result

Gene information

Detail information of AfisC6G05589

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G05589	chr6	980288231	980296172	+

Sequences

CDS

>AfisC6G05589
ATGGCTAGAAAGAATTACTCTGGCCACTTTCTACAATTATTATTTCTCATAGCCACATCACCATTAGTATCATCCAAAACCGAAACAGATGTTCTCTTGGAATTCAAATCCTCACTTTCTTTCAATAGAGGTGAAGACTCCCTACATAATTGGAACTCTGGGTCAAACGCATGCAAGATTAATGACTCCAATTGGAAGGGTGTAACCTGCCGTAACAACCAGGTGCGGAATCTACAGCTTGAGAACATGGGACTTGTAGGGCTACTTAACCTAACTGCCTTATCTAACCTACCTATTCTTCGTGCCATAAGTTTCGCCGATAACAGCTTAGTTGGGACGATGCCCGATATATCGAAGCTTGGTGCACTTAAAATGCTGTACTTGTCTAATAACAATTTTTCTGGGGTCATTCCTGATGAGGCTTTTTCAGGAATGAGGTCACTGAAAACAGTGTACATTTCTGGTAATCGATTTAAGGGGAACATACCTTCATCTTTGGCAAGGCTTTCAAAGCTTCTCGATTTGGGGTTGGATTCGAATGAGTTTGAAGGCGAGATTCCTGATTTTGAACAAGCTGTAGGATTACAGATGGTTAATGTTTCATATAATAAGTTGGAGGGAAGAATTCCTGATTCTTTGAAAAACATGAATCAGAGCTTGTTTGCCGGAAACAAGAATCTCTGTGGCGCTCCGCTTAATGCTATATGTCCATCGCACAAAAAATCCCGTGCTGTTCTCGTTGATATCATAGTAGCTTCTATATTTGCTTCCTTGATTATATTATGCATCATTTTCTCACTTATTAGGTGCTGTAAAAGCAAACGAATTGATTCTAAAAGTATCGATATTGTGTCAGTAGAAAGTTCAGTGTCTAGCGAAATAAGCATCAGTAGCAATATAAATAAAGTTTTCCCTGAAAAGTTATCATTCATCAAGGAAGAGGAAGAAAAGTTTGATATTCAAGATTTATTGAAAGCTTCAGCTGAAATATTAGGAAATGGAAATTTTGGATTTTCATATAAAGCAGTATTGAAATCTGGACCTTCAGTTGTGGTCAAGAGATATAAAGATATGAACAGAGTTGGAAGAGATGATTTTCAAGAACATATTAAAAGACTTGGTAAACTGAATCATGCTAATGTTTTGCCTATTCTAGCTTATTGTTATAGAAAGGAGGAGAAGTTGATTGTATCTAGATATGCAGTAAACAGGAGCTTGGCCCACATACTCCACGGAAATTCCGGAACTACTGTTACTCCATTAGAGTGGGCAAAGAGATTAAAAATTATCAAAGGAGTAGCTAGAGGACTTGCCTATGTACATGAAGAGCTATCTATGTTGACTCTGCCTCATGGACACCTTAAATCTTCAAATGTGCTTATCAATGAGAACTATGAACCGTTAGTTACAGACTACGCGCTCTTGCCAGTTGTGAACCATAGTACTGCCTCAAAAAATTTGGTTGCATACAAGTCTCCAGAAGTCAATAGAATGATTCAACCATCTAAAAAGAGTGATGTATGGAGTTTTGGGATATTGATAATTGAGATATTAACAGGTAAGTTACCACCTACATATCTACAAAACGGAACGGCAGGCGCTGATTTGGGAGAATGGGTAAAATCAGTCGTGAAGAAAGGACAAACATTTGACAATAAAATTGAGATGAAGAATGGAGAAAGCATGATGTTAAAATTGTTAGAAATCGGATTAAAATGCTGCGAGGTTGACGTACATAAAAGGATGGAAATGAAAGAAGTACTAGTAAAAATCGAGGAGTTAGAAGAGATTAGTGGTGGTGATAATGGCATTGAAGATTCATCTTTTCTGAGTGAAGTTGATTTGTATTCATCAACTGATTATTTCTCTTTTTCCTGA

