result

Gene information

Detail information of AfisC6G04746

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G04746	chr6	850049273	850057497	+

Sequences

CDS

>AfisC6G04746
ATGGACCTGAATCTCAATCTCAAACTATCCGACAACAGGATCCATCACAATTTCTTCGATTTCAACTACTTTCCGCTTTCCGACAACATGTCAGTCGATCCTGGATCGTCCGGCGTCCACATCCCTGACAACAACAGCAGCGTCGCTTCTAATTCGAACTCCAACACTCAGCTTCTTCCACACGATGCTTTGAAGACGCATTCTTTGACTGGGAACAGCGCGGTCAACCCTCGGCCCAACAAAAAGGTTCCTCGCGCTTTGCACGATGATGCCTTGGCTCAGTTTCTGATGAATTCTAGTTACGCGACGATTTCTTTGGGTGATTATTATGATCGATGGGCGATTGATTTGAATAAGTTGAACATGGGTGAGGCGTTTGCTCAAGGGGCGTTTGGAAAGTTGTATAGGGGGACCTACAACGGTGAAGATGTGGCCATAAAATTGCTGGAGAAGCCGGAGAATGATGCTGAGAGAGCACAGTTGATGGAGCAGCAGTTTGCCCAGGAGGTTATGATGCTTGCGACATTGAAGCATGATAATATTGTTAGGTTTATTGGTGCATGCAGAAAGAGCCTGGTTTGGTGCATTGTGACTGAATATGCAAAAGGTGGGTCGGTTAGGCAAGCACTTGTGAAGAAGAGCAGGGTGATTCCTACGAGGGTTGCAGTGCAGCAGGCACTGGATGTGGCTAGGGGAATGGAATACGTGCATGGATTGGGGTTTATTCACAGGGACTTGAAATCTGATAATCTTTTGATTTGTGCTGACAAATCGATTAAGATTGCAGATTTTGGTGTGGCAAGGATTGAGGTTAAGACTGAGGGAATGACTCCGGAGACTGGGACGTATCGCTGGATGGCACCGGAGATGATACAGCATCGGCCATACGACCACAAAGTAGACGTGTACAGCTTCGGCATAGTGCTTTGGGAGTTAATAACGGGTAGTCTGCCCTTCACGAACATGACAGCGGTGCAGGCAGCTTTTGCGGTAGTGAACAGGGGGTCACGGCCGACCATCCCCAATGATTGTCATCCTGTTCTCAGAGAATTGATGACCCGGTGCTGGGACGCCGACCCCAATGTCCGCCCTTCTTTCTCCGAAGTTGTCAAAGTACTCGAGCATGCCCAAACCAATCCTGGCAAGGCACGCTTCAGGTGTTGCATGGCAGAGCCCATGACTATTGATTGA

