATAAAATGTTAAACATACGAATTTTAGATACAACATAGTAGTAAAACCAAACATACAACCAGAAAATGCGGATTTTTTTATGGGAATCTTTGTATTTTATAGCTAGTTTCCTGGTCAGGTTATAGAATTAACCTTTGTAAAGCCTTTTACTGCTTCTAACATTACAAGATTATTCCTTCATTTGGATCATACAAGGCCTTGTTGTAATATGATATACTATTTGTAGGTTGCTTACAAGAAGATCACTATAAGTAAACTGAATACGGTTCACGAAAACTTACATGACGGTATGAGTAGATCATTATAAGATCATTATAAAAAGATCATTATAAGATCATTATTCCTTCAAGACTTACATGACGGTATGAGTAGAAAATACCACATGTAAACTGAATACGGTTCACGAAAAAATGGTTTAGTTTCTTGTAACAGGGTTTTAAGTTACGTCTGTTAATTGCATAATGTATTCTATTACTGTTGTAATTTTGATCAATGAATAATGTATATTGAAGATCTCTATGGTAATTAAAATTACATTCTGAGAGTTTGTATTGGTAAAAGGATCTGGTGGGTATAGATTATTTCTGCTCCAAATCCAAGGAAGATCCTCACATGATATTTTCAGATGCAGTGGGCAAGTATACAGAAACCCGGTACACACAGTTTATGTTACCCCTATAATATATATATATCCCCGCTATCTTTGCACAAAATATGCTGATCGATTTATAATAGCAGCTATCAGGACAAACGTACTAACAAGATAGATGTTTTGTGCAACGGCATGGAGGGATCTTACCTGATCGATCAACAGTTGTAAGTAAAACAGAAAATGATAAATTATTCAAGTGTGATGTGATAAACTTAAATAAGTAGCTAAACAGTTGACTTAGAAAACTAAATGAACAGGTTGGGCAACTGTCAGCAATGTTCATTATATGTGATTGGCATAATGCAAATTTTGTAAAATTGATGCCTGTGTTATATGGTTTATCGTCTTACAATCATTTTTTTTAAGAAAGTTATCAGTGGTATTAACATTTTCTAATTTTTGAACAAATTTACCTATTTGCACATCCCTATCTCTATTACTAACAAAGAGAATTGATTTTATACTATTCACTGGTGTGTGGGTTAAGTACCCTTTCAATTTTTCTTATTCGATCGCATCTCTACTTCCCTTGCATGCTGTGCATGGATGTGGACATGTATGTTAGTTTACTTTTTTTTCTCTTTTGTTGTAGCTGGAATCAATGGAATTACTATTGTAATTGAACATTGTAGCAAATGCTGGAAACAATATTTTTAGATAAATGTGTCAATTATTAGTGATTTGATTATATAGTGCCATCGGAATATGATCTGACCATGTAGTTTATAGTCCAAAATAAATCCATGTTTTATTGGACGAATATGCAAACAAAATACTGGATCATCATTTTGCATCTAAGTTCAGTCTTGCTACTTGATAAGTAGATGAAAACATAGGTTGCTATTGGCCATATAACTATGAATGTCATTACGGTTAATATATGCACATAAAGCATGCATTAACGCTAGCATACAAAATAG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020265084.1	9.8e-306	histone-lysine N-methyltransferase ATX4-like isoform X3
Swissprot	Q9SUE7.3	1.6e-228	Trithorax-homolog protein 4
trEMBL	A0A6I9QQ47	3.1e-261	histone-lysine N-methyltransferase ATX4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G27910.1	59.80	0.0	720	ATX4;SDG16	SET domain protein 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G04473	AT4G27910.1	602	220	8	272	856	431	1027	59.80	0.0	720
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g348013.t1
Allium fistulosum	AfisC6G04473
Allium sativum	Asa8G02721.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00855.14	PWWP	Domain	140	232	51.8	7.5e-14
PF13831.3	PHD_2	Family	440	474	45.9	2.6e-12
PF13832.3	zf-HC5HC2H_2	Domain	481	593	94.9	2.8e-27
PF00856.25	SET	Family	725	830	69.3	4.7e-19

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0005719	C	nuclear euchromatin
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GO:0045646	P	regulation of erythrocyte differentiation
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GO:0051568	P	histone H3-K4 methylation
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GO:1990188	F	euchromatin binding
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GO:2000648	P	positive regulation of stem cell proliferation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network