result

Gene information

Detail information of AfisC6G05524

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G05524	chr6	971465274	971474301	-

Sequences

CDS

>AfisC6G05524
ATGGCATCAAAAACTATGTCAAAGGCAAGCTTGATAGTGCCAAGCAAGGCAAATTTTAGCCAATCATTCGAATCCAGTCCTCCTCCAATTCAAAATAATGTGCCTTTTAAATATTTTTTAAGTGAAAATTTGTCAGAGCCTAATGTGTCATTGGATGATGAAATTGTTTCGACCACAGACTCTCTTATATCACTTCGGTTGCCCAAGGATCCAAATGAAGAACAAGAAAAGAAAATGACAGAACATTGTAGCTCTGGTTATGCAAAGGTTAGTGATGACATTAGCAGTTTACCCAAAACTAGTGAATGTGCTAAAATCAGTGACCAAGCTGAGAATGCCGACAGTGGAAAGAGTAGTATGTGTAGAGCTAGCACATGCAGCAATATAAGTGATGAAAGCAGTTCTAGTGGTAGTGTAAGCAAGCCGCACAAGGGGAATGATTCGAGATGGGAAGCTATCAAATCCATTAGAGCTAAAAATGGTGATTTTGATTTGAGCCATTTTAAACTGTTGAAAAAAGTGGGCTCTGGAGATATTGGCAGCGTGTATTTGTCTGAGTTAATTGGAACTAAAAGTTACTTTGCTCTGAAGGTTATGGATAAAGTAGCATTGGCAACTCGTAAAAAGTTGACCAGAGCTCAGATGGAATTAGATATATTGCAGTGCTTGGATCATCCTTTCCTCCCTACGTTATATTCCCATTTTGAGATGGAGAAGTTCTCATGTTTAGTAATGGAGTTTTGCCCTGGAGGAGACTTACACACGCTTCGTCAAAGGCAGCCTGGGAAACACTTCTCGGAATCTGCAGCCAAGTTCTATGTAGCAGAAGTGTTACTAGCTTTAGAATACCTTCACATGCTCGGCATAATCTACCGTGACCTGAAACCTGAAAACATCCTGGTCCGTGAAGACGGGCACATCATGCTCTCCGACTTTGACCTATCCCTCCGCTGCTCATTCAGCCCAACCCTAGTCAGCTCATCCTCTCATTCACAGCAAACAACAGCTACCACCACATACTGCATAGAATCCAAGTGCATTCAGCCTTCTTGCTCTGTTTCCACATCCTGCTTCTCCCCTCGACTCTTCCGCTCAAAATCAAAAAACAAAAAAAGTTCAAAACCGCCTCGAGAGCCCACCAACCAAGTGATCCCTCTCCCAGAGCTCATCGTCGAGCCCACGGACGCCAGATCGATGTCCTTCGTAGGCACCCACGAGTACCTGGCACCAGAAATTATTTTAGGACATGGTCACGGCAGCGCTGTCGATTGGTGGACTCTTGGAATATTTCTATACGAGCTGCTCTTCGGTAAGACCCCTTTCAAGGGTTCTGGTAACAGGGCGACCTTGTCCAACGTGGTCGAGCAGCCTCTTAGATTTCCAGAGTCTCCTTCTGTAAGCTTCGCGGCGAAGGACTTGATAAGAGGGTTGCTGATGAAGGACCCGAAAGGCAGGTTGGGAGTGAAGAGGGGAGCGGCTGAGATTAAGCAGCATATGTTCTTCGAAGGGGTGAATTGGGCTTTGATTAGATGCACCAGCCCGCCTGAGGTTCCTAGGCCCATGGGCGTTGAACGGTTGATGTTGGGGCCAAGTGGCAGCCAGGAGAAGGATGAGGGTGATCAGGAGATTGTTACTGCTGATAAGCATCTTCAGATGGATTTCTTTTGA

Protein

Gene

>AfisC6G05524
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010942863.1	5.4e-172	serine/threonine-protein kinase D6PK
Swissprot	Q0DCT8.1	1.2e-165	Protein kinase G11A
trEMBL	A0A6I9SFG8	3.9e-172	serine/threonine-protein kinase D6PK

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G47750.1	68.25	0.0	666	D6PKL2;PK5	D6 protein kinase like 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G05524	AT5G47750.1	485	139	4	84	555	104	586	68.25	0.0	666
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AfisC6G05524	AT5G55910.1	474	138	10	93	555	35	498	66.46	6e-174	607

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g249638.t1
Allium fistulosum	AfisC6G05524
Allium sativum	Asa8G01707.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	169	331	130.8	5.1e-38
PF00069.22	Pkinase	Domain	398	501	74.8	6.2e-21

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003729	F	mRNA binding
GO:0005773	C	vacuole
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005524	F	ATP binding
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GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0008728	F	GTP diphosphokinase activity
GO:0008893	F	guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase activity
GO:0009507	C	chloroplast
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GO:0009898	C	cytoplasmic side of plasma membrane
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GO:0010181	F	FMN binding
GO:0010362	P	negative regulation of anion channel activity by blue light
GO:0010540	P	basipetal auxin transport
GO:0015970	P	guanosine tetraphosphate biosynthetic process
GO:0015979	P	photosynthesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
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GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048766	P	root hair initiation
GO:0048767	P	root hair elongation
GO:0048825	P	cotyledon development
GO:0080167	P	response to karrikin
GO:1901981	F	phosphatidylinositol phosphate binding
GO:2000114	P	regulation of establishment of cell polarity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08286	E2.7.11.-; protein-serine/threonine kinase	EC:2.7.11.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network