Protein

Gene

>AfisC6G04746
AAAAAAGAGATAAAACAACGACCTTCTCTTTCTTCCCTTCTCATCACCACTTTCTTCAAAACCCCAAAAATACAAATCAAATCCTTAGTTGCGACCTAAAAATGGACCTGAATCTCAATCTCAAACTATCCGACAACAGGATCCATCACAATTTCTTCGATTTCAACTACTTTCCGCTTTCCGACAACATGTCAGTCGATCCTGGATCGTCCGGCGTCCACATCCCTGACAACAACAGCAGCGTCGCTTCTAATTCGAACTCCAACACTCAGCTTCTTCCACACGATGCTTTGAAGACGCATTCTTTGACTGGGAACAGCGCGGTCAACCCTCGGCCCAACAAAAAGGTTCCTCGCGCTTTGCACGATGATGCCTTGGCTCAGTTTCTGATGAATTCTAGTTACGCGACGATTTCTTTGGGTGATTATTATGATCGATGGGCGATTGATTTGAATAAGTTGAACATGGGTGAGGCGTTTGCTCAAGGGGCGTTTGGAAAGTTGTATAGGGGGACCTACAACGGTGAAGATGTGGCCATAAAATTGCTGGAGAAGCCGGAGAATGATGCTGAGAGAGCACAGTTGATGGAGCAGCAGTTTGCCCAGGAGGTTATGATGCTTGCGACATTGAAGCATGATAATATTGTTAGGTTTATTGGTGCATGCAGAAAGAGCCTGGTTTGGTGCATTGTGACTGAATATGCAAAAGGTGGGTCGGTTAGGCAAGCACTTGTGAAGAAGAGCAGGGTGATTCCTACGAGGGTTGCAGTGCAGCAGGCACTGGATGTGGCTAGGGGAATGGAATACGTGCATGGATTGGGGTTTATTCACAGGGACTTGAAATCTGATAATCTTTTGATTTGTGCTGACAAATCGATTAAGATTGCAGATTTTGGTGTGGCAAGGATTGAGGTTAAGACTGAGGGAATGACTCCGGAGACTGGGACGTATCGCTGGATGGCACCGTAAGTCTATAATTGTTTTACCACTTCTTTAATATGCCTGCATATGATTCGATTGCTTCGTCATTCTATTTATACACAACTAGTTATAAATAACATAAAAAATTGATGTACTGTATACTGGCTTATTATACATACTTTCGTATTTTTGGGCGTGCATAGGAATAAGGAAATTGGGTTATCTTTGCTAATTAATTTTCCCGTACTTTTCCCAAGGAAGAGCTTAAACGTAGTACATGCATAAAACACAATATATTTCTTCTTTAACATCATTCTCTAAGCATGCAATCTGTCAGTTTTTTATCAGTAGCCACAAAACACAAAAATTTGTGTGCTAAAATCATTAGCGATGGTTATAGATTTCGTCTGTGTAACAAAAAAAGTTTTGATTTACTGGACGTACTATAGCAAGTTCAGTAGCTAAGGGAACATACTTTCTTGATAAACTCTGAAAGAATATGATTACAACACTTCTAGCTTAACTCTGAAAGAATGATCTTGGTGAACTCTCTATTTTATTTGACATTTTATTTAACCTAACCAAGATAATATAAGTAATGATGCAACATACTTTCTCACAAACAATGTTGATGTTACGTACCAAAATAGTGAAAATTGGGTTGAACATTGAATCTCATATCATAAATTAAAAGAACCATCTTGATAAACGTGCAGCCACCAGGATTGTTAAACCCACTAAAGCATAACTCCATATGTAATTAAATGTGAAAAATAGTTTGGTTTTTGTTAGAAGAATGGAGTAGGTTCCTCTTATCTTTCACTTCTATTCATGGCTATTATGTGAAGAGATATCCCAATTTATAGCCAAGAATATAAAGATAGATTTGTAAATCTTTTTCATTAATGTATTCTATTTGCTCGAGTCAAATTTAATTTTGTCGTTACATGTCTCTTTACTTCCGCGTCTATTCAGGGCCATTATGTGAAGGTATTACCCAGTGTATCACAGGAAAATTATGCGAAGTTGTATTTGTTAAAAAAACCAGTAATTTATTTTATTTCCTTATAAATCAAATTTATTTATTTATTTTCTCATTACACTTTCCATTTAAGTACGATGTCAATCAACCATGTGCATGAACTGACTCTCACATGTATTTTTATGTAATTGTACTTAAATGCTAAATGCCTGGTTATAATTTGTTAAAGTTGTCAATGATTGTTTAAAAGTTAGTTGATCCCATAGGAGTTAATGTTGTTGCATTTTATATGTTTAAATATATGTACTACATCACAATACTATTATTGTATGATAAACTCAATACATATACATATACACCCACTAAAGCATAACTCCATATGTAATTAAATGTGAAAAGTAATTTGGTTTTTGTTAGAAGAATGGAGTAGGTTCCTCTTATCTTTCACTTCTATTCATGGCTATTATGTGAAGGGATATCCCAATTTATAGCCAAGAATATAAAGATAGATTTGTAAATCTTTTTCATTAATGTATTCTATTTGCTCAAGTCAAATTTAATTTTGTTGTTACATGTCTCTTTACTCCCGCGTCTATTCAGGGCCATCATGTGAAGGTATTACCCAGTGTATCACAGGAAAATTATGTGAAGTTGTATTTGTTAAAAAAAACCAGTAATTTATTTTATTTCCTTATAAATCAAATTTATTTATTTATTTCTCAATACACTTTCTATTTAAGTACGATGTCAATCAACCATGTGCATGAACTGACTCTCACATGTATTTTTATGTAATTGTACTTAAATGCTAAATGCCTGGTTATAATTTGTTAAAGTTGTCAATGATTGTTTAAAAGTTAGTTGATCCCATAGGGGTTAATGTTGTTGCATTTTATATGTTTAAATATATGTACTACATCACGATACTATTATTGTATGATAAACTCAATACATATACATACAAATATATACATATACATACACACACGTGTGCGCGCGCGCGCAAAGTAAGAGCTAATAATGTTATTTGCAGAATCAACTACTGTTGTTGAGCAATTTTTTAGTAGAACAACTACATTATATACGTGTGACAATTAGACTTGACCCACCGAATCTCATGTTTATGGTTACAAGCCTCGTTGGGGTTTTGATTCGTCAAGTCGTCCAAAAACAGTTGTATAACTTGATCTGATTTGACCAAAGGTTCAATGTTGATTGAATAGTAATACATGTTTTTGTTTTGTGATCAGGTCTTCAAGGATAGAGTAAGGTCAGGTCAGGTCCATTGAGTCAAATCAAGTCTTCGTGATATCTAGTACCATTTGTGCTCAATTTAACATTTGTATCGTTTGAAATGTATCCAAATCAGGTCAGATTGTGCTTTAGGTTTAGTTTTGTTTTCGAGTCCGGTGTGAGGATTTTTATTACAGTTGTCAGCTTTTACTATTAATACAACAACGACAACTAAGCCATTATTCCCAAACAAGTTGGAGTCAACTAAAGATGAAACTCGAAACTAAATAACAAAGTCAATTTAAAAGTAATAATAACAATTATAATAATTAAAAAAAACCATGATAATAATAATAAAATAAAGTATAATAATAATAATAATAAATAAATAAGTAAAATAAAGGTAAAAATAAAATAAAAATATATAAAGAAATAAAAAACCATGATGATAATAATAGTAGTAATAATGGTATTGATAGTAATAGAGATCGAAGATCAAATACTACGTCTTAGGCTTTTATTCACCAGTCCTATAATCTAAAACTTATAACGCTATCCCTAAACCCACCCTAAGCAAAAAGCTCATGGTTTTGGTATGTGGATCACTAACTTCTACGCGCTCCTGTCCGATACCAGCTTTTCGGATATATCTCAATCATTCACGTCCTTTTTTACTACTTCCTCCATGTTAATCTTGGTCGACCTCTACCCCTCTTTGAGCATTCGATGCGGCTTATAATTCCAACACGCACAGGTGCTTCGGGAGGTCTCCGTTGGAGATGTTCAAACCATCTTAAGCGGTGTTGGACTAGCTTCTCTTCAATTGGTGCTACTCCAAGTTTGTCATGTATATCATCATTTTTAATTTGGTCTCGTCTTGTATGACCATAGCTTCATCACAGCATACGCATCTCAACTATATTTATCTTCTGCGCATGTTGTCTTTTAGTAGGCCAACATTTTGCACCATACAATATCGTAGGCCTGATTGCCGTTCTGTAAAACTTTCCTTTAAGTTTTTGTGGGACTTTCCTGTCACATAAAATGTTAGACGCTAGTCGCTATTTCAACCACTCCGTTCGAATTCTAAAACTAACACCCTTCATTAATCTCCCAATCATGTTGCAACATTGATCCTAAATATTGAAAGGATTCCTTTTTGGGCACTACTTGTATGGTCAGAGTGATCTCCATCATTTGACCTGACACTGCTGAACTCACACTTTATATACTTTGTTTAGTTCTGCTAAGTCCAAAACCCTTTGATTCTAAAGTTTGTCTCCACAACTTCAGTTGTCAATCAATCCCTATACTATTTTCGTCAATTAGCACATCATCAGCAAAGAGCATACTTCAAGTAATCTCACCTTGTATATTCTTCGTAACCTCATCCATCATTAGGGCAAAAATGTAGGGGCCCAAAGATGACCCTTGATGTAATCCTATATTGAAGGGAAAGTCACTGGTTTCACTATCGCATTCTTTGACACTAGTCACAACATCATCATACACATCCTTGATAAGAGTAATGTACTTTGTTGGAACTCTCTTCTCCAGCCCACCACATAACCTTTCTCGGTATTTTGTCATAAGTTTTCTCTAAAATCGATAAATATCATGTGTAGATCTTTCTTTTACTTCTTCAATATCTCCATAAGTTATCTTATCAAGAAAATTGTATCTGTGGTCGACTTCCATAGGAATGAAATCAAATTGGTTTTTTGAAACGCTTGTCATCCTCCTTAATTGATGTTTAATGACTCTCTCCTAAAGCTTCATATGTATGACTCATAAGCTTGATTTCTTTGTAGTTTGTGCAACTTCGAATATCTCATTTACTCTTGAAGATTGGAACTAATATGTTT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267300.1	2.8e-154	LOW QUALITY PROTEIN: serine/threonine-protein kinase HT1-like
Swissprot	Q9ZQ31.2	4.9e-140	Serine/threonine/tyrosine-protein kinase 13
trEMBL	A0A1U7Z895	1.7e-145	serine/threonine-protein kinase HT1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G31170.1	68.25	8e-143	503		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G04746	AT4G31170.3	378	104	7	28	396	42	412	68.25	8e-143	503
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g379435.t1
Allium fistulosum	AfisC6G04746
Allium sativum	Asa8G02544.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	121	373	226.7	2.6e-67

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0016020	C	membrane
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004706	F	JUN kinase kinase kinase activity
GO:0004712	F	protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0007224	P	smoothened signaling pathway
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GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010182	P	sugar mediated signaling pathway
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0018107	P	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0019900	F	kinase binding
GO:0031624	F	ubiquitin conjugating enzyme binding
GO:0032147	P	activation of protein kinase activity
GO:0036094	F	small molecule binding
GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0043425	F	bHLH transcription factor binding
GO:0043433	P	negative regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity
GO:0043507	P	positive regulation of JUN kinase activity
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048365	F	Rac GTPase binding
GO:0048793	P	pronephros development
GO:0071570	P	cement gland development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network