Protein

Gene

>AfisC6G05589
AAAAAAAAATTCTTACAAGTGTTGGAGTCAAAAATAGAGGTCCTGGAAAATCTCCTGGCCAATGCCCATCACTTGCCTGAATAGATGAGAAGTACCTAATAGCCCTTCTTACAGTGGTCGTCACTGCTTCCTCGGTAATATTTTCGTTCTCATTCAACTTTATTTGGGGTAGTTTTGTACCAAGAGAAGTATTTTCTCTTGCAAACTACCATTATAAAAGTTAAGAGATTAATATGGTAGAGAAATATAACATCGATTATATCATTGTAACTGTATTATATTATATATATTGAGCATATTATGAACTAAAAAAACTGGAGCCTGTATTTTATATGGAGGGCTATTTTTGTTAAATCTTTTATCTCATCTAAAACTGTTCTGAAATTTACTATTAGCCTATTTGTTGTCAAGCAATACATTTTTTCTTGACACTTACAAAATAATTACACAATAAACGAATAATTTGACAATGTTATATTATTTTGGTGACTATACATATTTCTTGAAATACATTAATTTTATATTTCAAGTAAATCTTTTACCTGCATTCTCATTAAAAGATCTGATGCTTGTTTCTTTTGGAACCTATTCTTCCGAAATTCTTCTCTAATGATATCCACAGATTCTTGCTCTTTGTATGTTCCAAGTTTTGGATCAAATTCCCAAAATTGCCTTCCTATGAAATTGTACTTGCTTTTAACATATGGGCCTCCTTTAGCAAATATAAGCCTCCACATTATTAATACAGCCTAGAAGCATACAAATTTGTTCTCTTCATATCATGCTTAAGTTGCAAATAATTTACACAACACTTAAGGTGAAATTACACACACACACACACATGTATGTATGTACATACATACATACGTGCGTGTGTGTACACAGCCCAGAAGAATACAAAATTGTTTACACAACACTTGAGGTAAAACAAGTATATATAGTTATATACTAAGTGAATTGCTTCATTAAAATCCTCACATTCCCCTAATCTAAATGGAGTGTGTGCACGTGCGCGTGCGCAGCCTAGAAGCATACAAAATTGTTTACACAACACTAAGGTGAATCAAGTATATATAGTTATATACCTAGTGAATTGCCTCATTAAAATCCTCGACAGACCCCTAATCTAAATGGACTGTGTGCCCCCAAAGAACCAAGTTTCAGTTGTAAACATTGAGGGATATATGTATTATATAGATACACACCCATAGAAATATGTATATAATCAGCAGCACACATTTTAGTTTTTAGGCGCATACTTATTTTCATACAAGTATATCATTGTATTTTTCATGCAGCTTCTAGACTTGAAGTTTGACATTACCAACAGCGGCAACGATGTCACTTTTGGTAAAATATTATGCTATGTGATACGGGCAAGCTGATTCCATTGAGGTATGCTTTTGTGTTATGTATAGCATGCTAAATGTTCCGCTTTCACACGATATGCTTATGGGACATCTCAATAAAAGGATGCTGTTTAGTTTCCAGATAACCGGATAGGAAGATTAATGAACCATACATTATAGTGTTAACTTAAAGGTCATGTTTGAATATATTTTTTATTTCTAAACAACTGACTTGTAGAACATGAAGGGGAGGTGAAAAAGTATTAAAAATGTTACCGGAAGGAAATTAATTCTTGGCCGTCGAGTGCTCTGAATGCAGATTGAAATTTCCTGTGTGGAGATTTATAAATTGGGATACCAGAATACTAAAGCTAATTTAGTAGTTAGAATACTCTTCATAACAATATATGCTGCATACTGGGGTCATAAAACAAGTGTGTTTGCTAAAGATCAGGGAAATGCTATTTGTGCTTGCGGATTGGTGCTTGCTTGCTTTTAAACTTCAGAATTGTTGGTCTTAGTTTATTTGTTCATTATTCTGCATACTACCTGCCAAAGACAACCATTTGAATGGTGTTTTCCCATCGTTGGTGAAAAACATATCATTGTTCTTTCTTCTTGCTTATTTCCTTAAACCAAATCTTCTTGTAATGATGGCTAATATATATTTTTAAGAGCCAGATGGTTCGCGAGTGGATCGCTATTCCTTTTAGTTTACCATGACTTCAGAATTAAGCCTGGAGGCTGACCGCATTGTTTAAGTAGTTCCCCTGCTGCAGTTTTATACATGCTGTGTTTATGCATGCTTTGCATGACGATGTGCCGGCATTGTTAATATTACCATCCTAGTTTTTATATTCTTGTTAGTTGTTACCTACTTTCTTCTTCAATTTGAAGCAATATCATGCAGGAATACATAAGCCTGTCAACGGATACCCGGAAAATCCGAACTGCGTCCACATCCATATCCGAAAAACGGATAAATATCTGATATCCGGAAAAACGAATACGGATGCGGATACGAAGACATCCGTATCTGAAAATTATCCATCCAGTTTTTGTCAAAATTATAGTTTATATTGTGTATTTTAGTACAATGAAAGATATGCATTTATTATTTTATCAAGTTAGTAGTTTATATTTTATGCATATTCATTGCCCAAAACTATTTATTTTTATTATATTTGTTTATTTTTCACCTTTTTATAATCAATGAGATTGAAAATAAATTAAGATAAACCAAAATTTTTCTATTTATATCTCCAGATTTATTAATCATGCATATAGGATAATTATTCGATATCCGTCCGTATTCGCAGATGCGGATATCCGATATTTGAAAATGATTTTGGATGTGGATGGAGGTATGGTAGTATCAACAACCGAAAGTATTCGTTGGCAGGCCTAGAAATATGGTGGGATAAGAAATATATTATGGTGGAATATTTTTCATGCATAAAAACAGTGTTTAGAAATTATCATAATGTGCTTGCTGTAGAATTTATAGAAAAAGGAAAATAAAAAAGGATAAAGAATCATTTTCATATCATAGGATAAAAGCAGATGTATTTGAGGAAAGTATAAATTATATGCTTGCACGAGACTGATACAAAAGCGGTCAATGTTTCACTTGTGGTTCTGCACACTTTGAACAACAAGCAGGTCTAAGAACTTTGAAAAGATTTTCCTTCTTCAGTGTAAATATATTATGGATTGCATACAAATAGAGTTGATACTTGATACATAATTTCAACACATGGCTTGGGCAATTTACGGAGTGTTAGTAGAACTTTGAGTTTTTGATTTCTTTCTAAAACATAAATAGCATCTCTATCTTCGCTTGTAAAGTTTTGAATATTACTTAAAGAACATTACATTTACTTTTGACCATCAAATCCTTTTTACATCTTTAACATTACTAAAAGAACATATGGTCTGCGTTGGCCCTTCAGTTTTATTTTTGTTTGTTTAGGTAATGGATTCACACACTGGGTGGAATTACACTATTAAGTAATTTCCAGTGTTATTTTACCTGATACCCTCTGAAGTTTGATTCTCATTACACTTTATTTGGACGTAACTTTTTTATTTACCATTGTAACTTAAATTTCCCGGTAGATAGATATATGCTTTTACTTTTGGACCACATATTTTAAGGCGGTCTTAGGCTTTAGAAGGCCAACAAAGATTATATTTAATGTTAAGTAAGTTAATTTTATGCACTCGTTAATTATTATATTAAATAATATTTAATTTGCTTTCTTAATTTTTGTGAAACTGCAATACCAATGATGTTGTAGACGTAACAATTTAACAGATAATTTCTACTTGTTTTTTTGTCTAATTAATTGAAGAACATTGATATTAAGTATACTTTATTTGGTTTTAAATTTAACTATTTTGTCCATTTGTTCTAGTTGCTATCACCATAGTACTGGATGAACTAAACAGTCCCTTGTTACCTTTTGTTGCACAACTGGTATCATCATTAACTTATTCATGTTGCCATCCATTATAGTTTCCTGTTATGTTTTCCACTTTTTTGGGCATATCTGATCTCATTGTTATTTTAAATTGGATTGTTCAATATGAGAAATGTTATCAATGTATTTTCATTTTGAATTTGATCCAAGTATCTTTAATTATTGTGAGAATTCCGAGGAATCCTTTCTTAATTTGATTGTTAAATCCTTGTTGTTATCACCAGCAAACACTTAACCCAATAGTTTCCGTCTTTTTGTTGTATAATAGTATAACATTCAACGGCTAAGCTTTAGTATTTAACAGCTACTTTTTCTGCCAGTAACATTTCATCAAATTTTTCTAGAACAACTACTTCTGCACTCGTATCATACCATTTAATTTCTCAACCATCCAAACATTTATGGCTAGAAAGAATTACTCTGGCCACTTTCTACAATTATTATTTCTCATAGCCACATCACCATTAGTATCATCCAAAACCGAAACAGATGTTCTCTTGGAATTCAAATCCTCACTTTCTTTCAATAGAGGTGAAGACTCCCTACATAATTGGAACTCTGGGTCAAACGCATGCAAGATTAATGACTCCAATTGGAAGGGTGTAACCTGCCGTAACAACCAGGTGCGGAATCTACAGCTTGAGAACATGGGACTTGTAGGGCTACTTAACCTAACTGCCTTATCTAACCTACCTATTCTTCGTGCCATAAGTTTCGCCGATAACAGCTTAGTTGGGACGATGCCCGATATATCGAAGCTTGGTGCACTTAAAATGCTGTACTTGTCTAATAACAATTTTTCTGGGGTCATTCCTGATGAGGCTTTTTCAGGAATGAGGTCACTGAAAACAGTGTACATTTCTGGTAATCGATTTAAGGGGAACATACCTTCATCTTTGGCAAGGCTTTCAAAGCTTCTCGATTTGGGGTTGGATTCGAATGAGTTTGAAGGCGAGATTCCTGATTTTGAACAAGCTGTAGGATTACAGATGGTTAATGTTTCATATAATAAGTTGGAGGGAAGAATTCCTGATTCTTTGAAAAACATGAATCAGAGCTTGTTTGCCGGTAATTATTTGAAATGTATCCTTCATTTTAAATTATATATCTCTAATCATTTCGGGCCACTTTGAAAACTTACTTATATTTTAGAGCGTGTTCCAAAACT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008781714.1	7.5e-146	pollen receptor-like kinase 1
Swissprot	C0LGU0.1	6.2e-105	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RLK
trEMBL	A0A8B7BMR3	5.4e-146	pollen receptor-like kinase 5

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G35390.1	44.62	5e-141	498	PRK1	Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G05589	AT5G35390.1	650	302	12	11	618	18	651	44.62	5e-141	498
AfisC6G05589	AT4G31250.1	659	312	14	11	614	13	660	42.64	1e-138	490
AfisC6G05589	AT2G07040.1	635	305	13	22	618	18	636	43.46	5e-133	471

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	26	70	36.1	5.2e-09
PF13855.3	LRR_8	Repeat	123	181	36.4	2.8e-09
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	329	589	104.2	6.1e-30

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0022625	C	cytosolic large ribosomal subunit
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003729	F	mRNA binding
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005618	C	cell wall
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009846	P	pollen germination
GO:0016324	C	apical plasma membrane
GO:0031224	C	intrinsic component of membrane
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth
GO:0090406	C	pollen tube

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network