result

Gene information

Detail information of AfisC6G05402

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G05402	chr6	951633655	951648590	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G05402
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_021298245.1	1.9e-24	protein LSD1
Swissprot	P94077.1	3.9e-14	Putative zinc finger LSD1
trEMBL	A0A6J1BG34	1.4e-24	protein LSD1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G20380.2	59.78	5e-50	193	LSD1	LSD1 zinc finger family protein

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF06943.9	zf-LSD1	Domain	7	30	41.6	7.4e-11
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PF06943.9	zf-LSD1	Domain	84	108	49.5	2.4e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network